MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 3100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013161	GAGTT	2	10	1292	1301	20 %	40 %	40 %	0 %	257057920
2	NC_013161	AAAAT	2	10	2275	2284	80 %	20 %	0 %	0 %	257057921
3	NC_013161	CTAGA	2	10	3515	3524	40 %	20 %	20 %	20 %	257057922
4	NC_013161	TTATT	2	10	4635	4644	20 %	80 %	0 %	0 %	257057924
5	NC_013161	CTTGA	2	10	5617	5626	20 %	40 %	20 %	20 %	257057925
6	NC_013161	AATCA	2	10	6653	6662	60 %	20 %	0 %	20 %	257057926
7	NC_013161	TTTGC	2	10	9257	9266	0 %	60 %	20 %	20 %	257057927
8	NC_013161	TTAAA	2	10	9381	9390	60 %	40 %	0 %	0 %	257057927
9	NC_013161	GATCA	2	10	10845	10854	40 %	20 %	20 %	20 %	257057929
10	NC_013161	AATAT	2	10	11239	11248	60 %	40 %	0 %	0 %	257057929
11	NC_013161	GAATT	2	10	12853	12862	40 %	40 %	20 %	0 %	257057931
12	NC_013161	GATCA	2	10	14972	14981	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013161	AGAAA	2	10	17156	17165	80 %	0 %	20 %	0 %	257057936
14	NC_013161	TAATA	2	10	18037	18046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013161	TATTT	2	10	18339	18348	20 %	80 %	0 %	0 %	257057938
16	NC_013161	ATCAA	2	10	18554	18563	60 %	20 %	0 %	20 %	257057938
17	NC_013161	CAGAT	2	10	20503	20512	40 %	20 %	20 %	20 %	257057939
18	NC_013161	TAAAT	2	10	20998	21007	60 %	40 %	0 %	0 %	257057939
19	NC_013161	CATTA	2	10	28182	28191	40 %	40 %	0 %	20 %	257057945
20	NC_013161	TCTTA	2	10	29252	29261	20 %	60 %	0 %	20 %	257057945
21	NC_013161	TATTT	2	10	29493	29502	20 %	80 %	0 %	0 %	257057945
22	NC_013161	CTTTA	2	10	31218	31227	20 %	60 %	0 %	20 %	257057947
23	NC_013161	TCTTT	2	10	31404	31413	0 %	80 %	0 %	20 %	257057947
24	NC_013161	GCTTA	2	10	32806	32815	20 %	40 %	20 %	20 %	257057948
25	NC_013161	ATTTT	2	10	33606	33615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013161	ATTCA	2	10	34325	34334	40 %	40 %	0 %	20 %	257057951
27	NC_013161	TCAGT	2	10	37961	37970	20 %	40 %	20 %	20 %	257057955
28	NC_013161	TTGCG	2	10	38263	38272	0 %	40 %	40 %	20 %	257057955
29	NC_013161	GGTTG	2	10	38590	38599	0 %	40 %	60 %	0 %	257057955
30	NC_013161	GAGGG	2	10	38850	38859	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013161	GGAAA	2	10	38949	38958	60 %	0 %	40 %	0 %	257057956
32	NC_013161	TAGTT	2	10	40550	40559	20 %	60 %	20 %	0 %	257057957
33	NC_013161	AGACA	2	10	41061	41070	60 %	0 %	20 %	20 %	257057957
34	NC_013161	AATTA	2	10	43422	43431	60 %	40 %	0 %	0 %	257057959
35	NC_013161	CCATT	2	10	44087	44096	20 %	40 %	0 %	40 %	257057960
36	NC_013161	CCTAC	2	10	45545	45554	20 %	20 %	0 %	60 %	257057961
37	NC_013161	TTTGG	2	10	46339	46348	0 %	60 %	40 %	0 %	257057962
38	NC_013161	ATCAA	2	10	46534	46543	60 %	20 %	0 %	20 %	257057962
39	NC_013161	GATTT	2	10	47684	47693	20 %	60 %	20 %	0 %	257057963
40	NC_013161	AATTT	2	10	47926	47935	40 %	60 %	0 %	0 %	257057963
41	NC_013161	TAATT	2	10	48075	48084	40 %	60 %	0 %	0 %	257057963
42	NC_013161	ACTCA	2	10	48992	49001	40 %	20 %	0 %	40 %	257057964
43	NC_013161	TGAGG	2	10	49412	49421	20 %	20 %	60 %	0 %	257057965
44	NC_013161	AATCT	2	10	50190	50199	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013161	TAAAG	2	10	50881	50890	60 %	20 %	20 %	0 %	257057966
