MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Kytococcus sedentarius DSM 20547 chromosome

Total Repeats: 2473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013169	CCGAC	2	10	74	83	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_013169	CGAGG	2	10	2194	2203	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013169	GTCGG	2	10	2944	2953	0 %	20 %	60 %	20 %	256823907
4	NC_013169	CGCGG	2	10	4730	4739	0 %	0 %	60 %	40 %	256823909
5	NC_013169	CGGCC	2	10	5895	5904	0 %	0 %	40 %	60 %	256823910
6	NC_013169	GCAGC	2	10	8847	8856	20 %	0 %	40 %	40 %	256823912
7	NC_013169	GGCGC	2	10	11397	11406	0 %	0 %	60 %	40 %	256823913
8	NC_013169	GGTGA	2	10	14371	14380	20 %	20 %	60 %	0 %	256823917
9	NC_013169	GCGGT	2	10	14622	14631	0 %	20 %	60 %	20 %	256823918
10	NC_013169	GGTCG	2	10	16961	16970	0 %	20 %	60 %	20 %	256823921
11	NC_013169	GGTCG	2	10	17108	17117	0 %	20 %	60 %	20 %	256823921
12	NC_013169	CCGGG	2	10	17458	17467	0 %	0 %	60 %	40 %	256823921
13	NC_013169	CGGGG	2	10	18765	18774	0 %	0 %	80 %	20 %	256823921
14	NC_013169	TCACC	2	10	20750	20759	20 %	20 %	0 %	60 %	256823922
15	NC_013169	CTTGG	2	10	21656	21665	0 %	40 %	40 %	20 %	256823923
16	NC_013169	GCGCG	2	10	22007	22016	0 %	0 %	60 %	40 %	256823923
17	NC_013169	GGTGG	2	10	22214	22223	0 %	20 %	80 %	0 %	256823923
18	NC_013169	GACCC	2	10	22526	22535	20 %	0 %	20 %	60 %	256823923
19	NC_013169	GCCAG	2	10	22711	22720	20 %	0 %	40 %	40 %	256823923
20	NC_013169	GGGGT	2	10	22808	22817	0 %	20 %	80 %	0 %	256823924
21	NC_013169	TCGCG	2	10	24413	24422	0 %	20 %	40 %	40 %	256823925
22	NC_013169	TCGTC	2	10	25148	25157	0 %	40 %	20 %	40 %	256823925
23	NC_013169	CCGGG	2	10	26551	26560	0 %	0 %	60 %	40 %	256823927
24	NC_013169	ACGCG	2	10	26908	26917	20 %	0 %	40 %	40 %	256823927
25	NC_013169	CGGGC	2	10	28941	28950	0 %	0 %	60 %	40 %	256823929
26	NC_013169	ACCTC	2	10	29881	29890	20 %	20 %	0 %	60 %	256823929
27	NC_013169	CCGCC	2	10	29900	29909	0 %	0 %	20 %	80 %	256823929
28	NC_013169	GGCGG	2	10	30425	30434	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013169	AGGTC	2	10	34419	34428	20 %	20 %	40 %	20 %	256823933
30	NC_013169	GGCGA	2	10	37979	37988	20 %	0 %	60 %	20 %	256823936
31	NC_013169	CTCGT	2	10	38545	38554	0 %	40 %	20 %	40 %	256823937
32	NC_013169	CTGCG	2	10	40080	40089	0 %	20 %	40 %	40 %	256823938
33	NC_013169	CACCG	2	10	42453	42462	20 %	0 %	20 %	60 %	256823942
34	NC_013169	GGCCG	2	10	42728	42737	0 %	0 %	60 %	40 %	256823942
35	NC_013169	CGCGG	2	10	44326	44335	0 %	0 %	60 %	40 %	256823943
36	NC_013169	GCCGC	2	10	46947	46956	0 %	0 %	40 %	60 %	256823946
37	NC_013169	CGAGC	2	10	48604	48613	20 %	0 %	40 %	40 %	256823946
38	NC_013169	CCGGG	2	10	50299	50308	0 %	0 %	60 %	40 %	256823948
39	NC_013169	CGCGG	2	10	50778	50787	0 %	0 %	60 %	40 %	256823948
40	NC_013169	CCGTG	2	10	51300	51309	0 %	20 %	40 %	40 %	256823949
41	NC_013169	GGGTG	2	10	52814	52823	0 %	20 %	80 %	0 %	256823950
42	NC_013169	TGGTG	2	10	53050	53059	0 %	40 %	60 %	0 %	256823950
43	NC_013169	GGGCC	2	10	53497	53506	0 %	0 %	60 %	40 %	256823950
44	NC_013169	GCCGG	2	10	53799	53808	0 %	0 %	60 %	40 %	256823951
45	NC_013169	GCGCC	2	10	54323	54332	0 %	0 %	40 %	60 %	256823951
46	NC_013169	GCGCT	2	10	55875	55884	0 %	20 %	40 %	40 %	256823953
