MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880203

Total Repeats: 255

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013167	TAA	3	9	214	222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823862
2	NC_013167	ATT	2	6	314	319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823862
3	NC_013167	TTG	2	6	334	339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823862
4	NC_013167	GAC	2	6	358	363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823862
5	NC_013167	TCT	2	6	395	400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823862
6	NC_013167	ATT	2	6	436	441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823862
7	NC_013167	TTC	2	6	607	612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823863
8	NC_013167	ATT	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823863
9	NC_013167	TCC	2	6	828	833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823863
10	NC_013167	TCC	2	6	865	870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823863
11	NC_013167	ACC	3	9	1559	1567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823864
12	NC_013167	GTA	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823864
13	NC_013167	CCA	2	6	1710	1715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823864
14	NC_013167	AGC	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823864
15	NC_013167	CTT	2	6	1900	1905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
16	NC_013167	CTG	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823864
17	NC_013167	AGG	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823864
18	NC_013167	TAG	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823864
19	NC_013167	TGT	2	6	2013	2018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
20	NC_013167	TTG	3	9	2168	2176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
21	NC_013167	TTG	3	9	2213	2221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
22	NC_013167	AGA	2	6	2222	2227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823864
23	NC_013167	TTA	2	6	2286	2291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
24	NC_013167	TAT	2	6	2329	2334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
25	NC_013167	CAG	2	6	2398	2403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823864
26	NC_013167	TAT	2	6	2458	2463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
27	NC_013167	CTC	2	6	2495	2500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823864
28	NC_013167	TCT	2	6	2700	2705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
29	NC_013167	TTG	3	9	2786	2794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
30	NC_013167	TAA	2	6	2891	2896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
31	NC_013167	TCT	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
32	NC_013167	CTC	2	6	2971	2976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823864
33	NC_013167	GTT	2	6	3001	3006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
34	NC_013167	AAT	2	6	3026	3031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
35	NC_013167	TTA	2	6	3135	3140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
36	NC_013167	TCC	2	6	3278	3283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823864
37	NC_013167	TAA	2	6	3290	3295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
38	NC_013167	AAT	2	6	3360	3365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
39	NC_013167	GCT	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823864
40	NC_013167	TTC	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
41	NC_013167	AGA	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823864
42	NC_013167	TGC	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823865
43	NC_013167	AGG	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823866
44	NC_013167	AGC	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823866
45	NC_013167	GCT	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823866
46	NC_013167	TCA	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823866
47	NC_013167	TGG	2	6	3934	3939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256823866
48	NC_013167	GAT	2	6	4038	4043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
49	NC_013167	GAT	2	6	4116	4121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
50	NC_013167	GAT	2	6	4146	4151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
51	NC_013167	GAT	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
52	NC_013167	CTT	2	6	4179	4184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
53	NC_013167	TGA	3	9	4200	4208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
54	NC_013167	GTT	2	6	4285	4290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823866
55	NC_013167	TGA	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
56	NC_013167	TTG	2	6	4403	4408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823866
57	NC_013167	AGA	2	6	4468	4473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823866
58	NC_013167	CGA	2	6	4474	4479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823866
59	NC_013167	TTC	2	6	4511	4516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
60	NC_013167	CCG	2	6	4563	4568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256823866
61	NC_013167	TTC	2	6	4580	4585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
62	NC_013167	TCT	2	6	4782	4787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
63	NC_013167	GTT	2	6	4803	4808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823866
64	NC_013167	GCA	2	6	4823	4828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823866
65	NC_013167	CAA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823866
66	NC_013167	ATC	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823866
67	NC_013167	CGT	2	6	4876	4881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823866
68	NC_013167	ATT	2	6	4925	4930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823866
69	NC_013167	TCT	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
70	NC_013167	CCA	3	9	5166	5174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823867
71	NC_013167	GGT	2	6	5228	5233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256823867
72	NC_013167	AGC	2	6	5317	5322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823867
73	NC_013167	CTT	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
74	NC_013167	GGA	2	6	5481	5486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823867
75	NC_013167	TCA	2	6	5546	5551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823867
76	NC_013167	TAC	2	6	5578	5583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823867
