MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013160	TAAAAA	2	12	652	663	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013160	ACTCAA	2	12	956	967	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	256818685
3	NC_013160	TTTTCA	2	12	1124	1135	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256818685
4	NC_013160	CGAGAT	2	12	4773	4784	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256818689
5	NC_013160	CTTTTT	2	12	5772	5783	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013160	TTCAAT	2	12	8276	8287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013160	GGACAA	2	12	8710	8721	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013160	AGGCAA	2	12	11650	11661	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	256818694
9	NC_013160	TTTGCC	2	12	12797	12808	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	256818695
10	NC_013160	ATCTTA	2	12	13686	13697	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013160	CTAAAG	2	12	16045	16056	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256818697
12	NC_013160	TTTGCC	2	12	16860	16871	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	256818697
13	NC_013160	TGGAAG	2	12	19176	19187	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	256818698
14	NC_013160	CGATAG	2	12	20347	20358	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256818699
15	NC_013160	TTTAGT	2	12	26952	26963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	256818702
16	NC_013160	CTTTTT	2	12	30221	30232	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013160	GAGATC	2	12	31217	31228	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256818706
18	NC_013160	GGTCAT	2	12	32665	32676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256818707
19	NC_013160	CTAAAG	2	12	46601	46612	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013160	GATTAA	2	12	50942	50953	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256818724
21	NC_013160	ATTAGA	2	12	52360	52371	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256818725
22	NC_013160	CTTTTT	2	12	54355	54366	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	256818726
23	NC_013160	ATAAGC	2	12	55924	55935	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256818728
24	NC_013160	CTGAAG	2	12	56596	56607	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256818728
25	NC_013160	TTTTTG	2	12	57361	57372	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	256818728
26	NC_013160	CCTGAC	2	12	62566	62577	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256818732
27	NC_013160	TGGGTT	2	12	64912	64923	0 %	50 %	50 %	0 %	256818734
28	NC_013160	AAATGA	2	12	67446	67457	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256818737
29	NC_013160	CGAATA	2	12	67626	67637	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256818737
30	NC_013160	GGGAAA	2	12	69912	69923	50 %	0 %	50 %	0 %	256818738

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.