MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013160	A	6	6	282	287	100 %	0 %	0 %	0 %	256818683
2	NC_013160	A	6	6	418	423	100 %	0 %	0 %	0 %	256818684
3	NC_013160	A	7	7	622	628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013160	A	6	6	1438	1443	100 %	0 %	0 %	0 %	256818686
5	NC_013160	C	6	6	3008	3013	0 %	0 %	0 %	100 %	256818688
6	NC_013160	A	6	6	5134	5139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013160	T	7	7	5623	5629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013160	T	6	6	5657	5662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013160	T	6	6	6068	6073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013160	T	6	6	6237	6242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013160	T	6	6	6955	6960	0 %	100 %	0 %	0 %	256818691
12	NC_013160	T	6	6	7401	7406	0 %	100 %	0 %	0 %	256818691
13	NC_013160	C	6	6	7573	7578	0 %	0 %	0 %	100 %	256818691
14	NC_013160	A	6	6	8371	8376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013160	T	6	6	9151	9156	0 %	100 %	0 %	0 %	256818692
16	NC_013160	T	6	6	9329	9334	0 %	100 %	0 %	0 %	256818692
17	NC_013160	T	8	8	9367	9374	0 %	100 %	0 %	0 %	256818692
18	NC_013160	T	6	6	9479	9484	0 %	100 %	0 %	0 %	256818692
19	NC_013160	T	6	6	9708	9713	0 %	100 %	0 %	0 %	256818692
20	NC_013160	T	8	8	9845	9852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013160	T	6	6	10402	10407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013160	A	9	9	10474	10482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013160	A	6	6	11003	11008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013160	A	6	6	11504	11509	100 %	0 %	0 %	0 %	256818694
25	NC_013160	A	6	6	11706	11711	100 %	0 %	0 %	0 %	256818694
26	NC_013160	T	6	6	11825	11830	0 %	100 %	0 %	0 %	256818694
27	NC_013160	T	6	6	12535	12540	0 %	100 %	0 %	0 %	256818694
28	NC_013160	N	6	6	12685	12690	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013160	T	6	6	12748	12753	0 %	100 %	0 %	0 %	256818695
30	NC_013160	T	6	6	12951	12956	0 %	100 %	0 %	0 %	256818695
31	NC_013160	T	6	6	13452	13457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013160	A	7	7	14135	14141	100 %	0 %	0 %	0 %	256818696
33	NC_013160	A	6	6	15982	15987	100 %	0 %	0 %	0 %	256818697
34	NC_013160	A	6	6	16692	16697	100 %	0 %	0 %	0 %	256818697
35	NC_013160	T	6	6	16811	16816	0 %	100 %	0 %	0 %	256818697
36	NC_013160	T	6	6	17013	17018	0 %	100 %	0 %	0 %	256818697
37	NC_013160	T	6	6	17514	17519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013160	T	6	6	17976	17981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013160	A	6	6	18410	18415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013160	A	7	7	19070	19076	100 %	0 %	0 %	0 %	256818698
41	NC_013160	A	9	9	19090	19098	100 %	0 %	0 %	0 %	256818698
42	NC_013160	A	7	7	19248	19254	100 %	0 %	0 %	0 %	256818698
43	NC_013160	A	7	7	19323	19329	100 %	0 %	0 %	0 %	256818698
44	NC_013160	A	6	6	20691	20696	100 %	0 %	0 %	0 %	256818699
45	NC_013160	G	6	6	21537	21542	0 %	0 %	100 %	0 %	256818700
46	NC_013160	A	6	6	21617	21622	100 %	0 %	0 %	0 %	256818700
47	NC_013160	T	6	6	21644	21649	0 %	100 %	0 %	0 %	256818700
48	NC_013160	C	7	7	22270	22276	0 %	0 %	0 %	100 %	256818700
49	NC_013160	T	6	6	22668	22673	0 %	100 %	0 %	0 %	256818700
