MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 63986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013161	TCA	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013161	TAA	2	6	76	81	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013161	TAT	2	6	280	285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057920
4	NC_013161	TGC	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057920
5	NC_013161	TCG	2	6	721	726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057920
6	NC_013161	GAT	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057920
7	NC_013161	AAG	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057920
8	NC_013161	ATT	2	6	790	795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057920
9	NC_013161	TTC	2	6	957	962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057920
10	NC_013161	TCC	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057920
11	NC_013161	CGA	2	6	1232	1237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057920
12	NC_013161	GAA	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057920
13	NC_013161	TTC	2	6	1539	1544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013161	AAC	2	6	1753	1758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013161	ATT	2	6	1767	1772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013161	ATC	2	6	1916	1921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057921
17	NC_013161	AAT	2	6	2008	2013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
18	NC_013161	CGT	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057921
19	NC_013161	ATT	2	6	2090	2095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057921
20	NC_013161	TTG	2	6	2261	2266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057921
21	NC_013161	AGC	2	6	2319	2324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057921
22	NC_013161	GTC	2	6	2349	2354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057921
23	NC_013161	AAT	2	6	2362	2367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
24	NC_013161	ATC	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057921
25	NC_013161	GAA	2	6	2431	2436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057921
26	NC_013161	CAA	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057921
27	NC_013161	AAT	2	6	2536	2541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
28	NC_013161	TTA	2	6	2560	2565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057921
29	NC_013161	ATT	2	6	2622	2627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057921
30	NC_013161	ATG	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057921
31	NC_013161	TTG	2	6	2675	2680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057921
32	NC_013161	ATA	2	6	2746	2751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
33	NC_013161	CTT	2	6	2761	2766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057921
34	NC_013161	ACA	2	6	2874	2879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057921
35	NC_013161	TAA	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013161	GGC	2	6	3104	3109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057922
37	NC_013161	TTC	2	6	3153	3158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057922
38	NC_013161	GTT	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057922
39	NC_013161	ATA	2	6	3428	3433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
40	NC_013161	ATA	2	6	3500	3505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
41	NC_013161	AAT	2	6	3561	3566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
42	NC_013161	CCA	2	6	3573	3578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057922
43	NC_013161	TAA	2	6	3630	3635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
44	NC_013161	TTC	2	6	3788	3793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057922
45	NC_013161	GTT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057922
46	NC_013161	TTG	2	6	3812	3817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057922
47	NC_013161	TGA	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013161	AAC	2	6	3861	3866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013161	TAA	2	6	3877	3882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013161	GTA	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057923
51	NC_013161	AGC	2	6	3996	4001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057923
52	NC_013161	TAA	2	6	4036	4041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057923
53	NC_013161	AGT	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057923
54	NC_013161	ATT	2	6	4197	4202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013161	GTT	2	6	4207	4212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013161	TAT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013161	TTA	2	6	4310	4315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
58	NC_013161	ATT	2	6	4369	4374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
59	NC_013161	CCA	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057924
60	NC_013161	CCT	2	6	4391	4396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057924
61	NC_013161	ATT	2	6	4411	4416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
62	NC_013161	TGT	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057924
63	NC_013161	TTA	2	6	4478	4483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
64	NC_013161	TAA	2	6	4536	4541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057924
65	NC_013161	AGG	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057924
66	NC_013161	TTA	2	6	4617	4622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
67	NC_013161	ATT	2	6	4668	4673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
68	NC_013161	TTA	2	6	4775	4780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
69	NC_013161	ATT	2	6	4876	4881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
70	NC_013161	TTG	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057925
71	NC_013161	CAT	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057925
72	NC_013161	TAA	2	6	5259	5264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057925
73	NC_013161	GTT	2	6	5447	5452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057925
74	NC_013161	CAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057925
75	NC_013161	TTC	2	6	5602	5607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057925
76	NC_013161	GCT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057925
77	NC_013161	TTG	2	6	5959	5964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057925
78	NC_013161	TAA	2	6	5965	5970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057925
79	NC_013161	CTT	2	6	5979	5984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057925
80	NC_013161	TAA	3	9	6031	6039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057925
81	NC_013161	ATC	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057925
82	NC_013161	TGG	2	6	6171	6176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057925
83	NC_013161	AAT	2	6	6309	6314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
