MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880202

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013163	AAGA	2	8	136	143	75 %	0 %	25 %	0 %	257062241
2	NC_013163	TACT	2	8	347	354	25 %	50 %	0 %	25 %	257062241
3	NC_013163	TTAG	2	8	531	538	25 %	50 %	25 %	0 %	257062242
4	NC_013163	TTTG	2	8	711	718	0 %	75 %	25 %	0 %	257062242
5	NC_013163	TTAA	2	8	841	848	50 %	50 %	0 %	0 %	257062242
6	NC_013163	ATTG	2	8	960	967	25 %	50 %	25 %	0 %	257062242
7	NC_013163	TTCT	2	8	973	980	0 %	75 %	0 %	25 %	257062242
8	NC_013163	TGGA	2	8	2640	2647	25 %	25 %	50 %	0 %	257062243
9	NC_013163	GATT	2	8	2864	2871	25 %	50 %	25 %	0 %	257062243
10	NC_013163	CAAT	2	8	3390	3397	50 %	25 %	0 %	25 %	257062244
11	NC_013163	AATT	2	8	3467	3474	50 %	50 %	0 %	0 %	257062244
12	NC_013163	ACCC	2	8	3689	3696	25 %	0 %	0 %	75 %	257062244
13	NC_013163	ATGG	2	8	3746	3753	25 %	25 %	50 %	0 %	257062244
14	NC_013163	TTGA	2	8	3899	3906	25 %	50 %	25 %	0 %	257062244
15	NC_013163	GTTC	2	8	3948	3955	0 %	50 %	25 %	25 %	257062244
16	NC_013163	AAAG	2	8	4296	4303	75 %	0 %	25 %	0 %	257062244
17	NC_013163	CAAT	2	8	4314	4321	50 %	25 %	0 %	25 %	257062244
18	NC_013163	ATAG	2	8	4460	4467	50 %	25 %	25 %	0 %	257062244
19	NC_013163	ACGG	2	8	5718	5725	25 %	0 %	50 %	25 %	257062246
20	NC_013163	TTAA	2	8	5854	5861	50 %	50 %	0 %	0 %	257062247
21	NC_013163	TAAC	2	8	6476	6483	50 %	25 %	0 %	25 %	257062248
22	NC_013163	CTAA	2	8	7659	7666	50 %	25 %	0 %	25 %	257062250
23	NC_013163	CATC	2	8	7693	7700	25 %	25 %	0 %	50 %	257062250
24	NC_013163	AGCG	2	8	8087	8094	25 %	0 %	50 %	25 %	257062251
25	NC_013163	ACAT	2	8	8703	8710	50 %	25 %	0 %	25 %	257062251
26	NC_013163	AATC	2	8	9146	9153	50 %	25 %	0 %	25 %	257062252
27	NC_013163	TCAG	2	8	9537	9544	25 %	25 %	25 %	25 %	257062253
28	NC_013163	AGCC	2	8	10135	10142	25 %	0 %	25 %	50 %	257062254
29	NC_013163	TAGT	2	8	10373	10380	25 %	50 %	25 %	0 %	257062254
30	NC_013163	TCAC	2	8	10620	10627	25 %	25 %	0 %	50 %	257062256
31	NC_013163	CATT	2	8	10726	10733	25 %	50 %	0 %	25 %	257062256
32	NC_013163	TGGA	2	8	10812	10819	25 %	25 %	50 %	0 %	257062256
33	NC_013163	ATCC	2	8	11125	11132	25 %	25 %	0 %	50 %	257062257
34	NC_013163	GACC	2	8	11392	11399	25 %	0 %	25 %	50 %	257062257
35	NC_013163	TCAT	2	8	11660	11667	25 %	50 %	0 %	25 %	257062257
36	NC_013163	ACTA	2	8	13906	13913	50 %	25 %	0 %	25 %	257062258
37	NC_013163	GGCT	2	8	13980	13987	0 %	25 %	50 %	25 %	257062258
38	NC_013163	AAGA	2	8	14488	14495	75 %	0 %	25 %	0 %	257062259
39	NC_013163	GGGA	2	8	15395	15402	25 %	0 %	75 %	0 %	257062259
40	NC_013163	TAGT	2	8	16180	16187	25 %	50 %	25 %	0 %	257062260
41	NC_013163	ATCT	2	8	16614	16621	25 %	50 %	0 %	25 %	257062260
42	NC_013163	TAAA	2	8	16705	16712	75 %	25 %	0 %	0 %	257062260
43	NC_013163	GTGG	2	8	17100	17107	0 %	25 %	75 %	0 %	257062260
44	NC_013163	TTCT	2	8	17272	17279	0 %	75 %	0 %	25 %	257062260
45	NC_013163	TAAT	2	8	17467	17474	50 %	50 %	0 %	0 %	257062260
46	NC_013163	TTTA	2	8	18969	18976	25 %	75 %	0 %	0 %	257062260
47	NC_013163	AACA	2	8	20578	20585	75 %	0 %	0 %	25 %	257062262
48	NC_013163	CGAG	2	8	22019	22026	25 %	0 %	50 %	25 %	257062263
49	NC_013163	CTAT	2	8	22115	22122	25 %	50 %	0 %	25 %	257062263
50	NC_013163	AATA	2	8	22639	22646	75 %	25 %	0 %	0 %	257062264
51	NC_013163	AATG	2	8	22696	22703	50 %	25 %	25 %	0 %	257062264
52	NC_013163	AGAT	2	8	22706	22713	50 %	25 %	25 %	0 %	257062264
53	NC_013163	GATT	2	8	23150	23157	25 %	50 %	25 %	0 %	257062264
54	NC_013163	GACA	2	8	23294	23301	50 %	0 %	25 %	25 %	257062264
55	NC_013163	AACT	2	8	23574	23581	50 %	25 %	0 %	25 %	257062264
56	NC_013163	CTTG	2	8	23783	23790	0 %	50 %	25 %	25 %	257062264

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.