MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Capnocytophaga ochracea DSM 7271 chromosome

Total Repeats: 360

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013162	TTAAT	2	10	19464	19473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013162	ATAAA	2	10	22780	22789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013162	ATATA	2	10	22802	22811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013162	GTATT	2	10	34983	34992	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013162	CTTTT	2	10	49491	49500	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013162	AAATA	2	10	49506	49515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013162	TTAAA	2	10	49576	49585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013162	TAAGC	2	10	52228	52237	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013162	TCTTT	2	10	82762	82771	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013162	TCTTT	2	10	82850	82859	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013162	TATCT	2	10	92178	92187	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013162	CAAAA	2	10	93859	93868	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013162	TTTTA	2	10	104141	104150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013162	CTCTT	2	10	104435	104444	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013162	TCAAA	2	10	111378	111387	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013162	CCTTC	2	10	111450	111459	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_013162	TCTTT	2	10	111527	111536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013162	TAAAT	2	10	120918	120927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013162	ATAAA	2	10	125255	125264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013162	AAAGA	2	10	131140	131149	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013162	ATACT	2	10	139125	139134	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013162	TAATT	2	10	140577	140586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013162	CGAAA	2	10	170512	170521	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013162	TTATT	2	10	221810	221819	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013162	ATTAA	2	10	221880	221889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013162	TTAAA	2	10	238071	238080	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013162	ACAAA	2	10	248410	248419	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013162	ATTAT	2	10	252323	252332	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013162	TATTT	2	10	252752	252761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013162	TCAAT	2	10	280208	280217	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013162	TCCTC	2	10	289740	289749	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_013162	AAGAT	2	10	293531	293540	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013162	TTAAT	2	10	295181	295190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013162	GTTTT	2	10	321410	321419	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013162	AAAAG	2	10	334583	334592	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013162	TATGT	2	10	353562	353571	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013162	AAGCA	2	10	363389	363398	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013162	GAAAC	2	10	372232	372241	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013162	AATTT	2	10	373849	373858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013162	ACAAA	2	10	384310	384319	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013162	CTCAA	2	10	386672	386681	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013162	TATTT	2	10	408790	408799	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013162	TTGCA	2	10	409600	409609	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013162	TTTTA	2	10	410961	410970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013162	TAAAT	2	10	415927	415936	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013162	ATAAA	2	10	418275	418284	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013162	ATCTT	2	10	419010	419019	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013162	GATTT	2	10	442779	442788	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013162	TTTTA	2	10	442878	442887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013162	CTGTT	2	10	476961	476970	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013162	CTCTT	2	10	477049	477058	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013162	AAATC	2	10	482729	482738	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013162	TGTAT	2	10	491048	491057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013162	TTAAA	2	10	500074	500083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013162	TTCTT	2	10	503473	503482	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013162	TATAA	2	10	503828	503837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013162	TTAAA	2	10	514587	514596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013162	TAATT	2	10	530232	530241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013162	TAAAG	2	10	535166	535175	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013162	CTTAG	2	10	543506	543515	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013162	AATGG	2	10	545614	545623	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013162	TAAAA	2	10	560955	560964	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013162	CAATT	2	10	562732	562741	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013162	ATTAC	2	10	569843	569852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013162	TTTGA	2	10	581252	581261	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013162	TGCTT	2	10	591567	591576	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013162	TTCAA	2	10	607435	607444	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013162	TACGG	2	10	607692	607701	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013162	TTTTC	2	10	608006	608015	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013162	TTCAG	2	10	609107	609116	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_013162	TCCGA	2	10	610116	610125	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_013162	CTCGA	2	10	610282	610291	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_013162	CTACA	2	10	610731	610740	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_013162	TGAGC	2	10	610798	610807	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013162	TCAAA	2	10	621469	621478	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013162	GTTTT	2	10	622141	622150	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013162	TGTTT	2	10	630851	630860	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013162	