MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph03

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013191	GACG	2	8	206	213	25 %	0 %	50 %	25 %	257074492
2	NC_013191	CTGA	2	8	420	427	25 %	25 %	25 %	25 %	257074492
3	NC_013191	CGGG	2	8	448	455	0 %	0 %	75 %	25 %	257074492
4	NC_013191	TGCC	2	8	1051	1058	0 %	25 %	25 %	50 %	257074493
5	NC_013191	GTGC	2	8	1233	1240	0 %	25 %	50 %	25 %	257074493
6	NC_013191	ATCA	2	8	1564	1571	50 %	25 %	0 %	25 %	257074494
7	NC_013191	CAAA	2	8	2476	2483	75 %	0 %	0 %	25 %	257074496
8	NC_013191	GCCA	2	8	3027	3034	25 %	0 %	25 %	50 %	257074497
9	NC_013191	TCAA	2	8	3070	3077	50 %	25 %	0 %	25 %	257074497
10	NC_013191	TCTT	2	8	3872	3879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013191	CGGA	2	8	4000	4007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013191	GCGG	2	8	5374	5381	0 %	0 %	75 %	25 %	257074499
13	NC_013191	CGGC	2	8	6007	6014	0 %	0 %	50 %	50 %	257074500
14	NC_013191	GGGC	2	8	6466	6473	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013191	CATC	2	8	7239	7246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013191	TCCG	2	8	7370	7377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013191	GTAT	2	8	7540	7547	25 %	50 %	25 %	0 %	257074501
18	NC_013191	TTTC	2	8	8195	8202	0 %	75 %	0 %	25 %	257074501
19	NC_013191	ATCC	2	8	8674	8681	25 %	25 %	0 %	50 %	257074501
20	NC_013191	CTGC	2	8	9014	9021	0 %	25 %	25 %	50 %	257074502
21	NC_013191	GGGT	2	8	10103	10110	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013191	CCCA	2	8	10675	10682	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_013191	CGTC	2	8	11252	11259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013191	GGTC	2	8	12224	12231	0 %	25 %	50 %	25 %	257074504
25	NC_013191	GGCG	2	8	13010	13017	0 %	0 %	75 %	25 %	257074506
26	NC_013191	TGCT	2	8	13278	13285	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013191	CGTC	2	8	13550	13557	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013191	GCAC	2	8	13691	13698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013191	GTCG	2	8	13837	13844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013191	GCTT	2	8	14857	14864	0 %	50 %	25 %	25 %	257074507
31	NC_013191	ACGA	2	8	15914	15921	50 %	0 %	25 %	25 %	257074508
32	NC_013191	TCAT	2	8	16493	16500	25 %	50 %	0 %	25 %	257074508
33	NC_013191	GATA	2	8	16743	16750	50 %	25 %	25 %	0 %	257074509
34	NC_013191	CGGC	2	8	17080	17087	0 %	0 %	50 %	50 %	257074510
35	NC_013191	GCCG	2	8	17567	17574	0 %	0 %	50 %	50 %	257074510
36	NC_013191	GAAA	2	8	18100	18107	75 %	0 %	25 %	0 %	257074510
37	NC_013191	TCTT	2	8	18284	18291	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013191	GCCC	2	8	18782	18789	0 %	0 %	25 %	75 %	257074512
39	NC_013191	TCGA	2	8	18872	18879	25 %	25 %	25 %	25 %	257074512
40	NC_013191	CGTC	2	8	20022	20029	0 %	25 %	25 %	50 %	257074514
41	NC_013191	CAGC	2	8	20174	20181	25 %	0 %	25 %	50 %	257074514
42	NC_013191	GTCG	2	8	20835	20842	0 %	25 %	50 %	25 %	257074514
43	NC_013191	TCAA	2	8	21703	21710	50 %	25 %	0 %	25 %	257074514
