MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Capnocytophaga ochracea DSM 7271 chromosome

Total Repeats: 1803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013162	AAGTG	2	10	1591	1600	40 %	20 %	40 %	0 %	256818849
2	NC_013162	CTACT	2	10	1959	1968	20 %	40 %	0 %	40 %	256818850
3	NC_013162	TAAAA	2	10	4653	4662	80 %	20 %	0 %	0 %	256818851
4	NC_013162	TTACT	2	10	5411	5420	20 %	60 %	0 %	20 %	256818852
5	NC_013162	TGCGA	2	10	7608	7617	20 %	20 %	40 %	20 %	256818855
6	NC_013162	ATAGA	2	10	8510	8519	60 %	20 %	20 %	0 %	256818855
7	NC_013162	GTTTT	2	10	10991	11000	0 %	80 %	20 %	0 %	256818858
8	NC_013162	AAAGC	2	10	14561	14570	60 %	0 %	20 %	20 %	256818861
9	NC_013162	TTTGA	2	10	17904	17913	20 %	60 %	20 %	0 %	256818864
10	NC_013162	ACGCC	2	10	19223	19232	20 %	0 %	20 %	60 %	256818865
11	NC_013162	TTAAT	2	10	19464	19473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013162	CGATA	2	10	20993	21002	40 %	20 %	20 %	20 %	256818867
13	NC_013162	ATAAA	2	10	22780	22789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013162	ATATA	2	10	22802	22811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013162	AAAAC	2	10	23074	23083	80 %	0 %	0 %	20 %	256818868
16	NC_013162	AGATT	2	10	25915	25924	40 %	40 %	20 %	0 %	256818869
17	NC_013162	GAAGG	2	10	25974	25983	40 %	0 %	60 %	0 %	256818869
18	NC_013162	AAAGC	2	10	27486	27495	60 %	0 %	20 %	20 %	256818872
19	NC_013162	GTACG	2	10	29479	29488	20 %	20 %	40 %	20 %	256818873
20	NC_013162	CAAAT	2	10	30113	30122	60 %	20 %	0 %	20 %	256818873
21	NC_013162	ATTTA	2	10	30205	30214	40 %	60 %	0 %	0 %	256818874
22	NC_013162	TCTTT	2	10	31392	31401	0 %	80 %	0 %	20 %	256818874
23	NC_013162	AAATA	2	10	33004	33013	80 %	20 %	0 %	0 %	256818876
24	NC_013162	CATCG	2	10	33873	33882	20 %	20 %	20 %	40 %	256818877
25	NC_013162	GTATT	2	10	34983	34992	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013162	ATATA	2	10	38842	38851	60 %	40 %	0 %	0 %	256818881
27	NC_013162	GTTGG	2	10	40326	40335	0 %	40 %	60 %	0 %	256818881
28	NC_013162	ACCAC	2	10	40344	40353	40 %	0 %	0 %	60 %	256818881
29	NC_013162	ACATT	2	10	41671	41680	40 %	40 %	0 %	20 %	256818881
30	NC_013162	AGTTT	2	10	41706	41715	20 %	60 %	20 %	0 %	256818881
31	NC_013162	ATTTC	2	10	44389	44398	20 %	60 %	0 %	20 %	256818881
32	NC_013162	CTTTT	2	10	49491	49500	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013162	AAATA	2	10	49506	49515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013162	TTAAA	2	10	49576	49585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013162	ATATC	2	10	50041	50050	40 %	40 %	0 %	20 %	256818882
36	NC_013162	GCCTT	2	10	51422	51431	0 %	40 %	20 %	40 %	256818883
37	NC_013162	TAAGC	2	10	52228	52237	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013162	TTCAC	2	10	53136	53145	20 %	40 %	0 %	40 %	256818884
39	NC_013162	CTGAA	2	10	53939	53948	40 %	20 %	20 %	20 %	256818885
40	NC_013162	TTTTC	2	10	54404	54413	0 %	80 %	0 %	20 %	256818885
41	NC_013162	GTTAC	2	10	54900	54909	20 %	40 %	20 %	20 %	256818886