ACAAA	2	10	632941	632950	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013162	TATCT	2	10	633201	633210	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013162	ATATT	2	10	638402	638411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013162	CATTT	2	10	643780	643789	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013162	AAATA	2	10	643867	643876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013162	CCTTT	2	10	651743	651752	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013162	GATCA	2	10	674419	674428	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013162	TCATA	2	10	676291	676300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013162	CTCCA	2	10	677498	677507	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_013162	ATCTC	2	10	679225	679234	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_013162	AACAA	2	10	693177	693186	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013162	TCAGA	2	10	697916	697925	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_013162	CAAAA	2	10	701687	701696	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013162	AATTA	2	10	705814	705823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013162	TCATT	2	10	706209	706218	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013162	AAACT	2	10	706802	706811	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013162	AGAGA	2	10	708620	708629	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013162	CCTAC	2	10	714959	714968	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_013162	ATTTT	2	10	716210	716219	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013162	AAGAA	2	10	717101	717110	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013162	TTCAA	2	10	719267	719276	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013162	TACGG	2	10	719524	719533	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013162	TTTTC	2	10	719838	719847	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013162	TTCAG	2	10	720939	720948	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013162	TCCGA	2	10	721948	721957	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_013162	CTCGA	2	10	722114	722123	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_013162	CTACA	2	10	722563	722572	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_013162	TGAGC	2	10	722630	722639	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013162	GTTTT	2	10	727304	727313	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013162	GTTTT	2	10	728046	728055	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013162	TATTT	2	10	747773	747782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013162	TATTT	2	10	755726	755735	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013162	ATATG	2	10	768529	768538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013162	TGTTT	2	10	780424	780433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013162	TCATT	2	10	780476	780485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013162	CCCTA	2	10	805477	805486	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
114	NC_013162	ATTTT	2	10	814136	814145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013162	TAAAA	2	10	816829	816838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013162	CCCAA	2	10	824611	824620	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
117	NC_013162	GGTAG	2	10	829872	829881	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013162	TAAAT	2	10	831934	831943	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013162	AGGGA	2	10	832264	832273	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013162	TAAGC	2	10	850108	850117	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_013162	ATTTT	2	10	864512	864521	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013162	TCAGT	2	10	874361	874370	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013162	TAAGC	2	10	882265	882274	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_013162	CTTTA	2	10	897395	897404	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013162	TGTTA	2	10	898827	898836	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013162	TAATG	2	10	908677	908686	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013162	TTTTG	2	10	909512	909521	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013162	TCAAT	2	10	918563	918572	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013162	AGAAA	2	10	922435	922444	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013162	ATTGT	2	10	922951	922960	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013162	TAAAT	2	10	923514	923523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013162	TAACT	2	10	931109	931118	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013162	TGTTT	2	10	933209	933218	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013162	GTTAT	2	10	953281	953290	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013162	TACAA	2	10	960588	960597	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_013162	TAATT	2	10	974020	974029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013162	TTCTA	2	10	986062	986071	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013162	ATATA	2	10	994387	994396	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013162	TGAAT	2	10	998786	998795	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013162	TACCC	2	10	1002582	1002591	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_013162	ATAGA	2	10	1003299	1003308	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013162	TAATT	2	10	1034064	1034073	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013162	TCAAA	2	10	1036073	1036082	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013162	TCCCT	2	10	1072685	1072694	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
145	NC_013162	TTTTA	2	10	1075086	1075095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013162	CAAAA	2	10	1076999	1077008	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_013162	CCCCT	2	10	1079346	1079355	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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291	NC_013162	TAAAA	2	10	2111213	2111222	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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350	NC_013162	TACTA	2	10	2503357	2503366	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
351	NC_013162	TGTGA	2	10	2505410	2505419	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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357	NC_013162	TCATA	2	10	2579979	2579988	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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360	NC_013162	TTTTC	2	10	2591879	2591888	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.