MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Leptotrichia buccalis C-1013-b chromosome

Total Repeats: 1300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013192	AAGTAA	2	12	2853	2864	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124816
2	NC_013192	GAAGTT	2	12	4747	4758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124818
3	NC_013192	AAAAAG	2	12	9879	9890	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257124822
4	NC_013192	ACAATT	2	12	10852	10863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257124823
5	NC_013192	ATTTGC	2	12	12763	12774	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257124824
6	NC_013192	ATTTTT	2	12	13072	13083	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257124824
7	NC_013192	TAGGAA	2	12	14245	14256	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257124825
8	NC_013192	TTGCGA	2	12	14735	14746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257124826
9	NC_013192	TGGAAA	2	12	16483	16494	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257124828
10	NC_013192	TTGCTG	2	12	18504	18515	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	257124829
11	NC_013192	TGAAGA	2	12	19327	19338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257124830
12	NC_013192	GGAAAA	2	12	19666	19677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124830
13	NC_013192	TGAAAA	2	12	19846	19857	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124830
14	NC_013192	GCACTT	2	12	21268	21279	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257124831
15	NC_013192	ATTTTC	2	12	23670	23681	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	257124833
16	NC_013192	ATCAGA	2	12	23874	23885	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257124833
17	NC_013192	CGATAG	2	12	27524	27535	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257124837
18	NC_013192	TGACTT	2	12	28147	28158	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257124838
19	NC_013192	ATCAGG	2	12	31275	31286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257124841
20	NC_013192	TTTTCC	2	12	32344	32355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257124842
21	NC_013192	TTTAAT	2	12	33695	33706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124843
22	NC_013192	TTGTCA	2	12	34955	34966	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257124844
23	NC_013192	TCAAAA	2	12	36120	36131	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	257124846
24	NC_013192	AAAAAC	2	12	41726	41737	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	257124848
25	NC_013192	TTCAAT	2	12	47464	47475	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257124852
26	NC_013192	TCCTAC	2	12	50932	50943	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	257124855
27	NC_013192	ATCATT	2	12	51193	51204	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257124855
28	NC_013192	TATTTT	2	12	52914	52925	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257124856
29	NC_013192	ATTGAT	2	12	54660	54671	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257124859
30	NC_013192	AATTGA	2	12	58953	58964	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257124863
31	NC_013192	GTAAAA	2	12	62968	62979	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124866
32	NC_013192	TATTTT	2	12	68273	68284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257124872
33	NC_013192	TAATTA	2	12	68751	68762	50 %	50 %	0 %	0 %	257124872
34	NC_013192	CATTTC	2	12	72746	72757	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257124876
35	NC_013192	ATTCCA	2	12	74317	74328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257124877
36	NC_013192	TTTCCA	2	12	77217	77228	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257124879
37	NC_013192	ATTTTA	2	12	86772	86783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124894
38	NC_013192	CTTGCA	2	12	90500	90511	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257124899
39	NC_013192	CATTTT	2	12	93216	93227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	257124903
40	NC_013192	GAAAAA	2	12	93641	93652	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257124903
41	NC_013192	TAGGAG	3	18	97818	97835	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257124907
42	NC_013192	ACTTAT	2	12	98114	98125	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257124907
43	NC_013192	AGATAA	2	12	99726	99737	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124909
44	NC_013192	GTAAAA	2	12	99835	99846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124909
45	NC_013192	TAAAAA	2	12	102933	102944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	257124914
46	NC_013192	CAATTG	2	12	103518	103529	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257124915
47	NC_013192	ATTGAA	2	12	104767	104778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257124917
48	NC_013192	TAATGG	2	12	109876	109887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124923
49	NC_013192	AAGTGC	2	12	110056	110067	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257124923
50	NC_013192	AAGAAT	2	12	110361	110372	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124923
51	NC_013192	AAAATG	2	12	111560	111571	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124925
52	NC_013192	ATTTAG	2	12	121123	121134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257124929
53	NC_013192	TATTCC	2	12	128129	128140	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257124934
54	NC_013192	AAATAT	2	12	128557	128568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124935
55	NC_013192	TACAAA	2	12	135078	135089	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	257124939
56	NC_013192	ATAATT	2	12	136794	136805	50 %	50 %	0 %	0 %	257124941
57	NC_013192	TTCATC	2	12	139014	139025	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257124943
58	NC_013192	CATTTT	2	12	139142	139153	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	257124943
59	NC_013192	TTCCTT	2	12	141799	141810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257124945
60	NC_013192	GTCTTT	2	12	142359	142370	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	257124946
61	NC_013192	AGCACA	2	12	143796	143807	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257124948
62	NC_013192	GAACCA	2	12	143901	143912	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257124948
63	NC_013192	ATAAGT	2	12	149901	149912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257124952
64	NC_013192	ATTTTG	2	12	151623	151634	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	257124953
65	NC_013192	AAAGTA	2	12	152934	152945	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124954
66	NC_013192	TTAGAA	2	12	153392	153403	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257124954
