MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880202

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013163	CATAA	2	10	466	475	60 %	20 %	0 %	20 %	257062241
2	NC_013163	CTAAT	2	10	1904	1913	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013163	AAATT	2	10	3499	3508	60 %	40 %	0 %	0 %	257062244
4	NC_013163	TTTTC	2	10	4579	4588	0 %	80 %	0 %	20 %	257062244
5	NC_013163	AAGAG	2	10	5553	5562	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013163	ACCAA	2	10	7779	7788	60 %	0 %	0 %	40 %	257062250
7	NC_013163	GTCCC	2	10	8775	8784	0 %	20 %	20 %	60 %	257062251
8	NC_013163	AAAGT	2	10	8936	8945	60 %	20 %	20 %	0 %	257062251
9	NC_013163	AACAC	2	10	10040	10049	60 %	0 %	0 %	40 %	257062254
10	NC_013163	ACACC	2	10	10521	10530	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_013163	TTTGA	2	10	11020	11029	20 %	60 %	20 %	0 %	257062257
12	NC_013163	TAAGC	2	10	12770	12779	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013163	CAAGG	2	10	13997	14006	40 %	0 %	40 %	20 %	257062258
14	NC_013163	CAAGA	2	10	14290	14299	60 %	0 %	20 %	20 %	257062259
15	NC_013163	TGATT	2	10	16889	16898	20 %	60 %	20 %	0 %	257062260
16	NC_013163	GAAGG	2	10	21233	21242	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013163	GTTTT	2	10	22894	22903	0 %	80 %	20 %	0 %	257062264
18	NC_013163	AAGAT	2	10	23059	23068	60 %	20 %	20 %	0 %	257062264
19	NC_013163	AGCCA	2	10	23460	23469	40 %	0 %	20 %	40 %	257062264

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.