MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Kytococcus sedentarius DSM 20547 chromosome

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013169	ATGTGG	2	12	1859	1870	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013169	CGATGA	2	12	2120	2131	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013169	GGCACG	2	12	24146	24157	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013169	GCCGTC	2	12	57982	57993	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013169	GGCCGT	2	12	71301	71312	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013169	GGTGGG	2	12	77829	77840	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013169	CCTCGA	2	12	98095	98106	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013169	ACCGCG	2	12	98310	98321	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013169	CCGGCC	3	18	108841	108858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_013169	GTCGGT	2	12	153734	153745	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013169	GCACCC	2	12	177420	177431	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013169	CATGTG	2	12	219265	219276	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013169	CGGGTG	2	12	221224	221235	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013169	GGTGTT	2	12	239469	239480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013169	GCGTCC	2	12	240557	240568	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013169	CACCAG	2	12	242672	242683	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013169	TGCCAG	2	12	243682	243693	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013169	CGGCGC	2	12	258769	258780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013169	GGCTCG	2	12	262341	262352	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013169	CGTCGG	2	12	264246	264257	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013169	GCCCGC	2	12	271340	271351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013169	GCCGTC	2	12	278255	278266	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013169	CCCGCC	2	12	394311	394322	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
24	NC_013169	CCGCAC	2	12	399663	399674	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_013169	CTTCGC	2	12	414248	414259	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013169	TCCGCC	2	12	414357	414368	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_013169	CTGGGT	4	24	432641	432664	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013169	TGCGGC	2	12	469494	469505	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013169	CGCCGG	2	12	471973	471984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013169	CACGGC	2	12	472100	472111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013169	TGGCAG	2	12	484086	484097	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013169	CTGGCA	3	18	487612	487629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013169	CCTCGA	2	12	522555	522566	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013169	ACCGCG	2	12	522770	522781	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013169	CGCGGT	2	12	527335	527346	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013169	TCGAGG	2	12	527550	527561	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013169	CACGGG	2	12	603142	603153	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013169	GGGACG	2	12	613828	613839	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013169	CGCTCA	2	12	635560	635571	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013169	CGATGC	2	12	651925	651936	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013169	GCCCGG	2	12	662013	662024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013169	CGAACA	2	12	675951	675962	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013169	ACGCCG	2	12	675986	675997	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013169	CAACGC	2	12	676281	676292	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013169	ACCGCG	2	12	706594	706605	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013169	TTGGTA	2	12	743375	743386	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013169	AGTGCA	2	12	743612	743623	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013169	CAACGG	2	12	748392	748403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013169	GCCACC	2	12	780444	780455	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013169	CCTCGA	2	12	800691	800702	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013169	ACCGCG	2	12	800906	800917	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013169	GGACGT	2	12	801827	801838	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013169	CGGTGC	2	12	801863	801874	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013169	GCCCGC	2	12	810526	810537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_013169	GGTCGT	2	12	810636	810647	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013169	CCGGGC	2	12	885456	885467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013169	GTGATG	2	12	886678	886689	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013169	GCCGGG	2	12	887528	887539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013169	GGTGCT	2	12	889382	889393	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013169	CCGGCC	2	12	935039	935050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_013169	TCGGGG	2	12	1053491	1053502	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013169	CGCCAT	2	12	1086290	1086301	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013169	CCCTGC	2	12	1099835	1099846	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_013169	GGGCGT	2	12	1113752	1113763	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013169	GCTGGT	2	12	1115557	1115568	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013169	CGGCCT	2	12	1116515	1116526	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013169	CATCGC	2	12	1116674	1116685	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013169	CGTCCT	2	12	1135334	1135345	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013169	GCCCCC	2	12	1164254	1164265	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
70	NC_013169	GGCCGG	2	12	1168548	1168559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013169	CGCCCG	2	12	1185447	1185458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013169	GCCCCG	2	12	1193357	1193368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_013169	CGGCGA	2	12	1195222	1195233	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013169	GGGGGA	2	12	1195931	1195942	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013169	GAGGGC	2	12	1216457	1216468	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013169	GGATCG	2	12	1216479	1216490	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013169	GCGGCC	2	12	1233957	1233968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013169	GGGTGA	2	12	1238892	1238903	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013169	GCACCG	2	12	1241793	1241804	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013169	TTGGTA	2	12	1267964	1267975	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013169	AGTGCA	2	12	1268201	1268212	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013169	TTGCTG	2	12	1374597	1374608	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013169	ACTGAG	2	12	1380509	1380520	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013169	TCGACA	2	12	1424788	1424799	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013169	CGGCAG	2	12	1528054	1528065	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013169	GCACCG	2	12	1528908	1528919	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013169	GCGCCC	2	12	1563071	1563082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013169	GCGCCG	2	12	1588945	1588956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013169	GGGCGG	2	12	1602667	1602678	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013169	CCCCCT	2	12	1687349	1687360	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
