MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880203

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013167	GATG	2	8	204	211	25 %	25 %	50 %	0 %	256823862
2	NC_013167	AACT	2	8	267	274	50 %	25 %	0 %	25 %	256823862
3	NC_013167	TAAC	2	8	528	535	50 %	25 %	0 %	25 %	256823862
4	NC_013167	AGTT	2	8	707	714	25 %	50 %	25 %	0 %	256823863
5	NC_013167	ATCT	2	8	847	854	25 %	50 %	0 %	25 %	256823863
6	NC_013167	CCTT	2	8	1644	1651	0 %	50 %	0 %	50 %	256823864
7	NC_013167	ATTA	2	8	2036	2043	50 %	50 %	0 %	0 %	256823864
8	NC_013167	TTAA	2	8	2256	2263	50 %	50 %	0 %	0 %	256823864
9	NC_013167	TTTG	2	8	2520	2527	0 %	75 %	25 %	0 %	256823864
10	NC_013167	TGAG	2	8	2808	2815	25 %	25 %	50 %	0 %	256823864
11	NC_013167	AATT	2	8	2956	2963	50 %	50 %	0 %	0 %	256823864
12	NC_013167	TTAG	2	8	3495	3502	25 %	50 %	25 %	0 %	256823865
13	NC_013167	CAAT	2	8	3794	3801	50 %	25 %	0 %	25 %	256823866
14	NC_013167	CGTC	2	8	3845	3852	0 %	25 %	25 %	50 %	256823866
15	NC_013167	GATG	2	8	4594	4601	25 %	25 %	50 %	0 %	256823866
16	NC_013167	AATT	2	8	5860	5867	50 %	50 %	0 %	0 %	256823867
17	NC_013167	GACC	2	8	5901	5908	25 %	0 %	25 %	50 %	256823867
18	NC_013167	GCAA	2	8	6114	6121	50 %	0 %	25 %	25 %	256823867
19	NC_013167	TGAT	2	8	6786	6793	25 %	50 %	25 %	0 %	256823868
20	NC_013167	CATA	2	8	6826	6833	50 %	25 %	0 %	25 %	256823868
21	NC_013167	AATT	2	8	7992	7999	50 %	50 %	0 %	0 %	256823871
22	NC_013167	CTAA	2	8	8224	8231	50 %	25 %	0 %	25 %	256823872
23	NC_013167	ACCT	2	8	8423	8430	25 %	25 %	0 %	50 %	256823872
24	NC_013167	TACT	2	8	9036	9043	25 %	50 %	0 %	25 %	256823873
25	NC_013167	TTTG	2	8	9744	9751	0 %	75 %	25 %	0 %	256823874
26	NC_013167	CTGA	2	8	10636	10643	25 %	25 %	25 %	25 %	256823876
27	NC_013167	TTTC	2	8	10919	10926	0 %	75 %	0 %	25 %	256823877
28	NC_013167	GAAT	2	8	10996	11003	50 %	25 %	25 %	0 %	256823877
29	NC_013167	TGGA	2	8	11067	11074	25 %	25 %	50 %	0 %	256823877
30	NC_013167	TTAA	2	8	11667	11674	50 %	50 %	0 %	0 %	256823878
31	NC_013167	TAAC	2	8	11709	11716	50 %	25 %	0 %	25 %	256823878
32	NC_013167	ATTG	2	8	11778	11785	25 %	50 %	25 %	0 %	256823878
33	NC_013167	TAAC	2	8	11819	11826	50 %	25 %	0 %	25 %	256823878
34	NC_013167	TAAA	2	8	12150	12157	75 %	25 %	0 %	0 %	256823878
35	NC_013167	ATAA	2	8	12168	12175	75 %	25 %	0 %	0 %	256823878
36	NC_013167	GATA	2	8	12566	12573	50 %	25 %	25 %	0 %	256823879
37	NC_013167	GAAC	2	8	12642	12649	50 %	0 %	25 %	25 %	256823879
38	NC_013167	CTTG	2	8	12840	12847	0 %	50 %	25 %	25 %	256823879
39	NC_013167	CAGC	2	8	12937	12944	25 %	0 %	25 %	50 %	256823879
40	NC_013167	TTGA	2	8	13935	13942	25 %	50 %	25 %	0 %	256823880
41	NC_013167	TAGA	2	8	14001	14008	50 %	25 %	25 %	0 %	256823880
42	NC_013167	CTTG	2	8	14271	14278	0 %	50 %	25 %	25 %	256823881
43	NC_013167	CCTT	2	8	14855	14862	0 %	50 %	0 %	50 %	256823881
44	NC_013167	TGAG	2	8	14986	14993	25 %	25 %	50 %	0 %	256823881
45	NC_013167	CAAG	2	8	15908	15915	50 %	0 %	25 %	25 %	256823882
46	NC_013167	CCAA	2	8	16231	16238	50 %	0 %	0 %	50 %	256823882
47	NC_013167	TCTT	2	8	16878	16885	0 %	75 %	0 %	25 %	256823882
48	NC_013167	TTTA	2	8	17028	17035	25 %	75 %	0 %	0 %	256823883
49	NC_013167	TTTG	2	8	17696	17703	0 %	75 %	25 %	0 %	256823884
50	NC_013167	CTTG	2	8	18093	18100	0 %	50 %	25 %	25 %	256823884
51	NC_013167	ATCA	2	8	18169	18176	50 %	25 %	0 %	25 %	256823884
52	NC_013167	AAGC	2	8	18200	18207	50 %	0 %	25 %	25 %	256823884
53	NC_013167	GGAT	2	8	18323	18330	25 %	25 %	50 %	0 %	256823884
54	NC_013167	AAGA	2	8	18551	18558	75 %	0 %	25 %	0 %	256823884
55	NC_013167	TCTA	2	8	18568	18575	25 %	50 %	0 %	25 %	256823884
56	NC_013167	CTTT	2	8	18670	18677	0 %	75 %	0 %	25 %	256823884
57	NC_013167	GATA	2	8	19149	19156	50 %	25 %	25 %	0 %	256823885
58	NC_013167	TGAT	2	8	19444	19451	25 %	50 %	25 %	0 %	256823885
59	NC_013167	ATAA	2	8	20575	20582	75 %	25 %	0 %	0 %	256823887
60	NC_013167	TAAT	2	8	21769	21776	50 %	50 %	0 %	0 %	256823889
61	NC_013167	ATTG	2	8	22011	22018	25 %	50 %	25 %	0 %	256823889
62	NC_013167	TCAA	2	8	22122	22129	50 %	25 %	0 %	25 %	256823890

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.