MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph03

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013191	GGC	2	6	334	339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074492
2	NC_013191	ACG	2	6	441	446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074492
3	NC_013191	GCC	2	6	540	545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074492
4	NC_013191	CCG	2	6	583	588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074492
5	NC_013191	GCC	2	6	681	686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074492
6	NC_013191	GGT	2	6	1067	1072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257074493
7	NC_013191	AGC	2	6	1122	1127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074493
8	NC_013191	CGA	2	6	1338	1343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074494
9	NC_013191	TGG	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257074494
10	NC_013191	TGA	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074494
11	NC_013191	ACG	2	6	1535	1540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074494
12	NC_013191	CAT	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257074494
13	NC_013191	CCA	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257074495
14	NC_013191	GGC	2	6	1887	1892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074495
15	NC_013191	ACC	2	6	1902	1907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257074495
16	NC_013191	CCG	2	6	1921	1926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074495
17	NC_013191	GTC	2	6	1953	1958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074495
18	NC_013191	TCG	2	6	1960	1965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074495
19	NC_013191	CCA	2	6	1987	1992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257074495
20	NC_013191	AGT	2	6	2024	2029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074495
21	NC_013191	GCC	2	6	2043	2048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074495
22	NC_013191	TAA	2	6	2062	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257074495
23	NC_013191	GCA	2	6	2070	2075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074495
24	NC_013191	CAT	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257074495
25	NC_013191	GCC	2	6	2121	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074495
26	NC_013191	GCC	2	6	2133	2138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074495
27	NC_013191	GCC	2	6	2184	2189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074495
28	NC_013191	GCC	2	6	2199	2204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074495
29	NC_013191	GCC	2	6	2232	2237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074495
30	NC_013191	GCC	2	6	2421	2426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074495
31	NC_013191	AGC	2	6	2494	2499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074496
32	NC_013191	CAC	2	6	2503	2508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257074496
33	NC_013191	ACC	2	6	2516	2521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257074496
34	NC_013191	CCA	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257074496
35	NC_013191	GTT	2	6	2591	2596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257074496
36	NC_013191	CAA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257074496
37	NC_013191	CAT	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257074497
38	NC_013191	GCC	2	6	2979	2984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074497
39	NC_013191	AGC	2	6	3064	3069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074497
40	NC_013191	ATC	2	6	3222	3227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257074497
41	NC_013191	GCA	2	6	3392	3397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074497
42	NC_013191	CAG	2	6	3449	3454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074497
43	NC_013191	GCA	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074497
44	NC_013191	GGC	2	6	4902	4907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074498
45	NC_013191	GAA	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257074498
46	NC_013191	GCC	2	6	5150	5155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074499
47	NC_013191	CCG	2	6	5337	5342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074499
48	NC_013191	GCC	2	6	5366	5371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074499
49	NC_013191	GGT	2	6	5677	5682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257074500
50	NC_013191	CGG	2	6	5767	5772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074500
51	NC_013191	ACG	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074500
52	NC_013191	GGC	2	6	5818	5823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074500
53	NC_013191	AGC	2	6	5829	5834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074500
54	NC_013191	TGA	2	6	5874	5879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074500
55	NC_013191	CGA	2	6	5908	5913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074500
56	NC_013191	CAG	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074500
57	NC_013191	GCC	2	6	6047	6052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074500
58	NC_013191	GCA	2	6	6083	6088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074500
59	NC_013191	GCG	2	6	6092	6097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074500
60	NC_013191	GCC	3	9	6113	6121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074500
61	NC_013191	GGC	2	6	6142	6147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074500
62	NC_013191	CGG	2	6	6219	6224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074500
63	NC_013191	GGC	2	6	6280	6285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074500
64	NC_013191	TTG	2	6	7558	7563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257074501
65	NC_013191	GCT	2	6	7704	7709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074501
66	NC_013191	TGG	2	6	7737	7742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257074501
67	NC_013191	AGT	2	6	7744	7749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074501
68	NC_013191	CTC	2	6	7758	7763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257074501
69	NC_013191	ACC	2	6	7782	7787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257074501
70	NC_013191	GCA	2	6	7792	7797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074501
71	NC_013191	GTT	2	6	7874	7879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257074501
72	NC_013191	ATC	2	6	7906	7911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257074501
73	NC_013191	GGC	2	6	7962	7967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074501
74	NC_013191	TTG	2	6	8002	8007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257074501
75	NC_013191	CAT	2	6	8180	8185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257074501
