MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph02

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013190	GCATC	2	10	1707	1716	20 %	20 %	20 %	40 %	257074452
2	NC_013190	CGCGC	2	10	2886	2895	0 %	0 %	40 %	60 %	257074452
3	NC_013190	ATCGC	2	10	7214	7223	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013190	TTGCC	2	10	9062	9071	0 %	40 %	20 %	40 %	257074460
5	NC_013190	AAAGC	2	10	9715	9724	60 %	0 %	20 %	20 %	257074462
6	NC_013190	GCCCG	2	10	9819	9828	0 %	0 %	40 %	60 %	257074462
7	NC_013190	TGATC	2	10	12194	12203	20 %	40 %	20 %	20 %	257074462
8	NC_013190	ACGAG	2	10	12754	12763	40 %	0 %	40 %	20 %	257074462
9	NC_013190	AGGCC	2	10	14901	14910	20 %	0 %	40 %	40 %	257074464
10	NC_013190	TATCC	2	10	16139	16148	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013190	GGATA	2	10	16153	16162	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013190	TTGGC	2	10	19294	19303	0 %	40 %	40 %	20 %	257074469
13	NC_013190	TTGCG	2	10	19383	19392	0 %	40 %	40 %	20 %	257074469
14	NC_013190	CGAAG	2	10	19510	19519	40 %	0 %	40 %	20 %	257074469
15	NC_013190	GCAAG	2	10	20491	20500	40 %	0 %	40 %	20 %	257074469
16	NC_013190	GCCGC	2	10	20574	20583	0 %	0 %	40 %	60 %	257074469
17	NC_013190	CGTTG	2	10	21120	21129	0 %	40 %	40 %	20 %	257074470
18	NC_013190	CGGCA	2	10	23387	23396	20 %	0 %	40 %	40 %	257074472
19	NC_013190	GATCA	2	10	23856	23865	40 %	20 %	20 %	20 %	257074472
20	NC_013190	CGCCT	2	10	23963	23972	0 %	20 %	20 %	60 %	257074472
21	NC_013190	GCGCT	2	10	25417	25426	0 %	20 %	40 %	40 %	257074473
22	NC_013190	GGGGC	2	10	27158	27167	0 %	0 %	80 %	20 %	257074473
23	NC_013190	GTGCT	2	10	29318	29327	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013190	CCTCC	2	10	29527	29536	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_013190	GCGCC	2	10	30125	30134	0 %	0 %	40 %	60 %	257074478
26	NC_013190	CAAGC	2	10	32708	32717	40 %	0 %	20 %	40 %	257074482
27	NC_013190	GTAGG	2	10	33181	33190	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013190	CCGGC	2	10	35433	35442	0 %	0 %	40 %	60 %	257074485
29	NC_013190	GCAAC	2	10	35717	35726	40 %	0 %	20 %	40 %	257074485
30	NC_013190	GTTTT	2	10	37018	37027	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013190	AAGCG	2	10	37126	37135	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.