MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph02

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013190	TTGA	2	8	1003	1010	25 %	50 %	25 %	0 %	257074452
2	NC_013190	CTGG	2	8	1188	1195	0 %	25 %	50 %	25 %	257074452
3	NC_013190	CGCC	2	8	1355	1362	0 %	0 %	25 %	75 %	257074452
4	NC_013190	CGCC	2	8	1784	1791	0 %	0 %	25 %	75 %	257074452
5	NC_013190	CGAC	2	8	1871	1878	25 %	0 %	25 %	50 %	257074452
6	NC_013190	GCTG	2	8	2532	2539	0 %	25 %	50 %	25 %	257074452
7	NC_013190	GGAC	2	8	2683	2690	25 %	0 %	50 %	25 %	257074452
8	NC_013190	GCCG	2	8	3653	3660	0 %	0 %	50 %	50 %	257074453
9	NC_013190	CGTT	2	8	3948	3955	0 %	50 %	25 %	25 %	257074453
10	NC_013190	GCCG	2	8	3976	3983	0 %	0 %	50 %	50 %	257074453
11	NC_013190	CGAC	2	8	4142	4149	25 %	0 %	25 %	50 %	257074453
12	NC_013190	GCAC	2	8	4231	4238	25 %	0 %	25 %	50 %	257074453
13	NC_013190	CTGG	2	8	4816	4823	0 %	25 %	50 %	25 %	257074454
14	NC_013190	CTGG	2	8	5126	5133	0 %	25 %	50 %	25 %	257074454
15	NC_013190	CTCA	2	8	5485	5492	25 %	25 %	0 %	50 %	257074455
16	NC_013190	GAAG	2	8	6487	6494	50 %	0 %	50 %	0 %	257074456
17	NC_013190	CGTC	2	8	6797	6804	0 %	25 %	25 %	50 %	257074457
18	NC_013190	CCAG	2	8	7006	7013	25 %	0 %	25 %	50 %	257074458
19	NC_013190	GGCG	2	8	7474	7481	0 %	0 %	75 %	25 %	257074459
20	NC_013190	GTGA	2	8	7715	7722	25 %	25 %	50 %	0 %	257074459
21	NC_013190	CCTG	2	8	8422	8429	0 %	25 %	25 %	50 %	257074460
22	NC_013190	CTGC	2	8	8627	8634	0 %	25 %	25 %	50 %	257074460
23	NC_013190	CCCA	2	8	8949	8956	25 %	0 %	0 %	75 %	257074460
24	NC_013190	CCAG	2	8	8978	8985	25 %	0 %	25 %	50 %	257074460
25	NC_013190	CCAC	2	8	8987	8994	25 %	0 %	0 %	75 %	257074460
26	NC_013190	TCTG	2	8	9546	9553	0 %	50 %	25 %	25 %	257074461
27	NC_013190	ATTG	2	8	9950	9957	25 %	50 %	25 %	0 %	257074462
28	NC_013190	CGAT	2	8	10357	10364	25 %	25 %	25 %	25 %	257074462
29	NC_013190	TGCG	2	8	10552	10559	0 %	25 %	50 %	25 %	257074462
30	NC_013190	CCTG	2	8	10600	10607	0 %	25 %	25 %	50 %	257074462
31	NC_013190	CTCG	2	8	10704	10711	0 %	25 %	25 %	50 %	257074462
32	NC_013190	AGGT	2	8	10918	10925	25 %	25 %	50 %	0 %	257074462
33	NC_013190	CCCG	2	8	11148	11155	0 %	0 %	25 %	75 %	257074462
34	NC_013190	GCCG	2	8	11505	11512	0 %	0 %	50 %	50 %	257074462
35	NC_013190	GTCG	2	8	11517	11524	0 %	25 %	50 %	25 %	257074462
36	NC_013190	ACCG	2	8	11772	11779	25 %	0 %	25 %	50 %	257074462
37	NC_013190	GAGG	2	8	11790	11797	25 %	0 %	75 %	0 %	257074462
38	NC_013190	GTTG	2	8	11839	11846	0 %	50 %	50 %	0 %	257074462
39	NC_013190	CGCA	2	8	12042	12049	25 %	0 %	25 %	50 %	257074462
40	NC_013190	CTTC	2	8	12070	12077	0 %	50 %	0 %	50 %	257074462
41	NC_013190	GCCG	2	8	12399	12406	0 %	0 %	50 %	50 %	257074462
42	NC_013190	TCAC	2	8	12436	12443	25 %	25 %	0 %	50 %	257074462
43	NC_013190	CCAT	2	8	12683	12690	25 %	25 %	0 %	50 %	257074462
44	NC_013190	CTGC	2	8	13813	13820	0 %	25 %	25 %	50 %	257074463
45	NC_013190	GTGC	2	8	16121	16128	0 %	25 %	50 %	25 %	257074465
46	NC_013190	CCCA	2	8	17059	17066	25 %	0 %	0 %	75 %	257074466
47	NC_013190	GCTC	2	8	18367	18374	0 %	25 %	25 %	50 %	257074467
48	NC_013190	TCCT	2	8	18641	18648	0 %	50 %	0 %	50 %	257074467
49	NC_013190	CAGT	2	8	19227	19234	25 %	25 %	25 %	25 %	257074469
50	NC_013190	CTGC	2	8	19613	19620	0 %	25 %	25 %	50 %	257074469
51	NC_013190	ATCA	2	8	19709	19716	50 %	25 %	0 %	25 %	257074469
52	NC_013190	TGGC	2	8	20159	20166	0 %	25 %	50 %	25 %	257074469
