MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph02

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013190	GACTTC	2	12	1693	1704	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257074452
2	NC_013190	GTGGCG	2	12	3904	3915	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	257074453
3	NC_013190	GACCTG	2	12	6931	6942	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013190	CGGAAT	2	12	8517	8528	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257074460
5	NC_013190	CGGCTT	2	12	11927	11938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074462
6	NC_013190	TGAACA	2	12	12344	12355	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257074462
7	NC_013190	GGCTTC	2	12	13418	13429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257074463
8	NC_013190	CGTGAT	2	12	14227	14238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013190	ATCGTG	2	12	15478	15489	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257074464
10	NC_013190	ATGGTG	2	12	16053	16064	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	257074465
11	NC_013190	CATGGT	2	12	19474	19485	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257074469
12	NC_013190	CGTTTC	2	12	22813	22824	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257074471
13	NC_013190	ATCGGC	2	12	25798	25809	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257074473
14	NC_013190	CCTTCC	2	12	26237	26248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257074473
15	NC_013190	TGGCGC	2	12	29759	29770	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257074477
16	NC_013190	CGAATC	2	12	31852	31863	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257074481
17	NC_013190	CCGCAG	2	12	33935	33946	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257074484
18	NC_013190	CACGCC	2	12	37592	37603	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_013190	GCAATT	2	12	38237	38248	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257074488
20	NC_013190	ATGGTG	2	12	39520	39531	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	257074489

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.