MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013160	CTGAT	2	10	2471	2480	20 %	40 %	20 %	20 %	256818687
2	NC_013160	TGCTT	2	10	2521	2530	0 %	60 %	20 %	20 %	256818687
3	NC_013160	GGAGC	2	10	3939	3948	20 %	0 %	60 %	20 %	256818688
4	NC_013160	GACAG	2	10	4017	4026	40 %	0 %	40 %	20 %	256818688
5	NC_013160	GAACA	2	10	7504	7513	60 %	0 %	20 %	20 %	256818691
6	NC_013160	TTTGA	2	10	9166	9175	20 %	60 %	20 %	0 %	256818692
7	NC_013160	TCTTT	2	10	9925	9934	0 %	80 %	0 %	20 %	256818693
8	NC_013160	AGAGA	2	10	19123	19132	60 %	0 %	40 %	0 %	256818698
9	NC_013160	TTTTC	2	10	22878	22887	0 %	80 %	0 %	20 %	256818700
10	NC_013160	TTTAT	2	10	31811	31820	20 %	80 %	0 %	0 %	256818707
11	NC_013160	TCCTG	2	10	32156	32165	0 %	40 %	20 %	40 %	256818707
12	NC_013160	CCAGG	2	10	32386	32395	20 %	0 %	40 %	40 %	256818707
13	NC_013160	TTCGG	2	10	33079	33088	0 %	40 %	40 %	20 %	256818708
14	NC_013160	ACTGT	2	10	33433	33442	20 %	40 %	20 %	20 %	256818708
15	NC_013160	GTAGC	2	10	33765	33774	20 %	20 %	40 %	20 %	256818708
16	NC_013160	ATTAT	2	10	35888	35897	40 %	60 %	0 %	0 %	256818709
17	NC_013160	TAAAA	2	10	36007	36016	80 %	20 %	0 %	0 %	256818709
18	NC_013160	AATTT	2	10	47918	47927	40 %	60 %	0 %	0 %	256818721
19	NC_013160	GTCAG	2	10	50668	50677	20 %	20 %	40 %	20 %	256818724
20	NC_013160	CCCTC	2	10	52048	52057	0 %	20 %	0 %	80 %	256818725
21	NC_013160	AATTT	2	10	53408	53417	40 %	60 %	0 %	0 %	256818725
22	NC_013160	CTAAC	2	10	57258	57267	40 %	20 %	0 %	40 %	256818728
23	NC_013160	TTCTT	2	10	57566	57575	0 %	80 %	0 %	20 %	256818728
24	NC_013160	TGACC	2	10	70258	70267	20 %	20 %	20 %	40 %	256818738
25	NC_013160	TCCCA	2	10	72004	72013	20 %	20 %	0 %	60 %	256818738
26	NC_013160	AAAAC	2	10	73875	73884	80 %	0 %	0 %	20 %	256818739

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.