MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 plasmid pMEFER01

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013157	GTTCCA	2	12	707	718	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256811521
2	NC_013157	CCCATC	2	12	5875	5886	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	256811530
3	NC_013157	TCTACT	2	12	5891	5902	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256811530
4	NC_013157	CTATTG	2	12	6810	6821	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256811531
5	NC_013157	ATCACT	2	12	8467	8478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811531
6	NC_013157	TCTTCA	2	12	10234	10245	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256811537
7	NC_013157	CATAGA	2	12	12680	12691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013157	TATTTT	2	12	12980	12991	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013157	TTAAAA	2	12	13244	13255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013157	AAAATT	2	12	13273	13284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013157	GATATC	2	12	13316	13327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013157	TTGGAT	2	12	13733	13744	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	256811545
13	NC_013157	ATAAAA	2	12	14206	14217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256811545
14	NC_013157	AGTTGA	2	12	15228	15239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811545
15	NC_013157	GTAGAA	2	12	15448	15459	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256811545
16	NC_013157	TTCATC	2	12	19190	19201	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256811550
17	NC_013157	TAACTT	2	12	20044	20055	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256811551
18	NC_013157	CTTTGT	2	12	20744	20755	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	256811553

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.