76	NC_013191	AGG	2	6	8331	8336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257074501
77	NC_013191	GTT	2	6	8361	8366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257074501
78	NC_013191	CAA	2	6	8370	8375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257074501
79	NC_013191	GCT	2	6	8590	8595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074501
80	NC_013191	GTT	2	6	8773	8778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257074502
81	NC_013191	TGC	2	6	8818	8823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074502
82	NC_013191	TGC	2	6	9024	9029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074502
83	NC_013191	TGA	2	6	9042	9047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074502
84	NC_013191	GCA	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074502
85	NC_013191	GGC	2	6	9105	9110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074502
86	NC_013191	GTC	2	6	9131	9136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074502
87	NC_013191	GCA	2	6	9223	9228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074502
88	NC_013191	GCC	2	6	11070	11075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074503
89	NC_013191	CCA	2	6	11079	11084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257074503
90	NC_013191	TCC	2	6	11165	11170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257074503
91	NC_013191	CAA	2	6	11859	11864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257074504
92	NC_013191	GTG	2	6	11876	11881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257074504
93	NC_013191	GTC	2	6	11965	11970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074504
94	NC_013191	GCC	2	6	12050	12055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074504
95	NC_013191	TCT	2	6	12165	12170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257074504
96	NC_013191	ACC	2	6	12176	12181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257074504
97	NC_013191	ATC	2	6	12206	12211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257074504
98	NC_013191	GCA	2	6	12213	12218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074504
99	NC_013191	GTA	2	6	12274	12279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074504
100	NC_013191	GCC	2	6	12284	12289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074504
101	NC_013191	ATG	2	6	12562	12567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074505
102	NC_013191	TGC	2	6	12740	12745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074505
103	NC_013191	CGA	3	9	12819	12827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074505
104	NC_013191	TGC	2	6	12862	12867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074506
105	NC_013191	GGC	2	6	12935	12940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074506
106	NC_013191	TGA	2	6	12970	12975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074506
107	NC_013191	ATC	2	6	13018	13023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257074506
108	NC_013191	CCA	2	6	13112	13117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257074506
109	NC_013191	ATG	2	6	13155	13160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074506
110	NC_013191	CGC	2	6	13163	13168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074506
111	NC_013191	CAA	2	6	13202	13207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257074506
112	NC_013191	GCC	2	6	13210	13215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074506
113	NC_013191	AGG	2	6	14163	14168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257074507
114	NC_013191	CGT	2	6	14170	14175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074507
115	NC_013191	CCA	2	6	14200	14205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257074507
116	NC_013191	GTA	2	6	14261	14266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074507
117	NC_013191	CGC	2	6	14269	14274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074507
118	NC_013191	ACG	2	6	14288	14293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074507
119	NC_013191	TGC	2	6	14430	14435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074507
120	NC_013191	GCG	2	6	14510	14515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074507
121	NC_013191	CGC	2	6	14549	14554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074507
122	NC_013191	GTC	2	6	14681	14686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074507
123	NC_013191	CTC	2	6	14717	14722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257074507
124	NC_013191	TTC	2	6	14825	14830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257074507
125	NC_013191	AGC	2	6	14973	14978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074507
126	NC_013191	GTC	2	6	14979	14984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074507
127	NC_013191	ATT	2	6	15059	15064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257074507
128	NC_013191	CAG	2	6	15350	15355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074507
129	NC_013191	TGA	2	6	15388	15393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074507
130	NC_013191	CGA	2	6	15430	15435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074507
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134	NC_013191	CGC	2	6	15844	15849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257074508
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253	NC_013191	AGT	2	6	23785	23790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074516
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257	NC_013191	ACC	2	6	23879	23884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257074516
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376	NC_013191	ATG	2	6	36802	36807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074529
377	NC_013191	CAT	2	6	36906	36911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257074529
378	NC_013191	TGA	2	6	36917	36922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074529
379	NC_013191	GGC	2	6	36948	36953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074529
380	NC_013191	CGG	2	6	36991	36996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257074529
381	NC_013191	CTT	2	6	37067	37072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257074530
382	NC_013191	AGT	2	6	37212	37217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257074530
383	NC_013191	AGC	2	6	37266	37271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074530
384	NC_013191	TCG	2	6	37362	37367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074530
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387	NC_013191	CGA	2	6	37497	37502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257074531

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.