MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Capnocytophaga ochracea DSM 7271 chromosome

Total Repeats: 1443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013162	AAGTG	2	10	1591	1600	40 %	20 %	40 %	0 %	256818849
2	NC_013162	CTACT	2	10	1959	1968	20 %	40 %	0 %	40 %	256818850
3	NC_013162	TAAAA	2	10	4653	4662	80 %	20 %	0 %	0 %	256818851
4	NC_013162	TTACT	2	10	5411	5420	20 %	60 %	0 %	20 %	256818852
5	NC_013162	TGCGA	2	10	7608	7617	20 %	20 %	40 %	20 %	256818855
6	NC_013162	ATAGA	2	10	8510	8519	60 %	20 %	20 %	0 %	256818855
7	NC_013162	GTTTT	2	10	10991	11000	0 %	80 %	20 %	0 %	256818858
8	NC_013162	AAAGC	2	10	14561	14570	60 %	0 %	20 %	20 %	256818861
9	NC_013162	TTTGA	2	10	17904	17913	20 %	60 %	20 %	0 %	256818864
10	NC_013162	ACGCC	2	10	19223	19232	20 %	0 %	20 %	60 %	256818865
11	NC_013162	CGATA	2	10	20993	21002	40 %	20 %	20 %	20 %	256818867
12	NC_013162	AAAAC	2	10	23074	23083	80 %	0 %	0 %	20 %	256818868
13	NC_013162	AGATT	2	10	25915	25924	40 %	40 %	20 %	0 %	256818869
14	NC_013162	GAAGG	2	10	25974	25983	40 %	0 %	60 %	0 %	256818869
15	NC_013162	AAAGC	2	10	27486	27495	60 %	0 %	20 %	20 %	256818872
16	NC_013162	GTACG	2	10	29479	29488	20 %	20 %	40 %	20 %	256818873
17	NC_013162	CAAAT	2	10	30113	30122	60 %	20 %	0 %	20 %	256818873
18	NC_013162	ATTTA	2	10	30205	30214	40 %	60 %	0 %	0 %	256818874
19	NC_013162	TCTTT	2	10	31392	31401	0 %	80 %	0 %	20 %	256818874
20	NC_013162	AAATA	2	10	33004	33013	80 %	20 %	0 %	0 %	256818876
21	NC_013162	CATCG	2	10	33873	33882	20 %	20 %	20 %	40 %	256818877
22	NC_013162	ATATA	2	10	38842	38851	60 %	40 %	0 %	0 %	256818881
23	NC_013162	GTTGG	2	10	40326	40335	0 %	40 %	60 %	0 %	256818881
24	NC_013162	ACCAC	2	10	40344	40353	40 %	0 %	0 %	60 %	256818881
25	NC_013162	ACATT	2	10	41671	41680	40 %	40 %	0 %	20 %	256818881
26	NC_013162	AGTTT	2	10	41706	41715	20 %	60 %	20 %	0 %	256818881
27	NC_013162	ATTTC	2	10	44389	44398	20 %	60 %	0 %	20 %	256818881
28	NC_013162	ATATC	2	10	50041	50050	40 %	40 %	0 %	20 %	256818882
29	NC_013162	GCCTT	2	10	51422	51431	0 %	40 %	20 %	40 %	256818883
30	NC_013162	TTCAC	2	10	53136	53145	20 %	40 %	0 %	40 %	256818884
31	NC_013162	CTGAA	2	10	53939	53948	40 %	20 %	20 %	20 %	256818885
32	NC_013162	TTTTC	2	10	54404	54413	0 %	80 %	0 %	20 %	256818885
33	NC_013162	GTTAC	2	10	54900	54909	20 %	40 %	20 %	20 %	256818886
34	NC_013162	AGCTG	2	10	54960	54969	20 %	20 %	40 %	20 %	256818886
35	NC_013162	TGTTT	2	10	55672	55681	0 %	80 %	20 %	0 %	256818887
36	NC_013162	CTTTT	2	10	57011	57020	0 %	80 %	0 %	20 %	256818888
37	NC_013162	ATTTA	2	10	57026	57035	40 %	60 %	0 %	0 %	256818888
38	NC_013162	TCTTT	2	10	57175	57184	0 %	80 %	0 %	20 %	256818889
39	NC_013162	TATCT	2	10	57654	57663	20 %	60 %	0 %	20 %	256818890
40	NC_013162	TCTAT	2	10	60590	60599	20 %	60 %	0 %	20 %	256818892
41	NC_013162	TACTC	2	10	61066	61075	20 %	40 %	0 %	40 %	256818893
42	NC_013162	AAATC	2	10	63487	63496	60 %	20 %	0 %	20 %	256818896