50	NC_013160	T	6	6	23159	23164	0 %	100 %	0 %	0 %	256818700
51	NC_013160	G	6	6	23639	23644	0 %	0 %	100 %	0 %	256818700
52	NC_013160	A	6	6	24236	24241	100 %	0 %	0 %	0 %	256818700
53	NC_013160	T	6	6	24682	24687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013160	T	6	6	25479	25484	0 %	100 %	0 %	0 %	256818701
55	NC_013160	T	6	6	25935	25940	0 %	100 %	0 %	0 %	256818701
56	NC_013160	T	6	6	26047	26052	0 %	100 %	0 %	0 %	256818701
57	NC_013160	T	6	6	26118	26123	0 %	100 %	0 %	0 %	256818701
58	NC_013160	T	6	6	26267	26272	0 %	100 %	0 %	0 %	256818701
59	NC_013160	A	6	6	26556	26561	100 %	0 %	0 %	0 %	256818702
60	NC_013160	T	6	6	27225	27230	0 %	100 %	0 %	0 %	256818702
61	NC_013160	T	6	6	27435	27440	0 %	100 %	0 %	0 %	256818702
62	NC_013160	T	6	6	27567	27572	0 %	100 %	0 %	0 %	256818702
63	NC_013160	C	7	7	27711	27717	0 %	0 %	0 %	100 %	256818703
64	NC_013160	T	6	6	27813	27818	0 %	100 %	0 %	0 %	256818703
65	NC_013160	T	8	8	27861	27868	0 %	100 %	0 %	0 %	256818703
66	NC_013160	T	8	8	28219	28226	0 %	100 %	0 %	0 %	256818704
67	NC_013160	T	6	6	29357	29362	0 %	100 %	0 %	0 %	256818705
68	NC_013160	T	7	7	29561	29567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013160	T	7	7	30072	30078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013160	T	6	6	30106	30111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013160	T	6	6	30517	30522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013160	A	6	6	30859	30864	100 %	0 %	0 %	0 %	256818706
73	NC_013160	G	6	6	31151	31156	0 %	0 %	100 %	0 %	256818706
74	NC_013160	T	7	7	32238	32244	0 %	100 %	0 %	0 %	256818707
75	NC_013160	T	6	6	32452	32457	0 %	100 %	0 %	0 %	256818707
76	NC_013160	T	7	7	32676	32682	0 %	100 %	0 %	0 %	256818707
77	NC_013160	T	6	6	32742	32747	0 %	100 %	0 %	0 %	256818707
78	NC_013160	A	6	6	32891	32896	100 %	0 %	0 %	0 %	256818707
79	NC_013160	A	6	6	32901	32906	100 %	0 %	0 %	0 %	256818707
80	NC_013160	A	7	7	33009	33015	100 %	0 %	0 %	0 %	256818708
81	NC_013160	C	6	6	33196	33201	0 %	0 %	0 %	100 %	256818708
82	NC_013160	G	6	6	33349	33354	0 %	0 %	100 %	0 %	256818708
83	NC_013160	G	7	7	33461	33467	0 %	0 %	100 %	0 %	256818708
84	NC_013160	G	7	7	33477	33483	0 %	0 %	100 %	0 %	256818708
85	NC_013160	G	6	6	33486	33491	0 %	0 %	100 %	0 %	256818708
86	NC_013160	G	6	6	33494	33499	0 %	0 %	100 %	0 %	256818708
87	NC_013160	T	7	7	33908	33914	0 %	100 %	0 %	0 %	256818708
88	NC_013160	T	7	7	35198	35204	0 %	100 %	0 %	0 %	256818708
89	NC_013160	T	8	8	35818	35825	0 %	100 %	0 %	0 %	256818709
90	NC_013160	A	6	6	36185	36190	100 %	0 %	0 %	0 %	256818709
91	NC_013160	T	6	6	36480	36485	0 %	100 %	0 %	0 %	256818709
92	NC_013160	T	6	6	36715	36720	0 %	100 %	0 %	0 %	256818710
93	NC_013160	T	6	6	37004	37009	0 %	100 %	0 %	0 %	256818710
94	NC_013160	A	9	9	37055	37063	100 %	0 %	0 %	0 %	256818710
95	NC_013160	A	7	7	37163	37169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013160	T	6	6	38239	38244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013160	T	6	6	40527	40532	0 %	100 %	0 %	0 %	256818717
98	NC_013160	T	6	6	40587	40592	0 %	100 %	0 %	0 %	256818717
99	NC_013160	A	6	6	40622	40627	100 %	0 %	0 %	0 %	256818717
100	NC_013160	C	6	6	40888	40893	0 %	0 %	0 %	100 %	256818717
101	NC_013160	A	6	6	41021	41026	100 %	0 %	0 %	0 %	256818717
