MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Slackia heliotrinireducens DSM 20476 chromosome

Total Repeats: 47618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013165	CAG	2	6	137	142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062755
2	NC_013165	TTC	2	6	198	203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062755
3	NC_013165	ATC	2	6	237	242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062755
4	NC_013165	ACC	2	6	258	263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062755
5	NC_013165	TGG	2	6	277	282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062755
6	NC_013165	CGT	2	6	320	325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062755
7	NC_013165	GCA	2	6	329	334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062755
8	NC_013165	ATG	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062755
9	NC_013165	TCG	2	6	498	503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062755
10	NC_013165	TGC	2	6	643	648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062755
11	NC_013165	CGT	2	6	692	697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062755
12	NC_013165	CTC	2	6	707	712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062755
13	NC_013165	CGG	2	6	736	741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257062755
14	NC_013165	CGA	2	6	818	823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062755
15	NC_013165	TTC	2	6	831	836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062755
16	NC_013165	ACC	2	6	880	885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062755
17	NC_013165	GGT	2	6	905	910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062755
18	NC_013165	CCG	2	6	916	921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062755
19	NC_013165	GAT	2	6	935	940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062755
20	NC_013165	CGA	2	6	947	952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062755
21	NC_013165	CAT	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062755
22	NC_013165	TCA	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062755
23	NC_013165	CGA	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062755
24	NC_013165	TAC	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062755
25	NC_013165	CGC	2	6	1406	1411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062755
26	NC_013165	AAG	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062755
27	NC_013165	CCA	2	6	1444	1449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062755
28	NC_013165	ATC	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062755
29	NC_013165	GAT	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062755
30	NC_013165	CAA	2	6	1755	1760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062756
31	NC_013165	TGT	2	6	1785	1790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062756
32	NC_013165	CGT	2	6	1905	1910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062756
33	NC_013165	GCT	2	6	1956	1961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062756
34	NC_013165	CAG	2	6	2139	2144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062756
35	NC_013165	AAG	2	6	2152	2157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062756
36	NC_013165	CTG	2	6	2209	2214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062756
37	NC_013165	CAC	2	6	2217	2222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062756
38	NC_013165	CCG	2	6	2291	2296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062756
39	NC_013165	CGT	2	6	2345	2350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062756
40	NC_013165	CCG	2	6	2433	2438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062756
41	NC_013165	ACC	2	6	2488	2493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062756
42	NC_013165	ACC	2	6	2506	2511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062756
43	NC_013165	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062756
44	NC_013165	CCA	2	6	2612	2617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062756
45	NC_013165	ATC	2	6	2704	2709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062756
46	NC_013165	TCC	2	6	2719	2724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062756
47	NC_013165	TTC	2	6	2743	2748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062756
48	NC_013165	CTG	2	6	2812	2817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062756
49	NC_013165	GCT	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062757
50	NC_013165	CGT	2	6	2994	2999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062757
51	NC_013165	CGT	2	6	3181	3186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062757
52	NC_013165	GAC	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062757
53	NC_013165	TGC	2	6	3204	3209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062757
54	NC_013165	CGC	2	6	3233	3238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062757
55	NC_013165	ACC	2	6	3276	3281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062757
56	NC_013165	TGA	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062757
57	NC_013165	GTT	2	6	3421	3426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062757
58	NC_013165	CAG	2	6	3719	3724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062757
59	NC_013165	CTG	3	9	3797	3805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062757
60	NC_013165	CGC	2	6	3829	3834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062757
61	NC_013165	TCA	2	6	3882	3887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062757
62	NC_013165	GTG	2	6	3938	3943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062757
63	NC_013165	GCC	2	6	4055	4060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062758
64	NC_013165	TGG	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062758
65	NC_013165	CAT	2	6	4147	4152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062758
66	NC_013165	AGG	2	6	4155	4160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062758
67	NC_013165	CGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062758
68	NC_013165	CGC	2	6	4223	4228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062758
69	NC_013165	GTG	2	6	4268	4273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062758
70	NC_013165	CAT	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062758
71	NC_013165	AAC	2	6	4313	4318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062758
72	NC_013165	AGA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062758
73	NC_013165	CCG	2	6	4353	4358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062758
74	NC_013165	AAC	2	6	4502	4507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062758
75	NC_013165	ACG	2	6	4698	4703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062759
76	NC_013165	CAC	2	6	4790	4795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062759
77	NC_013165	TCA	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062759
78	NC_013165	AGA	2	6	4938	4943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062759
79	NC_013165	GTT	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062759
80	NC_013165	CGG	2	6	4981	4986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257062759
81	NC_013165	CGG	2	6	4993	4998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257062759
82	NC_013165	CGG	2	6	5017	5022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257062759