46	NC_013161	CAACA	2	10	51103	51112	60 %	0 %	0 %	40 %	257057967
47	NC_013161	AACTA	2	10	52298	52307	60 %	20 %	0 %	20 %	257057968
48	NC_013161	TATGA	2	10	52504	52513	40 %	40 %	20 %	0 %	257057968
49	NC_013161	ATTCC	2	10	52643	52652	20 %	40 %	0 %	40 %	257057968
50	NC_013161	ATCTG	2	10	52821	52830	20 %	40 %	20 %	20 %	257057968
51	NC_013161	TAAAG	2	10	55978	55987	60 %	20 %	20 %	0 %	257057972
52	NC_013161	ACCAG	2	10	56473	56482	40 %	0 %	20 %	40 %	257057972
53	NC_013161	CAGTC	2	10	57443	57452	20 %	20 %	20 %	40 %	257057973
54	NC_013161	ATCGC	2	10	58867	58876	20 %	20 %	20 %	40 %	257057974
55	NC_013161	CTAAA	2	10	59699	59708	60 %	20 %	0 %	20 %	257057975
56	NC_013161	TAATT	2	10	60482	60491	40 %	60 %	0 %	0 %	257057976
57	NC_013161	GGGAA	2	10	65224	65233	40 %	0 %	60 %	0 %	257057981
58	NC_013161	TCTTT	2	10	65279	65288	0 %	80 %	0 %	20 %	257057981
59	NC_013161	CTGAA	2	10	67791	67800	40 %	20 %	20 %	20 %	257057983
60	NC_013161	TATAG	2	10	69549	69558	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013161	ATAAC	2	10	75305	75314	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013161	AGTTA	2	10	75450	75459	40 %	40 %	20 %	0 %	257057990
63	NC_013161	ATAAA	2	10	79209	79218	80 %	20 %	0 %	0 %	257057994
64	NC_013161	TTTAG	2	10	80949	80958	20 %	60 %	20 %	0 %	257057994
65	NC_013161	ATATT	2	10	82274	82283	40 %	60 %	0 %	0 %	257057996
66	NC_013161	CCTTT	2	10	82291	82300	0 %	60 %	0 %	40 %	257057996
67	NC_013161	TATTT	2	10	83200	83209	20 %	80 %	0 %	0 %	257057996
68	NC_013161	ATTCA	2	10	83757	83766	40 %	40 %	0 %	20 %	257057996
69	NC_013161	TTATT	2	10	84232	84241	20 %	80 %	0 %	0 %	257057997
70	NC_013161	GGTTT	2	10	85851	85860	0 %	60 %	40 %	0 %	257057999
71	NC_013161	TTATT	2	10	86375	86384	20 %	80 %	0 %	0 %	257057999
72	NC_013161	ATAGT	2	10	87444	87453	40 %	40 %	20 %	0 %	257058000
73	NC_013161	CAATA	2	10	87782	87791	60 %	20 %	0 %	20 %	257058000
74	NC_013161	TGACT	2	10	89816	89825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013161	AGGTG	2	10	91295	91304	20 %	20 %	60 %	0 %	257058003
76	NC_013161	TCAAA	2	10	91970	91979	60 %	20 %	0 %	20 %	257058004
77	NC_013161	TTTGA	2	10	91980	91989	20 %	60 %	20 %	0 %	257058004
78	NC_013161	TAATT	2	10	95112	95121	40 %	60 %	0 %	0 %	257058008
79	NC_013161	CAACG	2	10	95653	95662	40 %	0 %	20 %	40 %	257058008
80	NC_013161	TTATT	2	10	96426	96435	20 %	80 %	0 %	0 %	257058008
81	NC_013161	ATTTT	2	10	96486	96495	20 %	80 %	0 %	0 %	257058008
82	NC_013161	CATAA	2	10	96604	96613	60 %	20 %	0 %	20 %	257058009
83	NC_013161	GTTTA	2	10	97317	97326	20 %	60 %	20 %	0 %	257058009
84	NC_013161	AGGGA	2	10	98369	98378	40 %	0 %	60 %	0 %	257058010
85	NC_013161	TTTCA	2	10	99080	99089	20 %	60 %	0 %	20 %	257058011
86	NC_013161	AATTT	2	10	99582	99591	40 %	60 %	0 %	0 %	257058011
87	NC_013161	GATTT	2	10	103298	103307	20 %	60 %	20 %	0 %	257058015
88	NC_013161	CATCA	2	10	103361	103370	40 %	20 %	0 %	40 %	257058015
89	NC_013161	CGGAA	2	10	104306	104315	40 %	0 %	40 %	20 %	257058016
90	NC_013161	TTTAT	2	10	104321	104330	20 %	80 %	0 %	0 %	257058016
91	NC_013161	CAACC	2	10	104709	104718	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
