MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 2965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013159	CCCTC	2	10	497	506	0 %	20 %	0 %	80 %	257054090
2	NC_013159	CCTCC	2	10	692	701	0 %	20 %	0 %	80 %	257054090
3	NC_013159	ACCAC	2	10	1774	1783	40 %	0 %	0 %	60 %	257054090
4	NC_013159	TCAGG	2	10	3616	3625	20 %	20 %	40 %	20 %	257054091
5	NC_013159	CGTCG	2	10	4047	4056	0 %	20 %	40 %	40 %	257054092
6	NC_013159	CCGGG	2	10	5091	5100	0 %	0 %	60 %	40 %	257054093
7	NC_013159	CGCGG	2	10	5121	5130	0 %	0 %	60 %	40 %	257054093
8	NC_013159	ACGTG	2	10	5141	5150	20 %	20 %	40 %	20 %	257054093
9	NC_013159	GCTCA	2	10	7749	7758	20 %	20 %	20 %	40 %	257054095
10	NC_013159	CCGCG	2	10	7979	7988	0 %	0 %	40 %	60 %	257054095
11	NC_013159	CGGCT	2	10	11749	11758	0 %	20 %	40 %	40 %	257054097
12	NC_013159	GGCGT	2	10	12113	12122	0 %	20 %	60 %	20 %	257054097
13	NC_013159	CACGG	2	10	13460	13469	20 %	0 %	40 %	40 %	257054098
14	NC_013159	AGTCC	2	10	16819	16828	20 %	20 %	20 %	40 %	257054104
15	NC_013159	CGTAC	2	10	18650	18659	20 %	20 %	20 %	40 %	257054106
16	NC_013159	TCGGG	2	10	18824	18833	0 %	20 %	60 %	20 %	257054106
17	NC_013159	CGGTG	2	10	24628	24637	0 %	20 %	60 %	20 %	257054112
18	NC_013159	CCGAG	2	10	27596	27605	20 %	0 %	40 %	40 %	257054117
19	NC_013159	GTCGT	2	10	28576	28585	0 %	40 %	40 %	20 %	257054118
20	NC_013159	GGACC	2	10	28740	28749	20 %	0 %	40 %	40 %	257054118
21	NC_013159	GCCGT	2	10	29025	29034	0 %	20 %	40 %	40 %	257054119
22	NC_013159	CCGTT	2	10	29613	29622	0 %	40 %	20 %	40 %	257054119
23	NC_013159	GAGCG	2	10	31544	31553	20 %	0 %	60 %	20 %	257054121
24	NC_013159	TGCCG	2	10	32002	32011	0 %	20 %	40 %	40 %	257054121
25	NC_013159	GATGG	2	10	32859	32868	20 %	20 %	60 %	0 %	257054122
26	NC_013159	CGCCC	2	10	32914	32923	0 %	0 %	20 %	80 %	257054122
27	NC_013159	CGGCG	2	10	33237	33246	0 %	0 %	60 %	40 %	257054122
28	NC_013159	TGGGG	2	10	33910	33919	0 %	20 %	80 %	0 %	257054123
29	NC_013159	CCGCC	2	10	36913	36922	0 %	0 %	20 %	80 %	257054125
30	NC_013159	GCTCG	2	10	37774	37783	0 %	20 %	40 %	40 %	257054125
31	NC_013159	CGTAG	2	10	38265	38274	20 %	20 %	40 %	20 %	257054125
32	NC_013159	AGTCG	2	10	38475	38484	20 %	20 %	40 %	20 %	257054126
33	NC_013159	CGAGG	2	10	43612	43621	20 %	0 %	60 %	20 %	257054130
34	NC_013159	CGGTG	2	10	51269	51278	0 %	20 %	60 %	20 %	257054136
35	NC_013159	CGGGA	2	10	51849	51858	20 %	0 %	60 %	20 %	257054136
36	NC_013159	GCGCT	2	10	52945	52954	0 %	20 %	40 %	40 %	257054137
37	NC_013159	TCGTC	2	10	53514	53523	0 %	40 %	20 %	40 %	257054138
38	NC_013159	GCCGT	2	10	53932	53941	0 %	20 %	40 %	40 %	257054139
39	NC_013159	CGTGG	2	10	58340	58349	0 %	20 %	60 %	20 %	257054143
40	NC_013159	TCGCC	2	10	58354	58363	0 %	20 %	20 %	60 %	257054143
41	NC_013159	GGGAC	2	10	58505	58514	20 %	0 %	60 %	20 %	257054143
