MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph03

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013191	CGATA	2	10	374	383	40 %	20 %	20 %	20 %	257074492
2	NC_013191	ACAGC	2	10	783	792	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013191	TTCGA	2	10	818	827	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013191	CGGCG	2	10	1407	1416	0 %	0 %	60 %	40 %	257074494
5	NC_013191	CAACC	2	10	2899	2908	40 %	0 %	0 %	60 %	257074497
6	NC_013191	GTGGC	2	10	7119	7128	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013191	CATGA	2	10	9418	9427	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013191	TGTCG	2	10	9891	9900	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013191	GTGCT	2	10	12293	12302	0 %	40 %	40 %	20 %	257074504
10	NC_013191	CGGTG	2	10	13184	13193	0 %	20 %	60 %	20 %	257074506
11	NC_013191	GTCGA	2	10	17716	17725	20 %	20 %	40 %	20 %	257074510
12	NC_013191	TGCGC	2	10	19339	19348	0 %	20 %	40 %	40 %	257074514
13	NC_013191	GCGCG	2	10	19818	19827	0 %	0 %	60 %	40 %	257074514
14	NC_013191	CGATG	2	10	20996	21005	20 %	20 %	40 %	20 %	257074514
15	NC_013191	GCCAG	2	10	21512	21521	20 %	0 %	40 %	40 %	257074514
16	NC_013191	TTTGC	2	10	25365	25374	0 %	60 %	20 %	20 %	257074517
17	NC_013191	CCAAG	2	10	27605	27614	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013191	GTCGG	2	10	30004	30013	0 %	20 %	60 %	20 %	257074523
19	NC_013191	CGAGA	2	10	30693	30702	40 %	0 %	40 %	20 %	257074523
20	NC_013191	CAAAA	2	10	31277	31286	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013191	CGGCC	2	10	31466	31475	0 %	0 %	40 %	60 %	257074524
22	NC_013191	TGGGC	2	10	31898	31907	0 %	20 %	60 %	20 %	257074524
23	NC_013191	CCGTT	2	10	33245	33254	0 %	40 %	20 %	40 %	257074526
24	NC_013191	AGGCC	2	10	33967	33976	20 %	0 %	40 %	40 %	257074527
25	NC_013191	CGTCT	2	10	35023	35032	0 %	40 %	20 %	40 %	257074528
26	NC_013191	GCCGA	2	10	36038	36047	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_013191	GCCAA	2	10	37097	37106	40 %	0 %	20 %	40 %	257074530
28	NC_013191	GCCGC	2	10	37524	37533	0 %	0 %	40 %	60 %	257074531
29	NC_013191	GCCTG	2	10	37582	37591	0 %	20 %	40 %	40 %	257074531

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.