MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph03

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013191	GGC	2	6	56	61	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013191	CTT	2	6	724	729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013191	CCG	2	6	738	743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013191	TGG	2	6	837	842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013191	CCG	2	6	843	848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013191	TCG	2	6	1712	1717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013191	CGT	2	6	1826	1831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013191	ACA	2	6	2772	2777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013191	TCT	2	6	3825	3830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013191	ACC	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_013191	AAG	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013191	AAG	2	6	3941	3946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013191	ACC	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_013191	CAA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013191	CCG	2	6	4068	4073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013191	CTG	2	6	4140	4145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013191	CAG	2	6	4152	4157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013191	GCG	2	6	4205	4210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013191	GTG	2	6	4228	4233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013191	GCC	2	6	4243	4248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_013191	CCA	2	6	4270	4275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013191	TCA	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013191	CAT	2	6	4423	4428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013191	GCC	2	6	4459	4464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_013191	CGC	2	6	4496	4501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013191	AGC	3	9	4507	4515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013191	CGC	2	6	4625	4630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013191	ACG	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013191	GGC	2	6	5415	5420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013191	GGC	2	6	5531	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013191	ATT	2	6	5569	5574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013191	AAT	2	6	5611	5616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013191	TAA	2	6	5622	5627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013191	AGG	2	6	6324	6329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013191	TTC	2	6	6348	6353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013191	TCG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013191	GAC	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013191	GGC	2	6	6675	6680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013191	GTT	2	6	6711	6716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013191	AAC	2	6	6738	6743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013191	AAC	2	6	6760	6765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013191	AAC	2	6	6782	6787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013191	AAC	2	6	6814	6819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013191	CTT	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013191	GTG	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013191	CGT	2	6	7096	7101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013191	GCA	2	6	7129	7134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013191	CGG	2	6	7204	7209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013191	GGC	2	6	7332	7337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013191	GCG	2	6	8728	8733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013191	CGT	2	6	9513	9518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013191	CCG	2	6	9536	9541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013191	CTT	2	6	9583	9588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013191	CTT	3	9	9595	9603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013191	GAA	2	6	9640	9645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013191	CGC	2	6	9720	9725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013191	CGG	2	6	9746	9751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013191	GCC	2	6	9764	9769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013191	GCA	2	6	9853	9858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013191	CGG	2	6	9884	9889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013191	CCG	2	6	9902	9907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_013191	TGG	2	6	9987	9992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013191	CAC	2	6	10049	10054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_013191	TGC	2	6	10176	10181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013191	CAG	2	6	10326	10331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013191	GCC	2	6	10338	10343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013191	GCG	2	6	10397	10402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013191	TCG	2	6	10487	10492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013191	CGG	2	6	10521	10526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013191	GCA	2	6	10601	10606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013191	GCC	2	6	10700	10705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013191	CGG	2	6	10730	10735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013191	CAA	2	6	10895	10900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013191	AGC	2	6	10969	10974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013191	CTT	2	6	10976	10981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013191	CGC	2	6	11200	11205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013191	CAA	2	6	11242	11247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013191	CAT	2	6	11362	11367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013191	GCG	2	6	11395	11400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013191	TGC	2	6	11414	11419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013191	GCA	2	6	11493	11498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013191	TCG	2	6	11624	11629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013191	GTT	2	6	11694	11699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013191	CGG	2	6	11741	11746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013191	AAT	2	6	12427	12432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013191	GAC	2	6	13324	13329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013191	CCG	2	6	13497	13502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013191	CAA	2	6	13540	13545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013191	CAT	2	6	13660	13665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013191	CGC	2	6	13712	13717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013191	GAT	2	6	13761	13766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013191	TGG	2	6	13848	13853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013191	GTG	2	6	13897	13902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013191	CGC	2	6	13912	13917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013191	GCT	2	6	13956	13961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013191	CAG	2	6	13994	13999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013191	CCA	2	6	14117	14122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_013191	TTG	2	6	16510	16515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013191	GTT	2	6	18277	18282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013191	GTC	2	6	18311	18316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013191	CGC	2	6	18989	18994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_013191	GCA	2	6	22805	22810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013191	GCT	2	6	26945	26950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013191	ACC	2	6	26953	26958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_013191	GCG	2	6	27701	27706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013191	ATG	2	6	27726	27731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013191	AGG	3	9	27751	27759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013191	GGC	2	6	28188	28193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013191	GGC	2	6	28213	28218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013191	AGA	2	6	28284	28289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013191	GTC	2	6	28465	28470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013191	GTC	3	9	28639	28647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013191	ATG	2	6	28679	28684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013191	GAT	2	6	28865	28870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013191	GAA	2	6	28894	28899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013191	GAC	2	6	31245	31250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013191	GTC	2	6	31269	31274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013191	AAT	2	6	31294	31299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013191	GTC	2	6	31922	31927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013191	CTT	2	6	31974	31979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013191	CTA	2	6	32103	32108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013191	TCG	2	6	32252	32257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013191	GAT	2	6	32335	32340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013191	GTC	2	6	32341	32346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013191	TCT	2	6	32462	32467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013191	ATG	2	6	32500	32505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013191	CGA	2	6	32529	32534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013191	ATC	2	6	35325	35330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013191	GAT	2	6	35343	35348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013191	TGA	2	6	35356	35361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013191	GTC	2	6	35371	35376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013191	AAG	2	6	35417	35422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013191	CAA	2	6	35436	35441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013191	GAC	2	6	35590	35595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013191	ATC	2	6	35632	35637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013191	CGC	2	6	35765	35770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_013191	GCC	2	6	35811	35816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_013191	GCA	2	6	35900	35905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013191	GTC	2	6	35936	35941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013191	CCG	2	6	35949	35954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_013191	AGC	2	6	36098	36103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013191	ATC	2	6	36116	36121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013191	AGA	2	6	36307	36312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013191	GCC	2	6	36337	36342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_013191	CGC	2	6	36395	36400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_013191	CGA	2	6	36438	36443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013191	CCG	2	6	36452	36457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.