92	NC_013161	GTTAA	2	10	106219	106228	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013161	CAAAC	2	10	110075	110084	60 %	0 %	0 %	40 %	257058022
94	NC_013161	TACTC	2	10	112172	112181	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_013161	AAAAT	2	10	112576	112585	80 %	20 %	0 %	0 %	257058025
96	NC_013161	TTTCT	2	10	113653	113662	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013161	TTAAT	2	10	114477	114486	40 %	60 %	0 %	0 %	257058026
98	NC_013161	TTTGG	2	10	115534	115543	0 %	60 %	40 %	0 %	257058027
99	NC_013161	ACCCC	2	10	118727	118736	20 %	0 %	0 %	80 %	257058032
100	NC_013161	CCCAT	2	10	120415	120424	20 %	20 %	0 %	60 %	257058032
101	NC_013161	CCCAT	2	10	121454	121463	20 %	20 %	0 %	60 %	257058032
102	NC_013161	GTTTT	2	10	121558	121567	0 %	80 %	20 %	0 %	257058032
103	NC_013161	TTATC	2	10	122836	122845	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013161	GTTGA	2	10	123209	123218	20 %	40 %	40 %	0 %	257058036
105	NC_013161	ATAAA	2	10	123427	123436	80 %	20 %	0 %	0 %	257058036
106	NC_013161	TTAAT	2	10	140301	140310	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013161	ACCCT	2	10	140543	140552	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_013161	TGGGA	2	10	143723	143732	20 %	20 %	60 %	0 %	257058052
109	NC_013161	TTCAT	2	10	144290	144299	20 %	60 %	0 %	20 %	257058053
110	NC_013161	AATTT	2	10	145450	145459	40 %	60 %	0 %	0 %	257058055
111	NC_013161	GCCAT	2	10	146353	146362	20 %	20 %	20 %	40 %	257058056
112	NC_013161	TTAAT	2	10	147292	147301	40 %	60 %	0 %	0 %	257058058
113	NC_013161	AGCAT	2	10	148046	148055	40 %	20 %	20 %	20 %	257058059
114	NC_013161	TCTAA	2	10	149796	149805	40 %	40 %	0 %	20 %	257058060
115	NC_013161	TAAGC	2	10	150681	150690	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013161	AAGAC	2	10	151206	151215	60 %	0 %	20 %	20 %	257058064
117	NC_013161	CAAGC	2	10	156820	156829	40 %	0 %	20 %	40 %	257058069
118	NC_013161	CTCCC	2	10	158554	158563	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
119	NC_013161	ATCCC	2	10	159457	159466	20 %	20 %	0 %	60 %	257058072
120	NC_013161	ACTCA	2	10	161523	161532	40 %	20 %	0 %	40 %	257058073
121	NC_013161	CAAAA	2	10	163399	163408	80 %	0 %	0 %	20 %	257058076
122	NC_013161	AAGTT	2	10	164984	164993	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013161	AATTT	2	10	165413	165422	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013161	GATAC	2	10	166681	166690	40 %	20 %	20 %	20 %	257058078
125	NC_013161	ACTTA	2	10	169451	169460	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013161	TACAA	2	10	169476	169485	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013161	AAATT	2	10	170197	170206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013161	TTGAA	2	10	170644	170653	40 %	40 %	20 %	0 %	257058084
129	NC_013161	CATAC	2	10	173637	173646	40 %	20 %	0 %	40 %	257058089
130	NC_013161	GGGAT	2	10	173857	173866	20 %	20 %	60 %	0 %	257058089
131	NC_013161	AATTT	2	10	174815	174824	40 %	60 %	0 %	0 %	257058090
132	NC_013161	ATCTT	2	10	175052	175061	20 %	60 %	0 %	20 %	257058090