43	NC_013162	TGCTC	2	10	65228	65237	0 %	40 %	20 %	40 %	256818900
44	NC_013162	ATATG	2	10	68886	68895	40 %	40 %	20 %	0 %	256818900
45	NC_013162	AAAGT	2	10	69167	69176	60 %	20 %	20 %	0 %	256818900
46	NC_013162	AAACA	2	10	78875	78884	80 %	0 %	0 %	20 %	256818906
47	NC_013162	ACAAT	2	10	79183	79192	60 %	20 %	0 %	20 %	256818907
48	NC_013162	AACCC	2	10	82065	82074	40 %	0 %	0 %	60 %	256818909
49	NC_013162	GCACC	2	10	82212	82221	20 %	0 %	20 %	60 %	256818909
50	NC_013162	AGCAA	2	10	86471	86480	60 %	0 %	20 %	20 %	256818911
51	NC_013162	TAAAC	2	10	86847	86856	60 %	20 %	0 %	20 %	256818912
52	NC_013162	TTAAA	2	10	87822	87831	60 %	40 %	0 %	0 %	256818913
53	NC_013162	GTAAG	2	10	88242	88251	40 %	20 %	40 %	0 %	256818913
54	NC_013162	TTTTG	2	10	92068	92077	0 %	80 %	20 %	0 %	256818916
55	NC_013162	ACAAA	2	10	94272	94281	80 %	0 %	0 %	20 %	256818918
56	NC_013162	AAATC	2	10	100151	100160	60 %	20 %	0 %	20 %	256818923
57	NC_013162	AAATC	2	10	101622	101631	60 %	20 %	0 %	20 %	256818925
58	NC_013162	CTTTT	2	10	102021	102030	0 %	80 %	0 %	20 %	256818925
59	NC_013162	AAATT	2	10	102706	102715	60 %	40 %	0 %	0 %	256818927
60	NC_013162	GTAAA	2	10	106051	106060	60 %	20 %	20 %	0 %	256818931
61	NC_013162	GAAAA	2	10	107565	107574	80 %	0 %	20 %	0 %	256818933
62	NC_013162	ACCTT	2	10	108706	108715	20 %	40 %	0 %	40 %	256818934
63	NC_013162	CTCAA	2	10	109234	109243	40 %	20 %	0 %	40 %	256818934
64	NC_013162	AAGCC	2	10	110491	110500	40 %	0 %	20 %	40 %	256818935
65	NC_013162	AACCT	2	10	110982	110991	40 %	20 %	0 %	40 %	256818936
66	NC_013162	GCTAC	2	10	114642	114651	20 %	20 %	20 %	40 %	256818940
67	NC_013162	CATTC	2	10	115175	115184	20 %	40 %	0 %	40 %	256818940
68	NC_013162	CGTGC	2	10	120308	120317	0 %	20 %	40 %	40 %	256818946
69	NC_013162	TGGAC	2	10	122727	122736	20 %	20 %	40 %	20 %	256818948
70	NC_013162	AGTTT	2	10	124756	124765	20 %	60 %	20 %	0 %	256818951
71	NC_013162	TACTA	2	10	127156	127165	40 %	40 %	0 %	20 %	256818954
72	NC_013162	TAGTG	2	10	130725	130734	20 %	40 %	40 %	0 %	256818956
73	NC_013162	TAATC	2	10	134676	134685	40 %	40 %	0 %	20 %	256818960
74	NC_013162	AATCC	2	10	134765	134774	40 %	20 %	0 %	40 %	256818960
75	NC_013162	TAAGG	2	10	135098	135107	40 %	20 %	40 %	0 %	256818960
76	NC_013162	GGTAG	2	10	135314	135323	20 %	20 %	60 %	0 %	256818960
77	NC_013162	GAAGG	2	10	137885	137894	40 %	0 %	60 %	0 %	256818963
78	NC_013162	ATATC	2	10	138046	138055	40 %	40 %	0 %	20 %	256818963
79	NC_013162	AAATT	2	10	141133	141142	60 %	40 %	0 %	0 %	256818968
80	NC_013162	AATTA	2	10	141164	141173	60 %	40 %	0 %	0 %	256818969
81	NC_013162	AATGC	2	10	141738	141747	40 %	20 %	20 %	20 %	256818969
82	NC_013162	TTAGG	2	10	144541	144550	20 %	40 %	40 %	0 %	256818972
83	NC_013162	ACCCT	2	10	145691	145700	20 %	20 %	0 %	60 %	256818974
84	NC_013162	AAACA	2	10	149601	149610	80 %	0 %	0 %	20 %	256818976
85	NC_013162	CCCTA	2	10	153718	153727	20 %	20 %	0 %	60 %	256818978
