MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 11792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013161	AATT	2	8	49	56	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013161	TCAA	2	8	429	436	50 %	25 %	0 %	25 %	257057920
3	NC_013161	GGTC	2	8	469	476	0 %	25 %	50 %	25 %	257057920
4	NC_013161	ACTA	2	8	1022	1029	50 %	25 %	0 %	25 %	257057920
5	NC_013161	ACGG	2	8	1177	1184	25 %	0 %	50 %	25 %	257057920
6	NC_013161	ATCG	2	8	1204	1211	25 %	25 %	25 %	25 %	257057920
7	NC_013161	TTAA	2	8	1778	1785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013161	CGAT	2	8	1815	1822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013161	ACAA	2	8	1959	1966	75 %	0 %	0 %	25 %	257057921
10	NC_013161	TTAA	2	8	2197	2204	50 %	50 %	0 %	0 %	257057921
11	NC_013161	CAAT	2	8	2799	2806	50 %	25 %	0 %	25 %	257057921
12	NC_013161	CAAG	2	8	2907	2914	50 %	0 %	25 %	25 %	257057921
13	NC_013161	AATT	2	8	2966	2973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013161	CAAA	2	8	3359	3366	75 %	0 %	0 %	25 %	257057922
15	NC_013161	TGAT	2	8	3373	3380	25 %	50 %	25 %	0 %	257057922
16	NC_013161	CAAC	2	8	3405	3412	50 %	0 %	0 %	50 %	257057922
17	NC_013161	TCCG	2	8	3440	3447	0 %	25 %	25 %	50 %	257057922
18	NC_013161	CCCA	2	8	3474	3481	25 %	0 %	0 %	75 %	257057922
19	NC_013161	TTTA	2	8	3894	3901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013161	TTTA	2	8	4462	4469	25 %	75 %	0 %	0 %	257057924
21	NC_013161	TTGT	2	8	4833	4840	0 %	75 %	25 %	0 %	257057924
22	NC_013161	TAAT	2	8	5313	5320	50 %	50 %	0 %	0 %	257057925
23	NC_013161	AACC	2	8	5465	5472	50 %	0 %	0 %	50 %	257057925
24	NC_013161	CAAT	2	8	6393	6400	50 %	25 %	0 %	25 %	257057926
25	NC_013161	AAGA	2	8	7134	7141	75 %	0 %	25 %	0 %	257057926
26	NC_013161	CGAC	2	8	8381	8388	25 %	0 %	25 %	50 %	257057926
27	NC_013161	AATT	2	8	9091	9098	50 %	50 %	0 %	0 %	257057927
28	NC_013161	CTAT	2	8	10362	10369	25 %	50 %	0 %	25 %	257057928
29	NC_013161	AGTT	2	8	10507	10514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013161	TTGT	2	8	10787	10794	0 %	75 %	25 %	0 %	257057929
31	NC_013161	TATT	2	8	11170	11177	25 %	75 %	0 %	0 %	257057929
32	NC_013161	TAAA	2	8	11568	11575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013161	CACT	2	8	11653	11660	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013161	CTAA	2	8	11947	11954	50 %	25 %	0 %	25 %	257057930
35	NC_013161	GTTT	2	8	12331	12338	0 %	75 %	25 %	0 %	257057931
36	NC_013161	AATT	2	8	12414	12421	50 %	50 %	0 %	0 %	257057931
37	NC_013161	TTAA	2	8	12472	12479	50 %	50 %	0 %	0 %	257057931
38	NC_013161	TTGA	2	8	12597	12604	25 %	50 %	25 %	0 %	257057931
39	NC_013161	ATCC	2	8	13154	13161	25 %	25 %	0 %	50 %	257057932
40	NC_013161	ACTA	2	8	13609	13616	50 %	25 %	0 %	25 %	257057932
41	NC_013161	AACT	2	8	14881	14888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013161	ACTT	2	8	14929	14936	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013161	TGGT	2	8	15235	15242	0 %	50 %	50 %	0 %	257057934
44	NC_013161	TAAA	2	8	15864	15871	75 %	25 %	0 %	0 %	257057935
45	NC_013161	TAAA	2	8	16450	16457	75 %	25 %	0 %	0 %	257057936