133	NC_013161	TTGTT	2	10	175839	175848	0 %	80 %	20 %	0 %	257058091
134	NC_013161	TTTAC	2	10	175897	175906	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_013161	GCAAA	2	10	181477	181486	60 %	0 %	20 %	20 %	257058099
136	NC_013161	TCCCG	2	10	181536	181545	0 %	20 %	20 %	60 %	257058099
137	NC_013161	ATCGC	2	10	185093	185102	20 %	20 %	20 %	40 %	257058102
138	NC_013161	TATTT	2	10	186580	186589	20 %	80 %	0 %	0 %	257058103
139	NC_013161	GTCCA	2	10	186684	186693	20 %	20 %	20 %	40 %	257058103
140	NC_013161	TGGTG	2	10	186957	186966	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013161	AATTA	2	10	187697	187706	60 %	40 %	0 %	0 %	257058105
142	NC_013161	GATAG	2	10	187787	187796	40 %	20 %	40 %	0 %	257058105
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145	NC_013161	AGATG	2	10	190437	190446	40 %	20 %	40 %	0 %	257058109
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147	NC_013161	TCGGT	2	10	191612	191621	0 %	40 %	40 %	20 %	257058109
148	NC_013161	TTGTT	2	10	193690	193699	0 %	80 %	20 %	0 %	257058112
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150	NC_013161	TTCGG	2	10	194186	194195	0 %	40 %	40 %	20 %	257058113
151	NC_013161	TTTTA	2	10	195130	195139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013161	CGGAA	2	10	196660	196669	40 %	0 %	40 %	20 %	257058116
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154	NC_013161	TTGAC	2	10	201635	201644	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
155	NC_013161	TGAAA	2	10	203030	203039	60 %	20 %	20 %	0 %	257058121
156	NC_013161	CTTGA	2	10	203500	203509	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_013161	GGTGT	2	10	203646	203655	0 %	40 %	60 %	0 %	257058122
158	NC_013161	TTTGA	2	10	204359	204368	20 %	60 %	20 %	0 %	257058124
159	NC_013161	CTTGA	2	10	205225	205234	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_013161	TATCC	2	10	206080	206089	20 %	40 %	0 %	40 %	257058125
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164	NC_013161	AGCTA	2	10	210775	210784	40 %	20 %	20 %	20 %	257058130
165	NC_013161	GTTTG	2	10	214672	214681	0 %	60 %	40 %	0 %	257058133
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177	NC_013161	ATTGA	2	10	245947	245956	40 %	40 %	20 %	0 %	257058175
178	NC_013161	TTGAG	2	10	251079	251088	20 %	40 %	40 %	0 %	257058179
179	NC_013161	TTCTC	2	10	251729	251738	0 %	60 %	0 %	40 %	257058180
180	NC_013161	CTAGT	2	10	253783	253792	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
181	NC_013161	TTAAG	2	10	254173	254182	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013161	AACAA	2	10	254354	254363	80 %	0 %	0 %	20 %	257058183
183	NC_013161	GTAGG	2	10	254511	254520	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
184	NC_013161	TAGGG	2	10	257254	257263	20 %	20 %	60 %	0 %	257058186
185	NC_013161	AATCC	2	10	257526	257535	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
186	NC_013161	TAAAT	2	10	259214	259223	60 %	40 %	0 %	0 %	257058188
187	NC_013161	AATCA	2	10	260646	260655	60 %	20 %	0 %	20 %	257058189
188	NC_013161	TGAAT	2	10	262376	262385	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
