MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 49842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013158	AAG	2	6	118	123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051091
2	NC_013158	GCG	2	6	188	193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051091
3	NC_013158	CGA	2	6	243	248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051091
4	NC_013158	CCG	2	6	327	332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051091
5	NC_013158	CGA	2	6	404	409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051091
6	NC_013158	CGA	2	6	411	416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051091
7	NC_013158	CGT	2	6	516	521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051091
8	NC_013158	GAC	2	6	556	561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051091
9	NC_013158	GAC	2	6	577	582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051091
10	NC_013158	CGA	3	9	645	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051091
11	NC_013158	GAT	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051091
12	NC_013158	GCC	2	6	726	731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051091
13	NC_013158	TGT	2	6	743	748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051091
14	NC_013158	CCG	2	6	754	759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051091
15	NC_013158	TCG	2	6	923	928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051091
16	NC_013158	GAC	3	9	958	966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051091
17	NC_013158	GTC	3	9	1036	1044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051091
18	NC_013158	CGG	2	6	1092	1097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051091
19	NC_013158	GCC	2	6	1142	1147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051091
20	NC_013158	AGG	2	6	1148	1153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051091
21	NC_013158	TCG	2	6	1232	1237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051091
22	NC_013158	GGC	2	6	1266	1271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051091
23	NC_013158	CGA	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051091
24	NC_013158	CCG	2	6	1498	1503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051091
25	NC_013158	TCC	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051091
26	NC_013158	CCG	2	6	1525	1530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051091
27	NC_013158	GCT	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051091
28	NC_013158	CGA	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051091
29	NC_013158	ACT	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051091
30	NC_013158	TCG	2	6	1808	1813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051091
31	NC_013158	GGC	2	6	1818	1823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051091
32	NC_013158	CGA	2	6	1845	1850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051091
33	NC_013158	CGG	2	6	1915	1920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051091
34	NC_013158	CGG	2	6	1994	1999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051091
35	NC_013158	GCC	2	6	2035	2040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051091
36	NC_013158	CGA	2	6	2103	2108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051091
37	NC_013158	GCT	2	6	2137	2142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051091
38	NC_013158	CGA	2	6	2519	2524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051092
39	NC_013158	CGA	2	6	2678	2683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051092
40	NC_013158	TCC	2	6	2734	2739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051092
41	NC_013158	TCG	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051093
42	NC_013158	TTC	2	6	2956	2961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051093
43	NC_013158	TTC	2	6	3021	3026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051093
44	NC_013158	GCC	2	6	3110	3115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051094
45	NC_013158	CGC	2	6	3145	3150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051094
46	NC_013158	CGG	2	6	3423	3428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051095
47	NC_013158	GCC	2	6	3429	3434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051095
48	NC_013158	CGG	2	6	3590	3595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051095
49	NC_013158	CGC	2	6	3683	3688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051095
50	NC_013158	GAT	2	6	3747	3752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051095
51	NC_013158	CGT	2	6	3755	3760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051095
52	NC_013158	CGA	2	6	3869	3874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051095
53	NC_013158	CGA	3	9	3899	3907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051095
54	NC_013158	CGA	2	6	3911	3916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051095
55	NC_013158	TCG	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051095
56	NC_013158	GTG	2	6	3976	3981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051095
57	NC_013158	GCC	2	6	4023	4028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051095
58	NC_013158	CGC	2	6	4077	4082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051095
59	NC_013158	CCG	2	6	4107	4112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051095
60	NC_013158	GCG	2	6	4152	4157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051095
61	NC_013158	CGG	3	9	4178	4186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051095
62	NC_013158	CGC	2	6	4217	4222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051095
63	NC_013158	GGC	2	6	4276	4281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051095
64	NC_013158	TCG	2	6	4319	4324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051095
65	NC_013158	CGT	2	6	4405	4410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051095
66	NC_013158	CGA	2	6	4495	4500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051096
67	NC_013158	GCG	2	6	4566	4571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051096
68	NC_013158	CGA	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051096
69	NC_013158	CGT	2	6	4642	4647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051096
70	NC_013158	GAC	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051096
71	NC_013158	GTC	2	6	4706	4711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051096
72	NC_013158	GCT	2	6	4785	4790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051096
73	NC_013158	CGG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051096
74	NC_013158	CGA	2	6	5023	5028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051096
75	NC_013158	GCC	2	6	5040	5045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051096
76	NC_013158	CGT	2	6	5050	5055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051096
77	NC_013158	GAT	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051096
78	NC_013158	CGG	2	6	5129	5134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051096
79	NC_013158	GAC	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051096
80	NC_013158	GCC	2	6	5289	5294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051096
81	NC_013158	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051096
82	NC_013158	GCG	2	6	5386	5391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051096
83	NC_013158	TGA	2	6	5404	5409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051096
84	NC_013158	GTC	2	6	5490	5495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051097
85	NC_013158	TCG	2	6	5496	5501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051097
86	NC_013158	TCG	2	6	5540	5545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051097
87	NC_013158	CGA	3	9	5556	5564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051097
88	NC_013158	GGC	2	6	5568	5573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051097
89	NC_013158	CGA	2	6	5625	5630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051097
90	NC_013158	GCC	3	9	5702	5710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051097
91	NC_013158	CGA	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051097
92	NC_013158	ACG	2	6	5748	5753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051097
93	NC_013158	GCC	2	6	5870	5875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051097
94	NC_013158	CGT	3	9	5944	5952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051097
95	NC_013158	CGA	2	6	6045	6050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051097
96	NC_013158	CTC	2	6	6118	6123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051097
97	NC_013158	ACC	2	6	6158	6163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051097