46	NC_013161	TTTG	2	8	16465	16472	0 %	75 %	25 %	0 %	257057936
47	NC_013161	AATT	2	8	16834	16841	50 %	50 %	0 %	0 %	257057936
48	NC_013161	AAGG	2	8	17375	17382	50 %	0 %	50 %	0 %	257057937
49	NC_013161	TTGA	2	8	17764	17771	25 %	50 %	25 %	0 %	257057937
50	NC_013161	TATT	2	8	18792	18799	25 %	75 %	0 %	0 %	257057938
51	NC_013161	GAAC	2	8	19024	19031	50 %	0 %	25 %	25 %	257057938
52	NC_013161	TTTA	2	8	19665	19672	25 %	75 %	0 %	0 %	257057938
53	NC_013161	GACA	2	8	21294	21301	50 %	0 %	25 %	25 %	257057940
54	NC_013161	AATT	2	8	21354	21361	50 %	50 %	0 %	0 %	257057940
55	NC_013161	AAGA	2	8	21785	21792	75 %	0 %	25 %	0 %	257057940
56	NC_013161	GATA	2	8	22619	22626	50 %	25 %	25 %	0 %	257057941
57	NC_013161	AATT	2	8	23525	23532	50 %	50 %	0 %	0 %	257057942
58	NC_013161	AAAT	2	8	23597	23604	75 %	25 %	0 %	0 %	257057942
59	NC_013161	TTTG	2	8	23943	23950	0 %	75 %	25 %	0 %	257057942
60	NC_013161	AATG	2	8	23965	23972	50 %	25 %	25 %	0 %	257057942
61	NC_013161	AGGA	2	8	24011	24018	50 %	0 %	50 %	0 %	257057942
62	NC_013161	TCTT	2	8	24395	24402	0 %	75 %	0 %	25 %	257057942
63	NC_013161	TTGT	2	8	25015	25022	0 %	75 %	25 %	0 %	257057942
64	NC_013161	TTCC	2	8	25069	25076	0 %	50 %	0 %	50 %	257057942
65	NC_013161	TAGT	2	8	25358	25365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013161	CAAT	2	8	25390	25397	50 %	25 %	0 %	25 %	257057943
67	NC_013161	AACG	2	8	25540	25547	50 %	0 %	25 %	25 %	257057943
68	NC_013161	CTAT	2	8	25650	25657	25 %	50 %	0 %	25 %	257057943
69	NC_013161	GTTT	2	8	26283	26290	0 %	75 %	25 %	0 %	257057944
70	NC_013161	GAAA	2	8	26305	26312	75 %	0 %	25 %	0 %	257057944
71	NC_013161	CATT	2	8	26635	26642	25 %	50 %	0 %	25 %	257057944
72	NC_013161	CATA	2	8	27184	27191	50 %	25 %	0 %	25 %	257057944
73	NC_013161	TCAT	2	8	27612	27619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013161	TAAA	2	8	30042	30049	75 %	25 %	0 %	0 %	257057946
75	NC_013161	AATT	2	8	30440	30447	50 %	50 %	0 %	0 %	257057947
76	NC_013161	TCCC	2	8	30602	30609	0 %	25 %	0 %	75 %	257057947
77	NC_013161	TTTC	2	8	30758	30765	0 %	75 %	0 %	25 %	257057947
78	NC_013161	ATTT	2	8	30806	30813	25 %	75 %	0 %	0 %	257057947
79	NC_013161	GTTT	2	8	30900	30907	0 %	75 %	25 %	0 %	257057947
80	NC_013161	TTTA	2	8	30981	30988	25 %	75 %	0 %	0 %	257057947
81	NC_013161	ATTT	2	8	30997	31004	25 %	75 %	0 %	0 %	257057947
82	NC_013161	GTGG	2	8	31792	31799	0 %	25 %	75 %	0 %	257057948
83	NC_013161	TGTT	3	12	33078	33089	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013161	ACCA	2	8	33420	33427	50 %	0 %	0 %	50 %	257057949
85	NC_013161	TAAT	2	8	34398	34405	50 %	50 %	0 %	0 %	257057951
86	NC_013161	GTAA	2	8	35022	35029	50 %	25 %	25 %	0 %	257057952
87	NC_013161	AAAG	2	8	35970	35977	75 %	0 %	25 %	0 %	257057953
88	NC_013161	GGTT	2	8	36168	36175	0 %	50 %	50 %	0 %	257057953
89	NC_013161	ATTG	2	8	36273	36280	25 %	50 %	25 %	0 %	257057953
90	NC_013161	GATA	2	8	37280	37287	50 %	25 %	25 %	0 %	257057954
91	NC_013161	AATA	2	8	37306	37313	75 %	25 %	0 %	0 %	257057954
92	NC_013161	TCAA	2	8	37690	37697	50 %	25 %	0 %	25 %	257057955
93	NC_013161	AGAT	2	8	37738	37745	50 %	25 %	25 %	0 %	257057955
