MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013160	AAAG	2	8	273	280	75 %	0 %	25 %	0 %	256818683
2	NC_013160	TAAA	2	8	533	540	75 %	25 %	0 %	0 %	256818684
3	NC_013160	AAAT	2	8	2512	2519	75 %	25 %	0 %	0 %	256818687
4	NC_013160	TTAT	2	8	2715	2722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013160	AAAC	2	8	3164	3171	75 %	0 %	0 %	25 %	256818688
6	NC_013160	GGAG	2	8	3264	3271	25 %	0 %	75 %	0 %	256818688
7	NC_013160	CCCA	2	8	3340	3347	25 %	0 %	0 %	75 %	256818688
8	NC_013160	TCAG	2	8	3391	3398	25 %	25 %	25 %	25 %	256818688
9	NC_013160	TGAA	2	8	3593	3600	50 %	25 %	25 %	0 %	256818688
10	NC_013160	GATT	2	8	4152	4159	25 %	50 %	25 %	0 %	256818688
11	NC_013160	TTGT	2	8	4308	4315	0 %	75 %	25 %	0 %	256818689
12	NC_013160	CAGA	2	8	4499	4506	50 %	0 %	25 %	25 %	256818689
13	NC_013160	CAAG	2	8	4595	4602	50 %	0 %	25 %	25 %	256818689
14	NC_013160	CTGC	2	8	4797	4804	0 %	25 %	25 %	50 %	256818689
15	NC_013160	CTGT	2	8	4864	4871	0 %	50 %	25 %	25 %	256818689
16	NC_013160	AGCC	2	8	4934	4941	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013160	AAAT	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013160	TTCT	2	8	5343	5350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013160	TTCG	2	8	5531	5538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013160	GACT	2	8	5677	5684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013160	GGAG	2	8	5933	5940	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013160	ATTT	2	8	6292	6299	25 %	75 %	0 %	0 %	256818690
23	NC_013160	AACC	2	8	7002	7009	50 %	0 %	0 %	50 %	256818691
24	NC_013160	GTCG	2	8	7436	7443	0 %	25 %	50 %	25 %	256818691
25	NC_013160	GCTT	2	8	7480	7487	0 %	50 %	25 %	25 %	256818691
26	NC_013160	ACCC	2	8	7988	7995	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_013160	TTTG	2	8	8215	8222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013160	GATT	2	8	8410	8417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013160	TAAT	2	8	8420	8427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013160	GATA	2	8	8656	8663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013160	ATCA	2	8	8695	8702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013160	GCAG	2	8	8804	8811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013160	TCTT	2	8	9031	9038	0 %	75 %	0 %	25 %	256818692
34	NC_013160	CAAT	2	8	9423	9430	50 %	25 %	0 %	25 %	256818692
35	NC_013160	CAAT	2	8	9747	9754	50 %	25 %	0 %	25 %	256818692
36	NC_013160	TGTT	2	8	9793	9800	0 %	75 %	25 %	0 %	256818692
37	NC_013160	TATT	2	8	9913	9920	25 %	75 %	0 %	0 %	256818693
38	NC_013160	TGGC	2	8	10162	10169	0 %	25 %	50 %	25 %	256818693
39	NC_013160	CTGA	2	8	10339	10346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013160	CATT	2	8	10855	10862	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013160	GACG	2	8	11380	11387	25 %	0 %	50 %	25 %	256818694
42	NC_013160	TTCT	2	8	11738	11745	0 %	75 %	0 %	25 %	256818694
43	NC_013160	AATT	2	8	11786	11793	50 %	50 %	0 %	0 %	256818694
44	NC_013160	AACT	2	8	11881	11888	50 %	25 %	0 %	25 %	256818694
45	NC_013160	AGAA	2	8	12178	12185	75 %	0 %	25 %	0 %	256818694
46	NC_013160	ATAA	2	8	12233	12240	75 %	25 %	0 %	0 %	256818694
47	NC_013160	TTTC	2	8	12559	12566	0 %	75 %	0 %	25 %	256818694
48	NC_013160	TAAA	2	8	12650	12657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013160	AGAA	2	8	12714	12721	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013160	CGTC	2	8	13073	13080	0 %	25 %	25 %	50 %	256818695
