MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph02

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013190	GC	3	6	206	211	0 %	0 %	50 %	50 %	257074451
2	NC_013190	GC	3	6	509	514	0 %	0 %	50 %	50 %	257074451
3	NC_013190	GC	3	6	1059	1064	0 %	0 %	50 %	50 %	257074452
4	NC_013190	GC	3	6	3363	3368	0 %	0 %	50 %	50 %	257074452
5	NC_013190	GC	4	8	4485	4492	0 %	0 %	50 %	50 %	257074453
6	NC_013190	CG	3	6	4754	4759	0 %	0 %	50 %	50 %	257074454
7	NC_013190	AC	3	6	6566	6571	50 %	0 %	0 %	50 %	257074457
8	NC_013190	CG	3	6	7444	7449	0 %	0 %	50 %	50 %	257074459
9	NC_013190	GC	3	6	7879	7884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013190	CG	3	6	8393	8398	0 %	0 %	50 %	50 %	257074460
11	NC_013190	CG	3	6	8506	8511	0 %	0 %	50 %	50 %	257074460
12	NC_013190	GC	3	6	9039	9044	0 %	0 %	50 %	50 %	257074460
13	NC_013190	GC	3	6	9291	9296	0 %	0 %	50 %	50 %	257074460
14	NC_013190	AC	3	6	9665	9670	50 %	0 %	0 %	50 %	257074461
15	NC_013190	CG	3	6	10197	10202	0 %	0 %	50 %	50 %	257074462
16	NC_013190	TG	3	6	10810	10815	0 %	50 %	50 %	0 %	257074462
17	NC_013190	CG	3	6	11694	11699	0 %	0 %	50 %	50 %	257074462
18	NC_013190	GC	3	6	12450	12455	0 %	0 %	50 %	50 %	257074462
19	NC_013190	AG	3	6	13215	13220	50 %	0 %	50 %	0 %	257074463
20	NC_013190	AG	3	6	15537	15542	50 %	0 %	50 %	0 %	257074464
21	NC_013190	TG	4	8	15655	15662	0 %	50 %	50 %	0 %	257074464
22	NC_013190	GC	3	6	16243	16248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013190	AC	3	6	16508	16513	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013190	CG	3	6	17357	17362	0 %	0 %	50 %	50 %	257074466
25	NC_013190	AC	3	6	18990	18995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013190	CG	3	6	19211	19216	0 %	0 %	50 %	50 %	257074469
27	NC_013190	CA	3	6	20640	20645	50 %	0 %	0 %	50 %	257074469
28	NC_013190	CG	3	6	20647	20652	0 %	0 %	50 %	50 %	257074469
29	NC_013190	GC	3	6	20716	20721	0 %	0 %	50 %	50 %	257074469
30	NC_013190	TC	3	6	21683	21688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013190	GC	3	6	21816	21821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013190	CG	3	6	22521	22526	0 %	0 %	50 %	50 %	257074471
33	NC_013190	CG	4	8	22924	22931	0 %	0 %	50 %	50 %	257074471
34	NC_013190	GC	3	6	23834	23839	0 %	0 %	50 %	50 %	257074472
35	NC_013190	GC	3	6	23885	23890	0 %	0 %	50 %	50 %	257074472
36	NC_013190	TC	3	6	24630	24635	0 %	50 %	0 %	50 %	257074473
37	NC_013190	GA	3	6	24941	24946	50 %	0 %	50 %	0 %	257074473
38	NC_013190	TC	3	6	24994	24999	0 %	50 %	0 %	50 %	257074473
39	NC_013190	CG	3	6	25439	25444	0 %	0 %	50 %	50 %	257074473
40	NC_013190	GC	3	6	25912	25917	0 %	0 %	50 %	50 %	257074473
41	NC_013190	CG	3	6	26784	26789	0 %	0 %	50 %	50 %	257074473
42	NC_013190	CG	3	6	26981	26986	0 %	0 %	50 %	50 %	257074473
43	NC_013190	GC	3	6	28028	28033	0 %	0 %	50 %	50 %	257074474
44	NC_013190	GC	3	6	30576	30581	0 %	0 %	50 %	50 %	257074479
45	NC_013190	GC	3	6	30742	30747	0 %	0 %	50 %	50 %	257074479
46	NC_013190	CG	3	6	32443	32448	0 %	0 %	50 %	50 %	257074482
47	NC_013190	AC	3	6	34389	34394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013190	AC	3	6	34411	34416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013190	AC	3	6	34433	34438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013190	CG	3	6	35069	35074	0 %	0 %	50 %	50 %	257074485
51	NC_013190	CG	3	6	35101	35106	0 %	0 %	50 %	50 %	257074485
52	NC_013190	CG	3	6	35510	35515	0 %	0 %	50 %	50 %	257074485
53	NC_013190	CT	3	6	35856	35861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013190	GC	3	6	35878	35883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013190	CG	3	6	36842	36847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013190	GC	3	6	37228	37233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013190	AC	3	6	38347	38352	50 %	0 %	0 %	50 %	257074488
58	NC_013190	GC	3	6	40406	40411	0 %	0 %	50 %	50 %	257074489
59	NC_013190	GC	3	6	41518	41523	0 %	0 %	50 %	50 %	257074490
60	NC_013190	TG	3	6	41696	41701	0 %	50 %	50 %	0 %	257074490

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.