42	NC_013162	AGCTG	2	10	54960	54969	20 %	20 %	40 %	20 %	256818886
43	NC_013162	TGTTT	2	10	55672	55681	0 %	80 %	20 %	0 %	256818887
44	NC_013162	CTTTT	2	10	57011	57020	0 %	80 %	0 %	20 %	256818888
45	NC_013162	ATTTA	2	10	57026	57035	40 %	60 %	0 %	0 %	256818888
46	NC_013162	TCTTT	2	10	57175	57184	0 %	80 %	0 %	20 %	256818889
47	NC_013162	TATCT	2	10	57654	57663	20 %	60 %	0 %	20 %	256818890
48	NC_013162	TCTAT	2	10	60590	60599	20 %	60 %	0 %	20 %	256818892
49	NC_013162	TACTC	2	10	61066	61075	20 %	40 %	0 %	40 %	256818893
50	NC_013162	AAATC	2	10	63487	63496	60 %	20 %	0 %	20 %	256818896
51	NC_013162	TGCTC	2	10	65228	65237	0 %	40 %	20 %	40 %	256818900
52	NC_013162	ATATG	2	10	68886	68895	40 %	40 %	20 %	0 %	256818900
53	NC_013162	AAAGT	2	10	69167	69176	60 %	20 %	20 %	0 %	256818900
54	NC_013162	AAACA	2	10	78875	78884	80 %	0 %	0 %	20 %	256818906
55	NC_013162	ACAAT	2	10	79183	79192	60 %	20 %	0 %	20 %	256818907
56	NC_013162	AACCC	2	10	82065	82074	40 %	0 %	0 %	60 %	256818909
57	NC_013162	GCACC	2	10	82212	82221	20 %	0 %	20 %	60 %	256818909
58	NC_013162	TCTTT	2	10	82762	82771	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013162	TCTTT	2	10	82850	82859	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013162	AGCAA	2	10	86471	86480	60 %	0 %	20 %	20 %	256818911
61	NC_013162	TAAAC	2	10	86847	86856	60 %	20 %	0 %	20 %	256818912
62	NC_013162	TTAAA	2	10	87822	87831	60 %	40 %	0 %	0 %	256818913
63	NC_013162	GTAAG	2	10	88242	88251	40 %	20 %	40 %	0 %	256818913
64	NC_013162	TTTTG	2	10	92068	92077	0 %	80 %	20 %	0 %	256818916
65	NC_013162	TATCT	2	10	92178	92187	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013162	CAAAA	2	10	93859	93868	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013162	ACAAA	2	10	94272	94281	80 %	0 %	0 %	20 %	256818918
68	NC_013162	AAATC	2	10	100151	100160	60 %	20 %	0 %	20 %	256818923
69	NC_013162	AAATC	2	10	101622	101631	60 %	20 %	0 %	20 %	256818925
70	NC_013162	CTTTT	2	10	102021	102030	0 %	80 %	0 %	20 %	256818925
71	NC_013162	AAATT	2	10	102706	102715	60 %	40 %	0 %	0 %	256818927
72	NC_013162	TTTTA	2	10	104141	104150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013162	CTCTT	2	10	104435	104444	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_013162	GTAAA	2	10	106051	106060	60 %	20 %	20 %	0 %	256818931
75	NC_013162	GAAAA	2	10	107565	107574	80 %	0 %	20 %	0 %	256818933
76	NC_013162	ACCTT	2	10	108706	108715	20 %	40 %	0 %	40 %	256818934
77	NC_013162	CTCAA	2	10	109234	109243	40 %	20 %	0 %	40 %	256818934
78	NC_013162	AAGCC	2	10	110491	110500	40 %	0 %	20 %	40 %	256818935
79	NC_013162	AACCT	2	10	110982	110991	40 %	20 %	0 %	40 %	256818936
80	NC_013162	TCAAA	2	10	111378	111387	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013162	CCTTC	2	10	111450	111459	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_013162	TCTTT	2	10	111527	111536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013162	GCTAC	2	10	114642	114651	20 %	20 %	20 %	40 %	256818940
84	NC_013162	CATTC	2	10	115175	115184	20 %	40 %	0 %	40 %	256818940