51	NC_013160	AATC	2	8	13603	13610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013160	CCAA	2	8	14900	14907	50 %	0 %	0 %	50 %	256818696
53	NC_013160	ATCA	2	8	15098	15105	50 %	25 %	0 %	25 %	256818696
54	NC_013160	TTTA	2	8	15865	15872	25 %	75 %	0 %	0 %	256818697
55	NC_013160	GAAA	2	8	15956	15963	75 %	0 %	25 %	0 %	256818697
56	NC_013160	TTAT	2	8	16282	16289	25 %	75 %	0 %	0 %	256818697
57	NC_013160	AGTT	2	8	16634	16641	25 %	50 %	25 %	0 %	256818697
58	NC_013160	AATT	2	8	16729	16736	50 %	50 %	0 %	0 %	256818697
59	NC_013160	AGAA	2	8	16777	16784	75 %	0 %	25 %	0 %	256818697
60	NC_013160	CGTC	2	8	17135	17142	0 %	25 %	25 %	50 %	256818697
61	NC_013160	CTTT	2	8	17604	17611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013160	AACC	2	8	18379	18386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013160	AGTT	2	8	18478	18485	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013160	TGAA	2	8	18790	18797	50 %	25 %	25 %	0 %	256818698
65	NC_013160	CAGA	2	8	19017	19024	50 %	0 %	25 %	25 %	256818698
66	NC_013160	GAAA	2	8	19114	19121	75 %	0 %	25 %	0 %	256818698
67	NC_013160	AGCC	2	8	19821	19828	25 %	0 %	25 %	50 %	256818699
68	NC_013160	CATC	2	8	21411	21418	25 %	25 %	0 %	50 %	256818700
69	NC_013160	CCAT	2	8	21453	21460	25 %	25 %	0 %	50 %	256818700
70	NC_013160	GGAT	2	8	21503	21510	25 %	25 %	50 %	0 %	256818700
71	NC_013160	GTTG	2	8	21664	21671	0 %	50 %	50 %	0 %	256818700
72	NC_013160	TTCG	2	8	21831	21838	0 %	50 %	25 %	25 %	256818700
73	NC_013160	GGTT	2	8	21886	21893	0 %	50 %	50 %	0 %	256818700
74	NC_013160	GACG	2	8	22705	22712	25 %	0 %	50 %	25 %	256818700
75	NC_013160	GGCT	2	8	23002	23009	0 %	25 %	50 %	25 %	256818700
76	NC_013160	ACTG	2	8	23041	23048	25 %	25 %	25 %	25 %	256818700
77	NC_013160	GTGG	2	8	23189	23196	0 %	25 %	75 %	0 %	256818700
78	NC_013160	TGTC	2	8	23896	23903	0 %	50 %	25 %	25 %	256818700
79	NC_013160	TTCA	2	8	24293	24300	25 %	50 %	0 %	25 %	256818700
80	NC_013160	TCAA	2	8	24306	24313	50 %	25 %	0 %	25 %	256818700
81	NC_013160	GATA	2	8	24426	24433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013160	TATC	2	8	24436	24443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013160	AATT	2	8	24630	24637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013160	TGGG	2	8	25050	25057	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013160	AAGC	2	8	25379	25386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013160	ATTA	2	8	25443	25450	50 %	50 %	0 %	0 %	256818701
87	NC_013160	TAAG	2	8	25493	25500	50 %	25 %	25 %	0 %	256818701
88	NC_013160	AGTA	2	8	25586	25593	50 %	25 %	25 %	0 %	256818701
89	NC_013160	GTTT	2	8	25693	25700	0 %	75 %	25 %	0 %	256818701
90	NC_013160	CACT	2	8	26273	26280	25 %	25 %	0 %	50 %	256818701
91	NC_013160	TAAT	2	8	26490	26497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013160	CCAG	2	8	26573	26580	25 %	0 %	25 %	50 %	256818702
93	NC_013160	CAAA	2	8	26715	26722	75 %	0 %	0 %	25 %	256818702
94	NC_013160	ATTC	2	8	27053	27060	25 %	50 %	0 %	25 %	256818702
95	NC_013160	TCTA	2	8	27315	27322	25 %	50 %	0 %	25 %	256818702
96	NC_013160	GCTT	2	8	27894	27901	0 %	50 %	25 %	25 %	256818704
97	NC_013160	TTTG	2	8	29042	29049	0 %	75 %	25 %	0 %	256818705
98	NC_013160	CTTT	2	8	29214	29221	0 %	75 %	0 %	25 %	256818705
99	NC_013160	CTTC	2	8	29258	29265	0 %	50 %	0 %	50 %	256818705
