MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Anaerococcus prevotii DSM 20548 plasmid pAPRE01

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013164	AATTG	2	10	896	905	40 %	40 %	20 %	0 %	256821125
2	NC_013164	ATTTT	2	10	2024	2033	20 %	80 %	0 %	0 %	256821125
3	NC_013164	GAAAA	2	10	2449	2458	80 %	0 %	20 %	0 %	256821126
4	NC_013164	AGTAG	2	10	3016	3025	40 %	20 %	40 %	0 %	256821127
5	NC_013164	GAAAA	2	10	3619	3628	80 %	0 %	20 %	0 %	256821127
6	NC_013164	AAGAA	2	10	3876	3885	80 %	0 %	20 %	0 %	256821127
7	NC_013164	TAAAA	2	10	4173	4182	80 %	20 %	0 %	0 %	256821127
8	NC_013164	ATTGT	2	10	5029	5038	20 %	60 %	20 %	0 %	256821128
9	NC_013164	TTGGT	2	10	5867	5876	0 %	60 %	40 %	0 %	256821128
10	NC_013164	AAATA	2	10	6278	6287	80 %	20 %	0 %	0 %	256821128
11	NC_013164	AATTA	2	10	6692	6701	60 %	40 %	0 %	0 %	256821128
12	NC_013164	AAATT	2	10	7500	7509	60 %	40 %	0 %	0 %	256821129
13	NC_013164	TAATA	2	10	7522	7531	60 %	40 %	0 %	0 %	256821129
14	NC_013164	GATAA	2	10	8426	8435	60 %	20 %	20 %	0 %	256821129
15	NC_013164	ATATT	2	10	13223	13232	40 %	60 %	0 %	0 %	256821137
16	NC_013164	ATTTT	2	10	13320	13329	20 %	80 %	0 %	0 %	256821137
17	NC_013164	AAAAT	2	10	13385	13394	80 %	20 %	0 %	0 %	256821137
18	NC_013164	TAAAA	2	10	14163	14172	80 %	20 %	0 %	0 %	256821138
19	NC_013164	ATATA	2	10	15475	15484	60 %	40 %	0 %	0 %	256821139
20	NC_013164	AAGAA	2	10	15958	15967	80 %	0 %	20 %	0 %	256821139
21	NC_013164	AAATC	2	10	17477	17486	60 %	20 %	0 %	20 %	256821140
22	NC_013164	GATTT	2	10	17644	17653	20 %	60 %	20 %	0 %	256821140
23	NC_013164	AATAT	2	10	18320	18329	60 %	40 %	0 %	0 %	256821140
24	NC_013164	TTTAT	2	10	19351	19360	20 %	80 %	0 %	0 %	256821141
25	NC_013164	TTAAT	2	10	19439	19448	40 %	60 %	0 %	0 %	256821141
26	NC_013164	ATTCC	2	10	20084	20093	20 %	40 %	0 %	40 %	256821141
27	NC_013164	TTTTC	2	10	20619	20628	0 %	80 %	0 %	20 %	256821142
28	NC_013164	GAATA	2	10	25833	25842	60 %	20 %	20 %	0 %	256821147
29	NC_013164	GAAAA	2	10	27046	27055	80 %	0 %	20 %	0 %	256821147
30	NC_013164	TGTTA	2	10	27072	27081	20 %	60 %	20 %	0 %	256821147
31	NC_013164	GATAC	2	10	29191	29200	40 %	20 %	20 %	20 %	256821148
32	NC_013164	ATCAA	2	10	29582	29591	60 %	20 %	0 %	20 %	256821148
33	NC_013164	ATTAA	2	10	30225	30234	60 %	40 %	0 %	0 %	256821148
34	NC_013164	TTGAA	2	10	34061	34070	40 %	40 %	20 %	0 %	256821149
35	NC_013164	ATATT	2	10	34689	34698	40 %	60 %	0 %	0 %	256821150
36	NC_013164	TAATA	2	10	34947	34956	60 %	40 %	0 %	0 %	256821150
