MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 1890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013159	TGGA	2	8	2272	2279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013159	GCCG	2	8	12731	12738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013159	GGTG	2	8	14117	14124	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013159	CCTT	2	8	14846	14853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013159	CTGG	2	8	14861	14868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013159	TTGT	2	8	14891	14898	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013159	TTGC	2	8	15136	15143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013159	GTCG	2	8	15783	15790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013159	CGAG	2	8	16130	16137	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013159	CCCG	2	8	16232	16239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_013159	CGTT	2	8	16448	16455	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013159	CCGG	2	8	20545	20552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013159	CCGA	2	8	21654	21661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013159	CGTC	2	8	25187	25194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013159	GGCA	2	8	25545	25552	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013159	GAGC	2	8	25564	25571	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013159	CCGG	2	8	25762	25769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013159	CCGG	2	8	25826	25833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013159	GCCG	2	8	25872	25879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013159	TGCT	2	8	40210	40217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013159	CTCC	2	8	40314	40321	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_013159	AGGA	2	8	40512	40519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013159	CGAA	2	8	40800	40807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013159	GGTC	2	8	41008	41015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013159	GCCG	2	8	41316	41323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013159	GCCC	2	8	41327	41334	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_013159	TCGG	2	8	45912	45919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013159	CCGA	2	8	48169	48176	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013159	ACCG	2	8	48193	48200	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013159	ACCG	2	8	48204	48211	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013159	GGTG	2	8	52324	52331	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013159	AAGA	2	8	53123	53130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013159	GCTT	2	8	54443	54450	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013159	TCGG	2	8	56830	56837	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013159	GAGC	2	8	59957	59964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013159	AGTG	2	8	66356	66363	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013159	TCGT	2	8	68789	68796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013159	CGAA	2	8	68892	68899	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013159	GTCG	2	8	84434	84441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013159	ACGA	2	8	84711	84718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013159	CCGG	2	8	86513	86520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013159	GCGG	2	8	88704	88711	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013159	CGTG	2	8	96117	96124	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013159	CCGG	2	8	96148	96155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013159	GAGG	2	8	96170	96177	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013159	TCCG	2	8	102828	102835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013159	TTCG	2	8	103759	103766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013159	GGGA	2	8	107656	107663	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013159	GAGG	2	8	107784	107791	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013159	CGGC	2	8	114016	114023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013159	GACG	2	8	114035	114042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013159	GTGA	2	8	114232	114239	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013159	GGAT	2	8	117533	117540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013159	CGGA	2	8	117616	117623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013159	GCTG	2	8	117680	117687	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013159	GGGC	2	8	117844	117851	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013159	TCCG	2	8	117877	117884	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013159	CCAC	2	8	121691	121698	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_013159	GAGT	2	8	124642	124649	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013159	GTGC	2	8	126343	126350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013159	CCGG	2	8	128640	128647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013159	GTAT	2	8	132686	132693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013159	TGGT	2	8	135185	135192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013159	GGTT	2	8	135226	135233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013159	CGTG	2	8	137917	137924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013159	GTCC	2	8	147660	147667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013159	CCGG	2	8	150349	150356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013159	ACGG	2	8	152558	152565	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013159	CGGA	2	8	152578	152585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013159	GTGG	2	8	155151	155158	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013159	CTGC	2	8	155213	155220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013159	GGAA	2	8	156989	156996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013159	GACA	2	8	157104	157111	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013159	AGCG	2	8	157495	157502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013159	CGAG	2	8	158759	158766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013159	GGAA	2	8	158918	158925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013159	ACAA	2	8	160875	160882	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013159	CGCC	2	8	164177	164184	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_013159	GATC	2	8	173980	173987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013159	TCGT	2	8	175787	175794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013159	AGCG	2	8	176534	176541	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013159	CGGG	2	8	177226	177233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013159	TCCC	2	8	177868	177875	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_013159	CTCC	2	8	179967	179974	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_013159	GAGG	2	8	180045	180052	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013159	GGGT	2	8	182056	182063	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013159	ACGT	2	8	197921	197928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013159	CGCT	2	8	198143	198150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013159	CGGT	2	8	198576	198583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013159	CCAG	2	8	198945	198952	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013159	GCCC	2	8	201804	201811	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_013159	TCCT	2	8	205893	205900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013159	CTCG	2	8	206496	206503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013159	GACG	2	8	206520	206527	