MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 8816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013158	CGAG	2	8	602	609	25 %	0 %	50 %	25 %	257051091
2	NC_013158	GCCG	2	8	1213	1220	0 %	0 %	50 %	50 %	257051091
3	NC_013158	CGAC	2	8	1484	1491	25 %	0 %	25 %	50 %	257051091
4	NC_013158	CGGC	2	8	1787	1794	0 %	0 %	50 %	50 %	257051091
5	NC_013158	CGAC	2	8	1985	1992	25 %	0 %	25 %	50 %	257051091
6	NC_013158	AACG	2	8	2092	2099	50 %	0 %	25 %	25 %	257051091
7	NC_013158	TCAC	2	8	2354	2361	25 %	25 %	0 %	50 %	257051092
8	NC_013158	CGAC	3	12	2538	2549	25 %	0 %	25 %	50 %	257051092
9	NC_013158	CGCC	2	8	2853	2860	0 %	0 %	25 %	75 %	257051093
10	NC_013158	TCAA	2	8	3082	3089	50 %	25 %	0 %	25 %	257051094
11	NC_013158	TGGC	2	8	3095	3102	0 %	25 %	50 %	25 %	257051094
12	NC_013158	TGGC	2	8	3255	3262	0 %	25 %	50 %	25 %	257051094
13	NC_013158	CCCG	2	8	3530	3537	0 %	0 %	25 %	75 %	257051095
14	NC_013158	TCCC	2	8	3855	3862	0 %	25 %	0 %	75 %	257051095
15	NC_013158	CGAG	2	8	4123	4130	25 %	0 %	50 %	25 %	257051095
16	NC_013158	GGCG	2	8	4373	4380	0 %	0 %	75 %	25 %	257051095
17	NC_013158	CGTC	2	8	4510	4517	0 %	25 %	25 %	50 %	257051096
18	NC_013158	CGTG	2	8	4547	4554	0 %	25 %	50 %	25 %	257051096
19	NC_013158	GTCC	2	8	4806	4813	0 %	25 %	25 %	50 %	257051096
20	NC_013158	GATC	2	8	5913	5920	25 %	25 %	25 %	25 %	257051097
21	NC_013158	TTCG	2	8	5991	5998	0 %	50 %	25 %	25 %	257051097
22	NC_013158	CGAT	2	8	6471	6478	25 %	25 %	25 %	25 %	257051097
23	NC_013158	GATC	2	8	6549	6556	25 %	25 %	25 %	25 %	257051097
24	NC_013158	CAGC	2	8	7193	7200	25 %	0 %	25 %	50 %	257051097
25	NC_013158	CGCC	2	8	7557	7564	0 %	0 %	25 %	75 %	257051097
26	NC_013158	GCCG	2	8	8113	8120	0 %	0 %	50 %	50 %	257051098
27	NC_013158	GATC	2	8	8748	8755	25 %	25 %	25 %	25 %	257051099
28	NC_013158	TGGT	2	8	8830	8837	0 %	50 %	50 %	0 %	257051099
29	NC_013158	TCGA	2	8	8955	8962	25 %	25 %	25 %	25 %	257051099
30	NC_013158	ATCG	2	8	9033	9040	25 %	25 %	25 %	25 %	257051099
31	NC_013158	GCCG	2	8	9531	9538	0 %	0 %	50 %	50 %	257051100
32	NC_013158	GAGC	2	8	9605	9612	25 %	0 %	50 %	25 %	257051100
33	NC_013158	TCGA	2	8	9737	9744	25 %	25 %	25 %	25 %	257051100
34	NC_013158	CCGT	2	8	9921	9928	0 %	25 %	25 %	50 %	257051101
35	NC_013158	ACGT	2	8	10116	10123	25 %	25 %	25 %	25 %	257051101
36	NC_013158	GCGT	2	8	10172	10179	0 %	25 %	50 %	25 %	257051101
37	NC_013158	GTGG	2	8	10226	10233	0 %	25 %	75 %	0 %	257051101
38	NC_013158	CCCG	2	8	10253	10260	0 %	0 %	25 %	75 %	257051101
39	NC_013158	CTGG	2	8	10266	10273	0 %	25 %	50 %	25 %	257051101
40	NC_013158	GCCG	2	8	10479	10486	0 %	0 %	50 %	50 %	257051101
41	NC_013158	ATCG	2	8	10565	10572	25 %	25 %	25 %	25 %	257051101
42	NC_013158	CTCA	2	8	10772	10779	25 %	25 %	0 %	50 %	257051101
43	NC_013158	GTCC	2	8	11519	11526	0 %	25 %	25 %	50 %	257051101
44	NC_013158	GCTG	2	8	12437	12444	0 %	25 %	50 %	25 %	257051101
45	NC_013158	CTCG	2	8	12775	12782	0 %	25 %	25 %	50 %	257051101
46	NC_013158	CGAT	2	8	12972	12979	25 %	25 %	25 %	25 %	257051101
