MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880203

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013167	TTA	2	6	93	98	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013167	TTA	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013167	TTA	2	6	114	119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013167	GTT	4	12	166	177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013167	TAA	2	6	553	558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013167	AAT	2	6	902	907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013167	TCA	2	6	991	996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013167	AAC	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013167	TAA	2	6	1086	1091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013167	TAA	2	6	1128	1133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013167	TAA	2	6	1135	1140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013167	TAA	2	6	1142	1147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013167	TAA	2	6	1149	1154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013167	TAA	2	6	1156	1161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013167	TAA	2	6	1163	1168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013167	ATA	2	6	1169	1174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013167	GAA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013167	TTA	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013167	TTA	2	6	1282	1287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013167	TTA	2	6	1296	1301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013167	GTG	2	6	6283	6288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013167	GGC	2	6	6490	6495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013167	ACT	2	6	7375	7380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013167	GTT	2	6	9964	9969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013167	TAG	2	6	9973	9978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013167	GAT	2	6	10003	10008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013167	TAA	2	6	10042	10047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013167	TAA	2	6	10049	10054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013167	TAA	2	6	10056	10061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013167	ATA	2	6	10062	10067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013167	TAA	2	6	11472	11477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013167	TAA	2	6	11479	11484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013167	TAA	2	6	11486	11491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013167	TAA	2	6	11493	11498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013167	TAA	2	6	11507	11512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013167	TAA	2	6	11514	11519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013167	TTA	2	6	11625	11630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013167	TTA	2	6	11639	11644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013167	TTA	2	6	11653	11658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013167	TAA	2	6	13597	13602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013167	TAA	2	6	13604	13609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013167	TAA	2	6	13611	13616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013167	TAA	2	6	13618	13623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013167	TAA	2	6	13625	13630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013167	TAA	2	6	13632	13637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013167	TAA	2	6	13639	13644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013167	TAA	2	6	13646	13651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013167	TAA	2	6	13698	13703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013167	ATT	2	6	13716	13721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013167	TTA	2	6	13724	13729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013167	TTA	2	6	13731	13736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013167	TTA	2	6	14136	14141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013167	TAA	2	6	15199	15204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013167	TTA	2	6	15308	15313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013167	CTT	2	6	15328	15333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013167	TAG	2	6	15442	15447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013167	ACC	2	6	15465	15470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_013167	GTT	2	6	15527	15532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013167	TAA	2	6	15569	15574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013167	TAA	2	6	15576	15581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013167	TAA	2	6	15583	15588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013167	ATA	2	6	15589	15594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013167	GAA	2	6	15641	15646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013167	TTA	2	6	15701	15706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013167	TTA	2	6	15708	15713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013167	TTA	2	6	15722	15727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013167	ATT	2	6	15735	15740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013167	TTA	2	6	15743	15748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013167	TTA	2	6	15757	15762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013167	TCC	2	6	17277	17282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013167	TAT	2	6	17327	17332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013167	ATT	2	6	17342	17347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013167	AAT	2	6	17348	17353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013167	CAA	2	6	17364	17369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013167	CGG	2	6	17554	17559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013167	TTA	3	9	19452	19460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013167	GTT	2	6	19645	19650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013167	ATT	2	6	19658	19663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013167	AAC	2	6	19734	19739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013167	TTA	2	6	19804	19809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013167	CTA	2	6	19868	19873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013167	TAA	2	6	19920	19925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013167	ACT	3	9	20011	20019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013167	TCT	2	6	20051	20056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013167	TCT	2	6	20111	20116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013167	CTG	2	6	20699	20704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013167	TCA	2	6	20725	20730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013167	ATT	2	6	22359	22364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013167	TAA	2	6	22397	22402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013167	TCT	2	6	22414	22419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013167	GAT	2	6	22487	22492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013167	AGC	2	6	22536	22541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013167	TAA	2	6	22581	22586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013167	TAA	2	6	22615	22620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013167	TGC	2	6	22626	22631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013167	ATT	2	6	22647	22652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013167	AGC	2	6	22668	22673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013167	TAA	2	6	22684	22689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013167	TAA	2	6	22698	22703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013167	TAA	2	6	22705	22710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.