42	NC_013159	TCGGC	2	10	58879	58888	0 %	20 %	40 %	40 %	257054143
43	NC_013159	CTGGT	2	10	59364	59373	0 %	40 %	40 %	20 %	257054143
44	NC_013159	CCCGG	2	10	60216	60225	0 %	0 %	40 %	60 %	257054144
45	NC_013159	GCGGT	2	10	60328	60337	0 %	20 %	60 %	20 %	257054144
46	NC_013159	GGCGT	2	10	64641	64650	0 %	20 %	60 %	20 %	257054150
47	NC_013159	GCATC	2	10	66743	66752	20 %	20 %	20 %	40 %	257054152
48	NC_013159	GCTCG	2	10	68631	68640	0 %	20 %	40 %	40 %	257054153
49	NC_013159	CGGCC	2	10	69088	69097	0 %	0 %	40 %	60 %	257054154
50	NC_013159	GCTGG	2	10	72300	72309	0 %	20 %	60 %	20 %	257054156
51	NC_013159	CACCG	2	10	72896	72905	20 %	0 %	20 %	60 %	257054157
52	NC_013159	CGCGA	2	10	73330	73339	20 %	0 %	40 %	40 %	257054157
53	NC_013159	CGGTC	2	10	79151	79160	0 %	20 %	40 %	40 %	257054161
54	NC_013159	CGGGA	2	10	79302	79311	20 %	0 %	60 %	20 %	257054161
55	NC_013159	CTCGG	2	10	80850	80859	0 %	20 %	40 %	40 %	257054161
56	NC_013159	AGGCG	2	10	81820	81829	20 %	0 %	60 %	20 %	257054162
57	NC_013159	GAGCG	2	10	83552	83561	20 %	0 %	60 %	20 %	257054164
58	NC_013159	ACCTG	2	10	83836	83845	20 %	20 %	20 %	40 %	257054165
59	NC_013159	ACCAC	2	10	84421	84430	40 %	0 %	0 %	60 %	257054165
60	NC_013159	TCCCG	2	10	86290	86299	0 %	20 %	20 %	60 %	257054166
61	NC_013159	CGCTG	2	10	86856	86865	0 %	20 %	40 %	40 %	257054167
62	NC_013159	CGCAC	2	10	89209	89218	20 %	0 %	20 %	60 %	257054169
63	NC_013159	TCGCA	2	10	93604	93613	20 %	20 %	20 %	40 %	257054174
64	NC_013159	GCTGT	2	10	93645	93654	0 %	40 %	40 %	20 %	257054174
65	NC_013159	GCCAG	2	10	96699	96708	20 %	0 %	40 %	40 %	257054178
66	NC_013159	CTCAC	2	10	96716	96725	20 %	20 %	0 %	60 %	257054178
67	NC_013159	ATGGA	2	10	99482	99491	40 %	20 %	40 %	0 %	257054181
68	NC_013159	ACGTG	2	10	100123	100132	20 %	20 %	40 %	20 %	257054183
69	NC_013159	GGTCT	2	10	101431	101440	0 %	40 %	40 %	20 %	257054184
70	NC_013159	GCGGG	2	10	102768	102777	0 %	0 %	80 %	20 %	257054184
71	NC_013159	CGGGG	2	10	103612	103621	0 %	0 %	80 %	20 %	257054185
72	NC_013159	CTCGG	2	10	104839	104848	0 %	20 %	40 %	40 %	257054187
73	NC_013159	CGGCC	2	10	104894	104903	0 %	0 %	40 %	60 %	257054187
74	NC_013159	TGACA	2	10	105910	105919	40 %	20 %	20 %	20 %	257054188
75	NC_013159	GGTCG	2	10	110487	110496	0 %	20 %	60 %	20 %	257054191
76	NC_013159	CGCGG	2	10	110763	110772	0 %	0 %	60 %	40 %	257054191
77	NC_013159	GCATC	2	10	112670	112679	20 %	20 %	20 %	40 %	257054192
78	NC_013159	GTGAC	2	10	113408	113417	20 %	20 %	40 %	20 %	257054193
79	NC_013159	AGCGA	2	10	114402	114411	40 %	0 %	40 %	20 %	257054194
80	NC_013159	GGTCC	2	10	116532	116541	0 %	20 %	40 %	40 %	257054196
81	NC_013159	CGATC	2	10	116639	116648	20 %	20 %	20 %	40 %	257054196
82	NC_013159	GCTGC	2	10	119484	119493	0 %	20 %	40 %	40 %	257054197