67	NC_013192	TGATAT	2	12	153802	153813	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257124954
68	NC_013192	AAAATA	2	12	154383	154394	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	257124955
69	NC_013192	TCTTAG	2	12	156374	156385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257124958
70	NC_013192	ATATTG	2	12	156954	156965	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257124959
71	NC_013192	AACTGG	2	12	157078	157089	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257124959
72	NC_013192	AGAAAT	2	12	159148	159159	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124959
73	NC_013192	GAAAAA	2	12	159266	159277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257124959
74	NC_013192	CAATTT	2	12	164118	164129	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257124964
75	NC_013192	AAATAC	2	12	166167	166178	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	257124967
76	NC_013192	TAATTG	2	12	168765	168776	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257124969
77	NC_013192	AAAAAT	2	12	170995	171006	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	257124971
78	NC_013192	ATGAAA	2	12	172313	172324	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124972
79	NC_013192	CAAAAA	2	12	173854	173865	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	257124974
80	NC_013192	CATCAC	2	12	174472	174483	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	257124975
81	NC_013192	ATTTTT	2	12	176205	176216	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257124977
82	NC_013192	TAAAAA	2	12	177136	177147	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	257124979
83	NC_013192	TCATTA	2	12	177277	177288	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257124979
84	NC_013192	ATATTT	2	12	186984	186995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124983
85	NC_013192	AGATGA	2	12	191363	191374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257124987
86	NC_013192	CAGATG	2	12	191626	191637	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257124987
87	NC_013192	ATGGAA	2	12	191824	191835	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257124987
88	NC_013192	AATTTT	2	12	194597	194608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124991
89	NC_013192	TGTTTT	2	12	200489	200500	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	257124995
90	NC_013192	TTTGTT	2	12	201841	201852	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	257124997
91	NC_013192	GAAAAA	2	12	208394	208405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257124999
92	NC_013192	GGAAGT	2	12	215005	215016	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257125004
93	NC_013192	TTTGGT	2	12	215129	215140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257125004
94	NC_013192	GAACAG	2	12	216571	216582	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	257125006
95	NC_013192	TCATAT	2	12	219053	219064	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257125010
96	NC_013192	TCAAAA	2	12	219254	219265	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	257125010
97	NC_013192	TAAAAA	2	12	223121	223132	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	257125015
98	NC_013192	TTAATA	2	12	228182	228193	50 %	50 %	0 %	0 %	257125021
99	NC_013192	TATGAA	2	12	229342	229353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257125022
100	NC_013192	ATTTTT	2	12	229757	229768	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257125023
101	NC_013192	AAAATA	2	12	232464	232475	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	257125025
102	NC_013192	AAAGAT	2	12	233924	233935	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257125027
103	NC_013192	AAATGG	2	12	236794	236805	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257125030
104	NC_013192	GAAAAA	2	12	238563	238574	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257125031
105	NC_013192	ACAACT	2	12	239613	239624	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	257125033
106	NC_013192	GAACAA	2	12	239703	239714	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	257125033
107	NC_013192	CAAAAA	2	12	244486	244497	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	257125037
108	NC_013192	TTAAAA	2	12	245612	245623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257125039
109	NC_013192	GTAAAG	2	12	247872	247883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257125043
110	NC_013192	TGAAAT	2	12	249835	249846	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257125048
111	NC_013192	TAGAGA	2	12	251659	251670	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257125053
112	NC_013192	AGAGAA	2	12	251675	251686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257125053
113	NC_013192	AAAGTA	2	12	252191	252202	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257125054
114	NC_013192	AAAAGA	2	12	252786	252797	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257125055
115	NC_013192	AACATT	2	12	254782	254793	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257125057
116	NC_013192	TTATTT	2	12	257729	257740	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257125059
117	NC_013192	TTGAAT	2	12	259617	259628	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257125062
118	NC_013192	AATTAA	2	12	260995	261006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257125062
119	NC_013192	ATTTTA	2	12	262055	262066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257125063
120	NC_013192	GAAAAT	2	12	270071	270082	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257125065
121	NC_013192	AAAATA	2	12	270357	270368	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	257125065
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221	NC_013192	TTTCTT	2	12	458969	458980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	257125229
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230	NC_013192	AAATGA	2	12	473021	473032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257125240
231	NC_013192	AATGAA	2	12	473709	473720	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257125240
232	NC_013192	CTCTTA	2	12	483262	483273	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257125242
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234	NC_013192	TTTATA	2	12	487738	487749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257125246
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464	NC_013192	CATAAT	2	12	919094	919105	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257125620
465	NC_013192	TCAAAA	2	12	919369	919380	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	257125620
466	NC_013192	ATGACA	2	12	926608	926619	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257125628
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