86	NC_013162	CGCCT	2	10	155346	155355	0 %	20 %	20 %	60 %	256818980
87	NC_013162	TTACC	2	10	156226	156235	20 %	40 %	0 %	40 %	256818981
88	NC_013162	TCATC	2	10	157129	157138	20 %	40 %	0 %	40 %	256818981
89	NC_013162	TATCA	2	10	157814	157823	40 %	40 %	0 %	20 %	256818981
90	NC_013162	AGAGA	2	10	165328	165337	60 %	0 %	40 %	0 %	256818988
91	NC_013162	AGATA	2	10	167306	167315	60 %	20 %	20 %	0 %	256818990
92	NC_013162	CACAA	2	10	169505	169514	60 %	0 %	0 %	40 %	256818992
93	NC_013162	GATAG	2	10	170176	170185	40 %	20 %	40 %	0 %	256818992
94	NC_013162	GGAAT	2	10	175260	175269	40 %	20 %	40 %	0 %	256818994
95	NC_013162	AGGGG	2	10	175801	175810	20 %	0 %	80 %	0 %	256818994
96	NC_013162	ATGGT	2	10	178291	178300	20 %	40 %	40 %	0 %	256818996
97	NC_013162	ACCTT	2	10	178676	178685	20 %	40 %	0 %	40 %	256818996
98	NC_013162	TTGGT	2	10	180399	180408	0 %	60 %	40 %	0 %	256818998
99	NC_013162	ATTTG	2	10	180474	180483	20 %	60 %	20 %	0 %	256818998
100	NC_013162	AGAAA	2	10	180875	180884	80 %	0 %	20 %	0 %	256818999
101	NC_013162	ATACT	2	10	181590	181599	40 %	40 %	0 %	20 %	256819002
102	NC_013162	AAAAC	2	10	182220	182229	80 %	0 %	0 %	20 %	256819002
103	NC_013162	TTATC	2	10	182251	182260	20 %	60 %	0 %	20 %	256819002
104	NC_013162	CAAAA	2	10	184550	184559	80 %	0 %	0 %	20 %	256819003
105	NC_013162	TACCT	2	10	185573	185582	20 %	40 %	0 %	40 %	256819004
106	NC_013162	AAACC	2	10	185603	185612	60 %	0 %	0 %	40 %	256819004
107	NC_013162	TATCT	2	10	188892	188901	20 %	60 %	0 %	20 %	256819006
108	NC_013162	ATTTT	2	10	190492	190501	20 %	80 %	0 %	0 %	256819007
109	NC_013162	GATAA	2	10	190827	190836	60 %	20 %	20 %	0 %	256819007
110	NC_013162	AACAA	2	10	194236	194245	80 %	0 %	0 %	20 %	256819007
111	NC_013162	TCAAA	2	10	201593	201602	60 %	20 %	0 %	20 %	256819012
112	NC_013162	TTTCC	2	10	202115	202124	0 %	60 %	0 %	40 %	256819012
113	NC_013162	TCAAA	2	10	202436	202445	60 %	20 %	0 %	20 %	256819012
114	NC_013162	TTTAT	2	10	202663	202672	20 %	80 %	0 %	0 %	256819012
115	NC_013162	ACAAT	2	10	208692	208701	60 %	20 %	0 %	20 %	256819017
116	NC_013162	TTATT	2	10	208998	209007	20 %	80 %	0 %	0 %	256819017
117	NC_013162	AGATA	2	10	210286	210295	60 %	20 %	20 %	0 %	256819018
118	NC_013162	GCTCA	2	10	214910	214919	20 %	20 %	20 %	40 %	256819025
119	NC_013162	AATAA	2	10	215543	215552	80 %	20 %	0 %	0 %	256819025
120	NC_013162	GCAAT	2	10	216571	216580	40 %	20 %	20 %	20 %	256819026
121	NC_013162	TTTTG	2	10	216693	216702	0 %	80 %	20 %	0 %	256819027
122	NC_013162	GCATC	2	10	218678	218687	20 %	20 %	20 %	40 %	256819029
123	NC_013162	AGAAT	2	10	218694	218703	60 %	20 %	20 %	0 %	256819029
124	NC_013162	CATTG	2	10	218814	218823	20 %	40 %	20 %	20 %	256819029
125	NC_013162	TACCA	2	10	222893	222902	40 %	20 %	0 %	40 %	256819031
126	NC_013162	GCCAC	2	10	223534	223543	20 %	0 %	20 %	60 %	256819031
127	NC_013162	CCAAA	2	10	223735	223744	60 %	0 %	0 %	40 %	256819031