37	NC_013164	AAAGG	2	10	34983	34992	60 %	0 %	40 %	0 %	256821150
38	NC_013164	TTAAA	2	10	37584	37593	60 %	40 %	0 %	0 %	256821154
39	NC_013164	ATTTA	2	10	38028	38037	40 %	60 %	0 %	0 %	256821154
40	NC_013164	ATATT	2	10	38991	39000	40 %	60 %	0 %	0 %	256821155
41	NC_013164	ACAGT	2	10	39144	39153	40 %	20 %	20 %	20 %	256821155
42	NC_013164	ATATT	2	10	39376	39385	40 %	60 %	0 %	0 %	256821155
43	NC_013164	ATGAT	2	10	39576	39585	40 %	40 %	20 %	0 %	256821155
44	NC_013164	ATTTT	2	10	40439	40448	20 %	80 %	0 %	0 %	256821156
45	NC_013164	AAATT	2	10	41282	41291	60 %	40 %	0 %	0 %	256821156
46	NC_013164	TATGT	2	10	43454	43463	20 %	60 %	20 %	0 %	256821158
47	NC_013164	ACAAA	2	10	44992	45001	80 %	0 %	0 %	20 %	256821159
48	NC_013164	AACAG	2	10	45124	45133	60 %	0 %	20 %	20 %	256821159
49	NC_013164	AGTAA	2	10	47475	47484	60 %	20 %	20 %	0 %	256821161
50	NC_013164	TCAAA	2	10	48053	48062	60 %	20 %	0 %	20 %	256821162
51	NC_013164	CCTTA	2	10	49216	49225	20 %	40 %	0 %	40 %	256821163
52	NC_013164	AAGAA	2	10	49773	49782	80 %	0 %	20 %	0 %	256821164
53	NC_013164	CAAAA	2	10	49970	49979	80 %	0 %	0 %	20 %	256821164
54	NC_013164	AAGAA	2	10	50864	50873	80 %	0 %	20 %	0 %	256821165
55	NC_013164	AAGAA	2	10	50901	50910	80 %	0 %	20 %	0 %	256821165
56	NC_013164	AAAAT	2	10	52455	52464	80 %	20 %	0 %	0 %	256821166
57	NC_013164	TAAAT	2	10	52789	52798	60 %	40 %	0 %	0 %	256821166
58	NC_013164	TAACT	2	10	53701	53710	40 %	40 %	0 %	20 %	256821168
59	NC_013164	AATAA	2	10	54709	54718	80 %	20 %	0 %	0 %	256821169
60	NC_013164	ATGAA	2	10	54960	54969	60 %	20 %	20 %	0 %	256821170
61	NC_013164	GAAAT	2	10	60635	60644	60 %	20 %	20 %	0 %	256821176
62	NC_013164	GAAAA	2	10	62401	62410	80 %	0 %	20 %	0 %	256821178
63	NC_013164	TTTTA	2	10	63220	63229	20 %	80 %	0 %	0 %	256821179
64	NC_013164	AAGAA	2	10	64516	64525	80 %	0 %	20 %	0 %	256821181
65	NC_013164	TTATA	2	10	65686	65695	40 %	60 %	0 %	0 %	256821182
66	NC_013164	ATTAA	2	10	68916	68925	60 %	40 %	0 %	0 %	256821187
67	NC_013164	TTAAC	2	10	70185	70194	40 %	40 %	0 %	20 %	256821190
68	NC_013164	ATTTC	2	10	70662	70671	20 %	60 %	0 %	20 %	256821191
69	NC_013164	GATAT	2	10	71413	71422	40 %	40 %	20 %	0 %	256821191
70	NC_013164	AAGAA	2	10	73562	73571	80 %	0 %	20 %	0 %	256821192
71	NC_013164	TAAGC	2	10	73617	73626	40 %	20 %	20 %	20 %	256821192
72	NC_013164	ATATT	2	10	75275	75284	40 %	60 %	0 %	0 %	256821192
73	NC_013164	ATCAA	2	10	75842	75851	60 %	20 %	0 %	20 %	256821194
74	NC_013164	AGCTA	2	10	75954	75963	40 %	20 %	20 %	20 %	256821194
75	NC_013164	AAAAT	2	10	76178	76187	80 %	20 %	0 %	0 %	256821194
