MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 4376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013158	GAG	2	6	2184	2189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013158	AGC	2	6	2233	2238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013158	CCG	2	6	2814	2819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013158	TGG	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013158	CGA	2	6	7751	7756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013158	CGG	2	6	7787	7792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013158	TTC	2	6	9316	9321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013158	GAG	2	6	18734	18739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013158	GCT	2	6	18884	18889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013158	CCA	2	6	19791	19796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_013158	GAT	2	6	19911	19916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013158	CCG	2	6	19943	19948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_013158	GAA	2	6	20025	20030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013158	GCC	2	6	20097	20102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013158	GAC	2	6	20109	20114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013158	GTT	2	6	20141	20146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013158	GAC	2	6	20187	20192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013158	GTC	2	6	21011	21016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013158	CAT	2	6	21087	21092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013158	GGT	2	6	21129	21134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013158	TCG	2	6	27877	27882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013158	ACC	2	6	31177	31182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013158	CGA	2	6	32704	32709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013158	GTG	2	6	34181	34186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013158	CGA	2	6	34265	34270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013158	CGG	2	6	35391	35396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013158	AAG	2	6	38522	38527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013158	GTC	2	6	40065	40070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013158	CCG	2	6	40654	40659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013158	ACG	3	9	40908	40916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013158	ACA	2	6	40935	40940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013158	GCG	2	6	41013	41018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013158	TGA	2	6	41078	41083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013158	CGC	2	6	41091	41096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_013158	CAG	2	6	41181	41186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013158	ACC	2	6	43115	43120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013158	GCG	2	6	43140	43145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013158	AGC	2	6	43537	43542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013158	TGT	2	6	44043	44048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013158	CGC	2	6	46725	46730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_013158	GAC	2	6	46735	46740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013158	GGT	2	6	47111	47116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013158	AAC	2	6	47122	47127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013158	TGG	2	6	50649	50654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013158	CCG	2	6	50658	50663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_013158	CTG	2	6	54026	54031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013158	CGG	2	6	56891	56896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013158	CCG	2	6	63796	63801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_013158	TCT	2	6	63809	63814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013158	GAC	2	6	64972	64977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013158	CGG	2	6	64987	64992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013158	GAC	2	6	65018	65023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013158	GCC	2	6	65030	65035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_013158	TGT	2	6	66428	66433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013158	TGG	2	6	66879	66884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013158	CGT	2	6	66904	66909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013158	CCG	2	6	66933	66938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_013158	CGG	2	6	67531	67536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013158	GAC	2	6	67911	67916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013158	GAT	2	6	69688	69693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013158	TTA	2	6	69712	69717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013158	TCC	2	6	74471	74476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013158	CGA	2	6	74526	74531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013158	TCC	2	6	74542	74547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013158	ATT	2	6	75915	75920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013158	ACG	2	6	76094	76099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013158	CGA	2	6	76181	76186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013158	CGG	2	6	76187	76192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013158	CAC	2	6	76227	76232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_013158	CGT	2	6	76269	76274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013158	GGC	2	6	76342	76347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013158	CGT	2	6	76501	76506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013158	GTG	2	6	76523	76528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013158	CTT	2	6	76640	76645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013158	CGA	2	6	76674	76679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013158	CTT	2	6	76728	76733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013158	GCG	2	6	76743	76748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013158	TCG	2	6	77303	77308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013158	CAC	2	6	77319	77324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_013158	TGG	2	6	78587	78592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013158	ACG	2	6	80464	80469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013158	TTC	2	6	80516	80521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013158	CGC	2	6	82662	82667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_013158	CAT	2	6	82758	82763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013158	CGG	2	6	86529	86534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013158	TGA	2	6	86600	86605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013158	CGA	2	6	88584	88589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013158	TGG	2	6	88993	88998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013158	AAC	2	6	89043	89048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013158	GGC	2	6	91265	91270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013158	GCG	3	9	91298	91306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013158	TGA	2	6	91348	91353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013158	CCT	2	6	91417	91422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_013158	GCT	2	6	91463	91468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013158	CGG	2	6	91730	91735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013158	CCG	3	9	92139	92147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_013158	TCG	2	6	92163	92168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013158	GTG	2	6	92564	92569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013158	ACC	2	6	93286	93291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_013158	TCG	2	6	93331	93336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013158	AGT	2	6	93545	93550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013158	TGA	2	6	93847	93852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013158	CGA	2	6	93970	93975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013158	TGA	2	6	93986	93991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013158	TCG	2	6	94470	94475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013158	GGT	2	6	94513	94518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013158	CGA	2	6	94783	94788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013158	ACT	2	6	95665	95670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013158	TGC	2	6	95697	95702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013158	CGA	2	6	95796	95801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013158	GTC	2	6	95818	95823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013158	ATC	2	6	102356	102361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013158	CCA	2	6	102407	102412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013158	AGG	2	6	102420	102425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013158	CCG	2	6	102466	102471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_013158	TCG	2	6	103264	103269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013158	GAG	2	6	103340	103345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013158	CAT	2	6	104533	104538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013158	TTC	2	6	104591	104596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013158	TGG	2	6	104641	104646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013158	GAG	2	6	107328	107333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013158	TCG	2	6	107392	107397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013158	CTG	2	6	107406	107411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013158	CGT	2	6	107426	107431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013158	CGC	2	6	107933	107938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_013158	CGT	2	6	108013	108018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013158	ATA	2	6	111129	111134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013158	ACA	2	6	111901	111906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013158	GTC	2	6	112296	112301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013158	CGT	2	6	112378	112383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013158	TAC	2	6	117124	117129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013158	CGT	2	6	117399	117404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013158	GAC	2	6	117487	117492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013158	ACG	2	6	117557	117562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013158	GCC	2	6	117622	117627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_013158	GTC	2	6	117703	117708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013158	CTA	2	6	117729	117734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013158	CGA	2	6	117735	117740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013158	TCC	2	6	117788	117793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_013158	CGA	2	6	117812	117817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013158	ACT	2	6	117875	117880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013158	GCG	2	6	118050	118055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013158	CAG	2	6	118258	118263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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145	NC_013158	ACA	2	6	118394	118399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013158	CGA	2	6	118407	118412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_013158	ACT	2	6	118534	118539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_013158	ACC	2	6	118631	118636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_013158	ACT	2	6	119898	119903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013158	CTC	2	6	120989	120994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_013158	TGA	2	6	121100	121105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_013158	TCG	2	6	121215	121220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_013158	GCC	2	6	121702	121707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_013158	TGG	2	6	126541	126546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013158	CGC	2	6	127719	127724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_013158	CAC	2	6	127745	127750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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164	NC_013158	TAC	2	6	132837	132842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_013158	TAA	2	6	133727	133732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_013158	CGT	2	6	135908	135913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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