MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880202

Total Repeats: 308

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013163	TCC	2	6	9	14	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013163	TAA	2	6	38	43	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062241
3	NC_013163	CCA	2	6	164	169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062241
4	NC_013163	ATA	2	6	173	178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062241
5	NC_013163	AAT	2	6	232	237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062241
6	NC_013163	TCA	2	6	239	244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062241
7	NC_013163	ATT	2	6	269	274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062241
8	NC_013163	TGA	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062241
9	NC_013163	GAT	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062241
10	NC_013163	GTT	2	6	426	431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062241
11	NC_013163	ATT	2	6	517	522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013163	TGC	2	6	585	590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062242
13	NC_013163	GCA	2	6	682	687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062242
14	NC_013163	GAG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062242
15	NC_013163	AGG	2	6	726	731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062242
16	NC_013163	AGG	2	6	771	776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062242
17	NC_013163	TAC	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062242
18	NC_013163	TCT	2	6	1096	1101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062242
19	NC_013163	AGA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062242
20	NC_013163	GTT	2	6	1356	1361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062242
21	NC_013163	TCT	2	6	1429	1434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062242
22	NC_013163	CTT	2	6	1489	1494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062242
23	NC_013163	GAA	2	6	1496	1501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062242
24	NC_013163	AGA	2	6	1536	1541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062242
25	NC_013163	TAA	2	6	1625	1630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062242
26	NC_013163	CTT	2	6	1884	1889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013163	AAT	2	6	1942	1947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013163	TCC	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013163	CAA	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013163	TGG	2	6	2218	2223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013163	TCC	2	6	2290	2295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013163	CGT	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013163	CTT	2	6	2489	2494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013163	GAT	2	6	2563	2568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062243
35	NC_013163	TTA	2	6	2700	2705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062243
36	NC_013163	CTT	2	6	2711	2716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062243
37	NC_013163	TCT	2	6	2827	2832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062243
38	NC_013163	ATT	2	6	3272	3277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062244
39	NC_013163	TCC	2	6	3317	3322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062244
40	NC_013163	TGA	2	6	3354	3359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062244
41	NC_013163	CAG	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062244
42	NC_013163	GCA	2	6	3550	3555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062244
43	NC_013163	ACT	3	9	3591	3599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062244
44	NC_013163	GTA	2	6	3624	3629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062244
45	NC_013163	TAA	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062244
46	NC_013163	GAG	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062244
47	NC_013163	AAT	2	6	3718	3723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062244
48	NC_013163	TTG	2	6	3821	3826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062244
49	NC_013163	ATG	2	6	3887	3892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062244
50	NC_013163	CTT	2	6	3990	3995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062244
51	NC_013163	TCT	2	6	4028	4033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062244
52	NC_013163	TGC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062244
53	NC_013163	TGT	2	6	4152	4157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062244
54	NC_013163	TAA	2	6	4211	4216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062244
55	NC_013163	TTC	2	6	4217	4222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062244
56	NC_013163	CCT	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062244
57	NC_013163	TCT	2	6	4284	4289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062244
58	NC_013163	TCA	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062244
59	NC_013163	CGG	2	6	4550	4555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257062244
60	NC_013163	TTC	3	9	4586	4594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013163	TTA	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013163	ATC	2	6	4642	4647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013163	CTT	2	6	4651	4656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013163	TCC	2	6	4681	4686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013163	CGA	2	6	4810	4815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013163	GCT	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013163	AAC	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013163	AAC	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013163	TCT	2	6	5010	5015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013163	AAC	2	6	5070	5075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062245
71	NC_013163	AGC	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062245
72	NC_013163	GTT	2	6	5141	5146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062245
73	NC_013163	TAA	2	6	5170	5175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062245
74	NC_013163	GTT	2	6	5196	5201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062245
75	NC_013163	GTG	3	9	5224	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062245
76	NC_013163	TTG	2	6	5241	5246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013163	CAC	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062246
78	NC_013163	ACC	2	6	5600	5605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062246
79	NC_013163	CAT	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062246
80	NC_013163	GCT	2	6	5630	5635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062246
81	NC_013163	CGT	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062246
82	NC_013163	TGC	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062246
83	NC_013163	ACA	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062246
84	NC_013163	TGC	2	6	5801	5806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013163	ATT	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062247
86	NC_013163	ATT	2	6	5929	5934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062247
87	NC_013163	CAA	2	6	5964	5969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062247
88	NC_013163	AAC	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062247
89	NC_013163	TAA	2	6	6253	6258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062247
90	NC_013163	TCA	3	9	6322	6330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062248
91	NC_013163	CTT	2	6	6389	6394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062248
92	NC_013163	CTA	2	6	6401	6406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062248
93	NC_013163	CTT	2	6	6410	6415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062248
94	NC_013163	TAA	2	6	6441	6446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062248
95	NC_013163	ATA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062248
96	NC_013163	CGT	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062249
97	NC_013163	TCC	2	6	6570	6575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062249
98	NC_013163	CGT	2	6	6596	6601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062249
99	NC_013163	CAA	2	6	6659	6664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062249
100	NC_013163	GCT	2	6	6772	6777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062249
101	NC_013163	TCC	2	6	6846	6851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062249
102	NC_013163	CCA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062249
103	NC_013163	CCG	2	6	7193	7198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062249
104	NC_013163	TTA	2	6	7215	7220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062249
105	NC_013163	GTC	2	6	7221	7226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062249
106	NC_013163	AAG	2	6	7333	7338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062249
107	NC_013163	CCG	3	9	7402	7410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062249