85	NC_013162	CGTGC	2	10	120308	120317	0 %	20 %	40 %	40 %	256818946
86	NC_013162	TAAAT	2	10	120918	120927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013162	TGGAC	2	10	122727	122736	20 %	20 %	40 %	20 %	256818948
88	NC_013162	AGTTT	2	10	124756	124765	20 %	60 %	20 %	0 %	256818951
89	NC_013162	ATAAA	2	10	125255	125264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013162	TACTA	2	10	127156	127165	40 %	40 %	0 %	20 %	256818954
91	NC_013162	TAGTG	2	10	130725	130734	20 %	40 %	40 %	0 %	256818956
92	NC_013162	AAAGA	2	10	131140	131149	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013162	TAATC	2	10	134676	134685	40 %	40 %	0 %	20 %	256818960
94	NC_013162	AATCC	2	10	134765	134774	40 %	20 %	0 %	40 %	256818960
95	NC_013162	TAAGG	2	10	135098	135107	40 %	20 %	40 %	0 %	256818960
96	NC_013162	GGTAG	2	10	135314	135323	20 %	20 %	60 %	0 %	256818960
97	NC_013162	GAAGG	2	10	137885	137894	40 %	0 %	60 %	0 %	256818963
98	NC_013162	ATATC	2	10	138046	138055	40 %	40 %	0 %	20 %	256818963
99	NC_013162	ATACT	2	10	139125	139134	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013162	TAATT	2	10	140577	140586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013162	AAATT	2	10	141133	141142	60 %	40 %	0 %	0 %	256818968
102	NC_013162	AATTA	2	10	141164	141173	60 %	40 %	0 %	0 %	256818969
103	NC_013162	AATGC	2	10	141738	141747	40 %	20 %	20 %	20 %	256818969
104	NC_013162	TTAGG	2	10	144541	144550	20 %	40 %	40 %	0 %	256818972
105	NC_013162	ACCCT	2	10	145691	145700	20 %	20 %	0 %	60 %	256818974
106	NC_013162	AAACA	2	10	149601	149610	80 %	0 %	0 %	20 %	256818976
107	NC_013162	CCCTA	2	10	153718	153727	20 %	20 %	0 %	60 %	256818978
108	NC_013162	CGCCT	2	10	155346	155355	0 %	20 %	20 %	60 %	256818980
109	NC_013162	TTACC	2	10	156226	156235	20 %	40 %	0 %	40 %	256818981
110	NC_013162	TCATC	2	10	157129	157138	20 %	40 %	0 %	40 %	256818981
111	NC_013162	TATCA	2	10	157814	157823	40 %	40 %	0 %	20 %	256818981
112	NC_013162	AGAGA	2	10	165328	165337	60 %	0 %	40 %	0 %	256818988
113	NC_013162	AGATA	2	10	167306	167315	60 %	20 %	20 %	0 %	256818990
114	NC_013162	CACAA	2	10	169505	169514	60 %	0 %	0 %	40 %	256818992
115	NC_013162	GATAG	2	10	170176	170185	40 %	20 %	40 %	0 %	256818992
116	NC_013162	CGAAA	2	10	170512	170521	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013162	GGAAT	2	10	175260	175269	40 %	20 %	40 %	0 %	256818994
118	NC_013162	AGGGG	2	10	175801	175810	20 %	0 %	80 %	0 %	256818994
119	NC_013162	ATGGT	2	10	178291	178300	20 %	40 %	40 %	0 %	256818996
120	NC_013162	ACCTT	2	10	178676	178685	20 %	40 %	0 %	40 %	256818996
121	NC_013162	TTGGT	2	10	180399	180408	0 %	60 %	40 %	0 %	256818998
122	NC_013162	ATTTG	2	10	180474	180483	20 %	60 %	20 %	0 %	256818998
123	NC_013162	AGAAA	2	10	180875	180884	80 %	0 %	20 %	0 %	256818999
124	NC_013162	ATACT	2	10	181590	181599	40 %	40 %	0 %	20 %	256819002
125	NC_013162	AAAAC	2	10	182220	182229	80 %	0 %	0 %	20 %	256819002
126	NC_013162	TTATC	2	10	182251	182260	20 %	60 %	0 %	20 %	256819002