44	NC_013191	AATA	2	8	22764	22771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013191	ACCC	2	8	23397	23404	25 %	0 %	0 %	75 %	257074516
46	NC_013191	GGCG	2	8	23616	23623	0 %	0 %	75 %	25 %	257074516
47	NC_013191	AGAA	2	8	23895	23902	75 %	0 %	25 %	0 %	257074516
48	NC_013191	CGTG	2	8	24798	24805	0 %	25 %	50 %	25 %	257074517
49	NC_013191	AGCC	2	8	24826	24833	25 %	0 %	25 %	50 %	257074517
50	NC_013191	GGCG	2	8	24888	24895	0 %	0 %	75 %	25 %	257074517
51	NC_013191	TCGG	2	8	25967	25974	0 %	25 %	50 %	25 %	257074517
52	NC_013191	ACCA	2	8	26137	26144	50 %	0 %	0 %	50 %	257074517
53	NC_013191	ATAA	2	8	26315	26322	75 %	25 %	0 %	0 %	257074517
54	NC_013191	GAAG	2	8	26468	26475	50 %	0 %	50 %	0 %	257074518
55	NC_013191	GTAA	2	8	26837	26844	50 %	25 %	25 %	0 %	257074518
56	NC_013191	CTTC	2	8	27363	27370	0 %	50 %	0 %	50 %	257074519
57	NC_013191	CGAC	2	8	27409	27416	25 %	0 %	25 %	50 %	257074519
58	NC_013191	CGAT	2	8	27491	27498	25 %	25 %	25 %	25 %	257074519
59	NC_013191	GCAG	2	8	28180	28187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013191	TCGT	2	8	28415	28422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013191	CGGC	2	8	29384	29391	0 %	0 %	50 %	50 %	257074522
62	NC_013191	GACC	2	8	29439	29446	25 %	0 %	25 %	50 %	257074522
63	NC_013191	ATTT	2	8	30014	30021	25 %	75 %	0 %	0 %	257074523
64	NC_013191	TCCT	2	8	30199	30206	0 %	50 %	0 %	50 %	257074523
65	NC_013191	CGAA	2	8	30267	30274	50 %	0 %	25 %	25 %	257074523
66	NC_013191	CCAG	2	8	30356	30363	25 %	0 %	25 %	50 %	257074523
67	NC_013191	GGCG	2	8	30515	30522	0 %	0 %	75 %	25 %	257074523
68	NC_013191	GGAC	2	8	31202	31209	25 %	0 %	50 %	25 %	257074523
69	NC_013191	GATT	2	8	31229	31236	25 %	50 %	25 %	0 %	257074523
70	NC_013191	CGGG	2	8	31330	31337	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013191	CTCG	2	8	31355	31362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013191	CGTG	2	8	31454	31461	0 %	25 %	50 %	25 %	257074524
73	NC_013191	GGCC	2	8	32783	32790	0 %	0 %	50 %	50 %	257074525
74	NC_013191	CCAT	2	8	33452	33459	25 %	25 %	0 %	50 %	257074526
75	NC_013191	GCCG	2	8	33591	33598	0 %	0 %	50 %	50 %	257074526
76	NC_013191	GGCC	2	8	34474	34481	0 %	0 %	50 %	50 %	257074527
77	NC_013191	GATC	2	8	34593	34600	25 %	25 %	25 %	25 %	257074527
78	NC_013191	CAGC	2	8	34892	34899	25 %	0 %	25 %	50 %	257074528
79	NC_013191	AAGG	2	8	35091	35098	50 %	0 %	50 %	0 %	257074528
80	NC_013191	CTGG	2	8	35539	35546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013191	ACCA	2	8	35738	35745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013191	GTCT	2	8	36124	36131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013191	CCGT	2	8	36213	36220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013191	GGTC	2	8	36860	36867	0 %	25 %	50 %	25 %	257074529
85	NC_013191	CCGC	2	8	37143	37150	0 %	0 %	25 %	75 %	257074530
86	NC_013191	GCCG	2	8	37229	37236	0 %	0 %	50 %	50 %	257074530
87	NC_013191	CAAA	2	8	37275	37282	75 %	0 %	0 %	25 %	257074530
88	NC_013191	GCAC	2	8	37377	37384	25 %	0 %	25 %	50 %	257074530
89	NC_013191	TGCC	2	8	37419	37426	0 %	25 %	25 %	50 %	257074531

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.