MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 1377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013158	ATAA	2	8	2304	2311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013158	TCCG	2	8	7909	7916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013158	ACGC	2	8	18659	18666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013158	CAGC	2	8	18705	18712	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013158	CCCG	2	8	18859	18866	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_013158	GACC	2	8	19240	19247	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013158	GACG	2	8	20010	20017	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013158	CCGG	2	8	20056	20063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013158	TCCC	2	8	38473	38480	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_013158	TGTC	2	8	38486	38493	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013158	GGTC	2	8	43516	43523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013158	GACG	2	8	49739	49746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013158	AATC	2	8	49785	49792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013158	GTAG	2	8	49826	49833	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013158	TCGG	2	8	52719	52726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013158	CTGT	2	8	53924	53931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013158	AATG	2	8	54215	54222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013158	TTTC	2	8	54438	54445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013158	TCTG	2	8	54541	54548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013158	CTCG	2	8	55873	55880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013158	TCCG	2	8	61341	61348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013158	GGCC	2	8	64316	64323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013158	GCAG	2	8	74506	74513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013158	CGCC	2	8	76127	76134	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_013158	GGAC	2	8	76414	76421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013158	GATA	2	8	76623	76630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013158	AGTG	2	8	82668	82675	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013158	GATT	2	8	86521	86528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013158	TCGT	2	8	88962	88969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013158	CGGC	2	8	92583	92590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013158	CGTT	2	8	93508	93515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013158	GTCT	2	8	93769	93776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013158	ACCG	2	8	93878	93885	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013158	GTCT	2	8	93952	93959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013158	CGCC	2	8	94668	94675	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_013158	ACTT	2	8	95290	95297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013158	TTGT	2	8	95312	95319	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013158	AGCG	2	8	104552	104559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013158	GCTG	2	8	107188	107195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013158	CGAT	2	8	112350	112357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013158	ATAC	2	8	117094	117101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013158	GTGA	2	8	117214	117221	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013158	GAAC	2	8	117250	117257	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013158	GGGA	2	8	117263	117270	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013158	TACT	2	8	117353	117360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013158	CGAC	2	8	117575	117582	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013158	TGGA	2	8	117965	117972	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013158	CAGG	2	8	118069	118076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013158	CACG	2	8	118383	118390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013158	CTGA	2	8	119589	119596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013158	ATCA	2	8	119602	119609	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013158	GTGC	2	8	119747	119754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013158	TCGT	2	8	119757	119764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013158	CGAA	2	8	119769	119776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013158	ATCC	2	8	119868	119875	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013158	CGGG	2	8	126514	126521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013158	TCCC	2	8	127729	127736	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_013158	GTTC	2	8	127754	127761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013158	TTGT	2	8	127800	127807	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013158	TCTA	2	8	127820	127827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013158	GGCA	2	8	132826	132833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013158	GACT	2	8	132856	132863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013158	AGGG	2	8	133656	133663	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013158	TTGT	2	8	138938	138945	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013158	CCTA	2	8	138953	138960	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013158	ATGA	2	8	140633	140640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013158	GAAC	2	8	140686	140693	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013158	CAAG	2	8	140815	140822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013158	GGCA	2	8	144321	144328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013158	ATCC	2	8	147713	147720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013158	GAAC	2	8	147777	147784	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013158	CCGT	2	8	148154	148161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013158	TCAC	2	8	148558	148565	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013158	TCGC	2	8	149173	149180	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013158	TGCT	2	8	159565	159572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013158	TCAT	2	8	162479	162486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013158	ACGG	2	8	162552	162559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013158	CGTC	2	8	166701	166708	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013158	GCCA	2	8	168872	168879	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013158	CTCC	2	8	169110	169117	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_013158	AATC	2	8	170423	170430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013158	TCAC	2	8	174736	174743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013158	CACC	2	8	181998	182005	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_013158	TCCG	2	8	183108	183115	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013158	GTCA	2	8	187418	187425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013158	GTCG	2	8	188997	189004	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013158	ACGT	2	8	192512	192519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013158	CACC	2	8	198383	198390	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_013158	GACA	2	8	198421	198428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013158	GCCT	2	8	199855	199862	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013158	ACGG	2	8	200386	200393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013158	CGTC	2	8	203267	203274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013158	CAAT	2	8	213351	213358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013158	GACC	2	8	213582	213589	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013158	CGCA	2	8	214733	214740	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013158	GCTC	2	8	215405	215412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013158	CTCG	2	8	216446	216453	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013158	GGGC	2	8	222508	222515	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013158	TGCT	2	8	225956	225963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013158	AATC	2	8	227415	227422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013158	GCCA	2	8	229560	229567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013158	TGGA	2	8	231225	231232	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013158	TATT	2	8	232243	232250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013158	ACTC	2	8	235164	235171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013158	TGCG	2	8	236185	236192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013158	GCTG	2	8	238492	238499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013158	TCGG	2	8	240036	240043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013158	TCCG	2	8	242472	242479	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013158	CAGA	2	8	242536	242543	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013158	GGTC	2	8	245467	245474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013158	GACC	2	8	247746	247753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013158	TGGT	2	8	254287	254294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013158	GGCC	2	8	257478	257485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013158	ACGG	2	8	257807	257814	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013158	GACG	2	8	257893	257900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013158	CTGT	2	8	264899	264906	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013158	GGCC	2	8	268024	268031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013158	CCGT	2	8	279631	279638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013158	ACGA	2	8	292757	292764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013158	GTAC	2	8	293627	293634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013158	TCGA	2	8	295655	295662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013158	ACCG	2	8	304584	304591	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013158	CGAT	2	8	309466	309473	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013158	ATTT	2	8	309492	309499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013158	GTTG	2	8	321132	321139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013158	CCGT	2	8	322091	322098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013158	CGTT	2	8	324372	324379	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013158	CGGC	2	8	324456	324463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013158	GTTC	2	8	324472	324479	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013158	GGTG	2	8	325513	325520	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013158	CGAT	2	8	325546	325553	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013158	CGGG	2	8	332764	332771	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013158	CGAA	2	8	334701	334708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013158	GTGG	2	8	339903	339910	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013158	TCGG	2	8	352694	352701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013158	GTCA	2	8	353287	353294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013158	GGCG	2	8	356084	356091	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013158	AACG	2	8	356130	356137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013158	TCGG	2	8	357404	357411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013158	GGGA	2	8	371912	371919	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013158	CGAA	2	8	373080	373087	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013158	ACTC	2	8	373444	373451	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013158	TCAC	2	8	373604	373611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013158	TCAC	2	8	374711	374718	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013158	GTTG	2	8	375859	375866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013158	TAGA	2	8	375924	375931	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013158	GCAG	2	8	375966	375973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013158	CGGG	2	8	378819	378826	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013158	CGGA	2	8	378858	378865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013158	CGAA	2	8	388504	388511	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013158	CCCT	2	8	389645	389652	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
152	NC_013158	CGTC	2	8	389995	390002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_013158	AGCG	2	8	393658	393665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_013158	CTGG	2	8	394396	394403	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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158	NC_013158	TTCG	2	8	396195	396202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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160	NC_013158	GCGA	2	8	396260	396267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_013158	CACC	2	8	430242	430249	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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488	NC_013158	ACGA	2	8	1108878	1108885	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_013158	CGGG	2	8	1138546	1138553	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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