MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013160	AAAG	2	8	273	280	75 %	0 %	25 %	0 %	256818683
2	NC_013160	TAAA	2	8	533	540	75 %	25 %	0 %	0 %	256818684
3	NC_013160	AAAT	2	8	2512	2519	75 %	25 %	0 %	0 %	256818687
4	NC_013160	AAAC	2	8	3164	3171	75 %	0 %	0 %	25 %	256818688
5	NC_013160	GGAG	2	8	3264	3271	25 %	0 %	75 %	0 %	256818688
6	NC_013160	CCCA	2	8	3340	3347	25 %	0 %	0 %	75 %	256818688
7	NC_013160	TCAG	2	8	3391	3398	25 %	25 %	25 %	25 %	256818688
8	NC_013160	TGAA	2	8	3593	3600	50 %	25 %	25 %	0 %	256818688
9	NC_013160	GATT	2	8	4152	4159	25 %	50 %	25 %	0 %	256818688
10	NC_013160	TTGT	2	8	4308	4315	0 %	75 %	25 %	0 %	256818689
11	NC_013160	CAGA	2	8	4499	4506	50 %	0 %	25 %	25 %	256818689
12	NC_013160	CAAG	2	8	4595	4602	50 %	0 %	25 %	25 %	256818689
13	NC_013160	CTGC	2	8	4797	4804	0 %	25 %	25 %	50 %	256818689
14	NC_013160	CTGT	2	8	4864	4871	0 %	50 %	25 %	25 %	256818689
15	NC_013160	ATTT	2	8	6292	6299	25 %	75 %	0 %	0 %	256818690
16	NC_013160	AACC	2	8	7002	7009	50 %	0 %	0 %	50 %	256818691
17	NC_013160	GTCG	2	8	7436	7443	0 %	25 %	50 %	25 %	256818691
18	NC_013160	GCTT	2	8	7480	7487	0 %	50 %	25 %	25 %	256818691
19	NC_013160	TCTT	2	8	9031	9038	0 %	75 %	0 %	25 %	256818692
20	NC_013160	CAAT	2	8	9423	9430	50 %	25 %	0 %	25 %	256818692
21	NC_013160	CAAT	2	8	9747	9754	50 %	25 %	0 %	25 %	256818692
22	NC_013160	TGTT	2	8	9793	9800	0 %	75 %	25 %	0 %	256818692
23	NC_013160	TATT	2	8	9913	9920	25 %	75 %	0 %	0 %	256818693
24	NC_013160	TGGC	2	8	10162	10169	0 %	25 %	50 %	25 %	256818693
25	NC_013160	GACG	2	8	11380	11387	25 %	0 %	50 %	25 %	256818694
26	NC_013160	TTCT	2	8	11738	11745	0 %	75 %	0 %	25 %	256818694
27	NC_013160	AATT	2	8	11786	11793	50 %	50 %	0 %	0 %	256818694
28	NC_013160	AACT	2	8	11881	11888	50 %	25 %	0 %	25 %	256818694
29	NC_013160	AGAA	2	8	12178	12185	75 %	0 %	25 %	0 %	256818694
30	NC_013160	ATAA	2	8	12233	12240	75 %	25 %	0 %	0 %	256818694
31	NC_013160	TTTC	2	8	12559	12566	0 %	75 %	0 %	25 %	256818694
32	NC_013160	CGTC	2	8	13073	13080	0 %	25 %	25 %	50 %	256818695
33	NC_013160	CCAA	2	8	14900	14907	50 %	0 %	0 %	50 %	256818696
34	NC_013160	ATCA	2	8	15098	15105	50 %	25 %	0 %	25 %	256818696
35	NC_013160	TTTA	2	8	15865	15872	25 %	75 %	0 %	0 %	256818697
36	NC_013160	GAAA	2	8	15956	15963	75 %	0 %	25 %	0 %	256818697
37	NC_013160	TTAT	2	8	16282	16289	25 %	75 %	0 %	0 %	256818697
38	NC_013160	AGTT	2	8	16634	16641	25 %	50 %	25 %	0 %	256818697
39	NC_013160	AATT	2	8	16729	16736	50 %	50 %	0 %	0 %	256818697
40	NC_013160	AGAA	2	8	16777	16784	75 %	0 %	25 %	0 %	256818697
41	NC_013160	CGTC	2	8	17135	17142	0 %	25 %	25 %	50 %	256818697
42	NC_013160	TGAA	2	8	18790	18797	50 %	25 %	25 %	0 %	256818698
43	NC_013160	CAGA	2	8	19017	19024	50 %	0 %	25 %	25 %	256818698
44	NC_013160	GAAA	2	8	19114	19121	75 %	0 %	25 %	0 %	256818698
45	NC_013160	AGCC	2	8	19821	19828	25 %	0 %	25 %	50 %	256818699
46	NC_013160	CATC	2	8	21411	21418	25 %	25 %	0 %	50 %	256818700
47	NC_013160	CCAT	2	8	21453	21460	25 %	25 %	0 %	50 %	256818700
48	NC_013160	GGAT	2	8	21503	21510	25 %	25 %	50 %	0 %	256818700
