MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013161	GATCA	2	10	14972	14981	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013161	TAATA	2	10	18037	18046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013161	ATTTT	2	10	33606	33615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013161	GAGGG	2	10	38850	38859	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013161	AATCT	2	10	50190	50199	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013161	TATAG	2	10	69549	69558	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013161	ATAAC	2	10	75305	75314	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013161	TGACT	2	10	89816	89825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013161	CAACC	2	10	104709	104718	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_013161	GTTAA	2	10	106219	106228	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013161	TACTC	2	10	112172	112181	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_013161	TTTCT	2	10	113653	113662	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013161	TTATC	2	10	122836	122845	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013161	TTAAT	2	10	140301	140310	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013161	ACCCT	2	10	140543	140552	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_013161	TAAGC	2	10	150681	150690	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013161	CTCCC	2	10	158554	158563	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
18	NC_013161	AAGTT	2	10	164984	164993	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013161	AATTT	2	10	165413	165422	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013161	ACTTA	2	10	169451	169460	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013161	TACAA	2	10	169476	169485	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013161	AAATT	2	10	170197	170206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013161	TTTAC	2	10	175897	175906	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013161	TGGTG	2	10	186957	186966	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013161	TTTTA	2	10	195130	195139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013161	TTGAC	2	10	201635	201644	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013161	CTTGA	2	10	203500	203509	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013161	CTTGA	2	10	205225	205234	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013161	TAACA	2	10	221686	221695	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013161	CTAGT	2	10	253783	253792	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013161	TTAAG	2	10	254173	254182	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013161	GTAGG	2	10	254511	254520	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013161	AATCC	2	10	257526	257535	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_013161	TGAAT	2	10	262376	262385	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013161	AGTTT	2	10	305105	305114	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013161	TCCTA	3	15	329306	329320	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_013161	TAAGA	2	10	332136	332145	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013161	CCTAC	2	10	340192	340201	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_013161	ATCTA	2	10	355776	355785	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013161	GAACA	2	10	373049	373058	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013161	TAATT	2	10	379848	379857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013161	TATAA	2	10	383873	383882	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013161	ATCAA	2	10	397986	397995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013161	TGATT	2	10	400945	400954	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013161	TATTC	2	10	404023	404032	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013161	AGAAA	2	10	407216	407225	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013161	CTTAA	2	10	427367	427376	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013161	TTAAA	2	10	427542	427551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013161	ATTTT	3	15	435535	435549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013161	CCTCA	2	10	438597	438606	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_013161	GATTA	2	10	443676	443685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013161	TGTCT	2	10	444255	444264	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013161	AATAA	2	10	446544	446553	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013161	CTTAA	2	10	451858	451867	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013161	CTAAG	2	10	454817	454826	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013161	TTCCC	2	10	465368	465377	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_013161	TTAAA	2	10	480057	480066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013161	TAACC	2	10	496644	496653	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_013161	CAACC	2	10	496742	496751	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_013161	AAATT	2	10	499755	499764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013161	AGATA	2	10	504270	504279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013161	TGCTA	2	10	511305	511314	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013161	TGTTT	2	10	512699	512708	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013161	CAAGT	2	10	543713	543722	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013161	ATTAT	2	10	549631	549640	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013161	GACTT	2	10	558195	558204	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013161	ACTTA	2	10	559629	559638	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013161	ATGGT	2	10	562621	562630	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013161	ATATT	2	10	569781	569790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013161	TAAAG	2	10	588144	588153	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013161	ATCTC	2	10	599237	599246	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_013161	AACTC	2	10	613829	613838	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_013161	GCTAA	2	10	623413	623422	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013161	CCTCT	2	10	631427	631436	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_013161	AATCC	2	10	642228	642237	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_013161	AACTT	2	10	659510	659519	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013161	TGTAT	2	10	665528	665537	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013161	ATCTT	2	10	677038	677047	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013161	CCTAC	2	10	678605	678614	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_013161	ACACC	2	10	679071	679080	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_013161	GGTAG	2	10	679972	679981	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013161	TCAAA	2	10	690541	690550	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013161	TCTTT	2	10	695214	695223	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_013161	CCCAC	2	10	699816	699825	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