47	NC_013158	CGGC	2	8	12994	13001	0 %	0 %	50 %	50 %	257051101
48	NC_013158	CGAT	2	8	13889	13896	25 %	25 %	25 %	25 %	257051102
49	NC_013158	CGCT	2	8	13897	13904	0 %	25 %	25 %	50 %	257051102
50	NC_013158	TCGG	2	8	14211	14218	0 %	25 %	50 %	25 %	257051102
51	NC_013158	CTGG	2	8	14510	14517	0 %	25 %	50 %	25 %	257051103
52	NC_013158	ACGT	2	8	14653	14660	25 %	25 %	25 %	25 %	257051103
53	NC_013158	GACC	2	8	15050	15057	25 %	0 %	25 %	50 %	257051104
54	NC_013158	GTCC	2	8	15087	15094	0 %	25 %	25 %	50 %	257051104
55	NC_013158	GGTC	2	8	15168	15175	0 %	25 %	50 %	25 %	257051104
56	NC_013158	CCGG	2	8	15380	15387	0 %	0 %	50 %	50 %	257051104
57	NC_013158	GACG	2	8	15885	15892	25 %	0 %	50 %	25 %	257051104
58	NC_013158	CGAT	2	8	16120	16127	25 %	25 %	25 %	25 %	257051104
59	NC_013158	GCAA	2	8	16172	16179	50 %	0 %	25 %	25 %	257051104
60	NC_013158	TGGA	2	8	16454	16461	25 %	25 %	50 %	0 %	257051104
61	NC_013158	CCCA	2	8	16666	16673	25 %	0 %	0 %	75 %	257051104
62	NC_013158	TCAG	2	8	16695	16702	25 %	25 %	25 %	25 %	257051104
63	NC_013158	TCCG	2	8	16709	16716	0 %	25 %	25 %	50 %	257051105
64	NC_013158	GCTC	2	8	16783	16790	0 %	25 %	25 %	50 %	257051105
65	NC_013158	GATG	2	8	16841	16848	25 %	25 %	50 %	0 %	257051105
66	NC_013158	CCGG	2	8	16872	16879	0 %	0 %	50 %	50 %	257051105
67	NC_013158	CGTC	2	8	17078	17085	0 %	25 %	25 %	50 %	257051105
68	NC_013158	TCGC	2	8	17881	17888	0 %	25 %	25 %	50 %	257051105
69	NC_013158	ATCC	2	8	17951	17958	25 %	25 %	0 %	50 %	257051105
70	NC_013158	GACG	2	8	18976	18983	25 %	0 %	50 %	25 %	257051106
71	NC_013158	GAAC	2	8	19054	19061	50 %	0 %	25 %	25 %	257051106
72	NC_013158	GCTG	2	8	19129	19136	0 %	25 %	50 %	25 %	257051106
73	NC_013158	CGAT	2	8	21269	21276	25 %	25 %	25 %	25 %	257051109
74	NC_013158	CTGG	2	8	21477	21484	0 %	25 %	50 %	25 %	257051109
75	NC_013158	TCGA	2	8	21529	21536	25 %	25 %	25 %	25 %	257051109
76	NC_013158	GGCC	2	8	21552	21559	0 %	0 %	50 %	50 %	257051109
77	NC_013158	GTGA	2	8	21737	21744	25 %	25 %	50 %	0 %	257051109
78	NC_013158	GCGG	2	8	21857	21864	0 %	0 %	75 %	25 %	257051110
79	NC_013158	ACGC	2	8	22157	22164	25 %	0 %	25 %	50 %	257051110
80	NC_013158	CGGG	2	8	22254	22261	0 %	0 %	75 %	25 %	257051110
81	NC_013158	TCGT	2	8	22492	22499	0 %	50 %	25 %	25 %	257051111
82	NC_013158	CGAC	2	8	23469	23476	25 %	0 %	25 %	50 %	257051111
83	NC_013158	TGAG	2	8	23778	23785	25 %	25 %	50 %	0 %	257051111
84	NC_013158	CGGA	2	8	23803	23810	25 %	0 %	50 %	25 %	257051112
85	NC_013158	CGGC	2	8	24032	24039	0 %	0 %	50 %	50 %	257051113
86	NC_013158	GCGA	2	8	24970	24977	25 %	0 %	50 %	25 %	257051113
87	NC_013158	TCGA	2	8	25105	25112	25 %	25 %	25 %	25 %	257051113
88	NC_013158	TCCG	2	8	25492	25499	0 %	25 %	25 %	50 %	257051113
89	NC_013158	GCCG	2	8	25797	25804	0 %	0 %	50 %	50 %	257051113
90	NC_013158	CGGT	2	8	26403	26410	0 %	25 %	50 %	25 %	257051113
91	NC_013158	TTCA	2	8	26479	26486	25 %	50 %	0 %	25 %	257051113
92	NC_013158	ACCC	2	8	26682	26689	25 %	0 %	0 %	75 %	257051113
93	NC_013158	TCCC	2	8	27068	27075	0 %	25 %	0 %	75 %	257051114
