MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Kangiella koreensis DSM 16069 chromosome

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013166	CAGGGG	2	12	35085	35096	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013166	TTTATT	2	12	73554	73565	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013166	AGCCCC	2	12	94346	94357	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013166	TAAATA	2	12	104015	104026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013166	TAAGAA	2	12	143733	143744	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013166	GTAAAA	2	12	152205	152216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013166	AAAAGA	2	12	194594	194605	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013166	ATAAAG	2	12	199923	199934	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013166	AACTTA	2	12	270737	270748	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013166	TAAGCA	2	12	297098	297109	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013166	ACCATG	2	12	341471	341482	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013166	AATAAG	2	12	360677	360688	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013166	TCTTTT	2	12	421551	421562	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013166	TGAAAT	2	12	432501	432512	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013166	TTTAAA	2	12	449874	449885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013166	CCCCTA	2	12	625179	625190	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013166	AAATTG	2	12	670275	670286	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013166	GATAAA	2	12	733209	733220	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013166	ACCGTT	2	12	772084	772095	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013166	ATTTTG	2	12	831306	831317	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013166	CAAATT	2	12	981423	981434	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013166	TTTCTA	2	12	1034921	1034932	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013166	AGAGCA	2	12	1055707	1055718	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013166	GCAAAG	2	12	1067835	1067846	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013166	AAAAAG	2	12	1101638	1101649	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013166	TGAAAT	2	12	1163965	1163976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013166	TGCAGA	2	12	1187449	1187460	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013166	GAGGGG	2	12	1211543	1211554	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013166	TTGATA	2	12	1219935	1219946	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013166	CGTTAT	2	12	1223989	1224000	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013166	AAAGTA	2	12	1230244	1230255	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013166	TAACGT	2	12	1262034	1262045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013166	AATCAG	2	12	1277797	1277808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013166	TAGTCG	2	12	1289408	1289419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013166	TTATAG	2	12	1349525	1349536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013166	ACCACT	2	12	1369765	1369776	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013166	AAGAGC	2	12	1472589	1472600	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013166	TGACAA	2	12	1499346	1499357	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013166	ACTTTT	2	12	1519096	1519107	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013166	CCCCAC	2	12	1582594	1582605	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
41	NC_013166	ATTAAT	2	12	1598387	1598398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013166	CTAACA	2	12	1674149	1674160	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013166	ATATTC	2	12	1785528	1785539	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013166	AGTTAA	2	12	1823244	1823255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013166	AAGTCT	2	12	1829685	1829696	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013166	AAATCA	2	12	1881449	1881460	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013166	CAAGCC	2	12	1890370	1890381	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013166	TGGCGA	2	12	1895080	1895091	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013166	GTATGC	2	12	1919137	1919148	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013166	TTTTTG	2	12	1936251	1936262	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013166	AATCAG	2	12	2007309	2007320	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013166	TAGTGT	2	12	2011298	2011309	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013166	AGATGA	2	12	2014039	2014050	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013166	GTTATT	2	12	2038755	2038766	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013166	TAACTT	2	12	2093615	2093626	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013166	TTTTAT	2	12	2130690	2130701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013166	TAAAAA	2	12	2151558	2151569	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013166	GCAAGT	2	12	2173871	2173882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013166	TAGCAT	2	12	2193565	2193576	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013166	TTGGTT	2	12	2254486	2254497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013166	TTCAGG	2	12	2268231	2268242	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013166	TTAAAA	2	12	2307128	2307139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013166	AGCCCT	2	12	2316248	2316259	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013166	TTTAAC	2	12	2374628	2374639	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013166	CTTCCA	2	12	2374736	2374747	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013166	CTTTAT	2	12	2403584	2403595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013166	ATAGTT	2	12	2484876	2484887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013166	AGTCTA	2	12	2487704	2487715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013166	TTTAAC	2	12	2495327	2495338	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013166	ACAAAA	2	12	2539367	2539378	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013166	TGATAC	2	12	2549865	2549876	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013166	TCATTT	2	12	2559545	2559556	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013166	CTTTTT	2	12	2581030	2581041	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013166	GAAAAA	2	12	2586130	2586141	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013166	ACAAGC	2	12	2607846	2607857	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013166	TATTTC	2	12	2683779	2683790	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013166	CTTAGA	2	12	2773522	2773533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013166	CCCCAT	2	12	2839393	2839404	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.