128	NC_013162	CCTTA	2	10	225417	225426	20 %	40 %	0 %	40 %	256819034
129	NC_013162	TTTCT	2	10	230730	230739	0 %	80 %	0 %	20 %	256819037
130	NC_013162	TAGAA	2	10	238038	238047	60 %	20 %	20 %	0 %	256819040
131	NC_013162	CAAAT	2	10	238796	238805	60 %	20 %	0 %	20 %	256819041
132	NC_013162	GATGA	2	10	239507	239516	40 %	20 %	40 %	0 %	256819041
133	NC_013162	TGATA	2	10	242519	242528	40 %	40 %	20 %	0 %	256819042
134	NC_013162	CAAAT	2	10	243900	243909	60 %	20 %	0 %	20 %	256819043
135	NC_013162	CTTTC	2	10	244933	244942	0 %	60 %	0 %	40 %	256819043
136	NC_013162	ACCAT	2	10	245332	245341	40 %	20 %	0 %	40 %	256819043
137	NC_013162	TGGCG	2	10	246513	246522	0 %	20 %	60 %	20 %	256819043
138	NC_013162	AAAAT	2	10	246793	246802	80 %	20 %	0 %	0 %	256819043
139	NC_013162	TATGG	2	10	247702	247711	20 %	40 %	40 %	0 %	256819044
140	NC_013162	ACCAA	2	10	248652	248661	60 %	0 %	0 %	40 %	256819045
141	NC_013162	TCCCC	2	10	251056	251065	0 %	20 %	0 %	80 %	256819046
142	NC_013162	ATAGC	2	10	254441	254450	40 %	20 %	20 %	20 %	256819048
143	NC_013162	CTATA	2	10	255195	255204	40 %	40 %	0 %	20 %	256819048
144	NC_013162	TGGTT	2	10	257068	257077	0 %	60 %	40 %	0 %	256819048
145	NC_013162	ATGCG	2	10	257119	257128	20 %	20 %	40 %	20 %	256819048
146	NC_013162	TTTCA	2	10	257161	257170	20 %	60 %	0 %	20 %	256819048
147	NC_013162	TGGTA	2	10	257860	257869	20 %	40 %	40 %	0 %	256819048
148	NC_013162	TGCTG	2	10	259505	259514	0 %	40 %	40 %	20 %	256819048
149	NC_013162	AGTAA	2	10	261220	261229	60 %	20 %	20 %	0 %	256819048
150	NC_013162	GTTTG	2	10	262724	262733	0 %	60 %	40 %	0 %	256819048
151	NC_013162	TGGTA	2	10	262879	262888	20 %	40 %	40 %	0 %	256819048
152	NC_013162	CAATA	2	10	263237	263246	60 %	20 %	0 %	20 %	256819048
153	NC_013162	ATCGC	2	10	266201	266210	20 %	20 %	20 %	40 %	256819048
154	NC_013162	TAACG	2	10	268448	268457	40 %	20 %	20 %	20 %	256819048
155	NC_013162	CTCAA	2	10	270206	270215	40 %	20 %	0 %	40 %	256819049
156	NC_013162	AAAGG	2	10	270664	270673	60 %	0 %	40 %	0 %	256819049
157	NC_013162	TATTC	2	10	273251	273260	20 %	60 %	0 %	20 %	256819053
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159	NC_013162	TGGTA	2	10	277474	277483	20 %	40 %	40 %	0 %	256819057
160	NC_013162	TTTAC	2	10	278431	278440	20 %	60 %	0 %	20 %	256819058
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164	NC_013162	CAGTA	2	10	286809	286818	40 %	20 %	20 %	20 %	256819065
165	NC_013162	TCCCC	2	10	286982	286991	0 %	20 %	0 %	80 %	256819065
166	NC_013162	CACTG	2	10	288734	288743	20 %	20 %	20 %	40 %	256819065
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169	NC_013162	TTTTG	2	10	292700	292709	0 %	80 %	20 %	0 %	256819068
170	NC_013162	AAAGT	2	10	293721	293730	60 %	20 %	20 %	0 %	256819069
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172	NC_013162	TAAGT	2	10	303259	303268	40 %	40 %	20 %	0 %	256819073
173	NC_013162	GATTT	2	10	306589	306598	20 %	60 %	20 %	0 %	256819078