47	NC_013169	CGGGC	2	10	57251	57260	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_013169	CGGCC	2	10	58112	58121	0 %	0 %	40 %	60 %	256823956
49	NC_013169	AGCTG	2	10	59403	59412	20 %	20 %	40 %	20 %	256823957
50	NC_013169	GCCCG	2	10	61307	61316	0 %	0 %	40 %	60 %	256823960
51	NC_013169	GGCGG	2	10	62336	62345	0 %	0 %	80 %	20 %	256823961
52	NC_013169	AGGGC	2	10	62431	62440	20 %	0 %	60 %	20 %	256823961
53	NC_013169	TGCGC	2	10	63842	63851	0 %	20 %	40 %	40 %	256823962
54	NC_013169	GCCGA	2	10	66569	66578	20 %	0 %	40 %	40 %	256823963
55	NC_013169	CGCTG	2	10	66656	66665	0 %	20 %	40 %	40 %	256823963
56	NC_013169	CCGCC	2	10	66993	67002	0 %	0 %	20 %	80 %	256823963
57	NC_013169	GGGCT	2	10	67475	67484	0 %	20 %	60 %	20 %	256823963
58	NC_013169	GCGCC	2	10	67708	67717	0 %	0 %	40 %	60 %	256823963
59	NC_013169	GTCGC	2	10	70723	70732	0 %	20 %	40 %	40 %	256823965
60	NC_013169	GGTGC	2	10	71934	71943	0 %	20 %	60 %	20 %	256823968
61	NC_013169	CCGCG	2	10	71950	71959	0 %	0 %	40 %	60 %	256823968
62	NC_013169	CGCAC	2	10	72887	72896	20 %	0 %	20 %	60 %	256823968
63	NC_013169	CGGTG	2	10	72917	72926	0 %	20 %	60 %	20 %	256823968
64	NC_013169	TGGGT	2	10	75011	75020	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013169	CCAGC	2	10	76061	76070	20 %	0 %	20 %	60 %	256823971
66	NC_013169	CCCGG	2	10	77408	77417	0 %	0 %	40 %	60 %	256823972
67	NC_013169	CGACC	2	10	78516	78525	20 %	0 %	20 %	60 %	256823973
68	NC_013169	CGGCG	2	10	79211	79220	0 %	0 %	60 %	40 %	256823973
69	NC_013169	CCGGG	2	10	80671	80680	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_013169	CGGCG	2	10	81179	81188	0 %	0 %	60 %	40 %	256823976
71	NC_013169	GTGCA	2	10	81651	81660	20 %	20 %	40 %	20 %	256823976
72	NC_013169	CCAGC	2	10	83012	83021	20 %	0 %	20 %	60 %	256823977
73	NC_013169	CGCGC	2	10	83521	83530	0 %	0 %	40 %	60 %	256823977
74	NC_013169	GGTGG	2	10	84807	84816	0 %	20 %	80 %	0 %	256823979
75	NC_013169	CGGGG	2	10	85580	85589	0 %	0 %	80 %	20 %	256823979
76	NC_013169	GCCGG	2	10	85699	85708	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_013169	CGGGG	2	10	85719	85728	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013169	TGCCC	2	10	86264	86273	0 %	20 %	20 %	60 %	256823981
79	NC_013169	CCTCG	2	10	86741	86750	0 %	20 %	20 %	60 %	256823981
80	NC_013169	GGACC	2	10	87188	87197	20 %	0 %	40 %	40 %	256823981
81	NC_013169	CGGCC	2	10	87952	87961	0 %	0 %	40 %	60 %	256823982
82	NC_013169	CACCG	2	10	88114	88123	20 %	0 %	20 %	60 %	256823983
83	NC_013169	GCCCG	2	10	88419	88428	0 %	0 %	40 %	60 %	256823983
84	NC_013169	CGGCC	2	10	88713	88722	0 %	0 %	40 %	60 %	256823983
85	NC_013169	CGAGA	2	10	88822	88831	40 %	0 %	40 %	20 %	256823983
86	NC_013169	GCACG	2	10	89277	89286	20 %	0 %	40 %	40 %	256823983
87	NC_013169	CGGCG	2	10	93100	93109	0 %	0 %	60 %	40 %	256823986
88	NC_013169	CCGAT	2	10	93393	93402	20 %	20 %	20 %	40 %	256823986
89	NC_013169	GCCGA	2	10	96879	96888	20 %	0 %	40 %	40 %	256823989
90	NC_013169	GCCAG	2	10	96998	97007	20 %	0 %	40 %	40 %	256823989