189	NC_013161	ACAAT	2	10	262965	262974	60 %	20 %	0 %	20 %	257058190
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216	NC_013161	AGTTA	2	10	307370	307379	40 %	40 %	20 %	0 %	257058224
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223	NC_013161	TAAGA	2	10	332136	332145	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
224	NC_013161	GATTT	2	10	333087	333096	20 %	60 %	20 %	0 %	257058250
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233	NC_013161	CTTTT	2	10	352564	352573	0 %	80 %	0 %	20 %	257058274
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237	NC_013161	ATAGC	2	10	358275	358284	40 %	20 %	20 %	20 %	257058277
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241	NC_013161	TCCTG	2	10	363940	363949	0 %	40 %	20 %	40 %	257058281
242	NC_013161	GAACA	2	10	373049	373058	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
243	NC_013161	AATGG	2	10	375577	375586	40 %	20 %	40 %	0 %	257058291
244	NC_013161	TTTTC	2	10	378278	378287	0 %	80 %	0 %	20 %	257058293
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246	NC_013161	TAATT	2	10	379848	379857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_013161	TATTT	2	10	380750	380759	20 %	80 %	0 %	0 %	257058295
248	NC_013161	TATTG	2	10	381211	381220	20 %	60 %	20 %	0 %	257058296
249	NC_013161	ATTAA	2	10	381538	381547	60 %	40 %	0 %	0 %	257058297
250	NC_013161	CCCAA	2	10	383202	383211	40 %	0 %	0 %	60 %	257058298
251	NC_013161	TATAA	2	10	383873	383882	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_013161	ACCGG	2	10	385445	385454	20 %	0 %	40 %	40 %	257058300
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254	NC_013161	ACCCA	2	10	386872	386881	40 %	0 %	0 %	60 %	257058301
255	NC_013161	GGTAA	2	10	387990	387999	40 %	20 %	40 %	0 %	257058302
256	NC_013161	GTACA	2	10	390070	390079	40 %	20 %	20 %	20 %	257058303
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258	NC_013161	GGTTC	2	10	394606	394615	0 %	40 %	40 %	20 %	257058308
259	NC_013161	AATTG	2	10	394881	394890	40 %	40 %	20 %	0 %	257058308
260	NC_013161	ATCAA	2	10	397986	397995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
261	NC_013161	GGGAC	2	10	399318	399327	20 %	0 %	60 %	20 %	257058313
262	NC_013161	TGATT	2	10	400945	400954	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_013161	ATCCT	2	10	401242	401251	20 %	40 %	0 %	40 %	257058315
264	NC_013161	GATGC	2	10	402897	402906	20 %	20 %	40 %	20 %	257058315
265	NC_013161	TATTC	2	10	404023	404032	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_013161	AGAAA	2	10	407216	407225	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_013161	ATTTT	2	10	409189	409198	20 %	80 %	0 %	0 %	257058321
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269	NC_013161	GTGGG	2	10	412003	412012	0 %	20 %	80 %	0 %	257058323
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279	NC_013161	CTTAA	2	10	427367	427376	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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294	NC_013161	AACGA	2	10	445072	445081	60 %	0 %	20 %	20 %	257058355
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