102	NC_013160	T	7	7	41475	41481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013160	T	6	6	41515	41520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013160	A	8	8	41752	41759	100 %	0 %	0 %	0 %	256818718
105	NC_013160	C	7	7	41803	41809	0 %	0 %	0 %	100 %	256818718
106	NC_013160	C	6	6	42212	42217	0 %	0 %	0 %	100 %	256818718
107	NC_013160	C	8	8	42364	42371	0 %	0 %	0 %	100 %	256818718
108	NC_013160	A	6	6	42663	42668	100 %	0 %	0 %	0 %	256818719
109	NC_013160	A	7	7	43138	43144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013160	A	6	6	43343	43348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013160	A	6	6	44452	44457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013160	A	6	6	44680	44685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013160	A	6	6	45100	45105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013160	A	6	6	45121	45126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013160	T	6	6	45420	45425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013160	T	8	8	45559	45566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013160	T	7	7	45574	45580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013160	A	6	6	45990	45995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013160	A	6	6	46456	46461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013160	A	7	7	47257	47263	100 %	0 %	0 %	0 %	256818721
121	NC_013160	A	6	6	48041	48046	100 %	0 %	0 %	0 %	256818721
122	NC_013160	A	8	8	48090	48097	100 %	0 %	0 %	0 %	256818721
123	NC_013160	A	6	6	48238	48243	100 %	0 %	0 %	0 %	256818721
124	NC_013160	T	6	6	48865	48870	0 %	100 %	0 %	0 %	256818722
125	NC_013160	A	6	6	49486	49491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013160	A	7	7	49761	49767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013160	T	6	6	49797	49802	0 %	100 %	0 %	0 %	256818723
128	NC_013160	T	6	6	49848	49853	0 %	100 %	0 %	0 %	256818723
129	NC_013160	T	6	6	50073	50078	0 %	100 %	0 %	0 %	256818723
130	NC_013160	A	6	6	50391	50396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013160	A	7	7	50640	50646	100 %	0 %	0 %	0 %	256818724
132	NC_013160	T	6	6	51526	51531	0 %	100 %	0 %	0 %	256818725
133	NC_013160	T	8	8	51647	51654	0 %	100 %	0 %	0 %	256818725
134	NC_013160	A	6	6	51834	51839	100 %	0 %	0 %	0 %	256818725
135	NC_013160	T	6	6	53270	53275	0 %	100 %	0 %	0 %	256818725
136	NC_013160	A	6	6	53448	53453	100 %	0 %	0 %	0 %	256818725
137	NC_013160	T	6	6	53681	53686	0 %	100 %	0 %	0 %	256818725
138	NC_013160	A	6	6	53780	53785	100 %	0 %	0 %	0 %	256818725
139	NC_013160	T	6	6	53824	53829	0 %	100 %	0 %	0 %	256818725
140	NC_013160	A	6	6	54025	54030	100 %	0 %	0 %	0 %	256818725
141	NC_013160	T	6	6	54152	54157	0 %	100 %	0 %	0 %	256818726
142	NC_013160	T	7	7	54926	54932	0 %	100 %	0 %	0 %	256818727
143	NC_013160	A	6	6	55185	55190	100 %	0 %	0 %	0 %	256818727
144	NC_013160	T	6	6	56203	56208	0 %	100 %	0 %	0 %	256818728
145	NC_013160	T	6	6	56584	56589	0 %	100 %	0 %	0 %	256818728
146	NC_013160	T	6	6	57392	57397	0 %	100 %	0 %	0 %	256818728
147	NC_013160	T	6	6	57480	57485	0 %	100 %	0 %	0 %	256818728
148	NC_013160	T	6	6	57535	57540	0 %	100 %	0 %	0 %	256818728