127	NC_013162	CAAAA	2	10	184550	184559	80 %	0 %	0 %	20 %	256819003
128	NC_013162	TACCT	2	10	185573	185582	20 %	40 %	0 %	40 %	256819004
129	NC_013162	AAACC	2	10	185603	185612	60 %	0 %	0 %	40 %	256819004
130	NC_013162	TATCT	2	10	188892	188901	20 %	60 %	0 %	20 %	256819006
131	NC_013162	ATTTT	2	10	190492	190501	20 %	80 %	0 %	0 %	256819007
132	NC_013162	GATAA	2	10	190827	190836	60 %	20 %	20 %	0 %	256819007
133	NC_013162	AACAA	2	10	194236	194245	80 %	0 %	0 %	20 %	256819007
134	NC_013162	TCAAA	2	10	201593	201602	60 %	20 %	0 %	20 %	256819012
135	NC_013162	TTTCC	2	10	202115	202124	0 %	60 %	0 %	40 %	256819012
136	NC_013162	TCAAA	2	10	202436	202445	60 %	20 %	0 %	20 %	256819012
137	NC_013162	TTTAT	2	10	202663	202672	20 %	80 %	0 %	0 %	256819012
138	NC_013162	ACAAT	2	10	208692	208701	60 %	20 %	0 %	20 %	256819017
139	NC_013162	TTATT	2	10	208998	209007	20 %	80 %	0 %	0 %	256819017
140	NC_013162	AGATA	2	10	210286	210295	60 %	20 %	20 %	0 %	256819018
141	NC_013162	GCTCA	2	10	214910	214919	20 %	20 %	20 %	40 %	256819025
142	NC_013162	AATAA	2	10	215543	215552	80 %	20 %	0 %	0 %	256819025
143	NC_013162	GCAAT	2	10	216571	216580	40 %	20 %	20 %	20 %	256819026
144	NC_013162	TTTTG	2	10	216693	216702	0 %	80 %	20 %	0 %	256819027
145	NC_013162	GCATC	2	10	218678	218687	20 %	20 %	20 %	40 %	256819029
146	NC_013162	AGAAT	2	10	218694	218703	60 %	20 %	20 %	0 %	256819029
147	NC_013162	CATTG	2	10	218814	218823	20 %	40 %	20 %	20 %	256819029
148	NC_013162	TTATT	2	10	221810	221819	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013162	ATTAA	2	10	221880	221889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013162	TACCA	2	10	222893	222902	40 %	20 %	0 %	40 %	256819031
151	NC_013162	GCCAC	2	10	223534	223543	20 %	0 %	20 %	60 %	256819031
152	NC_013162	CCAAA	2	10	223735	223744	60 %	0 %	0 %	40 %	256819031
153	NC_013162	CCTTA	2	10	225417	225426	20 %	40 %	0 %	40 %	256819034
154	NC_013162	TTTCT	2	10	230730	230739	0 %	80 %	0 %	20 %	256819037
155	NC_013162	TAGAA	2	10	238038	238047	60 %	20 %	20 %	0 %	256819040
156	NC_013162	TTAAA	2	10	238071	238080	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013162	CAAAT	2	10	238796	238805	60 %	20 %	0 %	20 %	256819041
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159	NC_013162	TGATA	2	10	242519	242528	40 %	40 %	20 %	0 %	256819042
160	NC_013162	CAAAT	2	10	243900	243909	60 %	20 %	0 %	20 %	256819043
161	NC_013162	CTTTC	2	10	244933	244942	0 %	60 %	0 %	40 %	256819043
162	NC_013162	ACCAT	2	10	245332	245341	40 %	20 %	0 %	40 %	256819043
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165	NC_013162	TATGG	2	10	247702	247711	20 %	40 %	40 %	0 %	256819044
166	NC_013162	ACAAA	2	10	248410	248419	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_013162	ACCAA	2	10	248652	248661	60 %	0 %	0 %	40 %	256819045
168	NC_013162	TCCCC	2	10	251056	251065	0 %	20 %	0 %	80 %	256819046