83	NC_013159	CCCGG	2	10	123334	123343	0 %	0 %	40 %	60 %	257054199
84	NC_013159	CCACG	2	10	124417	124426	20 %	0 %	20 %	60 %	257054199
85	NC_013159	GTCGG	2	10	125002	125011	0 %	20 %	60 %	20 %	257054200
86	NC_013159	GGGCA	2	10	127500	127509	20 %	0 %	60 %	20 %	257054203
87	NC_013159	CGATC	2	10	133497	133506	20 %	20 %	20 %	40 %	257054209
88	NC_013159	GCGCG	2	10	134708	134717	0 %	0 %	60 %	40 %	257054210
89	NC_013159	GGCCC	2	10	135699	135708	0 %	0 %	40 %	60 %	257054211
90	NC_013159	GGGCC	2	10	138667	138676	0 %	0 %	60 %	40 %	257054213
91	NC_013159	GCTGT	2	10	140657	140666	0 %	40 %	40 %	20 %	257054215
92	NC_013159	ACGGC	2	10	140923	140932	20 %	0 %	40 %	40 %	257054216
93	NC_013159	GTTCG	2	10	141396	141405	0 %	40 %	40 %	20 %	257054216
94	NC_013159	CCGGT	2	10	142561	142570	0 %	20 %	40 %	40 %	257054217
95	NC_013159	GCGTG	2	10	146208	146217	0 %	20 %	60 %	20 %	257054219
96	NC_013159	GGTGT	2	10	148564	148573	0 %	40 %	60 %	0 %	257054221
97	NC_013159	GGCCG	2	10	148624	148633	0 %	0 %	60 %	40 %	257054221
98	NC_013159	GCGCG	2	10	148879	148888	0 %	0 %	60 %	40 %	257054221
99	NC_013159	CGCCC	2	10	154798	154807	0 %	0 %	20 %	80 %	257054225
100	NC_013159	GAACC	2	10	156493	156502	40 %	0 %	20 %	40 %	257054227
101	NC_013159	GTTTC	2	10	158403	158412	0 %	60 %	20 %	20 %	257054229
102	NC_013159	CAGCG	2	10	160353	160362	20 %	0 %	40 %	40 %	257054230
103	NC_013159	CGCAC	2	10	160752	160761	20 %	0 %	20 %	60 %	257054230
104	NC_013159	GCTTC	2	10	162351	162360	0 %	40 %	20 %	40 %	257054232
105	NC_013159	GCCAG	2	10	163963	163972	20 %	0 %	40 %	40 %	257054234
106	NC_013159	CCGAG	2	10	164406	164415	20 %	0 %	40 %	40 %	257054235
107	NC_013159	TGCGT	2	10	164523	164532	0 %	40 %	40 %	20 %	257054235
108	NC_013159	CCGAC	2	10	165601	165610	20 %	0 %	20 %	60 %	257054237
109	NC_013159	GAACG	2	10	165630	165639	40 %	0 %	40 %	20 %	257054237
110	NC_013159	AGGCG	2	10	165949	165958	20 %	0 %	60 %	20 %	257054237
111	NC_013159	GCCAC	2	10	167711	167720	20 %	0 %	20 %	60 %	257054239
112	NC_013159	GCCGA	2	10	168354	168363	20 %	0 %	40 %	40 %	257054240
113	NC_013159	ACCGC	2	10	168548	168557	20 %	0 %	20 %	60 %	257054240
114	NC_013159	GGCCG	2	10	170833	170842	0 %	0 %	60 %	40 %	257054242
115	NC_013159	CGGAG	2	10	170894	170903	20 %	0 %	60 %	20 %	257054242
116	NC_013159	GCCGT	2	10	171908	171917	0 %	20 %	40 %	40 %	257054244
117	NC_013159	ACCCG	2	10	172222	172231	20 %	0 %	20 %	60 %	257054244
118	NC_013159	GTGAC	2	10	174478	174487	20 %	20 %	40 %	20 %	257054246
119	NC_013159	CATGG	2	10	176836	176845	20 %	20 %	40 %	20 %	257054248
120	NC_013159	TGGCG	2	10	177679	177688	0 %	20 %	60 %	20 %	257054249
121	NC_013159	CTCGC	2	10	178772	178781	0 %	20 %	20 %	60 %	257054250
122	NC_013159	CGCCA	2	10	183902	183911	20 %	0 %	20 %	60 %	257054257