98	NC_013158	CGG	2	6	6234	6239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051097
99	NC_013158	CGC	2	6	6403	6408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051097
100	NC_013158	CTC	2	6	6493	6498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051097
101	NC_013158	ACT	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051097
102	NC_013158	CAG	2	6	6616	6621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051097
103	NC_013158	CGG	2	6	6633	6638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051097
104	NC_013158	CGA	2	6	6789	6794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051097
105	NC_013158	CCG	2	6	6915	6920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051097
106	NC_013158	CGT	2	6	7009	7014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051097
107	NC_013158	CGT	2	6	7032	7037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051097
108	NC_013158	CAC	2	6	7084	7089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051097
109	NC_013158	CGG	2	6	7136	7141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051097
110	NC_013158	GGT	2	6	7177	7182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051097
111	NC_013158	GTC	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051097
112	NC_013158	CAC	2	6	7221	7226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051097
113	NC_013158	CGC	3	9	7254	7262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051097
114	NC_013158	TCG	2	6	7377	7382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051097
115	NC_013158	CCG	2	6	7395	7400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051097
116	NC_013158	CGT	2	6	7431	7436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051097
117	NC_013158	CCG	2	6	7460	7465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051097
118	NC_013158	GAG	2	6	7516	7521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051097
119	NC_013158	GAC	2	6	7528	7533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051097
120	NC_013158	ACC	2	6	7550	7555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051097
121	NC_013158	TCG	2	6	7578	7583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051097
122	NC_013158	CGC	2	6	8015	8020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051098
123	NC_013158	TCG	2	6	8081	8086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051098
124	NC_013158	TAT	2	6	8107	8112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257051098
125	NC_013158	TGC	2	6	8163	8168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051098
126	NC_013158	GTC	2	6	8188	8193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051098
127	NC_013158	GGC	2	6	8243	8248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051098
128	NC_013158	CTT	2	6	8283	8288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051098
129	NC_013158	TCG	2	6	8489	8494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051098
130	NC_013158	GGC	2	6	8595	8600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051098
131	NC_013158	GCC	2	6	8602	8607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051098
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251	NC_013158	CCT	2	6	16949	16954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051105
252	NC_013158	GCG	2	6	16985	16990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051105
253	NC_013158	ACC	2	6	17011	17016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051105
254	NC_013158	ACG	3	9	17033	17041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051105
255	NC_013158	CAC	2	6	17168	17173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051105
256	NC_013158	CGA	3	9	17183	17191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051105
257	NC_013158	CTG	2	6	17354	17359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051105
258	NC_013158	GTC	2	6	17389	17394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051105
259	NC_013158	CTG	2	6	17526	17531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051105
260	NC_013158	GGC	2	6	17682	17687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051105
261	NC_013158	TCA	2	6	18094	18099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051105
262	NC_013158	CGA	2	6	18113	18118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051105
263	NC_013158	GAG	2	6	18309	18314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051105
264	NC_013158	AGG	2	6	18340	18345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051105
265	NC_013158	GTT	2	6	18354	18359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051105
266	NC_013158	TCA	2	6	18400	18405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051105
267	NC_013158	ACG	2	6	18430	18435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051105
268	NC_013158	CTT	2	6	18509	18514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051105
269	NC_013158	CTG	2	6	18546	18551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051105
270	NC_013158	CAG	2	6	18561	18566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051105
271	NC_013158	CGA	2	6	18603	18608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051105
272	NC_013158	CGG	2	6	18611	18616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051105
273	NC_013158	GTT	2	6	18919	18924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051106
274	NC_013158	GCC	2	6	18941	18946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051106
275	NC_013158	GAG	2	6	19016	19021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051106
276	NC_013158	CGT	2	6	19078	19083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051106
277	NC_013158	GTT	2	6	19153	19158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051106
278	NC_013158	GCG	2	6	19170	19175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051106
279	NC_013158	GAG	2	6	19262	19267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051107
280	NC_013158	GAT	2	6	19280	19285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051107
281	NC_013158	TGG	2	6	19299	19304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051107
282	NC_013158	CCA	2	6	19483	19488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051107
283	NC_013158	CAC	2	6	19606	19611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051107
284	NC_013158	CGT	2	6	19621	19626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051107
285	NC_013158	GAC	3	9	19655	19663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051107
286	NC_013158	CAA	2	6	19718	19723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051107
287	NC_013158	GCC	2	6	20330	20335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051108
288	NC_013158	CAG	2	6	20388	20393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051108
289	NC_013158	CGG	2	6	20509	20514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051108
290	NC_013158	CGG	2	6	20595	20600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051108
291	NC_013158	CGA	2	6	20628	20633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051108
292	NC_013158	ATC	2	6	20728	20733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051108
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294	NC_013158	GGT	2	6	20891	20896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051108
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314	NC_013158	ACG	2	6	22637	22642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051111
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326	NC_013158	CGG	2	6	22926	22931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051111
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373	NC_013158	CGA	2	6	25239	25244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
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376	NC_013158	CGA	2	6	25508	25513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
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380	NC_013158	GAG	2	6	25618	25623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051113
381	NC_013158	CGA	2	6	25652	25657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051113
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383	NC_013158	GAG	2	6	25711	25716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051113
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497	NC_013158	GAC	2	6	31800	31805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051120
498	NC_013158	TCG	2	6	31816	31821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051120
499	NC_013158	ACG	2	6	31963	31968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051120
500	NC_013158	CGC	2	6	32006	32011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051120

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