MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013160	TTAT	2	8	2715	2722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013160	AGCC	2	8	4934	4941	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013160	AAAT	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013160	TTCT	2	8	5343	5350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013160	TTCG	2	8	5531	5538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013160	GACT	2	8	5677	5684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013160	GGAG	2	8	5933	5940	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013160	ACCC	2	8	7988	7995	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_013160	TTTG	2	8	8215	8222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013160	GATT	2	8	8410	8417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013160	TAAT	2	8	8420	8427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013160	GATA	2	8	8656	8663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013160	ATCA	2	8	8695	8702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013160	GCAG	2	8	8804	8811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013160	CTGA	2	8	10339	10346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013160	CATT	2	8	10855	10862	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013160	TAAA	2	8	12650	12657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013160	AGAA	2	8	12714	12721	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013160	AATC	2	8	13603	13610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013160	CTTT	2	8	17604	17611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013160	AACC	2	8	18379	18386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013160	AGTT	2	8	18478	18485	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013160	GATA	2	8	24426	24433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013160	TATC	2	8	24436	24443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013160	AATT	2	8	24630	24637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013160	TGGG	2	8	25050	25057	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013160	AAGC	2	8	25379	25386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013160	TAAT	2	8	26490	26497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013160	TCTG	2	8	29543	29550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013160	TTCT	2	8	29792	29799	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013160	TTCG	2	8	29980	29987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013160	GACT	2	8	30126	30133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013160	GGAG	2	8	30382	30389	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013160	TATT	2	8	37139	37146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013160	TAAT	2	8	37282	37289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013160	TTCC	2	8	38269	38276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013160	TCAA	2	8	40066	40073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013160	TTAA	2	8	40083	40090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013160	TAAT	2	8	41541	41548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013160	ATTT	2	8	43079	43086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013160	CAGA	2	8	43155	43162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013160	ATAC	2	8	43210	43217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013160	AAAG	2	8	43303	43310	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013160	GAAG	2	8	43440	43447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013160	CAAA	2	8	43711	43718	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013160	TTAA	2	8	44402	44409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013160	ATCA	2	8	44528	44535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013160	AAAT	2	8	44564	44571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013160	TGGT	2	8	44707	44714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013160	GCTA	2	8	44898	44905	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013160	CAAT	2	8	44977	44984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013160	GGCG	2	8	49530	49537	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013160	TAAG	2	8	49577	49584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013160	TTTG	2	8	49601	49608	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013160	ATTA	2	8	51264	51271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013160	TAAT	2	8	51273	51280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013160	CTTA	2	8	66086	66093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013160	TAAG	2	8	66615	66622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013160	ATGA	2	8	68515	68522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013160	ATCT	2	8	68593	68600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013160	GATT	2	8	68663	68670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013160	TGTT	2	8	68900	68907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013160	TGAA	2	8	69071	69078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013160	TCTA	2	8	69214	69221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013160	GATA	2	8	69416	69423	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013160	AAAG	2	8	75107	75114	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013160	AATT	2	8	75207	75214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013160	AGTG	2	8	75410	75417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013160	TTTA	2	8	75419	75426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013160	ATTT	2	8	75492	75499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.