91	NC_013169	GCCGG	2	10	97901	97910	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_013169	GCCGG	2	10	98467	98476	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_013169	GCCCG	2	10	98732	98741	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_013169	CCAGC	2	10	98850	98859	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_013169	ACCGC	2	10	98910	98919	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_013169	GCACG	2	10	98957	98966	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013169	GTCAG	2	10	99021	99030	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013169	TGCGG	2	10	102098	102107	0 %	20 %	60 %	20 %	256823996
99	NC_013169	GACGG	2	10	102703	102712	20 %	0 %	60 %	20 %	256823997
100	NC_013169	GGGGT	2	10	106409	106418	0 %	20 %	80 %	0 %	256824000
101	NC_013169	GCCCA	2	10	108483	108492	20 %	0 %	20 %	60 %	256824002
102	NC_013169	CGCAC	2	10	109071	109080	20 %	0 %	20 %	60 %	256824003
103	NC_013169	TCGCG	2	10	110693	110702	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_013169	GACCT	2	10	112695	112704	20 %	20 %	20 %	40 %	256824005
105	NC_013169	TGCGC	2	10	114354	114363	0 %	20 %	40 %	40 %	256824006
106	NC_013169	CAGGC	2	10	115618	115627	20 %	0 %	40 %	40 %	256824007
107	NC_013169	CTCGT	2	10	115789	115798	0 %	40 %	20 %	40 %	256824007
108	NC_013169	GCGGG	2	10	115961	115970	0 %	0 %	80 %	20 %	256824008
109	NC_013169	GCACG	2	10	115976	115985	20 %	0 %	40 %	40 %	256824008
110	NC_013169	CGGGG	2	10	117101	117110	0 %	0 %	80 %	20 %	256824008
111	NC_013169	GTCCG	2	10	117723	117732	0 %	20 %	40 %	40 %	256824008
112	NC_013169	GACCT	2	10	118395	118404	20 %	20 %	20 %	40 %	256824009
113	NC_013169	GCTCC	2	10	120159	120168	0 %	20 %	20 %	60 %	256824010
114	NC_013169	TCGCG	2	10	126560	126569	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_013169	GCCTG	2	10	127304	127313	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_013169	GCGCA	2	10	127427	127436	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_013169	GGTGG	2	10	127550	127559	0 %	20 %	80 %	0 %	256824017
118	NC_013169	CCCAC	2	10	128448	128457	20 %	0 %	0 %	80 %	256824018
119	NC_013169	CGGAC	2	10	131500	131509	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_013169	ACCGG	2	10	131870	131879	20 %	0 %	40 %	40 %	256824022
121	NC_013169	GTTGC	2	10	132340	132349	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_013169	TCGCC	2	10	134757	134766	0 %	20 %	20 %	60 %	256824025
123	NC_013169	CGGCG	2	10	136046	136055	0 %	0 %	60 %	40 %	256824025
124	NC_013169	GGCGG	2	10	136300	136309	0 %	0 %	80 %	20 %	256824025
125	NC_013169	GGTGC	2	10	136839	136848	0 %	20 %	60 %	20 %	256824027
126	NC_013169	GGGTG	2	10	138515	138524	0 %	20 %	80 %	0 %	256824028
127	NC_013169	CCGCG	2	10	139335	139344	0 %	0 %	40 %	60 %	256824029
128	NC_013169	TGGCC	2	10	140496	140505	0 %	20 %	40 %	40 %	256824032
129	NC_013169	CGACC	2	10	141018	141027	20 %	0 %	20 %	60 %	256824033
130	NC_013169	GGACG	2	10	141489	141498	20 %	0 %	60 %	20 %	256824034
131	NC_013169	GCGTG	2	10	142549	142558	0 %	20 %	60 %	20 %	256824035
132	NC_013169	CCAGG	2	10	144216	144225	20 %	0 %	40 %	40 %	256824037
133	NC_013169	CGGTC	2	10	145287	145296	0 %	20 %	40 %	40 %	256824038
134	NC_013169	CGCAC	2	10	146847	146856	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_013169	CGGCC	2	10	147146	147155	0 %	0 %	40 %	60 %	256824041
