MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph01

Total Repeats: 233

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013193	GC	3	6	2002	2007	0 %	0 %	50 %	50 %	257091508
2	NC_013193	GC	4	8	2348	2355	0 %	0 %	50 %	50 %	257091509
3	NC_013193	GC	3	6	2488	2493	0 %	0 %	50 %	50 %	257091509
4	NC_013193	GC	4	8	2523	2530	0 %	0 %	50 %	50 %	257091509
5	NC_013193	CG	3	6	2601	2606	0 %	0 %	50 %	50 %	257091509
6	NC_013193	CG	3	6	2898	2903	0 %	0 %	50 %	50 %	257091510
7	NC_013193	GC	3	6	3214	3219	0 %	0 %	50 %	50 %	257091511
8	NC_013193	CG	3	6	3816	3821	0 %	0 %	50 %	50 %	257091511
9	NC_013193	CG	3	6	4007	4012	0 %	0 %	50 %	50 %	257091511
10	NC_013193	AG	3	6	4066	4071	50 %	0 %	50 %	0 %	257091511
11	NC_013193	GC	3	6	4404	4409	0 %	0 %	50 %	50 %	257091511
12	NC_013193	GC	3	6	5479	5484	0 %	0 %	50 %	50 %	257091511
13	NC_013193	GC	3	6	5684	5689	0 %	0 %	50 %	50 %	257091511
14	NC_013193	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	257091511
15	NC_013193	GC	3	6	7091	7096	0 %	0 %	50 %	50 %	257091511
16	NC_013193	GC	4	8	7919	7926	0 %	0 %	50 %	50 %	257091512
17	NC_013193	GA	3	6	7950	7955	50 %	0 %	50 %	0 %	257091512
18	NC_013193	GC	3	6	8307	8312	0 %	0 %	50 %	50 %	257091513
19	NC_013193	GC	3	6	8922	8927	0 %	0 %	50 %	50 %	257091514
20	NC_013193	GC	3	6	9036	9041	0 %	0 %	50 %	50 %	257091514
21	NC_013193	CG	4	8	9042	9049	0 %	0 %	50 %	50 %	257091514
22	NC_013193	CG	3	6	10077	10082	0 %	0 %	50 %	50 %	257091516
23	NC_013193	GC	4	8	12647	12654	0 %	0 %	50 %	50 %	257091519
24	NC_013193	CT	3	6	13326	13331	0 %	50 %	0 %	50 %	257091520
25	NC_013193	GC	3	6	13543	13548	0 %	0 %	50 %	50 %	257091520
26	NC_013193	CG	3	6	13817	13822	0 %	0 %	50 %	50 %	257091521
27	NC_013193	CG	6	12	14677	14688	0 %	0 %	50 %	50 %	257091524
28	NC_013193	GC	4	8	15101	15108	0 %	0 %	50 %	50 %	257091524
29	NC_013193	TG	3	6	15248	15253	0 %	50 %	50 %	0 %	257091524
30	NC_013193	CG	3	6	15349	15354	0 %	0 %	50 %	50 %	257091524
31	NC_013193	AG	3	6	15866	15871	50 %	0 %	50 %	0 %	257091524
32	NC_013193	AC	3	6	16418	16423	50 %	0 %	0 %	50 %	257091524
33	NC_013193	GC	3	6	16976	16981	0 %	0 %	50 %	50 %	257091524
34	NC_013193	CG	3	6	17161	17166	0 %	0 %	50 %	50 %	257091525
35	NC_013193	GC	3	6	17727	17732	0 %	0 %	50 %	50 %	257091525
36	NC_013193	GC	3	6	17780	17785	0 %	0 %	50 %	50 %	257091525
37	NC_013193	CG	4	8	18569	18576	0 %	0 %	50 %	50 %	257091526
38	NC_013193	CG	3	6	19039	19044	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
39	NC_013193	GA	3	6	19481	19486	50 %	0 %	50 %	0 %	257091528
40	NC_013193	GC	3	6	19683	19688	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
41	NC_013193	GC	3	6	20029	20034	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
42	NC_013193	CG	3	6	20403	20408	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
43	NC_013193	CG	3	6	20460	20465	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
44	NC_013193	GT	3	6	20495	20500	0 %	50 %	50 %	0 %	257091528
45	NC_013193	GC	3	6	20501	20506	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
46	NC_013193	CG	3	6	20671	20676	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