53	NC_013190	CACG	2	8	20188	20195	25 %	0 %	25 %	50 %	257074469
54	NC_013190	GACG	2	8	20233	20240	25 %	0 %	50 %	25 %	257074469
55	NC_013190	GATG	2	8	20866	20873	25 %	25 %	50 %	0 %	257074469
56	NC_013190	GGCG	2	8	21360	21367	0 %	0 %	75 %	25 %	257074470
57	NC_013190	GCTG	2	8	21991	21998	0 %	25 %	50 %	25 %	257074471
58	NC_013190	GCCG	2	8	22573	22580	0 %	0 %	50 %	50 %	257074471
59	NC_013190	CTCA	2	8	23066	23073	25 %	25 %	0 %	50 %	257074471
60	NC_013190	GCAG	2	8	23164	23171	25 %	0 %	50 %	25 %	257074471
61	NC_013190	TCAT	2	8	23262	23269	25 %	50 %	0 %	25 %	257074472
62	NC_013190	GCGA	2	8	23451	23458	25 %	0 %	50 %	25 %	257074472
63	NC_013190	GCAG	2	8	23792	23799	25 %	0 %	50 %	25 %	257074472
64	NC_013190	CCAG	2	8	24065	24072	25 %	0 %	25 %	50 %	257074472
65	NC_013190	CGGC	2	8	24290	24297	0 %	0 %	50 %	50 %	257074472
66	NC_013190	CTTT	2	8	24680	24687	0 %	75 %	0 %	25 %	257074473
67	NC_013190	TGGC	2	8	24827	24834	0 %	25 %	50 %	25 %	257074473
68	NC_013190	AAGG	2	8	25405	25412	50 %	0 %	50 %	0 %	257074473
69	NC_013190	GATC	2	8	25640	25647	25 %	25 %	25 %	25 %	257074473
70	NC_013190	GGCT	2	8	26145	26152	0 %	25 %	50 %	25 %	257074473
71	NC_013190	ATGA	2	8	26353	26360	50 %	25 %	25 %	0 %	257074473
72	NC_013190	AAGA	2	8	26368	26375	75 %	0 %	25 %	0 %	257074473
73	NC_013190	ACCG	2	8	26550	26557	25 %	0 %	25 %	50 %	257074473
74	NC_013190	TTGC	2	8	27547	27554	0 %	50 %	25 %	25 %	257074473
75	NC_013190	ACGC	2	8	27780	27787	25 %	0 %	25 %	50 %	257074474
76	NC_013190	CGGC	2	8	27956	27963	0 %	0 %	50 %	50 %	257074474
77	NC_013190	GCCA	2	8	30345	30352	25 %	0 %	25 %	50 %	257074479
78	NC_013190	CGGC	2	8	30950	30957	0 %	0 %	50 %	50 %	257074479
79	NC_013190	TCGT	2	8	31681	31688	0 %	50 %	25 %	25 %	257074480
80	NC_013190	GCCT	2	8	31944	31951	0 %	25 %	25 %	50 %	257074481
81	NC_013190	CAAG	2	8	32671	32678	50 %	0 %	25 %	25 %	257074482
82	NC_013190	CAAG	2	8	33089	33096	50 %	0 %	25 %	25 %	257074483
83	NC_013190	TCGA	2	8	33103	33110	25 %	25 %	25 %	25 %	257074483
84	NC_013190	TGAA	2	8	33133	33140	50 %	25 %	25 %	0 %	257074483
85	NC_013190	CCAG	2	8	33335	33342	25 %	0 %	25 %	50 %	257074484
86	NC_013190	CTCA	2	8	33374	33381	25 %	25 %	0 %	50 %	257074484
87	NC_013190	ATCA	2	8	33782	33789	50 %	25 %	0 %	25 %	257074484
88	NC_013190	CACC	2	8	34240	34247	25 %	0 %	0 %	75 %	257074484
89	NC_013190	CACC	2	8	34270	34277	25 %	0 %	0 %	75 %	257074484
90	NC_013190	AAGG	2	8	35265	35272	50 %	0 %	50 %	0 %	257074485
91	NC_013190	CGCC	2	8	38114	38121	0 %	0 %	25 %	75 %	257074487
92	NC_013190	ACCG	2	8	38122	38129	25 %	0 %	25 %	50 %	257074487
93	NC_013190	CTTA	2	8	38193	38200	25 %	50 %	0 %	25 %	257074488
94	NC_013190	CTTC	2	8	38563	38570	0 %	50 %	0 %	50 %	257074488
95	NC_013190	TTAT	2	8	38716	38723	25 %	75 %	0 %	0 %	257074489
96	NC_013190	TGGT	2	8	38894	38901	0 %	50 %	50 %	0 %	257074489
97	NC_013190	CCGA	2	8	39064	39071	25 %	0 %	25 %	50 %	257074489
98	NC_013190	GGTC	2	8	39359	39366	0 %	25 %	50 %	25 %	257074489
99	NC_013190	GGTG	2	8	39657	39664	0 %	25 %	75 %	0 %	257074489
100	NC_013190	GCTG	2	8	40202	40209	0 %	25 %	50 %	25 %	257074489
101	NC_013190	CACG	2	8	40233	40240	25 %	0 %	25 %	50 %	257074489
102	NC_013190	TTCT	2	8	41136	41143	0 %	75 %	0 %	25 %	257074490
103	NC_013190	CGCC	2	8	41415	41422	0 %	0 %	25 %	75 %	257074490
104	NC_013190	GGGT	2	8	41634	41641	0 %	25 %	75 %	0 %	257074490

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.