77	NC_013167	TTA	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823867
78	NC_013167	TTC	2	6	5618	5623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
79	NC_013167	TTG	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823867
80	NC_013167	CTT	2	6	5889	5894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
81	NC_013167	TGA	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823867
82	NC_013167	GCT	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823867
83	NC_013167	GAT	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823867
84	NC_013167	TGC	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823867
85	NC_013167	CTT	2	6	6129	6134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
86	NC_013167	TCA	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823867
87	NC_013167	AAG	2	6	6595	6600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823868
88	NC_013167	TCC	2	6	6631	6636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823868
89	NC_013167	GAT	2	6	6908	6913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823868
90	NC_013167	TAA	2	6	6963	6968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823868
91	NC_013167	TAT	2	6	7105	7110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823868
92	NC_013167	TGT	2	6	7150	7155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823869
93	NC_013167	TCC	2	6	7252	7257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823869
94	NC_013167	CGG	2	6	7659	7664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256823870
95	NC_013167	GGA	2	6	7679	7684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823870
96	NC_013167	TTC	2	6	7703	7708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823870
97	NC_013167	TAG	2	6	7757	7762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823870
98	NC_013167	TGC	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823871
99	NC_013167	GTC	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823871
100	NC_013167	GGT	2	6	7903	7908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256823871
101	NC_013167	ACA	2	6	7936	7941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823871
102	NC_013167	AAG	2	6	7953	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823871
103	NC_013167	AGA	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823871
104	NC_013167	CTA	2	6	8022	8027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823871
105	NC_013167	GCT	2	6	8299	8304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823872
106	NC_013167	GCT	2	6	8332	8337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823872
107	NC_013167	GAT	2	6	8340	8345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823872
108	NC_013167	AGG	2	6	8369	8374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823872
109	NC_013167	TGA	2	6	8390	8395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823872
110	NC_013167	GAT	2	6	8401	8406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823872
111	NC_013167	CAC	2	6	8517	8522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823872
112	NC_013167	ATT	2	6	8638	8643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823872
113	NC_013167	TTA	2	6	8743	8748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823872
114	NC_013167	GGT	2	6	8764	8769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256823872
115	NC_013167	AGA	2	6	8819	8824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823872
116	NC_013167	CGG	2	6	8869	8874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256823872
117	NC_013167	GAC	2	6	8952	8957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823872
118	NC_013167	AGG	2	6	9054	9059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823873
119	NC_013167	ATA	2	6	9077	9082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823873
120	NC_013167	CAA	2	6	9158	9163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823873
121	NC_013167	TGT	3	9	9205	9213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823873
122	NC_013167	GAT	2	6	9218	9223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823873
123	NC_013167	GTT	2	6	9232	9237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823873
124	NC_013167	TAT	2	6	9269	9274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823873
125	NC_013167	ATT	2	6	9282	9287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823873
126	NC_013167	CCT	2	6	9331	9336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823873
127	NC_013167	GCA	2	6	9408	9413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823873
128	NC_013167	GAG	2	6	9449	9454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823873
129	NC_013167	GTA	2	6	9597	9602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823874
130	NC_013167	TCA	2	6	9632	9637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823874
131	NC_013167	TAA	2	6	9652	9657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823874
132	NC_013167	TAA	3	9	9703	9711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823874
133	NC_013167	AAT	2	6	9763	9768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823874
134	NC_013167	TTG	2	6	9805	9810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823874
135	NC_013167	TCT	2	6	9827	9832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823874
136	NC_013167	AGA	2	6	10390	10395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823875
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138	NC_013167	ATC	2	6	10500	10505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823876
139	NC_013167	CTT	2	6	10860	10865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823877
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159	NC_013167	TAT	2	6	12291	12296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823878
160	NC_013167	CTG	2	6	12444	12449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823878
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242	NC_013167	ATA	2	6	20788	20793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823888
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251	NC_013167	TGA	2	6	21728	21733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823889
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253	NC_013167	GTT	2	6	21992	21997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823889
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255	NC_013167	GTT	2	6	22215	22220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823890

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.