MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 2236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013161	AATT	2	8	49	56	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013161	TTAA	2	8	1778	1785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013161	CGAT	2	8	1815	1822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013161	AATT	2	8	2966	2973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013161	TTTA	2	8	3894	3901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013161	AGTT	2	8	10507	10514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013161	TAAA	2	8	11568	11575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013161	CACT	2	8	11653	11660	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013161	AACT	2	8	14881	14888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013161	ACTT	2	8	14929	14936	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013161	TAGT	2	8	25358	25365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013161	TCAT	2	8	27612	27619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013161	TGTT	3	12	33078	33089	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013161	TAAT	2	8	60235	60242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013161	ATTG	2	8	64556	64563	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013161	TCCT	2	8	64564	64571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013161	GTCC	2	8	69621	69628	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013161	AGCA	2	8	69719	69726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013161	ATTA	2	8	70453	70460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013161	AATT	2	8	75266	75273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013161	TTAA	2	8	79089	79096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013161	ATCT	2	8	92845	92852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013161	ATCA	2	8	97577	97584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013161	AATA	2	8	102664	102671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013161	TGGG	2	8	106206	106213	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013161	TTTC	2	8	106293	106300	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013161	GATG	2	8	108901	108908	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013161	TAAC	2	8	108977	108984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013161	TGGG	2	8	110219	110226	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013161	GAAT	2	8	111205	111212	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013161	ACCT	2	8	111282	111289	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013161	TTGA	2	8	112075	112082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013161	TTCA	2	8	113776	113783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013161	AATT	2	8	114674	114681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013161	AATT	2	8	114717	114724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013161	ACAA	2	8	114905	114912	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013161	TTAG	2	8	116970	116977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013161	ATCT	2	8	117009	117016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013161	TATT	2	8	118232	118239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013161	TGAA	2	8	118607	118614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013161	TGAG	2	8	121658	121665	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013161	CCTT	2	8	121701	121708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013161	TTTC	2	8	122086	122093	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013161	TTTA	2	8	124447	124454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013161	AATC	2	8	124541	124548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013161	TTCC	2	8	128316	128323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013161	ATTA	2	8	132297	132304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013161	CAAT	2	8	133301	133308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013161	TAAT	2	8	140323	140330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013161	TGAA	2	8	140482	140489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013161	GATT	2	8	140501	140508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013161	AGTT	2	8	146170	146177	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013161	TCTT	3	12	149131	149142	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013161	GATT	2	8	149223	149230	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013161	TTTA	2	8	151529	151536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013161	ATGA	2	8	152414	152421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013161	CCAT	2	8	152443	152450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013161	ACCC	2	8	152607	152614	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_013161	TAAT	2	8	152629	152636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013161	CAAG	2	8	152946	152953	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013161	TCGG	2	8	154309	154316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013161	TTGA	2	8	155848	155855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013161	TTGG	2	8	155885	155892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013161	CAAC	3	12	158199	158210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013161	TTGT	2	8	158211	158218	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013161	AATT	2	8	158333	158340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013161	ATCA	2	8	158580	158587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013161	AAGA	2	8	158614	158621	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013161	TATT	2	8	158952	158959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013161	CTCA	2	8	160783	160790	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013161	CACT	2	8	163095	163102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013161	TTTG	2	8	165144	165151	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013161	AAAT	2	8	165254	165261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013161	AGGT	2	8	168952	168959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013161	TTAA	2	8	169960	169967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013161	TTAG	2	8	169971	169978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013161	ATTG	2	8	170313	170320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013161	TAAA	2	8	178892	178899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013161	ATTA	2	8	182934	182941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013161	TCCC	2	8	186190	186197	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_013161	AATT	2	8	186939	186946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013161	AGAT	2	8	189054	189061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013161	AAAG	2	8	190402	190409	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013161	ACAA	2	8	193296	193303	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013161	CTTG	2	8	197394	197401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013161	TTTA	2	8	200254	200261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013161	TGAT	2	8	202942	202949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013161	GCAG	2	8	203997	204004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013161	TAAC	2	8	208701	208708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013161	AGAA	2	8	210248	210255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013161	AAGT	2	8	210277	210284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013161	ATCA	2	8	216442	216449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013161	AATT	2	8	216719	216726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013161	ATCT	2	8	221570	221577	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013161	AAGT	2	8	233032	233039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013161	TCTG	2	8	234974	234981	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013161	AAAC	2	8	238281	238288	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013161	AGAA	2	8	238325	238332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013161	CTGT	2	8	243729	243736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013161	ATCA	2	8	246495	246502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013161	CATT	2	8	246573	246580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013161	TCCT	2	8	253931	253938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013161	AAAT	2	8	254056	254063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013161	ATTA	2	8	254070	254077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013161	TAAG	2	8	254477	254484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013161	ATTA	2	8	254493	254500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013161	AATT	2	8	254583	254590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013161	CTTT	2	8	255452	255459	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013161	CAAA	2	8	255508	255515	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013161	TAGC	2	8	257369	257376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013161	ATAG	2	8	260284	260291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013161	ATTC	2	8	260429	260436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013161	CAGT	2	8	262522	262529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013161	CTTA	2	8	264246	264253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013161	AATC	2	8	264322	264329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013161	GCTA	2	8	268064	268071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013161	AAAG	2	8	273976	273983	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013161	AAAT	2	8	274035	274042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013161	TCAA	2	8	275834	275841	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013161	AATT	2	8	275914	275921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013161	TCAT	2	8	276917	276924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013161	AAAC	2	8	276963	276970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013161	TTGA	2	8	276993	277000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013161	CTAG	2	8	277060	277067	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013161	AGTT	2	8	280368	280375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013161	GGGT	2	8	291583	291590	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013161	AAAG	2	8	297370	297377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013161	TCAA	2	8	297644	297651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013161	CTTC	2	8	303293	303300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013161	TCAA	2	8	303352	303359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013161	CTGC	2	8	303389	303396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013161	TTGT	2	8	304453	304460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013161	GATT	2	8	305703	305710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013161	TTCT	2	8	305931	305938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013161	GATT	2	8	306051	306058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013161	GATT	2	8	306116	306123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013161	ATAG	2	8	308750	308757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013161	AGTT	2	8	309369	309376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013161	AATA	2	8	311116	311123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013161	CATA	2	8	311257	311264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013161	TAAT	2	8	312862	312869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013161	AATT	2	8	312870	312877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013161	AATG	2	8	312928	312935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013161	ATTT	2	8	314751	314758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013161	GATT	2	8	315979	315986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013161	TAAG	2	8	315987	315994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013161	TTGA	2	8	327226	327233	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013161	TTAG	2	8	329386	329393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013161	ACTT	2	8	332934	332941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013161	ACTA	2	8	333795	333802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013161	ACCA	2	8	335590	335597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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