MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaerococcus prevotii DSM 20548 plasmid pAPRE01

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013164	ATTT	2	8	4611	4618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013164	TTAA	2	8	8892	8899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013164	TATT	2	8	9172	9179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013164	AGTA	2	8	9551	9558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013164	ATAA	2	8	9982	9989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013164	CTAA	2	8	10037	10044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013164	ATTG	2	8	10424	10431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013164	TAAT	2	8	10474	10481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013164	CTTC	2	8	10541	10548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013164	ATTT	2	8	10799	10806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013164	CTAA	2	8	10888	10895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013164	AAAT	2	8	11086	11093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013164	TGCT	2	8	20822	20829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013164	ATTA	2	8	20866	20873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013164	GAGG	2	8	21051	21058	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013164	ATAA	2	8	21581	21588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013164	AGAA	2	8	43111	43118	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013164	ATTC	2	8	43369	43376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013164	TCTT	2	8	49526	49533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013164	TAAA	2	8	51194	51201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013164	CAAA	2	8	53441	53448	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013164	CAAA	2	8	54775	54782	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013164	AAAG	2	8	55189	55196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013164	CAAA	2	8	55292	55299	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013164	AAAG	2	8	56628	56635	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013164	TAAG	2	8	56643	56650	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013164	AGGG	2	8	56662	56669	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013164	TTAA	2	8	56798	56805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013164	AAAG	2	8	62090	62097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013164	AGCA	2	8	67048	67055	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013164	TTCT	2	8	67136	67143	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013164	ATGG	2	8	67264	67271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013164	TAAA	2	8	70558	70565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013164	TTAA	2	8	89189	89196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013164	CTGA	2	8	93650	93657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013164	ATTT	2	8	95102	95109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013164	AAGC	2	8	95487	95494	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013164	GGTT	2	8	95854	95861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013164	ACCA	2	8	95992	95999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013164	TTAT	2	8	96165	96172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013164	GAAA	2	8	96194	96201	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013164	AGAT	2	8	96243	96250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013164	ATTA	2	8	102324	102331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013164	AATT	2	8	105438	105445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013164	AATA	2	8	106050	106057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013164	AAGA	2	8	106655	106662	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013164	TAAT	2	8	107009	107016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013164	AAAG	2	8	112436	112443	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013164	TTAT	2	8	113279	113286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.