84	NC_013161	ATT	2	6	6348	6353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057926
85	NC_013161	TCT	2	6	6354	6359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057926
86	NC_013161	TAA	2	6	6434	6439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
87	NC_013161	AAT	2	6	6529	6534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
88	NC_013161	GCA	2	6	6540	6545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057926
89	NC_013161	TAA	2	6	6578	6583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
90	NC_013161	ATC	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057926
91	NC_013161	AAT	2	6	6797	6802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
92	NC_013161	AGG	2	6	6867	6872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057926
93	NC_013161	GAC	3	9	6931	6939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057926
94	NC_013161	CGA	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057926
95	NC_013161	CAG	2	6	7201	7206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057926
96	NC_013161	AGG	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057926
97	NC_013161	GAG	2	6	7388	7393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057926
98	NC_013161	GGA	2	6	7423	7428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057926
99	NC_013161	TTC	4	12	7511	7522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057926
100	NC_013161	GTT	2	6	7579	7584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057926
101	NC_013161	GGA	2	6	7640	7645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057926
102	NC_013161	GTT	2	6	7669	7674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057926
103	NC_013161	GCC	2	6	7851	7856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057926
104	NC_013161	GTG	2	6	7889	7894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057926
105	NC_013161	GTT	2	6	7951	7956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057926
106	NC_013161	CTG	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057926
107	NC_013161	GGT	2	6	8027	8032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057926
108	NC_013161	GAG	2	6	8075	8080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057926
109	NC_013161	TCC	2	6	8096	8101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057926
110	NC_013161	CGA	2	6	8122	8127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057926
111	NC_013161	TCG	2	6	8139	8144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057926
112	NC_013161	TTC	2	6	8204	8209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057926
113	NC_013161	TGA	2	6	8302	8307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057926
114	NC_013161	CGG	2	6	8409	8414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057926
115	NC_013161	TTC	2	6	8417	8422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057926
116	NC_013161	CTT	2	6	8452	8457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057926
117	NC_013161	AAC	2	6	8599	8604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057926
118	NC_013161	TCT	2	6	8622	8627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057926
119	NC_013161	TGT	2	6	8784	8789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057926
120	NC_013161	TTG	2	6	9121	9126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057927
121	NC_013161	TCC	2	6	9163	9168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057927
122	NC_013161	GGC	2	6	9181	9186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057927
123	NC_013161	TCT	2	6	9212	9217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057927
124	NC_013161	CTA	2	6	9225	9230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057927
125	NC_013161	TTC	2	6	9232	9237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057927
126	NC_013161	TTG	2	6	9395	9400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057927
127	NC_013161	TTC	2	6	9421	9426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057927
128	NC_013161	TCT	2	6	9431	9436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057927
129	NC_013161	TTG	2	6	9466	9471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057927
130	NC_013161	AGG	2	6	9473	9478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057927
131	NC_013161	TTC	2	6	9496	9501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057927
132	NC_013161	ATC	2	6	9517	9522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013161	TGA	2	6	9531	9536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013161	CTA	2	6	9546	9551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013161	ATA	2	6	9689	9694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057928
136	NC_013161	ACG	3	9	9722	9730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057928
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139	NC_013161	GGT	2	6	9901	9906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057928
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145	NC_013161	TAA	2	6	10422	10427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013161	GAT	2	6	10440	10445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013161	TCA	2	6	10466	10471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_013161	TGT	2	6	10521	10526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013161	AAT	2	6	10536	10541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013161	TTA	2	6	10548	10553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013161	TAT	2	6	10574	10579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057929
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157	NC_013161	ATT	2	6	10995	11000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057929
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261	NC_013161	CAA	2	6	18895	18900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057938
262	NC_013161	AAC	2	6	18985	18990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057938
263	NC_013161	AAG	2	6	19088	19093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057938
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265	NC_013161	TTA	2	6	19195	19200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057938
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269	NC_013161	CAA	2	6	19558	19563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057938
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283	NC_013161	TTA	2	6	20680	20685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057939
284	NC_013161	AAT	2	6	20751	20756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057939
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289	NC_013161	AAT	2	6	20984	20989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057939
290	NC_013161	AAT	2	6	21028	21033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057939
291	NC_013161	TGT	2	6	21088	21093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057940
292	NC_013161	AGA	2	6	21115	21120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057940
293	NC_013161	TTC	2	6	21144	21149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057940
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