MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013160	GAA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818683
2	NC_013160	GAA	2	6	159	164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818683
3	NC_013160	CGT	2	6	212	217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818683
4	NC_013160	TAT	2	6	245	250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818683
5	NC_013160	TAT	2	6	288	293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818683
6	NC_013160	TTG	2	6	401	406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818684
7	NC_013160	TGA	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818684
8	NC_013160	ATT	2	6	596	601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013160	TAG	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013160	ATT	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013160	AGA	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013160	ACC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818685
13	NC_013160	CCA	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818685
14	NC_013160	TCG	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818685
15	NC_013160	ATA	2	6	1308	1313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818685
16	NC_013160	ATT	2	6	1380	1385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013160	TAC	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818686
18	NC_013160	GTT	2	6	1503	1508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818686
19	NC_013160	GCA	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818686
20	NC_013160	ACA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818686
21	NC_013160	CAT	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818686
22	NC_013160	TCG	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818686
23	NC_013160	TGC	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818686
24	NC_013160	ACT	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818687
25	NC_013160	AAC	2	6	2073	2078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818687
26	NC_013160	TAA	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818687
27	NC_013160	GAC	2	6	2211	2216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818687
28	NC_013160	GGT	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818687
29	NC_013160	TCA	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818687
30	NC_013160	AGC	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818687
31	NC_013160	ACT	2	6	2934	2939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013160	TGG	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818688
33	NC_013160	CCA	2	6	3193	3198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818688
34	NC_013160	GTT	2	6	3322	3327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818688
35	NC_013160	GAC	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818688
36	NC_013160	AAT	2	6	3739	3744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818688
37	NC_013160	TCA	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818688
38	NC_013160	ATT	2	6	4043	4048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818688
39	NC_013160	GTC	2	6	4108	4113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818688
40	NC_013160	CTT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818688
41	NC_013160	CTG	2	6	4302	4307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818689
42	NC_013160	TGT	2	6	4322	4327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818689
43	NC_013160	AAT	2	6	4437	4442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818689
44	NC_013160	AGC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818689
45	NC_013160	CAA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818689
46	NC_013160	AAC	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818689
47	NC_013160	GCG	2	6	4658	4663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256818689
48	NC_013160	GCT	2	6	4677	4682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818689
49	NC_013160	CTT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818689
50	NC_013160	GAA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013160	CTA	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013160	TTC	2	6	5293	5298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013160	ACT	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013160	TCA	2	6	5325	5330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013160	ACC	2	6	5351	5356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013160	TAA	2	6	5368	5373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013160	TGA	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013160	CAC	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013160	TAA	2	6	5515	5520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013160	AAT	3	9	5573	5581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013160	AGT	2	6	5664	5669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013160	AAT	2	6	5795	5800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013160	ATT	2	6	5951	5956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013160	ACT	2	6	6147	6152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013160	CCA	2	6	6169	6174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013160	CTT	2	6	6373	6378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818690
67	NC_013160	ACC	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818690
68	NC_013160	TCA	2	6	6462	6467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818690
69	NC_013160	ATC	2	6	6570	6575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818690
70	NC_013160	CTT	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818690
71	NC_013160	CTT	2	6	6685	6690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818690
72	NC_013160	CCT	2	6	6726	6731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818691
73	NC_013160	CAT	2	6	6811	6816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818691
74	NC_013160	TTC	2	6	6940	6945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818691
75	NC_013160	GTT	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818691
76	NC_013160	AAT	2	6	7037	7042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818691
77	NC_013160	CAG	2	6	7059	7064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818691
78	NC_013160	TGG	3	9	7186	7194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818691
79	NC_013160	AGC	2	6	7300	7305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818691
80	NC_013160	TTC	2	6	7360	7365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818691
81	NC_013160	AAG	2	6	7429	7434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818691
82	NC_013160	AGT	2	6	7684	7689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013160	GTA	2	6	7692	7697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013160	AAC	2	6	7759	7764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013160	TAG	2	6	7824	7829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013160	TTC	2	6	7912	7917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013160	TGA	2	6	7953	7958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013160	GTC	2	6	8024	8029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013160	CAC	2	6	8047	8052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_013160	GAA	2	6	8149	8154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013160	AGA	2	6	8262	8267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013160	TAA	2	6	8432	8437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013160	AGG	2	6	8488	8493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013160	AAG	2	6	8681	8686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013160	TAA	2	6	8838	8843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013160	TAT	2	6	8938	8943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818692
97	NC_013160	AAC	2	6	9040	9045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818692
98	NC_013160	CAA	2	6	9078	9083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818692
99	NC_013160	GAT	2	6	9095	9100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818692
100	NC_013160	TTC	2	6	9112	9117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818692
101	NC_013160	CTT	2	6	9142	9147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818692
102	NC_013160	TTG	2	6	9211	9216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818692
103	NC_013160	GAC	2	6	9240	9245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818692
104	NC_013160	TAC	2	6	9283	9288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818692
105	NC_013160	TGC	2	6	9347	9352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818692
106	NC_013160	AAT	2	6	9360	9365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818692
107	NC_013160	TCT	4	12	9461	9472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818692
108	NC_013160	AGC	2	6	9578	9583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818692
109	NC_013160	TAT	2	6	9603	9608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818692
110	NC_013160	TTC	3	9	9640	9648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818692
111	NC_013160	TTG	2	6	9763	9768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818692
112	NC_013160	TAA	2	6	9781	9786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818692
113	NC_013160	TAT	3	9	9867	9875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013160	TTA	2	6	9963	9968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818693
115	NC_013160	TTG	2	6	10031	10036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818693
116	NC_013160	TAA	2	6	10126	10131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818693
117	NC_013160	TTC	2	6	10178	10183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818693
118	NC_013160	CTT	2	6	10204	10209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818693
119	NC_013160	ATT	2	6	10253	10258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818693
120	NC_013160	GCT	2	6	10312	10317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818693
121	NC_013160	GTT	2	6	10360	10365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013160	TAA	2	6	10506	10511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013160	TAA	3	9	10521	10529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013160	TTA	2	6	10546	10551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013160	AAT	2	6	10736	10741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013160	TAT	2	6	10754	10759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013160	CTT	2	6	10901	10906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013160	ATA	2	6	10992	10997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013160	AGT	2	6	11099	11104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818694
130	NC_013160	AGA	2	6	11240	11245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
131	NC_013160	AGA	2	6	11250	11255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
132	NC_013160	GAG	3	9	11260	11268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818694
133	NC_013160	GAA	2	6	11332	11337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
134	NC_013160	GAA	2	6	11340	11345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
135	NC_013160	AGA	2	6	11357	11362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
136	NC_013160	GAA	3	9	11388	11396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
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139	NC_013160	GAA	2	6	11542	11547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
140	NC_013160	AAG	2	6	11576	11581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
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263	NC_013160	GAA	3	9	19316	19324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818698
264	NC_013160	GAA	2	6	19387	19392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818698
265	NC_013160	TAG	2	6	19487	19492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818698
266	NC_013160	AAG	2	6	19493	19498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818698
267	NC_013160	GTT	2	6	19637	19642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818698
268	NC_013160	CAA	2	6	19681	19686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_013160	CAA	2	6	19744	19749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_013160	ACA	2	6	19755	19760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_013160	GCA	2	6	19832	19837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818699
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500	NC_013160	AAT	2	6	38286	38291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818713

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