49	NC_013160	GTTG	2	8	21664	21671	0 %	50 %	50 %	0 %	256818700
50	NC_013160	TTCG	2	8	21831	21838	0 %	50 %	25 %	25 %	256818700
51	NC_013160	GGTT	2	8	21886	21893	0 %	50 %	50 %	0 %	256818700
52	NC_013160	GACG	2	8	22705	22712	25 %	0 %	50 %	25 %	256818700
53	NC_013160	GGCT	2	8	23002	23009	0 %	25 %	50 %	25 %	256818700
54	NC_013160	ACTG	2	8	23041	23048	25 %	25 %	25 %	25 %	256818700
55	NC_013160	GTGG	2	8	23189	23196	0 %	25 %	75 %	0 %	256818700
56	NC_013160	TGTC	2	8	23896	23903	0 %	50 %	25 %	25 %	256818700
57	NC_013160	TTCA	2	8	24293	24300	25 %	50 %	0 %	25 %	256818700
58	NC_013160	TCAA	2	8	24306	24313	50 %	25 %	0 %	25 %	256818700
59	NC_013160	ATTA	2	8	25443	25450	50 %	50 %	0 %	0 %	256818701
60	NC_013160	TAAG	2	8	25493	25500	50 %	25 %	25 %	0 %	256818701
61	NC_013160	AGTA	2	8	25586	25593	50 %	25 %	25 %	0 %	256818701
62	NC_013160	GTTT	2	8	25693	25700	0 %	75 %	25 %	0 %	256818701
63	NC_013160	CACT	2	8	26273	26280	25 %	25 %	0 %	50 %	256818701
64	NC_013160	CCAG	2	8	26573	26580	25 %	0 %	25 %	50 %	256818702
65	NC_013160	CAAA	2	8	26715	26722	75 %	0 %	0 %	25 %	256818702
66	NC_013160	ATTC	2	8	27053	27060	25 %	50 %	0 %	25 %	256818702
67	NC_013160	TCTA	2	8	27315	27322	25 %	50 %	0 %	25 %	256818702
68	NC_013160	GCTT	2	8	27894	27901	0 %	50 %	25 %	25 %	256818704
69	NC_013160	TTTG	2	8	29042	29049	0 %	75 %	25 %	0 %	256818705
70	NC_013160	CTTT	2	8	29214	29221	0 %	75 %	0 %	25 %	256818705
71	NC_013160	CTTC	2	8	29258	29265	0 %	50 %	0 %	50 %	256818705
72	NC_013160	CTTT	2	8	29395	29402	0 %	75 %	0 %	25 %	256818705
73	NC_013160	GTAT	2	8	29488	29495	25 %	50 %	25 %	0 %	256818705
74	NC_013160	CGCC	2	8	31267	31274	0 %	0 %	25 %	75 %	256818706
75	NC_013160	TCAC	2	8	31419	31426	25 %	25 %	0 %	50 %	256818706
76	NC_013160	TTGA	2	8	31592	31599	25 %	50 %	25 %	0 %	256818706
77	NC_013160	GCCA	2	8	31648	31655	25 %	0 %	25 %	50 %	256818706
78	NC_013160	TAGA	2	8	31682	31689	50 %	25 %	25 %	0 %	256818706
79	NC_013160	TTAA	2	8	32018	32025	50 %	50 %	0 %	0 %	256818707
80	NC_013160	ACAG	2	8	32180	32187	50 %	0 %	25 %	25 %	256818707
81	NC_013160	GACA	2	8	32816	32823	50 %	0 %	25 %	25 %	256818707
82	NC_013160	TCAA	2	8	33071	33078	50 %	25 %	0 %	25 %	256818708
83	NC_013160	GGAG	2	8	33502	33509	25 %	0 %	75 %	0 %	256818708
84	NC_013160	CAAA	2	8	33993	34000	75 %	0 %	0 %	25 %	256818708
85	NC_013160	GTTG	2	8	34587	34594	0 %	50 %	50 %	0 %	256818708
86	NC_013160	GAAA	2	8	35807	35814	75 %	0 %	25 %	0 %	256818709
87	NC_013160	TTGA	2	8	35869	35876	25 %	50 %	25 %	0 %	256818709
88	NC_013160	ATCA	2	8	36031	36038	50 %	25 %	0 %	25 %	256818709
89	NC_013160	CTTG	2	8	36163	36170	0 %	50 %	25 %	25 %	256818709
90	NC_013160	TCAA	2	8	36239	36246	50 %	25 %	0 %	25 %	256818709
91	NC_013160	TGAT	2	8	36473	36480	25 %	50 %	25 %	0 %	256818709
92	NC_013160	ATCC	2	8	36813	36820	25 %	25 %	0 %	50 %	256818710
93	NC_013160	ACTG	2	8	37443	37450	25 %	25 %	25 %	25 %	256818711
94	NC_013160	CAAA	2	8	38089	38096	75 %	0 %	0 %	25 %	256818712
95	NC_013160	AATT	2	8	39680	39687	50 %	50 %	0 %	0 %	256818715