123	NC_013159	GCACC	2	10	185400	185409	20 %	0 %	20 %	60 %	257054258
124	NC_013159	CCGGC	2	10	186607	186616	0 %	0 %	40 %	60 %	257054259
125	NC_013159	GCTCC	2	10	186842	186851	0 %	20 %	20 %	60 %	257054259
126	NC_013159	TCGAG	2	10	188716	188725	20 %	20 %	40 %	20 %	257054262
127	NC_013159	AGCGA	2	10	192333	192342	40 %	0 %	40 %	20 %	257054266
128	NC_013159	TCGAT	2	10	193523	193532	20 %	40 %	20 %	20 %	257054267
129	NC_013159	GTCCG	2	10	194932	194941	0 %	20 %	40 %	40 %	257054269
130	NC_013159	GCCGG	2	10	195105	195114	0 %	0 %	60 %	40 %	257054269
131	NC_013159	CCGTG	2	10	196094	196103	0 %	20 %	40 %	40 %	257054270
132	NC_013159	CGGGC	2	10	196463	196472	0 %	0 %	60 %	40 %	257054270
133	NC_013159	TGTCG	2	10	196876	196885	0 %	40 %	40 %	20 %	257054270
134	NC_013159	CGGCG	2	10	196892	196901	0 %	0 %	60 %	40 %	257054270
135	NC_013159	CTCGG	2	10	199877	199886	0 %	20 %	40 %	40 %	257054271
136	NC_013159	CCGTG	2	10	201644	201653	0 %	20 %	40 %	40 %	257054273
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142	NC_013159	GCCGA	2	10	208898	208907	20 %	0 %	40 %	40 %	257054282
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148	NC_013159	CCTCG	2	10	216965	216974	0 %	20 %	20 %	60 %	257054290
149	NC_013159	CTCCG	2	10	217122	217131	0 %	20 %	20 %	60 %	257054290
150	NC_013159	TCCGC	2	10	217833	217842	0 %	20 %	20 %	60 %	257054292
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245	NC_013159	CGCTC	2	10	366402	366411	0 %	20 %	20 %	60 %	257054443
246	NC_013159	GCGAA	2	10	369242	369251	40 %	0 %	40 %	20 %	257054445
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248	NC_013159	GCCTC	2	10	373135	373144	0 %	20 %	20 %	60 %	257054449
249	NC_013159	ACGAC	2	10	373702	373711	40 %	0 %	20 %	40 %	257054449
250	NC_013159	TCCGA	2	10	375095	375104	20 %	20 %	20 %	40 %	257054451
251	NC_013159	GGCCG	2	10	385500	385509	0 %	0 %	60 %	40 %	257054455
252	NC_013159	TGGTC	2	10	386669	386678	0 %	40 %	40 %	20 %	257054457
253	NC_013159	GAACT	2	10	389120	389129	40 %	20 %	20 %	20 %	257054460
254	NC_013159	ACGTG	2	10	394453	394462	20 %	20 %	40 %	20 %	257054467
255	NC_013159	GGCCG	2	10	398876	398885	0 %	0 %	60 %	40 %	257054470
256	NC_013159	CCGGT	2	10	400047	400056	0 %	20 %	40 %	40 %	257054471
257	NC_013159	GTGCA	2	10	402478	402487	20 %	20 %	40 %	20 %	257054476
258	NC_013159	GGCGG	2	10	406945	406954	0 %	0 %	80 %	20 %	257054487
259	NC_013159	GGGGA	2	10	409906	409915	20 %	0 %	80 %	0 %	257054491
260	NC_013159	GAAGC	2	10	409930	409939	40 %	0 %	40 %	20 %	257054491
261	NC_013159	GATGC	2	10	410412	410421	20 %	20 %	40 %	20 %	257054492
262	NC_013159	CGGTG	2	10	412745	412754	0 %	20 %	60 %	20 %	257054496
263	NC_013159	TTGGC	2	10	415944	415953	0 %	40 %	40 %	20 %	257054500
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