149	NC_013160	T	7	7	58440	58446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013160	A	6	6	58887	58892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013160	T	6	6	58950	58955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013160	A	6	6	59127	59132	100 %	0 %	0 %	0 %	256818730
153	NC_013160	A	6	6	59283	59288	100 %	0 %	0 %	0 %	256818730
154	NC_013160	G	6	6	59374	59379	0 %	0 %	100 %	0 %	256818730
155	NC_013160	A	6	6	59916	59921	100 %	0 %	0 %	0 %	256818730
156	NC_013160	T	6	6	60036	60041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013160	T	7	7	60309	60315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013160	A	6	6	60337	60342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013160	T	7	7	60924	60930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013160	T	6	6	61156	61161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013160	C	6	6	62269	62274	0 %	0 %	0 %	100 %	256818732
162	NC_013160	G	7	7	62321	62327	0 %	0 %	100 %	0 %	256818732
163	NC_013160	A	6	6	62591	62596	100 %	0 %	0 %	0 %	256818732
164	NC_013160	G	6	6	62823	62828	0 %	0 %	100 %	0 %	256818733
165	NC_013160	C	6	6	63281	63286	0 %	0 %	0 %	100 %	256818733
166	NC_013160	G	6	6	64155	64160	0 %	0 %	100 %	0 %	256818734
167	NC_013160	G	6	6	64595	64600	0 %	0 %	100 %	0 %	256818734
168	NC_013160	G	7	7	64961	64967	0 %	0 %	100 %	0 %	256818734
169	NC_013160	T	8	8	65045	65052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013160	T	6	6	65182	65187	0 %	100 %	0 %	0 %	256818735
171	NC_013160	G	6	6	65416	65421	0 %	0 %	100 %	0 %	256818735
172	NC_013160	T	7	7	65937	65943	0 %	100 %	0 %	0 %	256818735
173	NC_013160	A	7	7	66514	66520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013160	T	7	7	66552	66558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_013160	A	7	7	66581	66587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_013160	G	7	7	66837	66843	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013160	T	8	8	66935	66942	0 %	100 %	0 %	0 %	256818737
178	NC_013160	T	6	6	66957	66962	0 %	100 %	0 %	0 %	256818737
179	NC_013160	T	6	6	66980	66985	0 %	100 %	0 %	0 %	256818737
180	NC_013160	T	6	6	66992	66997	0 %	100 %	0 %	0 %	256818737
181	NC_013160	T	7	7	67388	67394	0 %	100 %	0 %	0 %	256818737
182	NC_013160	T	7	7	68278	68284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_013160	G	6	6	68336	68341	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
184	NC_013160	A	6	6	68522	68527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_013160	A	6	6	68825	68830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_013160	A	6	6	70890	70895	100 %	0 %	0 %	0 %	256818738
187	NC_013160	A	6	6	71047	71052	100 %	0 %	0 %	0 %	256818738
188	NC_013160	A	6	6	71764	71769	100 %	0 %	0 %	0 %	256818738
189	NC_013160	T	6	6	71846	71851	0 %	100 %	0 %	0 %	256818738
190	NC_013160	T	6	6	71858	71863	0 %	100 %	0 %	0 %	256818738
191	NC_013160	A	6	6	73065	73070	100 %	0 %	0 %	0 %	256818739
192	NC_013160	C	6	6	73911	73916	0 %	0 %	0 %	100 %	256818739
193	NC_013160	T	6	6	74220	74225	0 %	100 %	0 %	0 %	256818740
194	NC_013160	A	6	6	74833	74838	100 %	0 %	0 %	0 %	256818740
195	NC_013160	A	6	6	75302	75307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_013160	A	6	6	75365	75370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_013160	A	6	6	75467	75472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.