MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Anaerococcus prevotii DSM 20548 plasmid pAPRE01

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013164	AGAAAA	2	12	2711	2722	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256821127
2	NC_013164	GGAGAA	2	12	2998	3009	50 %	0 %	50 %	0 %	256821127
3	NC_013164	CATGAA	2	12	4219	4230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256821127
4	NC_013164	AAAATT	2	12	5477	5488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256821128
5	NC_013164	AGATGA	2	12	7073	7084	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256821128
6	NC_013164	ATATAA	2	12	8251	8262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256821129
7	NC_013164	TATTGA	2	12	13815	13826	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256821137
8	NC_013164	ATCTGG	2	12	14274	14285	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256821138
9	NC_013164	AAAATT	2	12	16159	16170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256821139
10	NC_013164	AAGGAC	2	12	16194	16205	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	256821139
11	NC_013164	AGAAAA	2	12	16438	16449	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256821139
12	NC_013164	AAAAAT	2	12	18114	18125	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256821140
13	NC_013164	ATTGGT	2	12	18148	18159	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	256821140
14	NC_013164	AGATTT	2	12	19746	19757	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256821141
15	NC_013164	ATTTTA	2	12	21839	21850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256821144
16	NC_013164	AGAAAA	2	12	26175	26186	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256821147
17	NC_013164	TAAATA	2	12	28326	28337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256821147
18	NC_013164	AGATGA	2	12	28371	28382	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256821147
19	NC_013164	AAAGAG	2	12	30391	30402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256821148
20	NC_013164	TAAGAT	2	12	34235	34246	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256821150
21	NC_013164	AAAGGG	2	12	36355	36366	50 %	0 %	50 %	0 %	256821152
22	NC_013164	AATGGA	2	12	36545	36556	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256821152
23	NC_013164	AAAATT	2	12	36767	36778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256821153
24	NC_013164	AAGAAA	2	12	39682	39693	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256821156
25	NC_013164	TTTAGA	2	12	42074	42085	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256821157
26	NC_013164	ATTAAA	2	12	42161	42172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256821157
27	NC_013164	ATCTGG	2	12	42473	42484	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256821157
28	NC_013164	AGAAAT	2	12	43657	43668	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256821159
29	NC_013164	TGAAAA	2	12	44114	44125	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256821159
30	NC_013164	AATATG	2	12	49873	49884	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256821164
31	NC_013164	AGGAAA	2	12	51439	51450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256821166
32	NC_013164	ATGGAG	2	12	54435	54446	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	256821168
33	NC_013164	AGAGAT	2	12	55839	55850	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256821171
34	NC_013164	GATAAA	2	12	56092	56103	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256821171
35	NC_013164	TTTAGA	2	12	56912	56923	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256821172
36	NC_013164	AAGAAA	2	12	58093	58104	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256821173
37	NC_013164	ATGTGA	2	12	63014	63025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256821179
38	NC_013164	AAGTTA	2	12	63298	63309	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256821179
39	NC_013164	AAGAAA	2	12	64746	64757	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256821181
40	NC_013164	AATGCA	2	12	65430	65441	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256821182
41	NC_013164	AAGTTA	2	12	67972	67983	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256821185
42	NC_013164	TGGAGT	2	12	68756	68767	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	256821187
43	NC_013164	AAAAGA	2	12	69432	69443	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256821188
44	NC_013164	TACCAA	2	12	70140	70151	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	256821190
45	NC_013164	GAGATA	2	12	72670	72681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256821191
46	NC_013164	AAAAGC	2	12	73538	73549	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	256821192
47	NC_013164	AAAAAG	2	12	74116	74127	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256821192
48	NC_013164	AGAACA	2	12	74776	74787	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	256821192
49	NC_013164	AGATAA	2	12	75978	75989	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256821194
50	NC_013164	TTTACA	2	12	77325	77336	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256821195
51	NC_013164	CAAGAA	2	12	79954	79965	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	256821198
52	NC_013164	ATATGA	2	12	81068	81079	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256821198
53	NC_013164	TATGGA	2	12	83128	83139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256821200
54	NC_013164	TGGTGA	2	12	84091	84102	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	256821200
55	NC_013164	ATAAGG	2	12	84228	84239	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256821200
56	NC_013164	TGAAAA	2	12	84889	84900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256821200
57	NC_013164	TAAACC	2	12	89713	89724	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	256821201
58	NC_013164	AAAAAC	2	12	90063	90074	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	256821201
59	NC_013164	AGGAGA	2	12	91490	91501	50 %	0 %	50 %	0 %	256821202
60	NC_013164	GAAAAA	2	12	94914	94925	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256821206
61	NC_013164	GAAAAT	2	12	96435	96446	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256821208
62	NC_013164	GATAAA	2	12	97048	97059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256821208
63	NC_013164	AGAAAA	2	12	100457	100468	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256821211
64	NC_013164	ATGACA	2	12	102858	102869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256821214
65	NC_013164	AATTTG	2	12	103485	103496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256821214
66	NC_013164	GGTGTA	2	12	106882	106893	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	256821218
67	NC_013164	GTCATG	2	12	109848	109859	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256821221
68	NC_013164	TATTAA	2	12	110453	110464	50 %	50 %	0 %	0 %	256821222
69	NC_013164	TTTTAA	2	12	112671	112682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256821225
70	NC_013164	TAACTA	2	12	114661	114672	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256821226

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.