MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013160	TA	3	6	9	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013160	AG	3	6	1067	1072	50 %	0 %	50 %	0 %	256818685
3	NC_013160	TG	3	6	1204	1209	0 %	50 %	50 %	0 %	256818685
4	NC_013160	GA	3	6	4651	4656	50 %	0 %	50 %	0 %	256818689
5	NC_013160	AT	3	6	5119	5124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013160	TA	4	8	5866	5873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013160	AG	3	6	6324	6329	50 %	0 %	50 %	0 %	256818690
8	NC_013160	GT	3	6	8190	8195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013160	TC	4	8	10650	10657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013160	AG	3	6	11074	11079	50 %	0 %	50 %	0 %	256818694
11	NC_013160	AT	3	6	11118	11123	50 %	50 %	0 %	0 %	256818694
12	NC_013160	AG	3	6	11364	11369	50 %	0 %	50 %	0 %	256818694
13	NC_013160	GA	3	6	11426	11431	50 %	0 %	50 %	0 %	256818694
14	NC_013160	GA	3	6	11570	11575	50 %	0 %	50 %	0 %	256818694
15	NC_013160	AG	3	6	12270	12275	50 %	0 %	50 %	0 %	256818694
16	NC_013160	TC	3	6	12885	12890	0 %	50 %	0 %	50 %	256818695
17	NC_013160	TC	3	6	13029	13034	0 %	50 %	0 %	50 %	256818695
18	NC_013160	CT	3	6	13091	13096	0 %	50 %	0 %	50 %	256818695
19	NC_013160	AT	3	6	13337	13342	50 %	50 %	0 %	0 %	256818695
20	NC_013160	TC	3	6	13380	13385	0 %	50 %	0 %	50 %	256818695
21	NC_013160	TA	4	8	13551	13558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013160	TA	3	6	13816	13821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013160	TC	4	8	15696	15703	0 %	50 %	0 %	50 %	256818696
24	NC_013160	CT	3	6	16247	16252	0 %	50 %	0 %	50 %	256818697
25	NC_013160	TC	3	6	16947	16952	0 %	50 %	0 %	50 %	256818697
26	NC_013160	TC	3	6	17091	17096	0 %	50 %	0 %	50 %	256818697
27	NC_013160	CT	3	6	17153	17158	0 %	50 %	0 %	50 %	256818697
28	NC_013160	AT	3	6	17399	17404	50 %	50 %	0 %	0 %	256818697
29	NC_013160	TC	3	6	17442	17447	0 %	50 %	0 %	50 %	256818697
30	NC_013160	GA	3	6	19155	19160	50 %	0 %	50 %	0 %	256818698
31	NC_013160	TA	3	6	19193	19198	50 %	50 %	0 %	0 %	256818698
32	NC_013160	CT	3	6	19416	19421	0 %	50 %	0 %	50 %	256818698
33	NC_013160	TC	3	6	19606	19611	0 %	50 %	0 %	50 %	256818698
34	NC_013160	TC	3	6	20775	20780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013160	AC	3	6	24863	24868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013160	AT	3	6	25879	25884	50 %	50 %	0 %	0 %	256818701
37	NC_013160	TC	3	6	26416	26421	0 %	50 %	0 %	50 %	256818701
38	NC_013160	AT	3	6	26466	26471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013160	TG	3	6	26500	26505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013160	CT	3	6	26786	26791	0 %	50 %	0 %	50 %	256818702
41	NC_013160	CA	3	6	27243	27248	50 %	0 %	0 %	50 %	256818702
42	NC_013160	TC	3	6	27299	27304	0 %	50 %	0 %	50 %	256818702
43	NC_013160	CT	3	6	27642	27647	0 %	50 %	0 %	50 %	256818703
44	NC_013160	AG	3	6	27657	27662	50 %	0 %	50 %	0 %	256818703
45	NC_013160	GA	3	6	28321	28326	50 %	0 %	50 %	0 %	256818704
46	NC_013160	CT	3	6	28417	28422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013160	CA	3	6	28731	28736	50 %	0 %	0 %	50 %	256818705
48	NC_013160	CT	3	6	28960	28965	0 %	50 %	0 %	50 %	256818705
49	NC_013160	TC	3	6	28983	28988	0 %	50 %	0 %	50 %	256818705
50	NC_013160	TC	3	6	29071	29076	0 %	50 %	0 %	50 %	256818705
51	NC_013160	AT	3	6	29180	29185	50 %	50 %	0 %	0 %	256818705
52	NC_013160	AG	3	6	29268	29273	50 %	0 %	50 %	0 %	256818705
53	NC_013160	GA	3	6	29597	29602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013160	TA	4	8	30315	30322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013160	TC	3	6	30535	30540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013160	CT	3	6	31242	31247	0 %	50 %	0 %	50 %	256818706
57	NC_013160	GA	3	6	31837	31842	50 %	0 %	50 %	0 %	256818707
58	NC_013160	GA	3	6	32644	32649	50 %	0 %	50 %	0 %	256818707
59	NC_013160	AG	3	6	32772	32777	50 %	0 %	50 %	0 %	256818707
60	NC_013160	CG	3	6	34464	34469	0 %	0 %	50 %	50 %	256818708
61	NC_013160	AG	3	6	35533	35538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013160	CA	3	6	36634	36639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013160	CT	3	6	36925	36930	0 %	50 %	0 %	50 %	256818710
64	NC_013160	GA	3	6	36980	36985	50 %	0 %	50 %	0 %	256818710
65	NC_013160	AC	3	6	37207	37212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013160	TG	3	6	37292	37297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013160	TG	3	6	37653	37658	0 %	50 %	50 %	0 %	256818711