94	NC_013161	ATAG	2	8	39156	39163	50 %	25 %	25 %	0 %	257057956
95	NC_013161	CTCC	2	8	39180	39187	0 %	25 %	0 %	75 %	257057956
96	NC_013161	AGGT	2	8	39204	39211	25 %	25 %	50 %	0 %	257057956
97	NC_013161	GTTA	2	8	39980	39987	25 %	50 %	25 %	0 %	257057957
98	NC_013161	GTTA	2	8	40103	40110	25 %	50 %	25 %	0 %	257057957
99	NC_013161	TTAA	2	8	40488	40495	50 %	50 %	0 %	0 %	257057957
100	NC_013161	CAAA	2	8	40988	40995	75 %	0 %	0 %	25 %	257057957
101	NC_013161	ATTT	2	8	42304	42311	25 %	75 %	0 %	0 %	257057958
102	NC_013161	TGTA	2	8	43245	43252	25 %	50 %	25 %	0 %	257057959
103	NC_013161	ATTT	2	8	43530	43537	25 %	75 %	0 %	0 %	257057959
104	NC_013161	CAGA	2	8	43714	43721	50 %	0 %	25 %	25 %	257057959
105	NC_013161	TATT	2	8	44610	44617	25 %	75 %	0 %	0 %	257057960
106	NC_013161	TGAT	2	8	44680	44687	25 %	50 %	25 %	0 %	257057960
107	NC_013161	TTTC	2	8	45557	45564	0 %	75 %	0 %	25 %	257057961
108	NC_013161	ATTT	2	8	45782	45789	25 %	75 %	0 %	0 %	257057961
109	NC_013161	TACT	2	8	46050	46057	25 %	50 %	0 %	25 %	257057962
110	NC_013161	TATT	2	8	46658	46665	25 %	75 %	0 %	0 %	257057962
111	NC_013161	ATTT	2	8	46809	46816	25 %	75 %	0 %	0 %	257057962
112	NC_013161	AGCA	2	8	48088	48095	50 %	0 %	25 %	25 %	257057963
113	NC_013161	TTTA	2	8	48847	48854	25 %	75 %	0 %	0 %	257057964
114	NC_013161	CGAC	2	8	49067	49074	25 %	0 %	25 %	50 %	257057964
115	NC_013161	TCTA	2	8	49470	49477	25 %	50 %	0 %	25 %	257057965
116	NC_013161	TAGA	2	8	49831	49838	50 %	25 %	25 %	0 %	257057965
117	NC_013161	AATA	2	8	50049	50056	75 %	25 %	0 %	0 %	257057965
118	NC_013161	GATT	2	8	50682	50689	25 %	50 %	25 %	0 %	257057966
119	NC_013161	TATC	2	8	51044	51051	25 %	50 %	0 %	25 %	257057967
120	NC_013161	CCAT	2	8	51364	51371	25 %	25 %	0 %	50 %	257057967
121	NC_013161	TTGT	2	8	51514	51521	0 %	75 %	25 %	0 %	257057967
122	NC_013161	TTTA	2	8	51672	51679	25 %	75 %	0 %	0 %	257057967
123	NC_013161	ATTT	2	8	51867	51874	25 %	75 %	0 %	0 %	257057967
124	NC_013161	TGAC	2	8	53710	53717	25 %	25 %	25 %	25 %	257057969
125	NC_013161	CATC	2	8	53798	53805	25 %	25 %	0 %	50 %	257057969
126	NC_013161	AACC	2	8	53844	53851	50 %	0 %	0 %	50 %	257057969
127	NC_013161	TGAC	2	8	53969	53976	25 %	25 %	25 %	25 %	257057969
128	NC_013161	GCGA	2	8	54521	54528	25 %	0 %	50 %	25 %	257057970
129	NC_013161	CAAA	2	8	55358	55365	75 %	0 %	0 %	25 %	257057971
130	NC_013161	GTAA	2	8	55421	55428	50 %	25 %	25 %	0 %	257057971
131	NC_013161	CTCG	2	8	55673	55680	0 %	25 %	25 %	50 %	257057971
132	NC_013161	TGGT	2	8	55712	55719	0 %	50 %	50 %	0 %	257057971
133	NC_013161	CACG	2	8	56003	56010	25 %	0 %	25 %	50 %	257057972
134	NC_013161	CCCA	2	8	56050	56057	25 %	0 %	0 %	75 %	257057972
135	NC_013161	CAAA	2	8	56405	56412	75 %	0 %	0 %	25 %	257057972
136	NC_013161	CCAA	2	8	56500	56507	50 %	0 %	0 %	50 %	257057972
137	NC_013161	CCAG	2	8	57779	57786	25 %	0 %	25 %	50 %	257057973
138	NC_013161	ACCA	2	8	57869	57876	50 %	0 %	0 %	50 %	257057973
139	NC_013161	ACCA	2	8	58183	58190	50 %	0 %	0 %	50 %	257057973
140	NC_013161	TTAT	2	8	58877	58884	25 %	75 %	0 %	0 %	257057974
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