94	NC_013158	CACC	2	8	27257	27264	25 %	0 %	0 %	75 %	257051114
95	NC_013158	TGAC	2	8	27917	27924	25 %	25 %	25 %	25 %	257051115
96	NC_013158	CGAT	2	8	28236	28243	25 %	25 %	25 %	25 %	257051115
97	NC_013158	GGCA	2	8	28245	28252	25 %	0 %	50 %	25 %	257051115
98	NC_013158	GCTG	2	8	28533	28540	0 %	25 %	50 %	25 %	257051115
99	NC_013158	GGAC	2	8	28575	28582	25 %	0 %	50 %	25 %	257051115
100	NC_013158	CGGA	2	8	29067	29074	25 %	0 %	50 %	25 %	257051116
101	NC_013158	CGCC	2	8	29261	29268	0 %	0 %	25 %	75 %	257051116
102	NC_013158	GCCG	2	8	29587	29594	0 %	0 %	50 %	50 %	257051117
103	NC_013158	CGAT	2	8	29655	29662	25 %	25 %	25 %	25 %	257051117
104	NC_013158	GCTT	2	8	29701	29708	0 %	50 %	25 %	25 %	257051117
105	NC_013158	CGGC	2	8	29810	29817	0 %	0 %	50 %	50 %	257051117
106	NC_013158	CGGT	2	8	29869	29876	0 %	25 %	50 %	25 %	257051117
107	NC_013158	CGTT	2	8	30306	30313	0 %	50 %	25 %	25 %	257051117
108	NC_013158	GAGG	2	8	30413	30420	25 %	0 %	75 %	0 %	257051118
109	NC_013158	GCGG	2	8	30575	30582	0 %	0 %	75 %	25 %	257051118
110	NC_013158	ATCG	2	8	31028	31035	25 %	25 %	25 %	25 %	257051118
111	NC_013158	CGAT	2	8	31224	31231	25 %	25 %	25 %	25 %	257051119
112	NC_013158	TTCT	2	8	32139	32146	0 %	75 %	0 %	25 %	257051120
113	NC_013158	CGCC	2	8	32319	32326	0 %	0 %	25 %	75 %	257051120
114	NC_013158	GTCA	2	8	32400	32407	25 %	25 %	25 %	25 %	257051120
115	NC_013158	TCGC	2	8	32579	32586	0 %	25 %	25 %	50 %	257051120
116	NC_013158	GCGA	2	8	32616	32623	25 %	0 %	50 %	25 %	257051120
117	NC_013158	GACC	2	8	33901	33908	25 %	0 %	25 %	50 %	257051123
118	NC_013158	CACC	2	8	34417	34424	25 %	0 %	0 %	75 %	257051124
119	NC_013158	CCGA	2	8	34479	34486	25 %	0 %	25 %	50 %	257051124
120	NC_013158	GAAC	2	8	34922	34929	50 %	0 %	25 %	25 %	257051124
121	NC_013158	ACGT	2	8	35004	35011	25 %	25 %	25 %	25 %	257051124
122	NC_013158	CCGC	2	8	35083	35090	0 %	0 %	25 %	75 %	257051124
123	NC_013158	TCAC	2	8	35427	35434	25 %	25 %	0 %	50 %	257051125
124	NC_013158	GTCG	2	8	35441	35448	0 %	25 %	50 %	25 %	257051125
125	NC_013158	CGTC	3	12	36162	36173	0 %	25 %	25 %	50 %	257051125
126	NC_013158	GCCC	2	8	36587	36594	0 %	0 %	25 %	75 %	257051125
127	NC_013158	GCCG	3	12	36806	36817	0 %	0 %	50 %	50 %	257051125
128	NC_013158	CGCT	2	8	36889	36896	0 %	25 %	25 %	50 %	257051125
129	NC_013158	TCGA	2	8	36976	36983	25 %	25 %	25 %	25 %	257051125
130	NC_013158	GGCT	2	8	37169	37176	0 %	25 %	50 %	25 %	257051125
131	NC_013158	CCGA	2	8	37707	37714	25 %	0 %	25 %	50 %	257051126
132	NC_013158	TTCG	2	8	38104	38111	0 %	50 %	25 %	25 %	257051126
133	NC_013158	TCGC	2	8	38232	38239	0 %	25 %	25 %	50 %	257051126
134	NC_013158	ATCC	2	8	38269	38276	25 %	25 %	0 %	50 %	257051126
135	NC_013158	ATCG	2	8	38600	38607	25 %	25 %	25 %	25 %	257051127
136	NC_013158	GCGT	2	8	38774	38781	0 %	25 %	50 %	25 %	257051127
137	NC_013158	CGAT	2	8	39025	39032	25 %	25 %	25 %	25 %	257051127
138	NC_013158	GTTC	2	8	39118	39125	0 %	50 %	25 %	25 %	257051127
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