136	NC_013169	CGGCA	2	10	147618	147627	20 %	0 %	40 %	40 %	256824041
137	NC_013169	TCGGG	2	10	150901	150910	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013169	CGGGC	2	10	150943	150952	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_013169	CCGTC	2	10	153978	153987	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_013169	CCGGG	2	10	154014	154023	0 %	0 %	60 %	40 %	256824047
141	NC_013169	GCGCC	2	10	154672	154681	0 %	0 %	40 %	60 %	256824048
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251	NC_013169	GGGCA	2	10	273020	273029	20 %	0 %	60 %	20 %	256824165
252	NC_013169	CGGTG	2	10	277033	277042	0 %	20 %	60 %	20 %	256824168
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254	NC_013169	GGCCG	2	10	282436	282445	0 %	0 %	60 %	40 %	256824173
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258	NC_013169	CGGGG	2	10	286204	286213	0 %	0 %	80 %	20 %	256824177
259	NC_013169	CCAGG	2	10	288292	288301	20 %	0 %	40 %	40 %	256824180
260	NC_013169	AGGCC	2	10	288414	288423	20 %	0 %	40 %	40 %	256824180
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262	NC_013169	ACGGG	2	10	290522	290531	20 %	0 %	60 %	20 %	256824182
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264	NC_013169	TGAGG	2	10	291285	291294	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
265	NC_013169	GGGGT	2	10	291333	291342	0 %	20 %	80 %	0 %	256824184
266	NC_013169	CGCTG	2	10	292277	292286	0 %	20 %	40 %	40 %	256824184
267	NC_013169	CACCG	2	10	293720	293729	20 %	0 %	20 %	60 %	256824186
268	NC_013169	GGCCA	2	10	296160	296169	20 %	0 %	40 %	40 %	256824189
269	NC_013169	GGGTG	2	10	297718	297727	0 %	20 %	80 %	0 %	256824191
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271	NC_013169	GCACC	2	10	298890	298899	20 %	0 %	20 %	60 %	256824192
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403	NC_013169	CGAGC	2	10	438612	438621	20 %	0 %	40 %	40 %	256824322
404	NC_013169	CGGCG	2	10	438950	438959	0 %	0 %	60 %	40 %	256824322
405	NC_013169	CTCGC	2	10	440164	440173	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
406	NC_013169	CCCGC	2	10	440205	440214	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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433	NC_013169	GCCGT	2	10	465966	465975	0 %	20 %	40 %	40 %	256824345
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442	NC_013169	GCCCG	2	10	474500	474509	0 %	0 %	40 %	60 %	256824354
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444	NC_013169	CCCCG	2	10	477641	477650	0 %	0 %	20 %	80 %	256824357
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453	NC_013169	CCCCG	2	10	487548	487557	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
454	NC_013169	CCGGC	2	10	487756	487765	0 %	0 %	40 %	60 %	256824367
455	NC_013169	GGGGA	2	10	489230	489239	20 %	0 %	80 %	0 %	256824368
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461	NC_013169	TGCGC	2	10	495882	495891	0 %	20 %	40 %	40 %	256824376
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487	NC_013169	GCCGG	2	10	522927	522936	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_013169	GGCCC	2	10	527177	527186	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

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