108	NC_013163	ATT	2	6	7448	7453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062249
109	NC_013163	GTA	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013163	CAA	2	6	7894	7899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062250
111	NC_013163	TAA	2	6	8117	8122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062251
112	NC_013163	TCC	2	6	8292	8297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062251
113	NC_013163	TCA	2	6	8350	8355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062251
114	NC_013163	TGT	2	6	8477	8482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062251
115	NC_013163	ATT	2	6	8513	8518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062251
116	NC_013163	CTT	2	6	8535	8540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062251
117	NC_013163	TCA	2	6	8601	8606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062251
118	NC_013163	CCG	2	6	8669	8674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062251
119	NC_013163	TCC	2	6	8724	8729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062251
120	NC_013163	CAC	2	6	8840	8845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062251
121	NC_013163	CTT	2	6	8953	8958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062251
122	NC_013163	GCT	2	6	9074	9079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062252
123	NC_013163	CAG	2	6	9095	9100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062252
124	NC_013163	CAC	2	6	9120	9125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062252
125	NC_013163	CAC	2	6	9180	9185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062252
126	NC_013163	GCA	2	6	9247	9252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062252
127	NC_013163	CCA	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062252
128	NC_013163	GCT	2	6	9368	9373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062252
129	NC_013163	ACG	2	6	9455	9460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062253
130	NC_013163	CTG	2	6	9472	9477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062253
131	NC_013163	ATT	2	6	9642	9647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062253
132	NC_013163	TCT	3	9	9654	9662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013163	TGA	2	6	9754	9759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013163	ACA	3	9	9778	9786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013163	GAC	3	9	9884	9892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062254
136	NC_013163	GAC	2	6	9932	9937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062254
137	NC_013163	TGG	2	6	9958	9963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062254
138	NC_013163	ATC	2	6	10109	10114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062254
139	NC_013163	GCA	2	6	10192	10197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062254
140	NC_013163	AAC	2	6	10199	10204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062254
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143	NC_013163	ACA	2	6	10543	10548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013163	TCC	2	6	10590	10595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062256
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149	NC_013163	AAG	2	6	11048	11053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062257
150	NC_013163	CAA	2	6	11212	11217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062257
151	NC_013163	TTC	2	6	11420	11425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062257
152	NC_013163	CAT	2	6	11481	11486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062257
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154	NC_013163	TGG	2	6	11738	11743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062257
155	NC_013163	TTC	2	6	11980	11985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062257
156	NC_013163	GCT	2	6	12053	12058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062257
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159	NC_013163	CTC	2	6	12394	12399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062257
160	NC_013163	TAA	2	6	12555	12560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013163	TGG	2	6	12744	12749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013163	TCT	2	6	12890	12895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_013163	GAC	2	6	12913	12918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_013163	TAA	2	6	13109	13114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013163	CCG	2	6	13155	13160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_013163	TGA	2	6	13267	13272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013163	CAA	2	6	13420	13425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062258
168	NC_013163	ATT	2	6	13426	13431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062258
169	NC_013163	AAC	2	6	13514	13519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062258
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171	NC_013163	TCG	2	6	13845	13850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062258
172	NC_013163	TGA	2	6	13884	13889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062258
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197	NC_013163	TGA	2	6	15715	15720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
198	NC_013163	TTG	2	6	15759	15764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062260
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249	NC_013163	GAT	2	6	19279	19284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_013163	CAG	2	6	19312	19317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_013163	CCA	2	6	19343	19348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
252	NC_013163	ATT	2	6	19375	19380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_013163	CTT	2	6	19484	19489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_013163	GTC	2	6	19644	19649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062261
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256	NC_013163	ATA	2	6	19859	19864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_013163	GCA	2	6	19908	19913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_013163	AGT	2	6	19977	19982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_013163	AAT	2	6	19984	19989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_013163	AGC	2	6	20222	20227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062262
261	NC_013163	GAA	2	6	20241	20246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062262
262	NC_013163	ATG	2	6	20368	20373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062262
263	NC_013163	ACC	2	6	20462	20467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062262
264	NC_013163	TGT	2	6	20545	20550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062262
265	NC_013163	ACT	2	6	20628	20633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062262
266	NC_013163	TAA	2	6	20800	20805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062262
267	NC_013163	TCC	2	6	20814	20819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062262
268	NC_013163	ATT	2	6	20859	20864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062262
269	NC_013163	AAT	2	6	20906	20911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062262
270	NC_013163	CAG	2	6	20932	20937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062262
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272	NC_013163	ATT	2	6	21035	21040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062262
273	NC_013163	TTC	2	6	21073	21078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062262
274	NC_013163	AAT	2	6	21221	21226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_013163	CAG	2	6	21260	21265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_013163	AAT	2	6	21338	21343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062263
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280	NC_013163	AAT	2	6	21786	21791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062263
281	NC_013163	ACA	2	6	21938	21943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062263
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285	NC_013163	ATC	2	6	22214	22219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_013163	AGA	2	6	22239	22244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_013163	CTT	2	6	22295	22300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062264
288	NC_013163	AAT	2	6	22344	22349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062264
289	NC_013163	ATA	2	6	22418	22423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062264
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292	NC_013163	TTA	2	6	22498	22503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062264
293	NC_013163	AAT	2	6	22587	22592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062264
294	NC_013163	TAT	2	6	22659	22664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062264
295	NC_013163	TTA	2	6	22829	22834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062264
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.