91	NC_013169	CGTCAC	2	12	1701312	1701323	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013169	CCGGCC	2	12	1727783	1727794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013169	GGCCGG	2	12	1727809	1727820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013169	CGGCCG	2	12	1733852	1733863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013169	CCCCCG	2	12	1747120	1747131	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
96	NC_013169	GGGACG	2	12	1761035	1761046	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_013169	AACGCC	2	12	1773219	1773230	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013169	GCACGG	2	12	1777519	1777530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013169	GGCTCC	2	12	1791202	1791213	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013169	TCCTCG	2	12	1792653	1792664	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013169	AGGGCG	2	12	1792884	1792895	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013169	CGGCGC	2	12	1793098	1793109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013169	GCGCCC	2	12	1796679	1796690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_013169	CTGCCG	2	12	1796709	1796720	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013169	GGTGGG	2	12	1856394	1856405	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013169	TCCTCG	2	12	1857729	1857740	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013169	CCCCCA	2	12	1862653	1862664	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
108	NC_013169	GGTGGG	2	12	1873551	1873562	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013169	CCCGGG	2	12	1876752	1876763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013169	CCCAGC	2	12	1915690	1915701	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_013169	CCGGGG	2	12	1925649	1925660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013169	GAGCAG	2	12	1925694	1925705	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013169	GAGGGA	2	12	1926184	1926195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013169	AGGACG	2	12	1967537	1967548	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_013169	GCGGCC	2	12	2008526	2008537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013169	TGCAGG	2	12	2026159	2026170	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013169	CGGTCA	2	12	2054690	2054701	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013169	CGGCCG	2	12	2054891	2054902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013169	GGGGGT	2	12	2065834	2065845	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013169	CACCAT	2	12	2112452	2112463	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013169	CGCGGG	2	12	2148533	2148544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013169	AGGGCA	2	12	2167823	2167834	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013169	GGTGCA	2	12	2175074	2175085	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013169	CGGGCG	2	12	2202904	2202915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013169	CAACCG	2	12	2219581	2219592	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013169	GCCGGG	2	12	2219684	2219695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013169	GTTCAC	2	12	2221474	2221485	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013169	GGGTGG	2	12	2250940	2250951	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013169	ACCGTG	2	12	2280229	2280240	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013169	CATCTT	2	12	2280800	2280811	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013169	CGCAGC	2	12	2300388	2300399	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013169	CGGCTG	2	12	2302522	2302533	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013169	TTCCCC	2	12	2317252	2317263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_013169	GATGTC	2	12	2317498	2317509	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_013169	CCGACC	2	12	2328882	2328893	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_013169	CAGCGA	2	12	2331242	2331253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013169	GACGCC	2	12	2350152	2350163	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013169	GACCCC	2	12	2352325	2352336	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_013169	CCCCAC	2	12	2380301	2380312	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
140	NC_013169	GTGCCG	2	12	2380363	2380374	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013169	CGCCCC	2	12	2385674	2385685	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
142	NC_013169	CCCCGC	2	12	2386430	2386441	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
143	NC_013169	CGAACA	2	12	2411944	2411955	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013169	GCGCCG	2	12	2427964	2427975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013169	GCTTCG	2	12	2447711	2447722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013169	CGACCG	2	12	2448618	2448629	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013169	GGATGA	2	12	2458701	2458712	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013169	GTCGGT	2	12	2459296	2459307	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_013169	GAACGA	2	12	2463747	2463758	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_013169	CAGGCG	2	12	2463825	2463836	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013169	CTGCGG	2	12	2468337	2468348	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013169	CGTGGG	2	12	2472341	2472352	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_013169	GCCGGC	2	12	2474227	2474238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_013169	TCACGA	2	12	2493241	2493252	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_013169	GACGGC	2	12	2505323	2505334	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_013169	CCACGA	2	12	2507456	2507467	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
157	NC_013169	GTCCGC	2	12	2552222	2552233	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
158	NC_013169	CGGGGG	2	12	2552272	2552283	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_013169	CGACAG	2	12	2564504	2564515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_013169	CGTATC	2	12	2591116	2591127	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_013169	CCGCTG	2	12	2616117	2616128	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
162	NC_013169	GAGGCA	2	12	2621068	2621079	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_013169	GTGAGC	2	12	2657180	2657191	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_013169	CGTCGG	2	12	2657908	2657919	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_013169	CGCGGG	2	12	2662993	2663004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_013169	AGTGGG	2	12	2664436	2664447	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013169	GCCACC	2	12	2672853	2672864	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_013169	ACGGGG	2	12	2678890	2678901	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_013169	CGCCCG	2	12	2703018	2703029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_013169	GGGACG	2	12	2744863	2744874	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.