MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Capnocytophaga ochracea DSM 7271 chromosome

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013162	TCTTTA	2	12	6243	6254	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013162	TCAACT	2	12	36385	36396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013162	CCCCCA	2	12	36746	36757	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
4	NC_013162	CTTTAC	2	12	60040	60051	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013162	TCATAA	2	12	62708	62719	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013162	GATATA	2	12	93678	93689	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013162	TTTTAT	2	12	125298	125309	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013162	TACCCC	2	12	214321	214332	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013162	AAAAAG	2	12	219911	219922	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013162	CCTCTT	2	12	252266	252277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013162	AATATT	2	12	271375	271386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013162	GTTTAG	2	12	276466	276477	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013162	AAGGTA	2	12	302275	302286	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013162	AAAATT	2	12	311264	311275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013162	GTTAAT	2	12	352151	352162	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013162	AGTTAT	2	12	368678	368689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013162	CCTCTT	2	12	380132	380143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013162	GAGGAA	2	12	412181	412192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013162	TTTTAA	2	12	441670	441681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013162	CCTCTT	2	12	482888	482899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013162	GGAGAA	2	12	490867	490878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013162	CCTTTG	2	12	503503	503514	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013162	TCAATC	2	12	515448	515459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013162	CACTTC	2	12	542791	542802	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013162	GTTTTT	2	12	581103	581114	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013162	TTCTTT	2	12	591245	591256	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013162	CCTCTT	2	12	613424	613435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013162	GTAAGA	2	12	622363	622374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013162	TAAAAA	2	12	624104	624115	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013162	TAATTT	2	12	647660	647671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013162	CAATTT	2	12	677588	677599	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013162	CCTCTT	2	12	697491	697502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013162	CGGCTT	2	12	757518	757529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013162	AATTTG	2	12	784426	784437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013162	TCTTTT	2	12	827621	827632	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013162	CGTAGT	2	12	833960	833971	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013162	TAAAAA	2	12	875653	875664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013162	AAAACA	2	12	882506	882517	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013162	CCTCTT	2	12	891734	891745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013162	TTATAT	2	12	929198	929209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013162	TCTCAT	2	12	932473	932484	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013162	AATGTT	2	12	952386	952397	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013162	TTTTAA	2	12	985925	985936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013162	TCTGTT	2	12	987423	987434	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013162	ATGCCT	2	12	994418	994429	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013162	CCTCTT	2	12	1002987	1002998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013162	TTTTAA	2	12	1017369	1017380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013162	AAGTAC	2	12	1027177	1027188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013162	TAAAAG	2	12	1030607	1030618	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013162	TTTTCT	2	12	1064419	1064430	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013162	TAATCT	2	12	1102583	1102594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013162	CCTCTT	2	12	1134448	1134459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013162	ATAAAA	2	12	1161946	1161957	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013162	CCTCTT	2	12	1162643	1162654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013162	ATAAAT	2	12	1173549	1173560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013162	TTCTTT	2	12	1185303	1185314	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013162	CCTCTT	2	12	1194055	1194066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013162	GGGGGA	2	12	1199409	1199420	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013162	AATACA	2	12	1245049	1245060	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013162	ATTGAA	2	12	1275767	1275778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013162	GGGGAG	2	12	1281581	1281592	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013162	AATATA	2	12	1334747	1334758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013162	TATGCG	2	12	1336511	1336522	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013162	ATTTTT	2	12	1419132	1419143	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013162	TATTCA	2	12	1438315	1438326	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013162	AAAATG	2	12	1487541	1487552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013162	GATACA	2	12	1512980	1512991	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013162	AAAAGA	2	12	1516777	1516788	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013162	TTGAAC	2	12	1524897	1524908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013162	TTTTTA	2	12	1527310	1527321	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013162	AAAGAT	2	12	1536823	1536834	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013162	AGAAAA	2	12	1538181	1538192	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013162	TTTTTC	2	12	1553736	1553747	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013162	TTTTAT	2	12	1566267	1566278	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013162	TAAAAA	2	12	1568806	1568817	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013162	AAGATA	2	12	1683763	1683774	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013162	AAATAT	2	12	1689141	1689152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013162	CCTCTT	2	12	1712833	1712844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013162	ATAAAG	2	12	1720463	1720474	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013162	TCTTTT	2	12	1753074	1753085	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013162	TATAAA	2	12	1777361	1777372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013162	TAATGC	2	12	1777377	1777388	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013162	TTTTAT	2	12	1793164	1793175	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013162	AATTAT	2	12	1797336	1797347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013162	TTCTTT	2	12	1797773	1797784	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013162	TATATT	2	12	1822655	1822666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013162	TTCTTT	2	12	1858207	1858218	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013162	CTTCAC	2	12	1956162	1956173	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013162	AATTTA	2	12	1960903	1960914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013162	AATTAT	2	12	1996748	1996759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013162	AAATAA	2	12	2061137	2061148	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013162	ATTAAA	2	12	2087601	2087612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013162	ATTGTG	2	12	2119278	2119289	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013162	TTGCTA	2	12	2122724	2122735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013162	ATTTTT	2	12	2246127	2246138	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013162	TAAAAA	2	12	2256856	2256867	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013162	AAAAGA	2	12	2263416	2263427	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013162	TTTCGT	2	12	2313258	2313269	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_013162	ATACTT	2	12	2313274	2313285	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013162	TGTTTT	2	12	2317778	2317789	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013162	TTTTAA	2	12	2320497	2320508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013162	AAAAGA	2	12	2329269	2329280	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013162	TTTCAT	2	12	2341984	2341995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013162	TATTTT	2	12	2342354	2342365	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013162	TTAAAA	2	12	2370158	2370169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013162	AAATTT	2	12	2447661	2447672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013162	CCTCTC	2	12	2474704	2474715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_013162	GGAAGG	2	12	2474736	2474747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013162	TTTTCT	2	12	2491756	2491767	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_013162	ATTTTT	2	12	2496988	2496999	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013162	AAAATC	2	12	2511465	2511476	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013162	TTTTTA	2	12	2523254	2523265	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013162	ATAAAA	2	12	2550407	2550418	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013162	TAATTT	2	12	2580063	2580074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013162	CAAATA	2	12	2594389	2594400	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.