47	NC_013193	CG	4	8	21066	21073	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
48	NC_013193	GC	4	8	21225	21232	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
49	NC_013193	GC	3	6	21542	21547	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
50	NC_013193	CG	3	6	21573	21578	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
51	NC_013193	GC	3	6	21632	21637	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
52	NC_013193	CG	3	6	22101	22106	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
53	NC_013193	GC	3	6	22175	22180	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
54	NC_013193	GA	3	6	23018	23023	50 %	0 %	50 %	0 %	257091529
55	NC_013193	GC	3	6	23466	23471	0 %	0 %	50 %	50 %	257091529
56	NC_013193	AG	3	6	23929	23934	50 %	0 %	50 %	0 %	257091529
57	NC_013193	GC	3	6	25490	25495	0 %	0 %	50 %	50 %	257091530
58	NC_013193	GC	3	6	26236	26241	0 %	0 %	50 %	50 %	257091530
59	NC_013193	GC	5	10	27463	27472	0 %	0 %	50 %	50 %	257091531
60	NC_013193	GC	3	6	29000	29005	0 %	0 %	50 %	50 %	257091532
61	NC_013193	CG	3	6	29484	29489	0 %	0 %	50 %	50 %	257091532
62	NC_013193	GT	3	6	30142	30147	0 %	50 %	50 %	0 %	257091532
63	NC_013193	GC	3	6	30150	30155	0 %	0 %	50 %	50 %	257091532
64	NC_013193	GA	3	6	32457	32462	50 %	0 %	50 %	0 %	257091534
65	NC_013193	CG	3	6	32766	32771	0 %	0 %	50 %	50 %	257091534
66	NC_013193	TG	3	6	33447	33452	0 %	50 %	50 %	0 %	257091534
67	NC_013193	GC	3	6	33763	33768	0 %	0 %	50 %	50 %	257091534
68	NC_013193	CG	3	6	33894	33899	0 %	0 %	50 %	50 %	257091534
69	NC_013193	CA	3	6	34021	34026	50 %	0 %	0 %	50 %	257091534
70	NC_013193	CG	3	6	34278	34283	0 %	0 %	50 %	50 %	257091535
71	NC_013193	GC	3	6	34519	34524	0 %	0 %	50 %	50 %	257091535
72	NC_013193	TG	3	6	34786	34791	0 %	50 %	50 %	0 %	257091535
73	NC_013193	GC	3	6	35185	35190	0 %	0 %	50 %	50 %	257091535
74	NC_013193	GC	3	6	36187	36192	0 %	0 %	50 %	50 %	257091535
75	NC_013193	CA	4	8	36330	36337	50 %	0 %	0 %	50 %	257091535
76	NC_013193	CA	3	6	36433	36438	50 %	0 %	0 %	50 %	257091535
77	NC_013193	TC	3	6	36567	36572	0 %	50 %	0 %	50 %	257091535
78	NC_013193	CG	3	6	36658	36663	0 %	0 %	50 %	50 %	257091535
79	NC_013193	GC	4	8	36934	36941	0 %	0 %	50 %	50 %	257091535
80	NC_013193	CG	3	6	40246	40251	0 %	0 %	50 %	50 %	257091540
81	NC_013193	GC	3	6	40252	40257	0 %	0 %	50 %	50 %	257091540
82	NC_013193	GC	3	6	40422	40427	0 %	0 %	50 %	50 %	257091540
83	NC_013193	GT	3	6	42864	42869	0 %	50 %	50 %	0 %	257091543
84	NC_013193	AC	3	6	43088	43093	50 %	0 %	0 %	50 %	257091543
85	NC_013193	GC	3	6	43899	43904	0 %	0 %	50 %	50 %	257091545
86	NC_013193	GC	3	6	45416	45421	0 %	0 %	50 %	50 %	257091546
87	NC_013193	TC	3	6	47110	47115	0 %	50 %	0 %	50 %	257091547
88	NC_013193	CA	4	8	47728	47735	50 %	0 %	0 %	50 %	257091548
89	NC_013193	TC	3	6	49448	49453	0 %	50 %	0 %	50 %	257091549
90	NC_013193	CG	4	8	49956	49963	0 %	0 %	50 %	50 %	257091550
91	NC_013193	TC	3	6	50626	50631	0 %	50 %	0 %	50 %	257091551
92	NC_013193	TC	3	6	51060	51065	0 %	50 %	0 %	50 %	257091552
93	NC_013193	CG	3	6	51093	51098	0 %	0 %	50 %	50 %	257091552