100	NC_013160	CTTT	2	8	29395	29402	0 %	75 %	0 %	25 %	256818705
101	NC_013160	GTAT	2	8	29488	29495	25 %	50 %	25 %	0 %	256818705
102	NC_013160	TCTG	2	8	29543	29550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013160	TTCT	2	8	29792	29799	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013160	TTCG	2	8	29980	29987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013160	GACT	2	8	30126	30133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013160	GGAG	2	8	30382	30389	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013160	CGCC	2	8	31267	31274	0 %	0 %	25 %	75 %	256818706
108	NC_013160	TCAC	2	8	31419	31426	25 %	25 %	0 %	50 %	256818706
109	NC_013160	TTGA	2	8	31592	31599	25 %	50 %	25 %	0 %	256818706
110	NC_013160	GCCA	2	8	31648	31655	25 %	0 %	25 %	50 %	256818706
111	NC_013160	TAGA	2	8	31682	31689	50 %	25 %	25 %	0 %	256818706
112	NC_013160	TTAA	2	8	32018	32025	50 %	50 %	0 %	0 %	256818707
113	NC_013160	ACAG	2	8	32180	32187	50 %	0 %	25 %	25 %	256818707
114	NC_013160	GACA	2	8	32816	32823	50 %	0 %	25 %	25 %	256818707
115	NC_013160	TCAA	2	8	33071	33078	50 %	25 %	0 %	25 %	256818708
116	NC_013160	GGAG	2	8	33502	33509	25 %	0 %	75 %	0 %	256818708
117	NC_013160	CAAA	2	8	33993	34000	75 %	0 %	0 %	25 %	256818708
118	NC_013160	GTTG	2	8	34587	34594	0 %	50 %	50 %	0 %	256818708
119	NC_013160	GAAA	2	8	35807	35814	75 %	0 %	25 %	0 %	256818709
120	NC_013160	TTGA	2	8	35869	35876	25 %	50 %	25 %	0 %	256818709
121	NC_013160	ATCA	2	8	36031	36038	50 %	25 %	0 %	25 %	256818709
122	NC_013160	CTTG	2	8	36163	36170	0 %	50 %	25 %	25 %	256818709
123	NC_013160	TCAA	2	8	36239	36246	50 %	25 %	0 %	25 %	256818709
124	NC_013160	TGAT	2	8	36473	36480	25 %	50 %	25 %	0 %	256818709
125	NC_013160	ATCC	2	8	36813	36820	25 %	25 %	0 %	50 %	256818710
126	NC_013160	TATT	2	8	37139	37146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013160	TAAT	2	8	37282	37289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013160	ACTG	2	8	37443	37450	25 %	25 %	25 %	25 %	256818711
129	NC_013160	CAAA	2	8	38089	38096	75 %	0 %	0 %	25 %	256818712
130	NC_013160	TTCC	2	8	38269	38276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013160	AATT	2	8	39680	39687	50 %	50 %	0 %	0 %	256818715
132	NC_013160	CGTT	2	8	39849	39856	0 %	50 %	25 %	25 %	256818715
133	NC_013160	TCAA	2	8	40066	40073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013160	TTAA	2	8	40083	40090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013160	GTTT	2	8	40610	40617	0 %	75 %	25 %	0 %	256818717
136	NC_013160	GCAA	2	8	40836	40843	50 %	0 %	25 %	25 %	256818717
137	NC_013160	TAAT	2	8	41541	41548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013160	ATTT	2	8	43079	43086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013160	CAGA	2	8	43155	43162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013160	ATAC	2	8	43210	43217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013160	AAAG	2	8	43303	43310	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013160	GAAG	2	8	43440	43447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013160	CAAA	2	8	43711	43718	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013160	TTAA	2	8	44402	44409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013160	ATCA	2	8	44528	44535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013160	AAAT	2	8	44564	44571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.