68	NC_013160	AC	3	6	37666	37671	50 %	0 %	0 %	50 %	256818711
69	NC_013160	TA	3	6	38182	38187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013160	CT	3	6	38205	38210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013160	AG	3	6	38232	38237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013160	GT	3	6	38812	38817	0 %	50 %	50 %	0 %	256818714
73	NC_013160	AG	3	6	39057	39062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013160	TC	3	6	39255	39260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013160	TC	3	6	39269	39274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013160	TA	3	6	40378	40383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013160	CA	3	6	40410	40415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013160	TC	3	6	41042	41047	0 %	50 %	0 %	50 %	256818717
79	NC_013160	AG	3	6	41765	41770	50 %	0 %	50 %	0 %	256818718
80	NC_013160	AT	3	6	42317	42322	50 %	50 %	0 %	0 %	256818718
81	NC_013160	TA	3	6	42724	42729	50 %	50 %	0 %	0 %	256818719
82	NC_013160	CT	3	6	43104	43109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013160	AT	3	6	43575	43580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013160	AG	3	6	43683	43688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013160	GA	3	6	43772	43777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013160	TG	3	6	44024	44029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013160	GA	3	6	46482	46487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013160	AT	3	6	47053	47058	50 %	50 %	0 %	0 %	256818721
89	NC_013160	TC	3	6	47065	47070	0 %	50 %	0 %	50 %	256818721
90	NC_013160	TC	3	6	48619	48624	0 %	50 %	0 %	50 %	256818722
91	NC_013160	GA	3	6	49508	49513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013160	GA	3	6	50328	50333	50 %	0 %	50 %	0 %	256818723
93	NC_013160	GT	3	6	50981	50986	0 %	50 %	50 %	0 %	256818724
94	NC_013160	TA	3	6	52540	52545	50 %	50 %	0 %	0 %	256818725
95	NC_013160	TA	3	6	52824	52829	50 %	50 %	0 %	0 %	256818725
96	NC_013160	AT	3	6	52880	52885	50 %	50 %	0 %	0 %	256818725
97	NC_013160	AT	3	6	52920	52925	50 %	50 %	0 %	0 %	256818725
98	NC_013160	TA	3	6	53443	53448	50 %	50 %	0 %	0 %	256818725
99	NC_013160	CA	3	6	53562	53567	50 %	0 %	0 %	50 %	256818725
100	NC_013160	AT	3	6	53576	53581	50 %	50 %	0 %	0 %	256818725
101	NC_013160	AG	3	6	54002	54007	50 %	0 %	50 %	0 %	256818725
102	NC_013160	CA	3	6	54656	54661	50 %	0 %	0 %	50 %	256818726
103	NC_013160	GA	4	8	55087	55094	50 %	0 %	50 %	0 %	256818727
104	NC_013160	TG	3	6	57602	57607	0 %	50 %	50 %	0 %	256818728
105	NC_013160	TA	3	6	58062	58067	50 %	50 %	0 %	0 %	256818728
106	NC_013160	TC	3	6	58581	58586	0 %	50 %	0 %	50 %	256818729
107	NC_013160	CT	3	6	58751	58756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013160	GA	3	6	58857	58862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013160	CT	3	6	59104	59109	0 %	50 %	0 %	50 %	256818730
110	NC_013160	AT	3	6	60601	60606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013160	CT	3	6	62049	62054	0 %	50 %	0 %	50 %	256818732
112	NC_013160	TC	3	6	62339	62344	0 %	50 %	0 %	50 %	256818732
113	NC_013160	CT	3	6	62868	62873	0 %	50 %	0 %	50 %	256818733
114	NC_013160	GA	3	6	63338	63343	50 %	0 %	50 %	0 %	256818733
115	NC_013160	GA	3	6	64884	64889	50 %	0 %	50 %	0 %	256818734
116	NC_013160	CA	3	6	64990	64995	50 %	0 %	0 %	50 %	256818734
117	NC_013160	TG	3	6	65454	65459	0 %	50 %	50 %	0 %	256818735
118	NC_013160	CA	3	6	66663	66668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013160	TC	3	6	66687	66692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013160	TC	3	6	67790	67795	0 %	50 %	0 %	50 %	256818737
121	NC_013160	CT	3	6	68201	68206	0 %	50 %	0 %	50 %	256818737
122	NC_013160	TA	3	6	68432	68437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013160	GT	3	6	69734	69739	0 %	50 %	50 %	0 %	256818738
124	NC_013160	CA	3	6	70193	70198	50 %	0 %	0 %	50 %	256818738
125	NC_013160	TA	3	6	70236	70241	50 %	50 %	0 %	0 %	256818738
126	NC_013160	AC	3	6	71840	71845	50 %	0 %	0 %	50 %	256818738
127	NC_013160	CA	3	6	73775	73780	50 %	0 %	0 %	50 %	256818739
128	NC_013160	TC	3	6	74439	74444	0 %	50 %	0 %	50 %	256818740
129	NC_013160	TA	3	6	75136	75141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013160	GA	3	6	75239	75244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013160	GA	3	6	75621	75626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.