94	NC_013193	CG	3	6	51413	51418	0 %	0 %	50 %	50 %	257091552
95	NC_013193	CA	3	6	51608	51613	50 %	0 %	0 %	50 %	257091552
96	NC_013193	GC	3	6	51619	51624	0 %	0 %	50 %	50 %	257091552
97	NC_013193	CG	3	6	51668	51673	0 %	0 %	50 %	50 %	257091552
98	NC_013193	TC	3	6	52197	52202	0 %	50 %	0 %	50 %	257091553
99	NC_013193	GC	3	6	52443	52448	0 %	0 %	50 %	50 %	257091553
100	NC_013193	CG	3	6	53983	53988	0 %	0 %	50 %	50 %	257091555
101	NC_013193	CG	3	6	54265	54270	0 %	0 %	50 %	50 %	257091555
102	NC_013193	CG	3	6	54751	54756	0 %	0 %	50 %	50 %	257091555
103	NC_013193	CG	3	6	55026	55031	0 %	0 %	50 %	50 %	257091555
104	NC_013193	CG	3	6	55631	55636	0 %	0 %	50 %	50 %	257091556
105	NC_013193	CG	3	6	55916	55921	0 %	0 %	50 %	50 %	257091556
106	NC_013193	GC	3	6	55985	55990	0 %	0 %	50 %	50 %	257091556
107	NC_013193	GC	3	6	56519	56524	0 %	0 %	50 %	50 %	257091557
108	NC_013193	CG	3	6	56929	56934	0 %	0 %	50 %	50 %	257091557
109	NC_013193	CA	3	6	57786	57791	50 %	0 %	0 %	50 %	257091558
110	NC_013193	CG	3	6	58163	58168	0 %	0 %	50 %	50 %	257091559
111	NC_013193	GC	3	6	59701	59706	0 %	0 %	50 %	50 %	257091560
112	NC_013193	CG	4	8	59776	59783	0 %	0 %	50 %	50 %	257091560
113	NC_013193	GC	3	6	60169	60174	0 %	0 %	50 %	50 %	257091560
114	NC_013193	GC	3	6	60342	60347	0 %	0 %	50 %	50 %	257091560
115	NC_013193	CG	3	6	60827	60832	0 %	0 %	50 %	50 %	257091560
116	NC_013193	GC	4	8	60884	60891	0 %	0 %	50 %	50 %	257091560
117	NC_013193	AC	3	6	61247	61252	50 %	0 %	0 %	50 %	257091560
118	NC_013193	GC	3	6	61323	61328	0 %	0 %	50 %	50 %	257091560
119	NC_013193	GC	3	6	61935	61940	0 %	0 %	50 %	50 %	257091562
120	NC_013193	CG	3	6	62119	62124	0 %	0 %	50 %	50 %	257091562
121	NC_013193	GC	3	6	65504	65509	0 %	0 %	50 %	50 %	257091565
122	NC_013193	CG	5	10	66046	66055	0 %	0 %	50 %	50 %	257091565
123	NC_013193	CT	3	6	67798	67803	0 %	50 %	0 %	50 %	257091566
124	NC_013193	GC	3	6	69544	69549	0 %	0 %	50 %	50 %	257091568
125	NC_013193	GC	3	6	69647	69652	0 %	0 %	50 %	50 %	257091568
126	NC_013193	GA	3	6	70087	70092	50 %	0 %	50 %	0 %	257091569
127	NC_013193	CG	3	6	70716	70721	0 %	0 %	50 %	50 %	257091569
128	NC_013193	GC	3	6	70958	70963	0 %	0 %	50 %	50 %	257091569
129	NC_013193	CG	3	6	71563	71568	0 %	0 %	50 %	50 %	257091569
130	NC_013193	GC	3	6	73616	73621	0 %	0 %	50 %	50 %	257091572
131	NC_013193	GC	3	6	73637	73642	0 %	0 %	50 %	50 %	257091572
132	NC_013193	GC	3	6	74593	74598	0 %	0 %	50 %	50 %	257091574
133	NC_013193	GC	3	6	74997	75002	0 %	0 %	50 %	50 %	257091574
134	NC_013193	GC	3	6	75302	75307	0 %	0 %	50 %	50 %	257091574
135	NC_013193	GC	3	6	75595	75600	0 %	0 %	50 %	50 %	257091574
136	NC_013193	GC	3	6	75818	75823	0 %	0 %	50 %	50 %	257091574
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138	NC_013193	CG	3	6	77760	77765	0 %	0 %	50 %	50 %	257091575
139	NC_013193	GC	3	6	78246	78251	0 %	0 %	50 %	50 %	257091575
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141	NC_013193	GC	3	6	79880	79885	0 %	0 %	50 %	50 %	257091578
142	NC_013193	GC	3	6	80598	80603	0 %	0 %	50 %	50 %	257091578
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.