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013159	GGTG	3	12	207740	207751	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013159	GCCG	2	8	209215	209222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013159	GGGA	2	8	210703	210710	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013159	GACG	2	8	210711	210718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013159	GGCG	2	8	213567	213574	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013159	GGCC	2	8	217601	217608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013159	GGTC	2	8	217611	217618	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013159	GCCC	2	8	225075	225082	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_013159	GGGC	2	8	225718	225725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013159	GGTG	2	8	236936	236943	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013159	GGTC	2	8	237573	237580	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013159	GATC	2	8	244508	244515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013159	TGGG	2	8	247914	247921	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013159	GGTG	2	8	247922	247929	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013159	GCAG	2	8	249116	249123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013159	ACCG	2	8	250361	250368	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013159	TCCC	2	8	253790	253797	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_013159	AAGC	2	8	253826	253833	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013159	CTAA	2	8	253886	253893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013159	AGGG	2	8	255328	255335	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013159	GGGC	2	8	255623	255630	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013159	GGAC	2	8	264966	264973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013159	GAGG	2	8	265109	265116	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013159	ACCG	2	8	265266	265273	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013159	CTCG	2	8	265351	265358	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013159	CAGT	2	8	265448	265455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013159	GCCC	2	8	265481	265488	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_013159	TCCG	2	8	274873	274880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013159	GACC	2	8	275300	275307	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013159	CGGG	2	8	278685	278692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013159	GTAG	2	8	280711	280718	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013159	CCGG	2	8	292657	292664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013159	TCAC	2	8	297928	297935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013159	CCGG	2	8	302080	302087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013159	GCTC	2	8	304351	304358	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013159	GGTC	2	8	311776	311783	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013159	GGTT	2	8	311969	311976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013159	CGGT	2	8	328187	328194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013159	GCGA	2	8	328410	328417	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013159	CGAA	2	8	328464	328471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013159	CCGG	2	8	328472	328479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013159	CGTG	2	8	340984	340991	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013159	GCCG	2	8	341037	341044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013159	GCAT	2	8	341901	341908	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013159	GTGG	2	8	342916	342923	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013159	GTGG	2	8	342930	342937	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013159	GTCG	2	8	348270	348277	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013159	CCGT	2	8	348745	348752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013159	GTCG	2	8	348911	348918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013159	TGCG	2	8	349269	349276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013159	GCCC	2	8	353900	353907	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_013159	GGTG	2	8	357101	357108	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013159	CGGG	2	8	358747	358754	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013159	TGCC	2	8	362832	362839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013159	AAGG	2	8	363505	363512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013159	TCGT	2	8	363948	363955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013159	GACC	2	8	373971	373978	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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444	NC_013159	CTCG	2	8	1241380	1241387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
445	NC_013159	TCGT	2	8	1241783	1241790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_013159	CAGC	2	8	1245779	1245786	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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460	NC_013159	GTGC	2	8	1277880	1277887	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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470	NC_013159	GTGA	2	8	1293624	1293631	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
471	NC_013159	GCCG	2	8	1300539	1300546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
472	NC_013159	TCCT	2	8	1305328	1305335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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477	NC_013159	TCGC	2	8	1309963	1309970	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
478	NC_013159	GACC	2	8	1310244	1310251	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
479	NC_013159	TGAG	2	8	1313072	1313079	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
480	NC_013159	ACCT	2	8	1315307	1315314	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
481	NC_013159	GGTT	2	8	1315627	1315634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
482	NC_013159	ACGC	2	8	1324471	1324478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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484	NC_013159	CGTG	2	8	1329595	1329602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_013159	AGGG	2	8	1329668	1329675	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
486	NC_013159	ACCC	2	8	1330596	1330603	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
487	NC_013159	CGTG	2	8	1331310	1331317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
488	NC_013159	GCGG	2	8	1331355	1331362	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
489	NC_013159	AAGC	2	8	1331404	1331411	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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491	NC_013159	CGAA	2	8	1335246	1335253	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_013159	AGGG	2	8	1338118	1338125	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
493	NC_013159	TCGC	2	8	1338911	1338918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
494	NC_013159	TCGC	2	8	1338978	1338985	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_013159	TCGC	2	8	1339045	1339052	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
496	NC_013159	TCGC	2	8	1339112	1339119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_013159	TCGC	2	8	1339179	1339186	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_013159	TCGC	2	8	1339246	1339253	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_013159	TCGG	2	8	1343955	1343962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_013159	TCGA	2	8	1347420	1347427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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