MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph03

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013191	TCTT	2	8	3872	3879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013191	CGGA	2	8	4000	4007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013191	GGGC	2	8	6466	6473	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013191	CATC	2	8	7239	7246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013191	TCCG	2	8	7370	7377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013191	GGGT	2	8	10103	10110	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013191	CCCA	2	8	10675	10682	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_013191	CGTC	2	8	11252	11259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013191	TGCT	2	8	13278	13285	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013191	CGTC	2	8	13550	13557	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013191	GCAC	2	8	13691	13698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013191	GTCG	2	8	13837	13844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013191	TCTT	2	8	18284	18291	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013191	AATA	2	8	22764	22771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013191	GCAG	2	8	28180	28187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013191	TCGT	2	8	28415	28422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013191	CGGG	2	8	31330	31337	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013191	CTCG	2	8	31355	31362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013191	CTGG	2	8	35539	35546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013191	ACCA	2	8	35738	35745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013191	GTCT	2	8	36124	36131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013191	CCGT	2	8	36213	36220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.