MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880204

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013168	TCTA	2	8	219	226	25 %	50 %	0 %	25 %	256823892
2	NC_013168	GTTC	2	8	742	749	0 %	50 %	25 %	25 %	256823892
3	NC_013168	TTAA	2	8	917	924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013168	TAAA	2	8	1015	1022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013168	CAAC	2	8	1375	1382	50 %	0 %	0 %	50 %	256823894
6	NC_013168	CAAG	2	8	1580	1587	50 %	0 %	25 %	25 %	256823895
7	NC_013168	CCAG	2	8	1612	1619	25 %	0 %	25 %	50 %	256823895
8	NC_013168	ATTA	2	8	1914	1921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013168	AATT	2	8	1947	1954	50 %	50 %	0 %	0 %	256823896
10	NC_013168	CAGC	2	8	2121	2128	25 %	0 %	25 %	50 %	256823896
11	NC_013168	GCAA	2	8	2619	2626	50 %	0 %	25 %	25 %	256823897
12	NC_013168	TTCG	2	8	2690	2697	0 %	50 %	25 %	25 %	256823897
13	NC_013168	GCAA	2	8	3467	3474	50 %	0 %	25 %	25 %	256823897
14	NC_013168	CAAT	2	8	3924	3931	50 %	25 %	0 %	25 %	256823898
15	NC_013168	CAAA	2	8	3933	3940	75 %	0 %	0 %	25 %	256823898
16	NC_013168	CCAA	2	8	3947	3954	50 %	0 %	0 %	50 %	256823898
17	NC_013168	ACTC	2	8	4250	4257	25 %	25 %	0 %	50 %	256823898
18	NC_013168	CAAC	2	8	4886	4893	50 %	0 %	0 %	50 %	256823898
19	NC_013168	AACA	2	8	5433	5440	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013168	AATT	2	8	6021	6028	50 %	50 %	0 %	0 %	256823899
21	NC_013168	ATTA	2	8	6602	6609	50 %	50 %	0 %	0 %	256823899
22	NC_013168	AGAA	2	8	7000	7007	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013168	TTTA	2	8	7023	7030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013168	CTTA	2	8	7182	7189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013168	CAGC	2	8	7591	7598	25 %	0 %	25 %	50 %	256823900
26	NC_013168	TTGG	2	8	7694	7701	0 %	50 %	50 %	0 %	256823900
27	NC_013168	TCAT	2	8	8613	8620	25 %	50 %	0 %	25 %	256823901
28	NC_013168	TTAA	2	8	8662	8669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013168	TAAA	2	8	8894	8901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013168	AGAC	2	8	8949	8956	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013168	CCGT	2	8	8983	8990	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013168	ATAA	2	8	10086	10093	75 %	25 %	0 %	0 %	256823903
33	NC_013168	AGAA	2	8	10237	10244	75 %	0 %	25 %	0 %	256823903
34	NC_013168	GAAA	2	8	10349	10356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013168	ACTT	2	8	10836	10843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013168	ATTT	2	8	10957	10964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013168	AGTT	2	8	11013	11020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.