85	NC_013161	CCTAC	2	10	703163	703172	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_013161	AAATC	2	10	703402	703411	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013161	TTTAT	2	10	704126	704135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013161	GTTAT	2	10	704384	704393	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013161	CTACT	2	10	709274	709283	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_013161	CCTAC	2	10	713891	713900	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
91	NC_013161	ATGAA	2	10	715339	715348	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013161	TTAAT	2	10	717864	717873	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013161	TAGTT	2	10	721106	721115	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013161	TAGAA	2	10	721272	721281	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013161	TTAAT	2	10	739632	739641	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013161	CTCAA	2	10	740439	740448	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013161	ATCAA	2	10	742479	742488	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013161	GATAA	2	10	754385	754394	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013161	ATTCA	2	10	756878	756887	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013161	GTCAA	2	10	761629	761638	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013161	AATTT	2	10	772315	772324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013161	TATTT	2	10	772338	772347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013161	GTTAA	2	10	779931	779940	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013161	AAGAG	2	10	781208	781217	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013161	TTTAT	2	10	781325	781334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013161	ATCTA	2	10	786103	786112	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013161	ACTTA	2	10	787622	787631	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_013161	GTTAA	2	10	808466	808475	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013161	CAGAA	2	10	816067	816076	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013161	GAAAA	2	10	816584	816593	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013161	CGTTC	2	10	818037	818046	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_013161	AAGTT	2	10	821045	821054	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013161	ATGCT	2	10	821055	821064	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_013161	ATTTA	2	10	823050	823059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013161	TATTG	2	10	826790	826799	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013161	ATTGT	2	10	835956	835965	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013161	TAAAA	2	10	836037	836046	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013161	ATGGT	2	10	836826	836835	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013161	CTATC	2	10	843212	843221	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_013161	TAATT	2	10	846259	846268	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013161	ATTAA	2	10	849299	849308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013161	AAGAT	2	10	851918	851927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013161	TAGCG	2	10	875467	875476	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_013161	TTGTC	2	10	876207	876216	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013161	CAAAG	2	10	876456	876465	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013161	TAATC	2	10	876782	876791	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013161	TCCGT	2	10	877131	877140	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_013161	GTTTA	2	10	877468	877477	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013161	AGAGG	2	10	878001	878010	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013161	CAAAT	2	10	887795	887804	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013161	ACAAA	2	10	888175	888184	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_013161	GATAT	2	10	888306	888315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013161	TGGCT	2	10	910406	910415	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_013161	TGAAA	2	10	910815	910824	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013161	GCTTA	2	10	911750	911759	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_013161	AAGCA	2	10	912804	912813	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013161	AGCGT	2	10	914069	914078	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013161	TAGCT	2	10	918132	918141	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_013161	CTTAG	2	10	928508	928517	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013161	TTAAA	2	10	931602	931611	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013161	TAGCA	2	10	933853	933862	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_013161	TATAA	2	10	935601	935610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013161	AGTTA	2	10	936621	936630	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013161	GGTAG	2	10	941488	941497	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013161	GCTTG	2	10	942862	942871	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_013161	TAGCG	2	10	946012	946021	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_013161	TAGAA	2	10	1090508	1090517	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_013161	GGTTA	2	10	1203699	1203708	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_013161	CCTAC	2	10	2936380	2936389	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
467	NC_013161	ATTTT	2	10	2939604	2939613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_013161	AAATC	2	10	3101858	3101867	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
489	NC_013161	TCTCG	2	10	3105233	3105242	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
490	NC_013161	ATTGT	2	10	3113013	3113022	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
491	NC_013161	AGTAA	2	10	3177358	3177367	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
492	NC_013161	CTCAA	2	10	3189621	3189630	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
493	NC_013161	TAAAA	2	10	3196813	3196822	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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