96	NC_013160	CGTT	2	8	39849	39856	0 %	50 %	25 %	25 %	256818715
97	NC_013160	GTTT	2	8	40610	40617	0 %	75 %	25 %	0 %	256818717
98	NC_013160	GCAA	2	8	40836	40843	50 %	0 %	25 %	25 %	256818717
99	NC_013160	AATT	2	8	46109	46116	50 %	50 %	0 %	0 %	256818720
100	NC_013160	TAAC	2	8	46251	46258	50 %	25 %	0 %	25 %	256818720
101	NC_013160	CTAT	2	8	46959	46966	25 %	50 %	0 %	25 %	256818721
102	NC_013160	ATTG	2	8	47105	47112	25 %	50 %	25 %	0 %	256818721
103	NC_013160	CTTT	2	8	47123	47130	0 %	75 %	0 %	25 %	256818721
104	NC_013160	GAAC	2	8	47471	47478	50 %	0 %	25 %	25 %	256818721
105	NC_013160	TCAA	2	8	47520	47527	50 %	25 %	0 %	25 %	256818721
106	NC_013160	CCTC	2	8	47657	47664	0 %	25 %	0 %	75 %	256818721
107	NC_013160	CCAT	2	8	47673	47680	25 %	25 %	0 %	50 %	256818721
108	NC_013160	TGGG	2	8	47729	47736	0 %	25 %	75 %	0 %	256818721
109	NC_013160	AATT	2	8	47952	47959	50 %	50 %	0 %	0 %	256818721
110	NC_013160	ATTG	2	8	48029	48036	25 %	50 %	25 %	0 %	256818721
111	NC_013160	TCAA	2	8	48553	48560	50 %	25 %	0 %	25 %	256818722
112	NC_013160	TCCA	2	8	48779	48786	25 %	25 %	0 %	50 %	256818722
113	NC_013160	TATT	2	8	50695	50702	25 %	75 %	0 %	0 %	256818724
114	NC_013160	ACTA	2	8	51162	51169	50 %	25 %	0 %	25 %	256818724
115	NC_013160	TCTT	2	8	51385	51392	0 %	75 %	0 %	25 %	256818725
116	NC_013160	GATT	2	8	51400	51407	25 %	50 %	25 %	0 %	256818725
117	NC_013160	TCAT	2	8	51695	51702	25 %	50 %	0 %	25 %	256818725
118	NC_013160	CAAC	2	8	52115	52122	50 %	0 %	0 %	50 %	256818725
119	NC_013160	TGTT	2	8	52194	52201	0 %	75 %	25 %	0 %	256818725
120	NC_013160	CATT	2	8	52376	52383	25 %	50 %	0 %	25 %	256818725
121	NC_013160	ATCA	2	8	52546	52553	50 %	25 %	0 %	25 %	256818725
122	NC_013160	ATCA	2	8	52906	52913	50 %	25 %	0 %	25 %	256818725
123	NC_013160	ATTA	2	8	53137	53144	50 %	50 %	0 %	0 %	256818725
124	NC_013160	TAAA	2	8	53643	53650	75 %	25 %	0 %	0 %	256818725
125	NC_013160	ATTA	2	8	53671	53678	50 %	50 %	0 %	0 %	256818725
126	NC_013160	GATG	2	8	54339	54346	25 %	25 %	50 %	0 %	256818726
127	NC_013160	TATC	2	8	55095	55102	25 %	50 %	0 %	25 %	256818727
128	NC_013160	TTGA	2	8	55307	55314	25 %	50 %	25 %	0 %	256818727
129	NC_013160	TAAA	2	8	55661	55668	75 %	25 %	0 %	0 %	256818727
130	NC_013160	ATAA	2	8	56044	56051	75 %	25 %	0 %	0 %	256818728
131	NC_013160	CTTG	2	8	56078	56085	0 %	50 %	25 %	25 %	256818728
132	NC_013160	AATT	2	8	56560	56567	50 %	50 %	0 %	0 %	256818728
133	NC_013160	AAAT	2	8	56749	56756	75 %	25 %	0 %	0 %	256818728
134	NC_013160	AATT	2	8	57174	57181	50 %	50 %	0 %	0 %	256818728
135	NC_013160	AATG	2	8	57808	57815	50 %	25 %	25 %	0 %	256818728
136	NC_013160	CTTG	2	8	58031	58038	0 %	50 %	25 %	25 %	256818728
137	NC_013160	CTAA	2	8	58181	58188	50 %	25 %	0 %	25 %	256818728
138	NC_013160	AGAA	2	8	58522	58529	75 %	0 %	25 %	0 %	256818729
139	NC_013160	GTTG	2	8	59291	59298	0 %	50 %	50 %	0 %	256818730
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141	NC_013160	AGAT	2	8	59425	59432	50 %	25 %	25 %	0 %	256818730
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.