83	NC_013165	ACC	2	6	5165	5170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062759
84	NC_013165	CAC	2	6	5173	5178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062759
85	NC_013165	CGA	2	6	5299	5304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062759
86	NC_013165	CAG	2	6	5309	5314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062759
87	NC_013165	ACG	2	6	5352	5357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062759
88	NC_013165	TCG	2	6	5364	5369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062759
89	NC_013165	CAA	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062759
90	NC_013165	GTC	2	6	5456	5461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062759
91	NC_013165	CAA	2	6	5509	5514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062759
92	NC_013165	GGC	2	6	5531	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257062759
93	NC_013165	CGA	2	6	5635	5640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062759
94	NC_013165	GCC	2	6	5657	5662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062759
95	NC_013165	ATC	2	6	5663	5668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062759
96	NC_013165	TCG	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062759
97	NC_013165	AGC	2	6	5848	5853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062759
98	NC_013165	CGC	2	6	5876	5881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062759
99	NC_013165	TCG	2	6	5964	5969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062759
100	NC_013165	GGC	2	6	5984	5989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257062759
101	NC_013165	CGA	2	6	6136	6141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062759
102	NC_013165	CAT	4	12	6172	6183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062759
103	NC_013165	TTC	2	6	6233	6238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062759
104	NC_013165	GCC	2	6	6289	6294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062759
105	NC_013165	AGA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062759
106	NC_013165	AGC	2	6	6447	6452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062759
107	NC_013165	ACC	2	6	6461	6466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062759
108	NC_013165	CGC	3	9	6511	6519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062759
109	NC_013165	CGA	2	6	6550	6555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062759
110	NC_013165	AGA	2	6	6582	6587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062759
111	NC_013165	GGC	2	6	6658	6663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257062760
112	NC_013165	CCG	2	6	6690	6695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062760
113	NC_013165	CCG	2	6	6796	6801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062760
114	NC_013165	ACC	2	6	6891	6896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062760
115	NC_013165	ACG	2	6	6918	6923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062760
116	NC_013165	ACG	2	6	7107	7112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062760
117	NC_013165	TTC	2	6	7134	7139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062760
118	NC_013165	CTG	2	6	7157	7162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062760
119	NC_013165	ACC	2	6	7271	7276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062760
120	NC_013165	GCG	2	6	7320	7325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257062760
121	NC_013165	AAG	2	6	7407	7412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062760
122	NC_013165	CAT	3	9	7432	7440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062760
123	NC_013165	AGA	2	6	7482	7487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062760
124	NC_013165	AAG	2	6	7508	7513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062760
125	NC_013165	ACG	2	6	7536	7541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062760
126	NC_013165	CAT	3	9	7567	7575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062760
127	NC_013165	TCA	2	6	7656	7661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062760
128	NC_013165	TGG	2	6	7671	7676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062760
129	NC_013165	ACT	2	6	7716	7721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062760
130	NC_013165	TCG	2	6	7797	7802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062760
131	NC_013165	CGA	2	6	7831	7836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062760
132	NC_013165	CAT	2	6	7846	7851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062760
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150	NC_013165	CGA	2	6	8596	8601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062760
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152	NC_013165	CAC	2	6	8849	8854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062760
153	NC_013165	CGG	2	6	8857	8862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257062760
154	NC_013165	AAG	2	6	8894	8899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062760
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156	NC_013165	TGA	2	6	9030	9035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062760
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158	NC_013165	AAG	2	6	9092	9097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062760
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252	NC_013165	CAC	2	6	16290	16295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062762
253	NC_013165	GAA	2	6	16311	16316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062762
254	NC_013165	GTT	2	6	16318	16323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062762
255	NC_013165	GCC	2	6	16378	16383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062762
256	NC_013165	GTT	2	6	16570	16575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062762
257	NC_013165	GAG	2	6	16618	16623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062762
258	NC_013165	GAA	2	6	16683	16688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062762
259	NC_013165	TGC	2	6	16749	16754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062762
260	NC_013165	CCG	2	6	16907	16912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062762
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262	NC_013165	TGC	2	6	17121	17126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062762
263	NC_013165	GAG	2	6	17353	17358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062762
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279	NC_013165	CGA	2	6	17997	18002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062762
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285	NC_013165	TGC	2	6	18243	18248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062762
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292	NC_013165	TGC	2	6	18885	18890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062763
293	NC_013165	CGA	2	6	18940	18945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062763
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499	NC_013165	CGT	2	6	32164	32169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062776
500	NC_013165	CCG	2	6	32278	32283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062776

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