MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaerococcus prevotii DSM 20548 plasmid pAPRE01

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013164	TAG	2	6	2536	2541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013164	TGG	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013164	TAG	2	6	2644	2649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013164	AAT	2	6	2653	2658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013164	AGT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013164	TGT	2	6	4401	4406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013164	TGT	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013164	ATA	3	9	4550	4558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013164	ATT	2	6	4561	4566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013164	TAA	2	6	7218	7223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013164	ATT	2	6	8885	8890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013164	AAT	2	6	8925	8930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013164	TAT	2	6	8982	8987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013164	AGG	2	6	9048	9053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013164	GAT	2	6	9096	9101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013164	ACC	2	6	9188	9193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013164	AGG	2	6	9205	9210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013164	TAA	2	6	9231	9236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013164	ATG	3	9	9270	9278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013164	TAA	2	6	9353	9358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013164	TAA	2	6	9379	9384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013164	AGG	2	6	9411	9416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013164	ATT	2	6	9562	9567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013164	ATT	2	6	9749	9754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013164	ATG	2	6	9992	9997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013164	AGG	2	6	10045	10050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013164	AGT	2	6	10094	10099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013164	ATA	2	6	10103	10108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013164	GTA	2	6	10170	10175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013164	AAT	2	6	10306	10311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013164	ATT	2	6	10342	10347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013164	ATA	2	6	10378	10383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013164	AAT	2	6	10415	10420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013164	AAT	2	6	10487	10492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013164	ATA	2	6	10551	10556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013164	AGC	2	6	10704	10709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013164	TTC	2	6	10740	10745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013164	ATA	2	6	10807	10812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013164	GTA	2	6	10971	10976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013164	CGA	2	6	11012	11017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013164	TAA	2	6	11053	11058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013164	ATA	2	6	11063	11068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013164	ACT	2	6	11099	11104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013164	GTA	2	6	11127	11132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013164	TAG	2	6	11140	11145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013164	AAT	2	6	12450	12455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013164	TAG	2	6	12476	12481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013164	AGG	2	6	12541	12546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013164	AGG	2	6	12785	12790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013164	TAA	2	6	18974	18979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013164	AAG	2	6	18991	18996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013164	TAA	2	6	20892	20897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013164	ATT	2	6	21037	21042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013164	TAT	2	6	38956	38961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013164	TAG	2	6	43166	43171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013164	AGG	2	6	43408	43413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013164	ATA	2	6	43570	43575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013164	AGG	2	6	43602	43607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013164	ATA	2	6	45671	45676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013164	CTT	2	6	45736	45741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013164	AAG	2	6	45751	45756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013164	GAT	2	6	45779	45784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013164	AAC	2	6	45803	45808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013164	AGA	2	6	45812	45817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013164	ATT	2	6	45825	45830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013164	ATA	2	6	45917	45922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013164	TGC	2	6	46006	46011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013164	ACT	2	6	46120	46125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013164	ACT	2	6	46191	46196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013164	AAG	2	6	46206	46211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013164	TAT	2	6	46219	46224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013164	AGA	2	6	46275	46280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013164	AGA	2	6	46297	46302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013164	AAC	2	6	46309	46314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013164	GAA	2	6	46370	46375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013164	AAT	2	6	46386	46391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013164	GAA	2	6	46392	46397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013164	TAA	2	6	46439	46444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013164	GAA	2	6	46459	46464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013164	TAA	2	6	46574	46579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013164	ATA	2	6	46600	46605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013164	TCA	2	6	46612	46617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013164	TAG	2	6	46640	46645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013164	AGA	2	6	46734	46739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013164	ATG	2	6	46828	46833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013164	TAA	2	6	46911	46916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013164	AGA	2	6	47176	47181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013164	ACA	2	6	47249	47254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013164	TAA	2	6	47298	47303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013164	AGC	2	6	48263	48268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013164	TTA	2	6	48285	48290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013164	TAT	2	6	48316	48321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013164	TAA	2	6	48647	48652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013164	TCC	2	6	49455	49460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013164	ATG	2	6	49503	49508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013164	ATG	2	6	49587	49592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013164	AAT	2	6	50317	50322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013164	GAT	2	6	50340	50345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013164	AAG	2	6	50408	50413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013164	GAA	2	6	50503	50508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013164	AAT	2	6	50646	50651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013164	ACA	2	6	51269	51274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013164	AGT	2	6	51286	51291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013164	ACA	2	6	51368	51373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013164	AAC	2	6	53073	53078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013164	AGG	2	6	53092	53097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013164	CCA	3	9	53364	53372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_013164	GAA	2	6	53469	53474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013164	AAG	2	6	53482	53487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013164	AGA	2	6	53550	53555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013164	TAA	2	6	53613	53618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013164	GGT	2	6	53642	53647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013164	ATA	2	6	56226	56231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013164	AGA	2	6	56285	56290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013164	ATT	2	6	56460	56465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013164	TAA	2	6	56492	56497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013164	TAA	2	6	56519	56524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013164	ATT	2	6	56550	56555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013164	TAA	2	6	56565	56570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013164	GCC	2	6	56575	56580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013164	CTG	2	6	56590	56595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013164	AAT	2	6	56596	56601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013164	GAA	2	6	56686	56691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013164	ATT	2	6	56813	56818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013164	AGG	2	6	56835	56840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013164	GAA	2	6	58839	58844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013164	GTT	2	6	58887	58892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013164	GAG	2	6	58906	58911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013164	TAA	2	6	58927	58932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013164	GCT	2	6	58974	58979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013164	ATA	2	6	59072	59077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013164	GAG	2	6	59091	59096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013164	AAG	2	6	59720	59725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013164	AGA	2	6	59734	59739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013164	TAA	2	6	59797	59802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013164	GGT	2	6	59826	59831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013164	TAA	2	6	61961	61966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013164	TGA	2	6	62025	62030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013164	GTA	2	6	67297	67302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013164	ATT	2	6	67444	67449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013164	ATT	2	6	67498	67503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013164	AGG	2	6	68301	68306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.