169	NC_013162	ATTAT	2	10	252323	252332	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013162	TATTT	2	10	252752	252761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013162	ATAGC	2	10	254441	254450	40 %	20 %	20 %	20 %	256819048
172	NC_013162	CTATA	2	10	255195	255204	40 %	40 %	0 %	20 %	256819048
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176	NC_013162	TGGTA	2	10	257860	257869	20 %	40 %	40 %	0 %	256819048
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193	NC_013162	TACCT	2	10	286392	286401	20 %	40 %	0 %	40 %	256819065
194	NC_013162	CAGTA	2	10	286809	286818	40 %	20 %	20 %	20 %	256819065
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199	NC_013162	CATCG	2	10	290012	290021	20 %	20 %	20 %	40 %	256819067
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202	NC_013162	AAAGT	2	10	293721	293730	60 %	20 %	20 %	0 %	256819069
203	NC_013162	TTAAT	2	10	295181	295190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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223	NC_013162	CTTTT	2	10	338241	338250	0 %	80 %	0 %	20 %	256819104
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236	NC_013162	TTTCT	2	10	353317	353326	0 %	80 %	0 %	20 %	256819117
237	NC_013162	CTGAG	2	10	353503	353512	20 %	20 %	40 %	20 %	256819117
238	NC_013162	TATGT	2	10	353562	353571	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
239	NC_013162	CGAAT	2	10	355758	355767	40 %	20 %	20 %	20 %	256819120
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244	NC_013162	AGAGC	2	10	366008	366017	40 %	0 %	40 %	20 %	256819131
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249	NC_013162	GAAAC	2	10	372232	372241	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
250	NC_013162	AATTT	2	10	373849	373858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_013162	GCAAT	2	10	378452	378461	40 %	20 %	20 %	20 %	256819143
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253	NC_013162	TAAAC	2	10	379771	379780	60 %	20 %	0 %	20 %	256819143
254	NC_013162	TAAAA	2	10	381217	381226	80 %	20 %	0 %	0 %	256819144
255	NC_013162	ATCGT	2	10	382304	382313	20 %	40 %	20 %	20 %	256819145
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257	NC_013162	ACAAA	2	10	384310	384319	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
258	NC_013162	GTACA	2	10	385004	385013	40 %	20 %	20 %	20 %	256819150
259	NC_013162	TATAA	2	10	385858	385867	60 %	40 %	0 %	0 %	256819151
260	NC_013162	CTCAA	2	10	386672	386681	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
261	NC_013162	TTGTT	2	10	387203	387212	0 %	80 %	20 %	0 %	256819152
262	NC_013162	CCTTT	2	10	389133	389142	0 %	60 %	0 %	40 %	256819152
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264	NC_013162	AATGG	2	10	392481	392490	40 %	20 %	40 %	0 %	256819154
265	NC_013162	ATCAA	2	10	394030	394039	60 %	20 %	0 %	20 %	256819155
266	NC_013162	GAAAA	2	10	394454	394463	80 %	0 %	20 %	0 %	256819157
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404	NC_013162	TTTTC	2	10	608006	608015	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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