76	NC_013164	ATAAA	2	10	78245	78254	80 %	20 %	0 %	0 %	256821196
77	NC_013164	AGATA	2	10	80039	80048	60 %	20 %	20 %	0 %	256821198
78	NC_013164	GGAAA	2	10	81150	81159	60 %	0 %	40 %	0 %	256821198
79	NC_013164	CTTTT	2	10	82131	82140	0 %	80 %	0 %	20 %	256821199
80	NC_013164	AAAGA	2	10	85997	86006	80 %	0 %	20 %	0 %	256821200
81	NC_013164	CATTT	2	10	86496	86505	20 %	60 %	0 %	20 %	256821200
82	NC_013164	TAACT	2	10	87163	87172	40 %	40 %	0 %	20 %	256821200
83	NC_013164	ACGAA	2	10	90871	90880	60 %	0 %	20 %	20 %	256821201
84	NC_013164	ATTAT	2	10	94379	94388	40 %	60 %	0 %	0 %	256821205
85	NC_013164	TTTAA	2	10	94754	94763	40 %	60 %	0 %	0 %	256821205
86	NC_013164	ATCAA	2	10	96798	96807	60 %	20 %	0 %	20 %	256821208
87	NC_013164	TAATA	2	10	97007	97016	60 %	40 %	0 %	0 %	256821208
88	NC_013164	TTATT	2	10	97214	97223	20 %	80 %	0 %	0 %	256821209
89	NC_013164	ATGAA	2	10	97502	97511	60 %	20 %	20 %	0 %	256821209
90	NC_013164	ATCAA	2	10	99244	99253	60 %	20 %	0 %	20 %	256821211
91	NC_013164	AAAAC	2	10	99463	99472	80 %	0 %	0 %	20 %	256821211
92	NC_013164	ATTAT	2	10	101113	101122	40 %	60 %	0 %	0 %	256821212
93	NC_013164	CTATG	2	10	101829	101838	20 %	40 %	20 %	20 %	256821212
94	NC_013164	ATTTT	2	10	103420	103429	20 %	80 %	0 %	0 %	256821214
95	NC_013164	ATAAA	2	10	103653	103662	80 %	20 %	0 %	0 %	256821215
96	NC_013164	GAATA	2	10	104020	104029	60 %	20 %	20 %	0 %	256821215
97	NC_013164	ATATT	2	10	104967	104976	40 %	60 %	0 %	0 %	256821215
98	NC_013164	TTTAG	2	10	105734	105743	20 %	60 %	20 %	0 %	256821216
99	NC_013164	TTTAT	2	10	106460	106469	20 %	80 %	0 %	0 %	256821217
100	NC_013164	TGTAA	2	10	107496	107505	40 %	40 %	20 %	0 %	256821219
101	NC_013164	ATTTT	2	10	109205	109214	20 %	80 %	0 %	0 %	256821221
102	NC_013164	ATTAT	2	10	109295	109304	40 %	60 %	0 %	0 %	256821221
103	NC_013164	AATAA	2	10	110304	110313	80 %	20 %	0 %	0 %	256821222
104	NC_013164	ATTTT	2	10	110399	110408	20 %	80 %	0 %	0 %	256821222
105	NC_013164	ATTTT	2	10	110543	110552	20 %	80 %	0 %	0 %	256821223
106	NC_013164	CAAAA	2	10	111853	111862	80 %	0 %	0 %	20 %	256821224
107	NC_013164	TTATA	2	10	113486	113495	40 %	60 %	0 %	0 %	256821226
108	NC_013164	TTTTA	2	10	113519	113528	20 %	80 %	0 %	0 %	256821226
109	NC_013164	TGTTA	2	10	114068	114077	20 %	60 %	20 %	0 %	256821226
110	NC_013164	ATAAA	2	10	114700	114709	80 %	20 %	0 %	0 %	256821226
111	NC_013164	GATAA	2	10	115228	115237	60 %	20 %	20 %	0 %	256821227

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.