174	NC_013162	AAATT	2	10	307551	307560	60 %	40 %	0 %	0 %	256819079
175	NC_013162	AGCCC	2	10	308762	308771	20 %	0 %	20 %	60 %	256819081
176	NC_013162	TAGTG	2	10	313519	313528	20 %	40 %	40 %	0 %	256819086
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178	NC_013162	AGTTG	2	10	318396	318405	20 %	40 %	40 %	0 %	256819089
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199	NC_013162	GTGTG	2	10	351151	351160	0 %	40 %	60 %	0 %	256819116
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201	NC_013162	TTTCT	2	10	353317	353326	0 %	80 %	0 %	20 %	256819117
202	NC_013162	CTGAG	2	10	353503	353512	20 %	20 %	40 %	20 %	256819117
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211	NC_013162	AGTTC	2	10	369337	369346	20 %	40 %	20 %	20 %	256819136
212	NC_013162	GCAAT	2	10	378452	378461	40 %	20 %	20 %	20 %	256819143
213	NC_013162	TTTTG	2	10	379052	379061	0 %	80 %	20 %	0 %	256819143
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231	NC_013162	TCCCC	2	10	406375	406384	0 %	20 %	0 %	80 %	256819167
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241	NC_013162	CACCT	2	10	430155	430164	20 %	20 %	0 %	60 %	256819186
242	NC_013162	GCGAA	2	10	434105	434114	40 %	0 %	40 %	20 %	256819192
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246	NC_013162	ATTTT	2	10	439009	439018	20 %	80 %	0 %	0 %	256819197
247	NC_013162	TTTGA	2	10	440797	440806	20 %	60 %	20 %	0 %	256819198
248	NC_013162	TACCA	2	10	443116	443125	40 %	20 %	0 %	40 %	256819200
249	NC_013162	GGGTT	2	10	444747	444756	0 %	40 %	60 %	0 %	256819202
250	NC_013162	TGCTG	2	10	445281	445290	0 %	40 %	40 %	20 %	256819202
251	NC_013162	ATTGA	2	10	446138	446147	40 %	40 %	20 %	0 %	256819202
252	NC_013162	TTAGA	2	10	447531	447540	40 %	40 %	20 %	0 %	256819203
253	NC_013162	AAGCC	2	10	447921	447930	40 %	0 %	20 %	40 %	256819203
254	NC_013162	TTTCT	2	10	457148	457157	0 %	80 %	0 %	20 %	256819209
255	NC_013162	AAAAG	2	10	457158	457167	80 %	0 %	20 %	0 %	256819209
256	NC_013162	TTATT	2	10	457235	457244	20 %	80 %	0 %	0 %	256819209
257	NC_013162	GGGTA	2	10	457716	457725	20 %	20 %	60 %	0 %	256819211
258	NC_013162	CAGTA	2	10	460764	460773	40 %	20 %	20 %	20 %	256819212
259	NC_013162	CAACT	2	10	461757	461766	40 %	20 %	0 %	40 %	256819212
260	NC_013162	GGAAT	2	10	470218	470227	40 %	20 %	40 %	0 %	256819216
261	NC_013162	CCTCA	2	10	471995	472004	20 %	20 %	0 %	60 %	256819216
262	NC_013162	TTGTC	2	10	472740	472749	0 %	60 %	20 %	20 %	256819216
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264	NC_013162	AGGTG	2	10	473162	473171	20 %	20 %	60 %	0 %	256819216
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387	NC_013162	TTACC	2	10	727696	727705	20 %	40 %	0 %	40 %	256819417
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392	NC_013162	TCCAT	2	10	733475	733484	20 %	40 %	0 %	40 %	256819421
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